MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012854	CGTCTT	2	12	125517	125528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241554194
2502	NC_012854	TGT	2	6	125567	125572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554194
2503	NC_012854	GCG	2	6	125602	125607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554194
2504	NC_012854	GCC	2	6	125649	125654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554194
2505	NC_012854	GGC	2	6	125661	125666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554194
2506	NC_012854	GGC	2	6	125673	125678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554194
2507	NC_012854	CGC	2	6	125687	125692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554194
2508	NC_012854	TGAT	2	8	125752	125759	25 %	50 %	25 %	0 %	241554194
2509	NC_012854	GGC	2	6	125808	125813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554194
2510	NC_012854	CG	3	6	125831	125836	0 %	0 %	50 %	50 %	241554194
2511	NC_012854	GCC	2	6	125859	125864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554194
2512	NC_012854	CGC	2	6	125903	125908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554194
2513	NC_012854	CCAC	2	8	125924	125931	25 %	0 %	0 %	75 %	241554194
2514	NC_012854	GATC	2	8	125984	125991	25 %	25 %	25 %	25 %	241554194
2515	NC_012854	CGC	4	12	126024	126035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554194
2516	NC_012854	GAC	2	6	126054	126059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554194
2517	NC_012854	TCC	2	6	126121	126126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554194
2518	NC_012854	GCCG	2	8	126132	126139	0 %	0 %	50 %	50 %	241554194
2519	NC_012854	CG	3	6	126138	126143	0 %	0 %	50 %	50 %	241554194
2520	NC_012854	ATG	2	6	126244	126249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554194
2521	NC_012854	TCC	2	6	126301	126306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554195
2522	NC_012854	ATC	2	6	126352	126357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554195
2523	NC_012854	CAT	2	6	126363	126368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554195
2524	NC_012854	CGG	2	6	126403	126408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554195
2525	NC_012854	CAG	3	9	126481	126489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554195
2526	NC_012854	CCG	2	6	126531	126536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554195
2527	NC_012854	TTC	2	6	126563	126568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554195
2528	NC_012854	GTC	3	9	126655	126663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554195
2529	NC_012854	TCT	2	6	126687	126692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554195
2530	NC_012854	GCG	2	6	126749	126754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554195
2531	NC_012854	GAC	3	9	126799	126807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554195
2532	NC_012854	GCC	2	6	126872	126877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554196
2533	NC_012854	TGA	2	6	126901	126906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554196
2534	NC_012854	CGG	2	6	126934	126939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554196
2535	NC_012854	TCG	2	6	126951	126956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554196
2536	NC_012854	CCGG	2	8	126972	126979	0 %	0 %	50 %	50 %	241554196
2537	NC_012854	GCG	2	6	127036	127041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554196
2538	NC_012854	GC	3	6	127163	127168	0 %	0 %	50 %	50 %	241554196
2539	NC_012854	TGA	2	6	127195	127200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554196
2540	NC_012854	TGG	2	6	127270	127275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554196
2541	NC_012854	CAG	3	9	127277	127285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554196
2542	NC_012854	CCG	2	6	127297	127302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554196
2543	NC_012854	GCG	2	6	127315	127320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554196
2544	NC_012854	TTG	2	6	127341	127346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554196
2545	NC_012854	CGC	2	6	127430	127435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554196
2546	NC_012854	CG	3	6	127472	127477	0 %	0 %	50 %	50 %	241554196
2547	NC_012854	TGA	3	9	127504	127512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554196
2548	NC_012854	TTC	2	6	127611	127616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554196
2549	NC_012854	TGA	2	6	127774	127779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554197
2550	NC_012854	TGG	2	6	127804	127809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554197
2551	NC_012854	CATC	2	8	127829	127836	25 %	25 %	0 %	50 %	241554197
2552	NC_012854	CTG	2	6	128085	128090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554197
2553	NC_012854	CG	3	6	128173	128178	0 %	0 %	50 %	50 %	241554197
2554	NC_012854	AAG	2	6	128187	128192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554197
2555	NC_012854	AGG	2	6	128235	128240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554197
2556	NC_012854	CGCC	2	8	128273	128280	0 %	0 %	25 %	75 %	241554197
2557	NC_012854	CGG	2	6	128366	128371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554197
2558	NC_012854	ATC	2	6	128388	128393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554197
2559	NC_012854	CG	3	6	128446	128451	0 %	0 %	50 %	50 %	241554197
2560	NC_012854	GAAC	2	8	128531	128538	50 %	0 %	25 %	25 %	241554197
2561	NC_012854	CGT	2	6	128573	128578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554197
2562	NC_012854	CGT	2	6	128687	128692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554197
2563	NC_012854	TCAT	2	8	128720	128727	25 %	50 %	0 %	25 %	241554198
2564	NC_012854	GCC	2	6	128728	128733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554198
2565	NC_012854	CGG	2	6	128805	128810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
2566	NC_012854	ATT	2	6	128831	128836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554198
2567	NC_012854	CGG	2	6	128844	128849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
2568	NC_012854	GAT	2	6	128877	128882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554198
2569	NC_012854	GCCG	2	8	128972	128979	0 %	0 %	50 %	50 %	241554198
2570	NC_012854	GCA	2	6	129009	129014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2571	NC_012854	ATGCCG	2	12	129052	129063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2572	NC_012854	GGC	2	6	129073	129078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
2573	NC_012854	TGG	2	6	129092	129097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554198
2574	NC_012854	GCC	2	6	129148	129153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554198
2575	NC_012854	GCT	2	6	129204	129209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2576	NC_012854	TCG	2	6	129260	129265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2577	NC_012854	GC	3	6	129268	129273	0 %	0 %	50 %	50 %	241554198
2578	NC_012854	TCG	2	6	129293	129298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2579	NC_012854	CGAC	2	8	129299	129306	25 %	0 %	25 %	50 %	241554198
2580	NC_012854	GC	3	6	129331	129336	0 %	0 %	50 %	50 %	241554198
2581	NC_012854	GCG	2	6	129341	129346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
2582	NC_012854	CCGA	2	8	129347	129354	25 %	0 %	25 %	50 %	241554198
2583	NC_012854	GCGG	2	8	129447	129454	0 %	0 %	75 %	25 %	241554198
2584	NC_012854	GGC	2	6	129511	129516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554198
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2586	NC_012854	GCT	2	6	129642	129647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2587	NC_012854	CGC	2	6	129678	129683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554198
2588	NC_012854	GCA	2	6	129704	129709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554198
2589	NC_012854	TCGCC	2	10	129895	129904	0 %	20 %	20 %	60 %	241554199
2590	NC_012854	CAG	2	6	129920	129925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554199
2591	NC_012854	GCGG	2	8	129926	129933	0 %	0 %	75 %	25 %	241554199
2592	NC_012854	TGG	2	6	129970	129975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554199
2593	NC_012854	ATG	2	6	130071	130076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554199
2594	NC_012854	CAG	2	6	130136	130141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554199
2595	NC_012854	GCC	2	6	130157	130162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554199
2596	NC_012854	GGC	2	6	130179	130184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554199
2597	NC_012854	TTC	2	6	130223	130228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554199
2598	NC_012854	CGC	2	6	130251	130256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554199
2599	NC_012854	CG	3	6	130264	130269	0 %	0 %	50 %	50 %	241554199
2600	NC_012854	CG	3	6	130273	130278	0 %	0 %	50 %	50 %	241554199
2601	NC_012854	CGT	2	6	130280	130285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554199
2602	NC_012854	TGAT	2	8	130377	130384	25 %	50 %	25 %	0 %	241554199
2603	NC_012854	CG	5	10	130446	130455	0 %	0 %	50 %	50 %	241554199
2604	NC_012854	GAT	2	6	130478	130483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554199
2605	NC_012854	CCGG	2	8	130489	130496	0 %	0 %	50 %	50 %	241554199
2606	NC_012854	GCA	2	6	130501	130506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554199
2607	NC_012854	TTC	2	6	130520	130525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554199
2608	NC_012854	CGA	2	6	130535	130540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554199
2609	NC_012854	GAG	3	9	130556	130564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554199
2610	NC_012854	TTG	2	6	130626	130631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554199
2611	NC_012854	ATG	2	6	130728	130733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554199
2612	NC_012854	GCT	2	6	131173	131178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554200
2613	NC_012854	TCG	2	6	131179	131184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554200
2614	NC_012854	CGG	2	6	131213	131218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554200
2615	NC_012854	GCTG	2	8	131221	131228	0 %	25 %	50 %	25 %	241554200
2616	NC_012854	GCC	2	6	131247	131252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554200
2617	NC_012854	CAA	2	6	131282	131287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554200
2618	NC_012854	ATG	2	6	131292	131297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554200
2619	NC_012854	ACG	3	9	131302	131310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554200
2620	NC_012854	CAA	2	6	131345	131350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554200
2621	NC_012854	ATG	2	6	131491	131496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554200
2622	NC_012854	TCC	2	6	131548	131553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554200
2623	NC_012854	ACC	2	6	131628	131633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554200
2624	NC_012854	CGA	2	6	131684	131689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554200
2625	NC_012854	CGG	2	6	131732	131737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554200
2626	NC_012854	CGG	2	6	131954	131959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554200
2627	NC_012854	TCA	2	6	131980	131985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554200
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2630	NC_012854	CGT	2	6	132330	132335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554201
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2632	NC_012854	CGGC	2	8	132435	132442	0 %	0 %	50 %	50 %	241554201
2633	NC_012854	GTC	2	6	132469	132474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554201
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2645	NC_012854	CGG	2	6	133430	133435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554201
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2652	NC_012854	CCT	2	6	133770	133775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554201
2653	NC_012854	CCGG	2	8	133829	133836	0 %	0 %	50 %	50 %	241554201
2654	NC_012854	GCG	2	6	133842	133847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554201
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2689	NC_012854	GTC	2	6	135491	135496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554203
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2692	NC_012854	GGCA	2	8	135622	135629	25 %	0 %	50 %	25 %	241554203
2693	NC_012854	GCAG	2	8	135649	135656	25 %	0 %	50 %	25 %	241554203
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2726	NC_012854	GCCA	2	8	137268	137275	25 %	0 %	25 %	50 %	241554204
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2728	NC_012854	GAA	2	6	137285	137290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554204
2729	NC_012854	TTCC	2	8	137321	137328	0 %	50 %	0 %	50 %	241554204
2730	NC_012854	CGA	2	6	137338	137343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554204
2731	NC_012854	CGGG	2	8	137353	137360	0 %	0 %	75 %	25 %	241554204
2732	NC_012854	GCC	2	6	137385	137390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554204
2733	NC_012854	GA	3	6	137406	137411	50 %	0 %	50 %	0 %	241554204
2734	NC_012854	GTC	2	6	137435	137440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554204
2735	NC_012854	CGAT	2	8	137464	137471	25 %	25 %	25 %	25 %	241554204
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2741	NC_012854	TCC	2	6	137841	137846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554204
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2861	NC_012854	GAT	2	6	142356	142361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554208
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2864	NC_012854	GTC	2	6	142398	142403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554208
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2981	NC_012854	TCG	2	6	147823	147828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554212
2982	NC_012854	GGCC	2	8	147857	147864	0 %	0 %	50 %	50 %	241554212
2983	NC_012854	TCG	2	6	147871	147876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554212
2984	NC_012854	GCCG	2	8	147881	147888	0 %	0 %	50 %	50 %	241554212
2985	NC_012854	TCG	2	6	147907	147912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554212
2986	NC_012854	CGA	2	6	147917	147922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554212
2987	NC_012854	CGC	2	6	147995	148000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554212
2988	NC_012854	TCG	2	6	148069	148074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554212
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2991	NC_012854	CGC	2	6	148218	148223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554212
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2994	NC_012854	CGA	2	6	148256	148261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554212
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