MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012855	GCT	2	6	63900	63905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589587
1002	NC_012855	ACC	2	6	63919	63924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589587
1003	NC_012855	CGA	2	6	63936	63941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589587
1004	NC_012855	A	7	7	63965	63971	100 %	0 %	0 %	0 %	241589587
1005	NC_012855	CGC	2	6	64127	64132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589587
1006	NC_012855	CGA	2	6	64149	64154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589587
1007	NC_012855	CGC	2	6	64266	64271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589587
1008	NC_012855	GCC	2	6	64315	64320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589587
1009	NC_012855	CA	3	6	64324	64329	50 %	0 %	0 %	50 %	241589587
1010	NC_012855	G	6	6	64336	64341	0 %	0 %	100 %	0 %	241589587
1011	NC_012855	TCA	2	6	64349	64354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589587
1012	NC_012855	TCTG	2	8	64372	64379	0 %	50 %	25 %	25 %	241589587
1013	NC_012855	GCG	2	6	64396	64401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589587
1014	NC_012855	CGA	2	6	64510	64515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1015	NC_012855	GAT	2	6	64576	64581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589588
1016	NC_012855	CG	4	8	64635	64642	0 %	0 %	50 %	50 %	241589588
1017	NC_012855	TG	3	6	64668	64673	0 %	50 %	50 %	0 %	241589588
1018	NC_012855	TGAT	2	8	64743	64750	25 %	50 %	25 %	0 %	241589588
1019	NC_012855	TTC	2	6	64772	64777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589588
1020	NC_012855	AGC	2	6	64818	64823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1021	NC_012855	AAG	2	6	64910	64915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589588
1022	NC_012855	TGG	2	6	65012	65017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589588
1023	NC_012855	GC	3	6	65029	65034	0 %	0 %	50 %	50 %	241589588
1024	NC_012855	GCG	2	6	65060	65065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589588
1025	NC_012855	GCT	2	6	65072	65077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1026	NC_012855	CT	3	6	65076	65081	0 %	50 %	0 %	50 %	241589588
1027	NC_012855	CAG	2	6	65119	65124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1028	NC_012855	CG	3	6	65125	65130	0 %	0 %	50 %	50 %	241589588
1029	NC_012855	GAG	2	6	65141	65146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589588
1030	NC_012855	GCT	2	6	65209	65214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1031	NC_012855	CCT	2	6	65218	65223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589588
1032	NC_012855	GGC	2	6	65227	65232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589588
1033	NC_012855	TACGG	2	10	65239	65248	20 %	20 %	40 %	20 %	241589588
1034	NC_012855	TTC	2	6	65265	65270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589588
1035	NC_012855	GGTC	2	8	65289	65296	0 %	25 %	50 %	25 %	241589588
1036	NC_012855	CGAA	2	8	65311	65318	50 %	0 %	25 %	25 %	241589588
1037	NC_012855	CAAG	2	8	65325	65332	50 %	0 %	25 %	25 %	241589588
1038	NC_012855	GCTC	2	8	65341	65348	0 %	25 %	25 %	50 %	241589588
1039	NC_012855	CAGT	2	8	65362	65369	25 %	25 %	25 %	25 %	241589588
1040	NC_012855	GA	4	8	65381	65388	50 %	0 %	50 %	0 %	241589588
1041	NC_012855	CG	3	6	65514	65519	0 %	0 %	50 %	50 %	241589588
1042	NC_012855	CAG	2	6	65593	65598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589588
1043	NC_012855	GTT	2	6	65699	65704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589588
1044	NC_012855	GC	3	6	65836	65841	0 %	0 %	50 %	50 %	241589588
1045	NC_012855	CGG	2	6	65862	65867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589588
1046	NC_012855	CGAG	2	8	65938	65945	25 %	0 %	50 %	25 %	241589588
1047	NC_012855	AG	3	6	66036	66041	50 %	0 %	50 %	0 %	241589588
1048	NC_012855	TGG	3	9	66111	66119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589588
1049	NC_012855	CAT	2	6	66122	66127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589588
1050	NC_012855	ACAT	2	8	66275	66282	50 %	25 %	0 %	25 %	241589588
1051	NC_012855	CTT	2	6	66293	66298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589588
1052	NC_012855	GCGG	2	8	66364	66371	0 %	0 %	75 %	25 %	241589588
1053	NC_012855	GGA	2	6	66385	66390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589588
1054	NC_012855	GGC	2	6	66395	66400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589588
1055	NC_012855	CCG	2	6	66543	66548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589588
1056	NC_012855	CG	4	8	67190	67197	0 %	0 %	50 %	50 %	241589589
1057	NC_012855	CTC	2	6	67267	67272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589589
1058	NC_012855	GC	3	6	67433	67438	0 %	0 %	50 %	50 %	241589589
1059	NC_012855	TCCGCA	2	12	67495	67506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241589589
1060	NC_012855	GCA	3	9	67504	67512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589589
1061	NC_012855	TC	3	6	67631	67636	0 %	50 %	0 %	50 %	241589590
1062	NC_012855	TGG	2	6	67660	67665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589590
1063	NC_012855	GGT	2	6	67675	67680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589590
1064	NC_012855	TGC	2	6	67713	67718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589590
1065	NC_012855	GAA	2	6	67826	67831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589590
1066	NC_012855	CTG	2	6	67883	67888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589590
1067	NC_012855	CG	3	6	67968	67973	0 %	0 %	50 %	50 %	241589590
1068	NC_012855	GAT	2	6	68057	68062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589590
1069	NC_012855	CG	3	6	68308	68313	0 %	0 %	50 %	50 %	241589590
1070	NC_012855	CCA	2	6	68356	68361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589590
1071	NC_012855	CGA	2	6	68363	68368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589590
1072	NC_012855	TGA	2	6	68422	68427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589590
1073	NC_012855	AGT	2	6	68434	68439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589590
1074	NC_012855	GTGG	2	8	68456	68463	0 %	25 %	75 %	0 %	241589590
1075	NC_012855	GAA	3	9	68495	68503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589590
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1077	NC_012855	GT	3	6	68547	68552	0 %	50 %	50 %	0 %	241589590
1078	NC_012855	GGT	2	6	68625	68630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589590
1079	NC_012855	CGA	2	6	68662	68667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589590
1080	NC_012855	CGT	2	6	68710	68715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589590
1081	NC_012855	CGC	2	6	68756	68761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589590
1082	NC_012855	CCTT	2	8	68821	68828	0 %	50 %	0 %	50 %	241589591
1083	NC_012855	TCG	2	6	68992	68997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589591
1084	NC_012855	TGA	3	9	69002	69010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589591
1085	NC_012855	TCG	2	6	69014	69019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589591
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1089	NC_012855	GCA	2	6	69260	69265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589592
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1091	NC_012855	ACG	2	6	69420	69425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589592
1092	NC_012855	GCA	2	6	69445	69450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589592
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1096	NC_012855	TGG	2	6	69699	69704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589592
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1099	NC_012855	CAG	2	6	69803	69808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589592
1100	NC_012855	GCG	2	6	69831	69836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589592
1101	NC_012855	TGAT	2	8	69837	69844	25 %	50 %	25 %	0 %	241589592
1102	NC_012855	TCG	2	6	69926	69931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589592
1103	NC_012855	CGC	2	6	69951	69956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589592
1104	NC_012855	AGC	2	6	69982	69987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589592
1105	NC_012855	GAG	2	6	69990	69995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589592
1106	NC_012855	CCA	2	6	70079	70084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589593
1107	NC_012855	CGT	2	6	70137	70142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589593
1108	NC_012855	GCT	2	6	70189	70194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589593
1109	NC_012855	TGG	2	6	70265	70270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589593
1110	NC_012855	CA	3	6	70302	70307	50 %	0 %	0 %	50 %	241589593
1111	NC_012855	ACG	2	6	70492	70497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589593
1112	NC_012855	CTG	2	6	70558	70563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589593
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1114	NC_012855	CAG	2	6	70594	70599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589593
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1118	NC_012855	GGGC	2	8	70777	70784	0 %	0 %	75 %	25 %	241589594
1119	NC_012855	CGA	2	6	70856	70861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589594
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1121	NC_012855	CGT	2	6	70953	70958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589594
1122	NC_012855	GTGGA	2	10	71059	71068	20 %	20 %	60 %	0 %	241589594
1123	NC_012855	CTA	2	6	71075	71080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589594
1124	NC_012855	TGTT	2	8	71092	71099	0 %	75 %	25 %	0 %	241589594
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1126	NC_012855	GAC	2	6	71274	71279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589594
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1251	NC_012855	TGA	2	6	79445	79450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589599
1252	NC_012855	CGT	3	9	79503	79511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589599
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1254	NC_012855	GAT	2	6	79605	79610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589599
1255	NC_012855	CGTT	2	8	79617	79624	0 %	50 %	25 %	25 %	241589599
1256	NC_012855	GGA	2	6	79821	79826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589600
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1369	NC_012855	GC	3	6	86687	86692	0 %	0 %	50 %	50 %	241589605
1370	NC_012855	TTC	2	6	86703	86708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589605
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1375	NC_012855	CCG	2	6	86833	86838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589605
1376	NC_012855	ACG	2	6	86869	86874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589605
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1389	NC_012855	GGA	2	6	87401	87406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589605
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1499	NC_012855	CGG	2	6	93200	93205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589612
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