MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012855	CGG	2	6	31445	31450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589565
502	NC_012855	CAC	2	6	31472	31477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589565
503	NC_012855	GAC	2	6	31505	31510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589565
504	NC_012855	AC	3	6	31540	31545	50 %	0 %	0 %	50 %	241589565
505	NC_012855	CCG	2	6	31665	31670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589565
506	NC_012855	TTG	3	9	32351	32359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589566
507	NC_012855	GGT	2	6	32392	32397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589566
508	NC_012855	GCA	2	6	32457	32462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589566
509	NC_012855	TCG	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589566
510	NC_012855	TCA	2	6	32583	32588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589566
511	NC_012855	TTG	2	6	32612	32617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589566
512	NC_012855	GTA	2	6	32626	32631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589566
513	NC_012855	CCCATA	2	12	32729	32740	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	241589566
514	NC_012855	GGC	3	9	32749	32757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589566
515	NC_012855	AAC	3	9	32824	32832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589566
516	NC_012855	CCA	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589566
517	NC_012855	CAT	2	6	32982	32987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589566
518	NC_012855	CGC	2	6	32988	32993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589566
519	NC_012855	ATC	2	6	33004	33009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589566
520	NC_012855	GAT	2	6	33023	33028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589566
521	NC_012855	CCG	2	6	33129	33134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589566
522	NC_012855	AGCGT	2	10	33209	33218	20 %	20 %	40 %	20 %	241589566
523	NC_012855	CAT	2	6	33240	33245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589566
524	NC_012855	GAC	3	9	33247	33255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589566
525	NC_012855	TCA	2	6	33263	33268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589566
526	NC_012855	TCC	2	6	33391	33396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589566
527	NC_012855	TGC	2	6	33437	33442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589566
528	NC_012855	CTG	3	9	33512	33520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589566
529	NC_012855	TTGA	2	8	33530	33537	25 %	50 %	25 %	0 %	241589566
530	NC_012855	GCA	2	6	33554	33559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589566
531	NC_012855	TTTTCA	2	12	33791	33802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	241589567
532	NC_012855	TGCT	2	8	34199	34206	0 %	50 %	25 %	25 %	241589568
533	NC_012855	CG	3	6	34225	34230	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
534	NC_012855	CATG	2	8	34289	34296	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
535	NC_012855	ATC	2	6	34344	34349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589568
536	NC_012855	GCGT	2	8	34368	34375	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
537	NC_012855	GCC	2	6	34380	34385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589568
538	NC_012855	CGA	2	6	34402	34407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
539	NC_012855	GCA	2	6	34441	34446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
540	NC_012855	GCAT	2	8	34449	34456	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
541	NC_012855	GCC	2	6	34514	34519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589568
542	NC_012855	GGC	2	6	34541	34546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589568
543	NC_012855	CAG	2	6	34565	34570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
544	NC_012855	CTGCCA	2	12	34586	34597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241589568
545	NC_012855	CAC	2	6	34673	34678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589568
546	NC_012855	CAG	2	6	34757	34762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
547	NC_012855	GGT	2	6	34931	34936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589568
548	NC_012855	GCCGC	2	10	35013	35022	0 %	0 %	40 %	60 %	241589568
549	NC_012855	GGTC	2	8	35044	35051	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
550	NC_012855	ATC	2	6	35055	35060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589568
551	NC_012855	GCA	2	6	35071	35076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
552	NC_012855	CGGC	2	8	35079	35086	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
553	NC_012855	GAGC	2	8	35087	35094	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
554	NC_012855	GGA	2	6	35165	35170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589568
555	NC_012855	GCA	2	6	35179	35184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
556	NC_012855	CAC	2	6	35331	35336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589568
557	NC_012855	CCA	2	6	35356	35361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589568
558	NC_012855	CCA	2	6	35384	35389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589568
559	NC_012855	TCG	2	6	35422	35427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589568
560	NC_012855	GC	3	6	35449	35454	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
561	NC_012855	AAG	2	6	35465	35470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589568
562	NC_012855	GC	4	8	35476	35483	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
563	NC_012855	GCA	2	6	35512	35517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589568
564	NC_012855	GCGA	2	8	35520	35527	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
565	NC_012855	AC	3	6	35712	35717	50 %	0 %	0 %	50 %	241589569
566	NC_012855	CGGC	2	8	35824	35831	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
567	NC_012855	CGA	2	6	35843	35848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
568	NC_012855	GCGA	2	8	35880	35887	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
569	NC_012855	ACG	2	6	35974	35979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
570	NC_012855	TGA	2	6	36013	36018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589569
571	NC_012855	GTG	2	6	36024	36029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589569
572	NC_012855	TCG	2	6	36077	36082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
573	NC_012855	CGG	2	6	36083	36088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
574	NC_012855	AT	3	6	36170	36175	50 %	50 %	0 %	0 %	241589569
575	NC_012855	CGT	2	6	36203	36208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
576	NC_012855	GCT	2	6	36233	36238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
577	NC_012855	GTC	2	6	36477	36482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
578	NC_012855	GC	3	6	36483	36488	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
579	NC_012855	TTG	2	6	36505	36510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589569
580	NC_012855	CG	4	8	36602	36609	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
581	NC_012855	CG	3	6	36612	36617	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
582	NC_012855	CCA	2	6	36635	36640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589569
583	NC_012855	CCG	2	6	36694	36699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589569
584	NC_012855	CAA	2	6	36704	36709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589569
585	NC_012855	TCA	2	6	36721	36726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589569
586	NC_012855	G	6	6	36764	36769	0 %	0 %	100 %	0 %	241589569
587	NC_012855	GAAG	2	8	36791	36798	50 %	0 %	50 %	0 %	241589569
588	NC_012855	CGAA	2	8	36871	36878	50 %	0 %	25 %	25 %	241589569
589	NC_012855	GTC	2	6	36909	36914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
590	NC_012855	CGG	2	6	36926	36931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
591	NC_012855	ATTC	2	8	36987	36994	25 %	50 %	0 %	25 %	241589569
592	NC_012855	GTT	2	6	37016	37021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589569
593	NC_012855	GGA	2	6	37022	37027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589569
594	NC_012855	GCCA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
595	NC_012855	GTT	2	6	37115	37120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589569
596	NC_012855	CGGC	2	8	37167	37174	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
597	NC_012855	GCG	2	6	37196	37201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
598	NC_012855	CGA	2	6	37210	37215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
599	NC_012855	GCC	2	6	37222	37227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589569
600	NC_012855	TGA	2	6	37253	37258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589569
601	NC_012855	AGCGC	2	10	37260	37269	20 %	0 %	40 %	40 %	241589569
602	NC_012855	CGA	2	6	37277	37282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
603	NC_012855	GGC	2	6	37293	37298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
604	NC_012855	GTG	2	6	37302	37307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589569
605	NC_012855	CCT	2	6	37315	37320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589569
606	NC_012855	AGG	2	6	37357	37362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589569
607	NC_012855	CGAC	2	8	37400	37407	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
608	NC_012855	CG	3	6	37426	37431	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
609	NC_012855	GTCC	2	8	37443	37450	0 %	25 %	25 %	50 %	241589569
610	NC_012855	CGC	2	6	37473	37478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589569
611	NC_012855	CGCGGC	2	12	37509	37520	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
612	NC_012855	TGG	2	6	37590	37595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589569
613	NC_012855	CTG	2	6	37611	37616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589569
614	NC_012855	GAC	2	6	37652	37657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
615	NC_012855	CGG	2	6	37658	37663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
616	NC_012855	GGC	2	6	37701	37706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589569
617	NC_012855	CGA	2	6	37751	37756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589569
618	NC_012855	AGGC	2	8	37783	37790	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
619	NC_012855	GC	3	6	37904	37909	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
620	NC_012855	TCGGCA	2	12	38119	38130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241589570
621	NC_012855	CG	3	6	38184	38189	0 %	0 %	50 %	50 %	241589570
622	NC_012855	AGCGC	2	10	38259	38268	20 %	0 %	40 %	40 %	241589570
623	NC_012855	CG	3	6	38317	38322	0 %	0 %	50 %	50 %	241589570
624	NC_012855	GGA	2	6	38407	38412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589570
625	NC_012855	GCC	2	6	38415	38420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589570
626	NC_012855	ATC	2	6	38435	38440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589570
627	NC_012855	CAT	2	6	38575	38580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589570
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750	NC_012855	CCGGCG	2	12	45323	45334	0 %	0 %	50 %	50 %	241589575
751	NC_012855	CGC	2	6	45426	45431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589575
752	NC_012855	GAA	2	6	46460	46465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589576
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