MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012855	GGCCT	2	10	121946	121955	0 %	20 %	40 %	40 %	241589638
2002	NC_012855	TAC	2	6	121959	121964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589638
2003	NC_012855	GAC	3	9	121995	122003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589638
2004	NC_012855	GGC	2	6	122024	122029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589638
2005	NC_012855	GA	3	6	122042	122047	50 %	0 %	50 %	0 %	241589638
2006	NC_012855	TCAA	2	8	122079	122086	50 %	25 %	0 %	25 %	241589638
2007	NC_012855	TCAAGG	2	12	122116	122127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241589638
2008	NC_012855	TGGGG	2	10	122392	122401	0 %	20 %	80 %	0 %	241589639
2009	NC_012855	ACTC	2	8	122452	122459	25 %	25 %	0 %	50 %	241589639
2010	NC_012855	CGA	2	6	122476	122481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589639
2011	NC_012855	CAG	2	6	122486	122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589639
2012	NC_012855	CGC	2	6	122515	122520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589639
2013	NC_012855	ACG	2	6	122538	122543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589639
2014	NC_012855	T	6	6	122557	122562	0 %	100 %	0 %	0 %	241589639
2015	NC_012855	TGC	3	9	122619	122627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589639
2016	NC_012855	GGT	3	9	122698	122706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589639
2017	NC_012855	GC	3	6	122720	122725	0 %	0 %	50 %	50 %	241589639
2018	NC_012855	TCC	2	6	122808	122813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589639
2019	NC_012855	CTC	3	9	123004	123012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589640
2020	NC_012855	TG	3	6	123022	123027	0 %	50 %	50 %	0 %	241589640
2021	NC_012855	CTG	2	6	123064	123069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589640
2022	NC_012855	TTC	3	9	123103	123111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589640
2023	NC_012855	CCG	2	6	123165	123170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589640
2024	NC_012855	CGC	2	6	123213	123218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589640
2025	NC_012855	TGG	2	6	123350	123355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589641
2026	NC_012855	CTG	2	6	123421	123426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2027	NC_012855	CCG	2	6	123431	123436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589641
2028	NC_012855	CATC	2	8	123448	123455	25 %	25 %	0 %	50 %	241589641
2029	NC_012855	GGC	2	6	123535	123540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589641
2030	NC_012855	TCG	2	6	123578	123583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2031	NC_012855	GGAT	2	8	123607	123614	25 %	25 %	50 %	0 %	241589641
2032	NC_012855	GAC	2	6	123703	123708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2033	NC_012855	GATG	2	8	123768	123775	25 %	25 %	50 %	0 %	241589641
2034	NC_012855	CTG	2	6	123780	123785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2035	NC_012855	GCG	2	6	123867	123872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589641
2036	NC_012855	GATCT	2	10	123892	123901	20 %	40 %	20 %	20 %	241589641
2037	NC_012855	ACGG	2	8	123904	123911	25 %	0 %	50 %	25 %	241589641
2038	NC_012855	GAG	2	6	123946	123951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589641
2039	NC_012855	AGC	2	6	124013	124018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2040	NC_012855	CAG	2	6	124037	124042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2041	NC_012855	ACG	2	6	124058	124063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2042	NC_012855	CCG	2	6	124094	124099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589641
2043	NC_012855	CGA	2	6	124143	124148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2044	NC_012855	CGG	2	6	124185	124190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589641
2045	NC_012855	GCT	2	6	124215	124220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2046	NC_012855	TGG	2	6	124228	124233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589641
2047	NC_012855	GAT	2	6	124300	124305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589641
2048	NC_012855	TGG	2	6	124315	124320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589641
2049	NC_012855	GTT	2	6	124407	124412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589641
2050	NC_012855	TCT	2	6	124460	124465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589641
2051	NC_012855	GATCGA	2	12	124491	124502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241589641
2052	NC_012855	GCG	2	6	124520	124525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589641
2053	NC_012855	GC	3	6	124553	124558	0 %	0 %	50 %	50 %	241589641
2054	NC_012855	CTT	2	6	124578	124583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589641
2055	NC_012855	CTG	2	6	124750	124755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589641
2056	NC_012855	GGC	2	6	124780	124785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589641
2057	NC_012855	CT	3	6	124788	124793	0 %	50 %	0 %	50 %	241589641
2058	NC_012855	GAA	2	6	124837	124842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589641
2059	NC_012855	GAT	3	9	124847	124855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589641
2060	NC_012855	CAA	2	6	124859	124864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589642
2061	NC_012855	GCA	2	6	124917	124922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589642
2062	NC_012855	CGT	2	6	125045	125050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589642
2063	NC_012855	CCTG	2	8	125120	125127	0 %	25 %	25 %	50 %	241589642
2064	NC_012855	CGT	2	6	125129	125134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589642
2065	NC_012855	GAC	2	6	125144	125149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589642
2066	NC_012855	GT	3	6	125462	125467	0 %	50 %	50 %	0 %	241589643
2067	NC_012855	CAGT	2	8	125479	125486	25 %	25 %	25 %	25 %	241589643
2068	NC_012855	AGA	2	6	125487	125492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589643
2069	NC_012855	GCC	2	6	125505	125510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589643
2070	NC_012855	GCT	2	6	125545	125550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589643
2071	NC_012855	GCCC	2	8	125555	125562	0 %	0 %	25 %	75 %	241589643
2072	NC_012855	GGC	2	6	125573	125578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589643
2073	NC_012855	GCG	2	6	125721	125726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589644
2074	NC_012855	TGT	2	6	125745	125750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589644
2075	NC_012855	TCG	2	6	125771	125776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589644
2076	NC_012855	AACGT	2	10	125852	125861	40 %	20 %	20 %	20 %	241589644
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2080	NC_012855	CCAG	2	8	125932	125939	25 %	0 %	25 %	50 %	241589644
2081	NC_012855	GTA	2	6	125989	125994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589644
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2083	NC_012855	CATC	2	8	126120	126127	25 %	25 %	0 %	50 %	241589644
2084	NC_012855	CGG	2	6	126164	126169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589644
2085	NC_012855	TGGA	2	8	127014	127021	25 %	25 %	50 %	0 %	241589645
2086	NC_012855	GCAG	2	8	127271	127278	25 %	0 %	50 %	25 %	241589645
2087	NC_012855	CGGC	2	8	127426	127433	0 %	0 %	50 %	50 %	241589646
2088	NC_012855	CG	3	6	127513	127518	0 %	0 %	50 %	50 %	241589646
2089	NC_012855	ACC	2	6	127536	127541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589646
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2091	NC_012855	CTA	2	6	127701	127706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589647
2092	NC_012855	ACT	2	6	127721	127726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589647
2093	NC_012855	AGT	2	6	127732	127737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589647
2094	NC_012855	CTA	2	6	127887	127892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589647
2095	NC_012855	ACGG	2	8	127898	127905	25 %	0 %	50 %	25 %	241589647
2096	NC_012855	GTT	2	6	127911	127916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589647
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2099	NC_012855	GCT	2	6	128277	128282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589648
2100	NC_012855	CTGG	2	8	128288	128295	0 %	25 %	50 %	25 %	241589648
2101	NC_012855	CGG	2	6	128330	128335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589648
2102	NC_012855	CCA	2	6	128363	128368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589648
2103	NC_012855	TGATT	2	10	128373	128382	20 %	60 %	20 %	0 %	241589648
2104	NC_012855	TGG	2	6	128402	128407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589648
2105	NC_012855	GCG	2	6	128432	128437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589648
2106	NC_012855	ATC	2	6	128515	128520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589649
2107	NC_012855	CGC	2	6	128526	128531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589649
2108	NC_012855	GTT	2	6	128539	128544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589649
2109	NC_012855	TCCG	2	8	128593	128600	0 %	25 %	25 %	50 %	241589649
2110	NC_012855	AAGGGC	2	12	128617	128628	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241589649
2111	NC_012855	ACG	2	6	128638	128643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589649
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2113	NC_012855	GCT	2	6	128697	128702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589649
2114	NC_012855	CGG	2	6	128726	128731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589649
2115	NC_012855	CGG	2	6	128747	128752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589649
2116	NC_012855	GTG	2	6	128753	128758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589649
2117	NC_012855	CCAA	2	8	128761	128768	50 %	0 %	0 %	50 %	241589649
2118	NC_012855	GAC	2	6	128779	128784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589649
2119	NC_012855	TGAC	2	8	128814	128821	25 %	25 %	25 %	25 %	241589649
2120	NC_012855	TCA	2	6	128847	128852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589650
2121	NC_012855	CAG	2	6	128939	128944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589650
2122	NC_012855	AAG	2	6	128952	128957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589650
2123	NC_012855	AGA	2	6	129055	129060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589651
2124	NC_012855	TCA	2	6	129141	129146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589651
2125	NC_012855	TAC	2	6	129149	129154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589651
2126	NC_012855	AGC	2	6	129234	129239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589651
2127	NC_012855	TG	3	6	129242	129247	0 %	50 %	50 %	0 %	241589651
2128	NC_012855	CTT	2	6	129334	129339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589652
2129	NC_012855	TAC	2	6	129511	129516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589652
2130	NC_012855	GAC	2	6	129618	129623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589652
2131	NC_012855	GCCG	2	8	129648	129655	0 %	0 %	50 %	50 %	241589652
2132	NC_012855	TCGTGG	2	12	129833	129844	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241589653
2133	NC_012855	GAC	2	6	129891	129896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589653
2134	NC_012855	GT	3	6	129912	129917	0 %	50 %	50 %	0 %	241589653
2135	NC_012855	CGT	2	6	130026	130031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589653
2136	NC_012855	GGT	2	6	130185	130190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589653
2137	NC_012855	A	6	6	130349	130354	100 %	0 %	0 %	0 %	241589654
2138	NC_012855	GTG	2	6	130386	130391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589654
2139	NC_012855	TTC	2	6	130393	130398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589654
2140	NC_012855	GTTG	2	8	130429	130436	0 %	50 %	50 %	0 %	241589654
2141	NC_012855	CGC	2	6	130550	130555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589654
2142	NC_012855	TCG	2	6	130569	130574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589654
2143	NC_012855	ACC	2	6	130694	130699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589655
2144	NC_012855	TCC	2	6	130706	130711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589655
2145	NC_012855	GAT	2	6	130722	130727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589655
2146	NC_012855	CCT	2	6	130748	130753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589655
2147	NC_012855	TGA	3	9	130778	130786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589655
2148	NC_012855	GAA	2	6	130787	130792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589655
2149	NC_012855	GAG	2	6	130812	130817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589655
2150	NC_012855	CGG	2	6	130847	130852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589655
2151	NC_012855	AAGGG	2	10	130879	130888	40 %	0 %	60 %	0 %	241589655
2152	NC_012855	GAA	2	6	130994	130999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589656
2153	NC_012855	TGCCGA	2	12	131039	131050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241589656
2154	NC_012855	GAA	2	6	131123	131128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589656
2155	NC_012855	GCC	2	6	131183	131188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589656
2156	NC_012855	AAG	2	6	131232	131237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589656
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2158	NC_012855	GAA	2	6	131316	131321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589656
2159	NC_012855	CGC	2	6	131847	131852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589657
2160	NC_012855	GGCG	2	8	131857	131864	0 %	0 %	75 %	25 %	241589657
2161	NC_012855	GC	3	6	131882	131887	0 %	0 %	50 %	50 %	241589657
2162	NC_012855	TGC	2	6	131916	131921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589657
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2165	NC_012855	CAAG	2	8	132065	132072	50 %	0 %	25 %	25 %	241589657
2166	NC_012855	TCG	2	6	132120	132125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589657
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2171	NC_012855	CTG	2	6	132718	132723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589659
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2177	NC_012855	TTCAG	2	10	133248	133257	20 %	40 %	20 %	20 %	241589660
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2190	NC_012855	CTG	2	6	134216	134221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589662
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2193	NC_012855	AGTG	2	8	134329	134336	25 %	25 %	50 %	0 %	241589662
2194	NC_012855	AGG	2	6	134348	134353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589662
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2206	NC_012855	GCT	2	6	134647	134652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589662
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2213	NC_012855	CAGCC	2	10	135129	135138	20 %	0 %	20 %	60 %	241589663
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2224	NC_012855	GGCT	2	8	135658	135665	0 %	25 %	50 %	25 %	241589664
2225	NC_012855	CAG	2	6	135678	135683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589664
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2231	NC_012855	CGG	2	6	136103	136108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589664
2232	NC_012855	GTC	2	6	136240	136245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589664
2233	NC_012855	AGC	2	6	136297	136302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589664
2234	NC_012855	GA	3	6	136345	136350	50 %	0 %	50 %	0 %	241589664
2235	NC_012855	CAC	2	6	136380	136385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589664
2236	NC_012855	CGTG	2	8	136403	136410	0 %	25 %	50 %	25 %	241589664
2237	NC_012855	CCTT	2	8	136444	136451	0 %	50 %	0 %	50 %	241589664
2238	NC_012855	GCTTG	2	10	136463	136472	0 %	40 %	40 %	20 %	241589664
2239	NC_012855	TCC	2	6	136495	136500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589664
2240	NC_012855	CGAG	2	8	136526	136533	25 %	0 %	50 %	25 %	241589664
2241	NC_012855	TG	3	6	136543	136548	0 %	50 %	50 %	0 %	241589664
2242	NC_012855	CCT	2	6	136562	136567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589664
2243	NC_012855	TCA	2	6	136645	136650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589664
2244	NC_012855	GC	3	6	136652	136657	0 %	0 %	50 %	50 %	241589664
2245	NC_012855	GCA	2	6	136700	136705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589664
2246	NC_012855	GAG	2	6	136725	136730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589664
2247	NC_012855	CG	3	6	136794	136799	0 %	0 %	50 %	50 %	241589664
2248	NC_012855	CTG	2	6	136800	136805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589664
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2250	NC_012855	CGG	2	6	136842	136847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589664
2251	NC_012855	CGA	2	6	136850	136855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589664
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2253	NC_012855	CGA	2	6	136877	136882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589664
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2255	NC_012855	GTGA	2	8	137029	137036	25 %	25 %	50 %	0 %	241589665
2256	NC_012855	AGCG	2	8	137051	137058	25 %	0 %	50 %	25 %	241589665
2257	NC_012855	TGA	3	9	137074	137082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589665
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2259	NC_012855	CGG	2	6	137272	137277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589665
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2262	NC_012855	GC	4	8	137669	137676	0 %	0 %	50 %	50 %	241589666
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2356	NC_012855	CA	3	6	143839	143844	50 %	0 %	0 %	50 %	241589677
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2486	NC_012855	CTC	2	6	153569	153574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589692
2487	NC_012855	TTC	2	6	153800	153805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589692
2488	NC_012855	AAG	2	6	153932	153937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589692
2489	NC_012855	TG	3	6	153975	153980	0 %	50 %	50 %	0 %	241589692
2490	NC_012855	CAG	2	6	153982	153987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589692
2491	NC_012855	GAC	2	6	154019	154024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589692
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2493	NC_012855	CTT	2	6	154160	154165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589692
2494	NC_012855	TGA	2	6	154213	154218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589692
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