MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012854	CTGG	2	8	529	536	0 %	25 %	50 %	25 %	241554071
2	NC_012854	GATC	2	8	3269	3276	25 %	25 %	25 %	25 %	241554073
3	NC_012854	GCGG	2	8	3407	3414	0 %	0 %	75 %	25 %	241554073
4	NC_012854	AGCG	2	8	3455	3462	25 %	0 %	50 %	25 %	241554073
5	NC_012854	AAGC	2	8	3853	3860	50 %	0 %	25 %	25 %	241554074
6	NC_012854	GAGG	2	8	4153	4160	25 %	0 %	75 %	0 %	241554074
7	NC_012854	GAAA	2	8	4767	4774	75 %	0 %	25 %	0 %	241554074
8	NC_012854	GCGG	2	8	4777	4784	0 %	0 %	75 %	25 %	241554074
9	NC_012854	ACGG	2	8	5868	5875	25 %	0 %	50 %	25 %	241554076
10	NC_012854	CCGT	2	8	6988	6995	0 %	25 %	25 %	50 %	241554077
11	NC_012854	TTTC	2	8	7552	7559	0 %	75 %	0 %	25 %	241554077
12	NC_012854	GCTC	2	8	8726	8733	0 %	25 %	25 %	50 %	241554079
13	NC_012854	TCAC	2	8	8983	8990	25 %	25 %	0 %	50 %	241554079
14	NC_012854	CCGA	2	8	9897	9904	25 %	0 %	25 %	50 %	241554080
15	NC_012854	TCTT	2	8	10800	10807	0 %	75 %	0 %	25 %	241554080
16	NC_012854	TGGC	2	8	11136	11143	0 %	25 %	50 %	25 %	241554080
17	NC_012854	GACC	2	8	11346	11353	25 %	0 %	25 %	50 %	241554080
18	NC_012854	GGAC	2	8	11573	11580	25 %	0 %	50 %	25 %	241554080
19	NC_012854	TGAG	2	8	11738	11745	25 %	25 %	50 %	0 %	241554080
20	NC_012854	GCCA	2	8	12256	12263	25 %	0 %	25 %	50 %	241554081
21	NC_012854	ATCC	2	8	12957	12964	25 %	25 %	0 %	50 %	241554081
22	NC_012854	GCTC	2	8	13133	13140	0 %	25 %	25 %	50 %	241554081
23	NC_012854	GGAC	2	8	13700	13707	25 %	0 %	50 %	25 %	241554082
24	NC_012854	CGCT	2	8	14155	14162	0 %	25 %	25 %	50 %	241554082
25	NC_012854	CGTG	2	8	14499	14506	0 %	25 %	50 %	25 %	241554082
26	NC_012854	GCAC	2	8	15954	15961	25 %	0 %	25 %	50 %	241554083
27	NC_012854	CGGC	2	8	16133	16140	0 %	0 %	50 %	50 %	241554083
28	NC_012854	ATCG	2	8	16340	16347	25 %	25 %	25 %	25 %	241554083
29	NC_012854	ACGC	2	8	16961	16968	25 %	0 %	25 %	50 %	241554084
30	NC_012854	CCAG	2	8	17086	17093	25 %	0 %	25 %	50 %	241554084
31	NC_012854	AAAG	2	8	18220	18227	75 %	0 %	25 %	0 %	241554085
32	NC_012854	CTGG	2	8	18524	18531	0 %	25 %	50 %	25 %	241554085
33	NC_012854	TTCT	2	8	18691	18698	0 %	75 %	0 %	25 %	241554085
34	NC_012854	CTTC	2	8	18990	18997	0 %	50 %	0 %	50 %	241554086
35	NC_012854	GGTC	2	8	20365	20372	0 %	25 %	50 %	25 %	241554087
36	NC_012854	CAAT	2	8	20551	20558	50 %	25 %	0 %	25 %	241554087
37	NC_012854	TTGA	2	8	20952	20959	25 %	50 %	25 %	0 %	241554088
38	NC_012854	GGAT	2	8	21416	21423	25 %	25 %	50 %	0 %	241554088
39	NC_012854	GAGC	2	8	21802	21809	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
40	NC_012854	TGAC	2	8	23208	23215	25 %	25 %	25 %	25 %	241554089
41	NC_012854	AGCC	2	8	23350	23357	25 %	0 %	25 %	50 %	241554089
42	NC_012854	GCCG	2	8	23384	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	241554089
43	NC_012854	GCCG	2	8	23395	23402	0 %	0 %	50 %	50 %	241554089
44	NC_012854	CAGG	2	8	23524	23531	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
45	NC_012854	CGGA	2	8	23553	23560	25 %	0 %	50 %	25 %	241554089
46	NC_012854	CGTT	2	8	23795	23802	0 %	50 %	25 %	25 %	241554089
47	NC_012854	TTGC	2	8	23805	23812	0 %	50 %	25 %	25 %	241554089
48	NC_012854	GCCG	2	8	24922	24929	0 %	0 %	50 %	50 %	241554090
49	NC_012854	AGCA	2	8	25142	25149	50 %	0 %	25 %	25 %	241554090
50	NC_012854	GCCC	2	8	25520	25527	0 %	0 %	25 %	75 %	241554090
51	NC_012854	AGCG	2	8	26161	26168	25 %	0 %	50 %	25 %	241554092
52	NC_012854	GACG	2	8	26592	26599	25 %	0 %	50 %	25 %	241554093
53	NC_012854	CAGC	2	8	26692	26699	25 %	0 %	25 %	50 %	241554093
54	NC_012854	CAGG	2	8	26758	26765	25 %	0 %	50 %	25 %	241554093
55	NC_012854	GACC	2	8	26932	26939	25 %	0 %	25 %	50 %	241554094
56	NC_012854	CCAT	2	8	27570	27577	25 %	25 %	0 %	50 %	241554094
57	NC_012854	GCCA	2	8	27602	27609	25 %	0 %	25 %	50 %	241554094
58	NC_012854	CCGG	3	12	27630	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	241554094
59	NC_012854	CGAT	2	8	27702	27709	25 %	25 %	25 %	25 %	241554094
60	NC_012854	TCGG	2	8	27823	27830	0 %	25 %	50 %	25 %	241554094
61	NC_012854	AGGC	2	8	28571	28578	25 %	0 %	50 %	25 %	241554096
62	NC_012854	CGGC	2	8	29408	29415	0 %	0 %	50 %	50 %	241554097
63	NC_012854	ATGC	2	8	29536	29543	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
64	NC_012854	ATCG	2	8	29617	29624	25 %	25 %	25 %	25 %	241554097
65	NC_012854	GTTC	2	8	30482	30489	0 %	50 %	25 %	25 %	241554097
66	NC_012854	AAGC	2	8	31020	31027	50 %	0 %	25 %	25 %	241554098
67	NC_012854	GCCC	2	8	31173	31180	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
68	NC_012854	GGCC	2	8	31234	31241	0 %	0 %	50 %	50 %	241554098
69	NC_012854	GATC	2	8	31263	31270	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
70	NC_012854	TGTC	2	8	31308	31315	0 %	50 %	25 %	25 %	241554098
71	NC_012854	CCGC	2	8	31497	31504	0 %	0 %	25 %	75 %	241554098
72	NC_012854	GATC	2	8	31677	31684	25 %	25 %	25 %	25 %	241554098
73	NC_012854	TGGA	2	8	32683	32690	25 %	25 %	50 %	0 %	241554099
74	NC_012854	CGGC	2	8	32754	32761	0 %	0 %	50 %	50 %	241554099
75	NC_012854	CGTG	2	8	36297	36304	0 %	25 %	50 %	25 %	241554101
76	NC_012854	CCGA	2	8	38174	38181	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
77	NC_012854	CCGA	2	8	38213	38220	25 %	0 %	25 %	50 %	241554103
78	NC_012854	GGGC	2	8	38334	38341	0 %	0 %	75 %	25 %	241554103
79	NC_012854	AAGC	2	8	39060	39067	50 %	0 %	25 %	25 %	241554104
80	NC_012854	GCGT	2	8	39422	39429	0 %	25 %	50 %	25 %	241554104
81	NC_012854	CGGT	2	8	39898	39905	0 %	25 %	50 %	25 %	241554105
82	NC_012854	GCTC	2	8	40072	40079	0 %	25 %	25 %	50 %	241554105
83	NC_012854	GCTA	2	8	40296	40303	25 %	25 %	25 %	25 %	241554105
84	NC_012854	CGGC	2	8	40327	40334	0 %	0 %	50 %	50 %	241554105
85	NC_012854	ATGC	2	8	40512	40519	25 %	25 %	25 %	25 %	241554105
86	NC_012854	GGCG	2	8	40728	40735	0 %	0 %	75 %	25 %	241554105
87	NC_012854	TCTG	2	8	40951	40958	0 %	50 %	25 %	25 %	241554106
88	NC_012854	CGAA	2	8	41571	41578	50 %	0 %	25 %	25 %	241554106
89	NC_012854	GGCG	2	8	41816	41823	0 %	0 %	75 %	25 %	241554107
90	NC_012854	CGGG	2	8	41964	41971	0 %	0 %	75 %	25 %	241554107
91	NC_012854	GCAT	2	8	42900	42907	25 %	25 %	25 %	25 %	241554108
92	NC_012854	AAGC	2	8	43003	43010	50 %	0 %	25 %	25 %	241554108
93	NC_012854	GCCT	2	8	43316	43323	0 %	25 %	25 %	50 %	241554109
94	NC_012854	CTGG	2	8	43939	43946	0 %	25 %	50 %	25 %	241554110
95	NC_012854	TCGC	2	8	44461	44468	0 %	25 %	25 %	50 %	241554111
96	NC_012854	GTCG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	50 %	25 %	241554111
97	NC_012854	GAAA	2	8	45893	45900	75 %	0 %	25 %	0 %	241554112
98	NC_012854	CGAG	2	8	46280	46287	25 %	0 %	50 %	25 %	241554113
99	NC_012854	AGCG	2	8	47190	47197	25 %	0 %	50 %	25 %	241554113
100	NC_012854	CAGC	2	8	47585	47592	25 %	0 %	25 %	50 %	241554113
101	NC_012854	CAAG	2	8	48646	48653	50 %	0 %	25 %	25 %	241554115
102	NC_012854	GCCC	2	8	50696	50703	0 %	0 %	25 %	75 %	241554120
103	NC_012854	AGGT	2	8	51468	51475	25 %	25 %	50 %	0 %	241554121
104	NC_012854	GACT	2	8	52036	52043	25 %	25 %	25 %	25 %	241554121
105	NC_012854	GGTC	2	8	53416	53423	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
106	NC_012854	GAGC	2	8	53545	53552	25 %	0 %	50 %	25 %	241554123
107	NC_012854	TCGG	2	8	53931	53938	0 %	25 %	50 %	25 %	241554123
108	NC_012854	ACCA	2	8	54413	54420	50 %	0 %	0 %	50 %	241554124
109	NC_012854	GGAT	2	8	54496	54503	25 %	25 %	50 %	0 %	241554124
110	NC_012854	TCGA	2	8	54635	54642	25 %	25 %	25 %	25 %	241554124
111	NC_012854	CGTC	2	8	54987	54994	0 %	25 %	25 %	50 %	241554124
112	NC_012854	AGAT	2	8	56047	56054	50 %	25 %	25 %	0 %	241554125
113	NC_012854	AGAA	2	8	56323	56330	75 %	0 %	25 %	0 %	241554125
114	NC_012854	TCCA	2	8	56403	56410	25 %	25 %	0 %	50 %	241554125
115	NC_012854	ATCG	2	8	57549	57556	25 %	25 %	25 %	25 %	241554126
116	NC_012854	TTCG	2	8	57842	57849	0 %	50 %	25 %	25 %	241554126
117	NC_012854	TCGA	2	8	58003	58010	25 %	25 %	25 %	25 %	241554126
118	NC_012854	GAAA	2	8	58378	58385	75 %	0 %	25 %	0 %	241554126
119	NC_012854	ACCG	2	8	58643	58650	25 %	0 %	25 %	50 %	241554127
120	NC_012854	GGTC	2	8	59138	59145	0 %	25 %	50 %	25 %	241554128
121	NC_012854	CCGC	2	8	59533	59540	0 %	0 %	25 %	75 %	241554129
122	NC_012854	GATG	2	8	59812	59819	25 %	25 %	50 %	0 %	241554129
123	NC_012854	GCGA	2	8	59969	59976	25 %	0 %	50 %	25 %	241554130
124	NC_012854	TGAC	2	8	60643	60650	25 %	25 %	25 %	25 %	241554130
125	NC_012854	AGCC	2	8	60763	60770	25 %	0 %	25 %	50 %	241554130
126	NC_012854	CGTC	2	8	61446	61453	0 %	25 %	25 %	50 %	241554130
127	NC_012854	AGCA	2	8	61845	61852	50 %	0 %	25 %	25 %	241554130
128	NC_012854	GCCG	2	8	62641	62648	0 %	0 %	50 %	50 %	241554131
129	NC_012854	CCGG	2	8	63398	63405	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
130	NC_012854	ATGA	2	8	64657	64664	50 %	25 %	25 %	0 %	241554134
131	NC_012854	GCCG	2	8	64732	64739	0 %	0 %	50 %	50 %	241554134
132	NC_012854	CCGT	2	8	64859	64866	0 %	25 %	25 %	50 %	241554134
133	NC_012854	CGTG	2	8	65040	65047	0 %	25 %	50 %	25 %	241554134
134	NC_012854	GCAT	2	8	65481	65488	25 %	25 %	25 %	25 %	241554134
135	NC_012854	GGCA	2	8	65493	65500	25 %	0 %	50 %	25 %	241554134
136	NC_012854	CCCG	2	8	66238	66245	0 %	0 %	25 %	75 %	241554135
137	NC_012854	GTCG	2	8	66262	66269	0 %	25 %	50 %	25 %	241554135
138	NC_012854	CGAT	2	8	66491	66498	25 %	25 %	25 %	25 %	241554135
139	NC_012854	GGCC	2	8	67149	67156	0 %	0 %	50 %	50 %	241554135
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