MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012854	TTG	2	6	171901	171906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554235
3502	NC_012854	GAT	2	6	171951	171956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554235
3503	NC_012854	GGC	2	6	171978	171983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554235
3504	NC_012854	GCC	2	6	172053	172058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554235
3505	NC_012854	GAT	3	9	172086	172094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554235
3506	NC_012854	ACGGAT	2	12	172136	172147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241554235
3507	NC_012854	CAT	2	6	172188	172193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554235
3508	NC_012854	TGTAGG	2	12	172333	172344	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241554236
3509	NC_012854	GC	3	6	172354	172359	0 %	0 %	50 %	50 %	241554236
3510	NC_012854	CGGCGA	2	12	172363	172374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241554236
3511	NC_012854	ATT	2	6	172403	172408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554236
3512	NC_012854	AGCCG	2	10	172420	172429	20 %	0 %	40 %	40 %	241554236
3513	NC_012854	TGA	2	6	172465	172470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554236
3514	NC_012854	GAT	2	6	172502	172507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554236
3515	NC_012854	TCCG	2	8	172556	172563	0 %	25 %	25 %	50 %	241554236
3516	NC_012854	CA	3	6	172567	172572	50 %	0 %	0 %	50 %	241554236
3517	NC_012854	ATC	2	6	172590	172595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554236
3518	NC_012854	TGGT	2	8	172617	172624	0 %	50 %	50 %	0 %	241554236
3519	NC_012854	CG	3	6	172702	172707	0 %	0 %	50 %	50 %	241554236
3520	NC_012854	GAT	2	6	172736	172741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554236
3521	NC_012854	TCG	2	6	172863	172868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554236
3522	NC_012854	AGC	2	6	172924	172929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554236
3523	NC_012854	GAC	2	6	173048	173053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554236
3524	NC_012854	CCA	2	6	173089	173094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554236
3525	NC_012854	TTG	2	6	173193	173198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554236
3526	NC_012854	GCGA	2	8	173265	173272	25 %	0 %	50 %	25 %	241554237
3527	NC_012854	GAG	2	6	173283	173288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554237
3528	NC_012854	GAT	2	6	173300	173305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554237
3529	NC_012854	GCG	2	6	173325	173330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554237
3530	NC_012854	A	6	6	173332	173337	100 %	0 %	0 %	0 %	241554237
3531	NC_012854	GTA	2	6	173339	173344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554237
3532	NC_012854	CCGA	2	8	173358	173365	25 %	0 %	25 %	50 %	241554237
3533	NC_012854	GC	3	6	173383	173388	0 %	0 %	50 %	50 %	241554237
3534	NC_012854	CCG	2	6	173394	173399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554237
3535	NC_012854	AGC	2	6	173419	173424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554237
3536	NC_012854	AGCG	2	8	173437	173444	25 %	0 %	50 %	25 %	241554237
3537	NC_012854	CGA	2	6	173480	173485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554237
3538	NC_012854	TAG	2	6	173511	173516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554237
3539	NC_012854	GA	3	6	173520	173525	50 %	0 %	50 %	0 %	241554237
3540	NC_012854	GCC	2	6	173531	173536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554237
3541	NC_012854	GCC	2	6	173541	173546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554237
3542	NC_012854	GGAT	2	8	173589	173596	25 %	25 %	50 %	0 %	241554237
3543	NC_012854	CGA	2	6	173629	173634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554237
3544	NC_012854	GAA	2	6	173705	173710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554237
3545	NC_012854	GCC	2	6	173730	173735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554237
3546	NC_012854	GCC	2	6	173759	173764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554237
3547	NC_012854	GAA	2	6	173819	173824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554237
3548	NC_012854	CAT	2	6	173846	173851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554237
3549	NC_012854	CCA	2	6	173929	173934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554237
3550	NC_012854	CAGC	2	8	173938	173945	25 %	0 %	25 %	50 %	241554237
3551	NC_012854	TCGCC	2	10	174055	174064	0 %	20 %	20 %	60 %	241554237
3552	NC_012854	GATGCC	2	12	174134	174145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554237
3553	NC_012854	AGA	2	6	174219	174224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554238
3554	NC_012854	GCA	2	6	174249	174254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554238
3555	NC_012854	GCC	2	6	174298	174303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3556	NC_012854	CGA	2	6	174375	174380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554238
3557	NC_012854	CGG	2	6	174402	174407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554238
3558	NC_012854	CCG	2	6	174435	174440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3559	NC_012854	GCGCG	2	10	174531	174540	0 %	0 %	60 %	40 %	241554238
3560	NC_012854	GCC	2	6	174547	174552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3561	NC_012854	GCGG	2	8	174559	174566	0 %	0 %	75 %	25 %	241554238
3562	NC_012854	TCG	2	6	174579	174584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554238
3563	NC_012854	CCG	2	6	174678	174683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3564	NC_012854	TTG	2	6	174704	174709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554238
3565	NC_012854	GCA	2	6	174726	174731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554238
3566	NC_012854	TCA	2	6	174750	174755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554238
3567	NC_012854	GGCGAT	2	12	174757	174768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241554238
3568	NC_012854	AGC	3	9	174776	174784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554238
3569	NC_012854	CGC	2	6	174804	174809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3570	NC_012854	GCC	2	6	174847	174852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3571	NC_012854	ACC	2	6	174854	174859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554238
3572	NC_012854	GCG	2	6	174932	174937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554238
3573	NC_012854	CGC	2	6	174942	174947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3574	NC_012854	GAT	2	6	174973	174978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554238
3575	NC_012854	CGGG	2	8	174992	174999	0 %	0 %	75 %	25 %	241554238
3576	NC_012854	CCG	2	6	175079	175084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554238
3577	NC_012854	TA	3	6	175086	175091	50 %	50 %	0 %	0 %	241554238
3578	NC_012854	ACA	2	6	175184	175189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554238
3579	NC_012854	GGCTC	2	10	175190	175199	0 %	20 %	40 %	40 %	241554238
3580	NC_012854	CG	3	6	175202	175207	0 %	0 %	50 %	50 %	241554238
3581	NC_012854	ACG	2	6	175393	175398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554239
3582	NC_012854	GCC	2	6	175443	175448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554239
3583	NC_012854	TCA	2	6	175451	175456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554239
3584	NC_012854	CGG	2	6	175502	175507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3585	NC_012854	GC	3	6	175514	175519	0 %	0 %	50 %	50 %	241554239
3586	NC_012854	GCC	2	6	175545	175550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554239
3587	NC_012854	CTT	2	6	175587	175592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554239
3588	NC_012854	CGGC	2	8	175699	175706	0 %	0 %	50 %	50 %	241554239
3589	NC_012854	CGA	2	6	175715	175720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554239
3590	NC_012854	TGA	2	6	175748	175753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554239
3591	NC_012854	TGG	2	6	175781	175786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554239
3592	NC_012854	CCT	2	6	175793	175798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554239
3593	NC_012854	GCGA	2	8	175804	175811	25 %	0 %	50 %	25 %	241554239
3594	NC_012854	GC	4	8	175858	175865	0 %	0 %	50 %	50 %	241554239
3595	NC_012854	GGC	2	6	175914	175919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3596	NC_012854	TCT	2	6	175931	175936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554239
3597	NC_012854	TCG	2	6	175943	175948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554239
3598	NC_012854	CGG	2	6	175955	175960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3599	NC_012854	CCT	2	6	176030	176035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554239
3600	NC_012854	GCC	2	6	176043	176048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554239
3601	NC_012854	GGC	2	6	176079	176084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3602	NC_012854	AGG	2	6	176117	176122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554239
3603	NC_012854	TCT	2	6	176171	176176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554239
3604	NC_012854	TCT	2	6	176203	176208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554239
3605	NC_012854	GTC	2	6	176280	176285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554239
3606	NC_012854	GCG	2	6	176332	176337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3607	NC_012854	GAG	2	6	176338	176343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554239
3608	NC_012854	GGA	2	6	176393	176398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554239
3609	NC_012854	CGG	2	6	176404	176409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554239
3610	NC_012854	ACC	2	6	176809	176814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554240
3611	NC_012854	GCGA	2	8	176829	176836	25 %	0 %	50 %	25 %	241554240
3612	NC_012854	TCGC	2	8	176893	176900	0 %	25 %	25 %	50 %	241554240
3613	NC_012854	GATT	2	8	176963	176970	25 %	50 %	25 %	0 %	241554240
3614	NC_012854	GC	3	6	176971	176976	0 %	0 %	50 %	50 %	241554240
3615	NC_012854	CGT	2	6	176994	176999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554240
3616	NC_012854	GCG	2	6	177102	177107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554240
3617	NC_012854	CG	3	6	177106	177111	0 %	0 %	50 %	50 %	241554240
3618	NC_012854	CTGGAG	2	12	177112	177123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241554240
3619	NC_012854	GAA	3	9	177160	177168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554240
3620	NC_012854	GC	3	6	177212	177217	0 %	0 %	50 %	50 %	241554240
3621	NC_012854	GC	3	6	177256	177261	0 %	0 %	50 %	50 %	241554240
3622	NC_012854	CGG	2	6	177274	177279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554240
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3740	NC_012854	CATCG	2	10	182393	182402	20 %	20 %	20 %	40 %	241554245
3741	NC_012854	AGC	2	6	182460	182465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554245
3742	NC_012854	CAG	2	6	182474	182479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554245
3743	NC_012854	CGA	2	6	182488	182493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554245
3744	NC_012854	GA	3	6	182555	182560	50 %	0 %	50 %	0 %	241554245
3745	NC_012854	GCC	2	6	182573	182578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554245
3746	NC_012854	AGC	3	9	182589	182597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554245
3747	NC_012854	GAAT	2	8	182671	182678	50 %	25 %	25 %	0 %	241554245
3748	NC_012854	AGC	2	6	182763	182768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554245
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3750	NC_012854	AAGCG	2	10	182918	182927	40 %	0 %	40 %	20 %	241554245
3751	NC_012854	CGG	2	6	182934	182939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554245
3752	NC_012854	TCA	2	6	182974	182979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554245
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3754	NC_012854	GCCG	2	8	183069	183076	0 %	0 %	50 %	50 %	241554246
3755	NC_012854	GCA	2	6	183081	183086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554246
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3757	NC_012854	TCC	2	6	183116	183121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554246
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3763	NC_012854	CAT	2	6	183336	183341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554246
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3765	NC_012854	CGA	2	6	183387	183392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554246
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3768	NC_012854	CGC	2	6	183512	183517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554246
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3771	NC_012854	CAT	2	6	183550	183555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554246
3772	NC_012854	TC	3	6	183657	183662	0 %	50 %	0 %	50 %	241554246
3773	NC_012854	GCAC	2	8	183665	183672	25 %	0 %	25 %	50 %	241554246
3774	NC_012854	TCG	2	6	183710	183715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554246
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3822	NC_012854	GCCG	2	8	185870	185877	0 %	0 %	50 %	50 %	241554248
3823	NC_012854	GCC	2	6	185889	185894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554248
3824	NC_012854	TGCCG	2	10	185895	185904	0 %	20 %	40 %	40 %	241554248
3825	NC_012854	CGG	3	9	185922	185930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554248
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3847	NC_012854	TCG	2	6	186958	186963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554248
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3850	NC_012854	GCGCCA	2	12	187155	187166	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241554249
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3853	NC_012854	GC	3	6	187293	187298	0 %	0 %	50 %	50 %	241554249
3854	NC_012854	GCA	3	9	187314	187322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554249
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3857	NC_012854	TGC	2	6	187382	187387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554249
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3859	NC_012854	TGC	2	6	187432	187437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554249
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3861	NC_012854	CGA	2	6	187465	187470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554249
3862	NC_012854	TCC	2	6	187493	187498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554249
3863	NC_012854	AGC	2	6	187532	187537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554249
3864	NC_012854	GCC	2	6	187607	187612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554249
3865	NC_012854	GA	3	6	187640	187645	50 %	0 %	50 %	0 %	241554249
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3869	NC_012854	GCA	2	6	187775	187780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554250
3870	NC_012854	CTG	2	6	187830	187835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554250
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3872	NC_012854	CCAT	2	8	187880	187887	25 %	25 %	0 %	50 %	241554250
3873	NC_012854	TGA	2	6	187934	187939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554250
3874	NC_012854	GCG	2	6	187958	187963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554250
3875	NC_012854	CGT	2	6	188019	188024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554250
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3880	NC_012854	AGC	2	6	188219	188224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554250
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3882	NC_012854	CGA	2	6	188246	188251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554250
3883	NC_012854	GCG	2	6	188253	188258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554250
3884	NC_012854	CTT	2	6	188295	188300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554250
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3888	NC_012854	CGGC	2	8	188437	188444	0 %	0 %	50 %	50 %	241554250
3889	NC_012854	GCTG	2	8	188453	188460	0 %	25 %	50 %	25 %	241554250
3890	NC_012854	TCG	2	6	188482	188487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554250
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3893	NC_012854	GCA	2	6	188583	188588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554251
3894	NC_012854	TCT	2	6	188634	188639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554251
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3904	NC_012854	CGT	2	6	189140	189145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554251
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3915	NC_012854	GCA	2	6	189940	189945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554253
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3934	NC_012854	CAGC	2	8	190991	190998	25 %	0 %	25 %	50 %	241554254
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3954	NC_012854	GCC	2	6	192320	192325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554255
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3966	NC_012854	CG	3	6	194212	194217	0 %	0 %	50 %	50 %	241554257
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3970	NC_012854	TC	3	6	194425	194430	0 %	50 %	0 %	50 %	241554257
3971	NC_012854	CG	3	6	194449	194454	0 %	0 %	50 %	50 %	241554257
3972	NC_012854	TTC	2	6	194487	194492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554257
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3975	NC_012854	CGC	2	6	194653	194658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554258
3976	NC_012854	TCC	3	9	194684	194692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554258
3977	NC_012854	TGG	2	6	194933	194938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554258
3978	NC_012854	CTTG	2	8	194961	194968	0 %	50 %	25 %	25 %	241554258
3979	NC_012854	GCCG	2	8	194971	194978	0 %	0 %	50 %	50 %	241554258
3980	NC_012854	GCT	2	6	195010	195015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3981	NC_012854	TCG	2	6	195020	195025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3982	NC_012854	GC	4	8	195035	195042	0 %	0 %	50 %	50 %	241554258
3983	NC_012854	GCG	2	6	195098	195103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554258
3984	NC_012854	CTT	2	6	195208	195213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554258
3985	NC_012854	TGA	2	6	195251	195256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554258
3986	NC_012854	GCT	2	6	195267	195272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3987	NC_012854	TGC	2	6	195357	195362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3988	NC_012854	CGA	2	6	195413	195418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3989	NC_012854	GCT	2	6	195486	195491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3990	NC_012854	TTC	2	6	195493	195498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554258
3991	NC_012854	TCG	2	6	195518	195523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554258
3992	NC_012854	CGG	2	6	195525	195530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554258
3993	NC_012854	CGC	2	6	195578	195583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554258
3994	NC_012854	GATGG	2	10	195659	195668	20 %	20 %	60 %	0 %	241554258
3995	NC_012854	TCA	2	6	195680	195685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554258
3996	NC_012854	GCC	2	6	195691	195696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554258
3997	NC_012854	GGC	2	6	195748	195753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554258
3998	NC_012854	CGC	2	6	195816	195821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554258
3999	NC_012854	TGCT	2	8	195839	195846	0 %	50 %	25 %	25 %	241554258
4000	NC_012854	ATTTGC	2	12	195978	195989	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241554258

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