MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012855	CAG	2	6	93306	93311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589612
1502	NC_012855	CAG	2	6	93327	93332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589612
1503	NC_012855	TC	3	6	93360	93365	0 %	50 %	0 %	50 %	241589612
1504	NC_012855	GGC	2	6	93380	93385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589612
1505	NC_012855	G	8	8	93389	93396	0 %	0 %	100 %	0 %	241589612
1506	NC_012855	GAA	2	6	93443	93448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589612
1507	NC_012855	AAC	2	6	93465	93470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589612
1508	NC_012855	GCG	2	6	93576	93581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589612
1509	NC_012855	ACT	2	6	93608	93613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589612
1510	NC_012855	GCT	2	6	93642	93647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589612
1511	NC_012855	CTC	2	6	93699	93704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589612
1512	NC_012855	GCT	2	6	93752	93757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589612
1513	NC_012855	GATG	2	8	93794	93801	25 %	25 %	50 %	0 %	241589612
1514	NC_012855	GCGAA	2	10	93807	93816	40 %	0 %	40 %	20 %	241589612
1515	NC_012855	TCA	2	6	93857	93862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589612
1516	NC_012855	TGG	2	6	93886	93891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589612
1517	NC_012855	GATC	2	8	93904	93911	25 %	25 %	25 %	25 %	241589612
1518	NC_012855	CTG	2	6	94039	94044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589613
1519	NC_012855	CAG	2	6	94068	94073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589613
1520	NC_012855	GCC	2	6	94272	94277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589613
1521	NC_012855	GACG	2	8	94322	94329	25 %	0 %	50 %	25 %	241589613
1522	NC_012855	CAG	2	6	94395	94400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589613
1523	NC_012855	CAG	2	6	94444	94449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589613
1524	NC_012855	TGA	2	6	94471	94476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589613
1525	NC_012855	GTG	2	6	94688	94693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589613
1526	NC_012855	TCA	2	6	94966	94971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589614
1527	NC_012855	AGC	2	6	95004	95009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589614
1528	NC_012855	CAG	2	6	95024	95029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589614
1529	NC_012855	CT	3	6	95074	95079	0 %	50 %	0 %	50 %	241589614
1530	NC_012855	GA	3	6	95125	95130	50 %	0 %	50 %	0 %	241589614
1531	NC_012855	CAT	3	9	95153	95161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589614
1532	NC_012855	ATG	2	6	95187	95192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589614
1533	NC_012855	TGG	2	6	95327	95332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589614
1534	NC_012855	GGTT	2	8	95370	95377	0 %	50 %	50 %	0 %	241589614
1535	NC_012855	CTC	2	6	95378	95383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589614
1536	NC_012855	CAC	2	6	95459	95464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589614
1537	NC_012855	GCC	2	6	95496	95501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589614
1538	NC_012855	TGGCA	2	10	95534	95543	20 %	20 %	40 %	20 %	241589614
1539	NC_012855	GAT	2	6	95630	95635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589614
1540	NC_012855	ACC	2	6	95682	95687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589614
1541	NC_012855	TCA	2	6	95758	95763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589614
1542	NC_012855	GGC	2	6	95814	95819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589614
1543	NC_012855	CG	3	6	95821	95826	0 %	0 %	50 %	50 %	241589614
1544	NC_012855	GAA	2	6	95858	95863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589614
1545	NC_012855	GGC	2	6	95933	95938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589614
1546	NC_012855	GCA	2	6	95943	95948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589614
1547	NC_012855	GCC	2	6	95961	95966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589614
1548	NC_012855	CGA	2	6	95985	95990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589614
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1550	NC_012855	GTGC	2	8	96096	96103	0 %	25 %	50 %	25 %	241589614
1551	NC_012855	TGG	2	6	96125	96130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589614
1552	NC_012855	AAGGA	2	10	96232	96241	60 %	0 %	40 %	0 %	241589615
1553	NC_012855	CTA	2	6	96280	96285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589615
1554	NC_012855	GC	3	6	96319	96324	0 %	0 %	50 %	50 %	241589615
1555	NC_012855	TCG	2	6	96482	96487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589615
1556	NC_012855	TAC	2	6	96620	96625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589616
1557	NC_012855	CAT	2	6	96686	96691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589616
1558	NC_012855	AGG	2	6	96708	96713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589616
1559	NC_012855	GTA	2	6	96769	96774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589617
1560	NC_012855	CGG	2	6	96780	96785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589617
1561	NC_012855	CTG	2	6	96803	96808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589617
1562	NC_012855	TTG	2	6	96953	96958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589617
1563	NC_012855	CCG	2	6	97082	97087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589617
1564	NC_012855	CTCG	2	8	97185	97192	0 %	25 %	25 %	50 %	241589617
1565	NC_012855	GGA	2	6	97200	97205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589617
1566	NC_012855	CGCCTG	2	12	97216	97227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241589617
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1568	NC_012855	GGCG	2	8	97335	97342	0 %	0 %	75 %	25 %	241589617
1569	NC_012855	GAA	2	6	97395	97400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589617
1570	NC_012855	GAC	2	6	97404	97409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589617
1571	NC_012855	AG	3	6	97512	97517	50 %	0 %	50 %	0 %	241589617
1572	NC_012855	AC	3	6	97544	97549	50 %	0 %	0 %	50 %	241589617
1573	NC_012855	CTG	2	6	97558	97563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589617
1574	NC_012855	CG	3	6	97573	97578	0 %	0 %	50 %	50 %	241589617
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1582	NC_012855	CTTTGA	2	12	97860	97871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241589617
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1584	NC_012855	GC	3	6	97905	97910	0 %	0 %	50 %	50 %	241589617
1585	NC_012855	CCT	2	6	98065	98070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589617
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1591	NC_012855	CG	3	6	98499	98504	0 %	0 %	50 %	50 %	241589617
1592	NC_012855	GTT	2	6	98506	98511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589617
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1594	NC_012855	TCC	2	6	98552	98557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589617
1595	NC_012855	CCGT	2	8	98579	98586	0 %	25 %	25 %	50 %	241589617
1596	NC_012855	CGA	2	6	98598	98603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589617
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1598	NC_012855	GC	3	6	98635	98640	0 %	0 %	50 %	50 %	241589617
1599	NC_012855	AAG	3	9	98870	98878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589618
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1603	NC_012855	TCGTT	2	10	99033	99042	0 %	60 %	20 %	20 %	241589618
1604	NC_012855	GGT	2	6	99122	99127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589618
1605	NC_012855	AGC	2	6	99133	99138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589618
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1607	NC_012855	ACG	2	6	99221	99226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589618
1608	NC_012855	AGC	2	6	99241	99246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589618
1609	NC_012855	CAA	2	6	99283	99288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589618
1610	NC_012855	CGA	3	9	99298	99306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589618
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1614	NC_012855	CG	4	8	99538	99545	0 %	0 %	50 %	50 %	241589618
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1621	NC_012855	CAACT	2	10	100060	100069	40 %	20 %	0 %	40 %	241589619
1622	NC_012855	ACT	2	6	100073	100078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589619
1623	NC_012855	GCG	2	6	100093	100098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589619
1624	NC_012855	CGA	2	6	100119	100124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589619
1625	NC_012855	TGCC	2	8	100148	100155	0 %	25 %	25 %	50 %	241589619
1626	NC_012855	CTG	2	6	100172	100177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589619
1627	NC_012855	CGC	2	6	100206	100211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589619
1628	NC_012855	GTC	2	6	100255	100260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589619
1629	NC_012855	GCT	2	6	100266	100271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589619
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1633	NC_012855	GAA	3	9	100373	100381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589620
1634	NC_012855	TCA	2	6	100435	100440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589620
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1643	NC_012855	CGG	2	6	100708	100713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589620
1644	NC_012855	CCT	2	6	100737	100742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589620
1645	NC_012855	GAT	2	6	100811	100816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589620
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1652	NC_012855	TGC	2	6	101006	101011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589620
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1656	NC_012855	AATG	2	8	101171	101178	50 %	25 %	25 %	0 %	241589620
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1664	NC_012855	GCA	2	6	101543	101548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589620
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1726	NC_012855	TGGTGC	2	12	104951	104962	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241589623
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1732	NC_012855	CGGCA	2	10	105241	105250	20 %	0 %	40 %	40 %	241589623
1733	NC_012855	GAC	2	6	105291	105296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589623
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1862	NC_012855	TGGC	2	8	111914	111921	0 %	25 %	50 %	25 %	241589629
1863	NC_012855	AC	3	6	111950	111955	50 %	0 %	0 %	50 %	241589629
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1865	NC_012855	AGC	2	6	112003	112008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589629
1866	NC_012855	CGT	2	6	112034	112039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589629
1867	NC_012855	CTGG	2	8	112138	112145	0 %	25 %	50 %	25 %	241589629
1868	NC_012855	GCAG	2	8	112155	112162	25 %	0 %	50 %	25 %	241589629
1869	NC_012855	CG	3	6	112299	112304	0 %	0 %	50 %	50 %	241589629
1870	NC_012855	TGG	2	6	112422	112427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589629
1871	NC_012855	CGG	2	6	112518	112523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589629
1872	NC_012855	ACT	2	6	112627	112632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589629
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1875	NC_012855	GTG	2	6	112679	112684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589629
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1880	NC_012855	TGC	2	6	112866	112871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589629
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1897	NC_012855	CGG	2	6	113855	113860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589631
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1970	NC_012855	CGA	2	6	119549	119554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589636
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1973	NC_012855	GCTGC	2	10	119765	119774	0 %	20 %	40 %	40 %	241589636
1974	NC_012855	TGG	2	6	119820	119825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589636
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1976	NC_012855	CG	3	6	120119	120124	0 %	0 %	50 %	50 %	241589636
1977	NC_012855	GTG	2	6	120147	120152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589636
1978	NC_012855	GAC	2	6	120180	120185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589636
1979	NC_012855	TGCG	2	8	120193	120200	0 %	25 %	50 %	25 %	241589636
1980	NC_012855	GAG	2	6	120213	120218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589636
1981	NC_012855	CGG	2	6	120277	120282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589636
1982	NC_012855	TGC	2	6	120751	120756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589637
1983	NC_012855	CTG	2	6	120770	120775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589637
1984	NC_012855	GATCA	2	10	120809	120818	40 %	20 %	20 %	20 %	241589637
1985	NC_012855	CGGC	2	8	120924	120931	0 %	0 %	50 %	50 %	241589637
1986	NC_012855	GGCTG	2	10	120958	120967	0 %	20 %	60 %	20 %	241589637
1987	NC_012855	CCG	2	6	120972	120977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589637
1988	NC_012855	GCG	2	6	121005	121010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589637
1989	NC_012855	GCA	2	6	121051	121056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589637
1990	NC_012855	TGG	2	6	121146	121151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589637
1991	NC_012855	GA	3	6	121320	121325	50 %	0 %	50 %	0 %	241589638
1992	NC_012855	AAGC	2	8	121353	121360	50 %	0 %	25 %	25 %	241589638
1993	NC_012855	ATCG	2	8	121407	121414	25 %	25 %	25 %	25 %	241589638
1994	NC_012855	TCG	2	6	121505	121510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589638
1995	NC_012855	GAT	2	6	121536	121541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589638
1996	NC_012855	AGC	2	6	121546	121551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589638
1997	NC_012855	CTA	2	6	121559	121564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589638
1998	NC_012855	ATTGG	2	10	121718	121727	20 %	40 %	40 %	0 %	241589638
1999	NC_012855	GAG	2	6	121863	121868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589638
2000	NC_012855	CAAG	2	8	121934	121941	50 %	0 %	25 %	25 %	241589638

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