MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012854	ACCG	2	8	82217	82224	25 %	0 %	25 %	50 %	241554152
1502	NC_012854	CAA	2	6	82273	82278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554152
1503	NC_012854	GAA	2	6	82297	82302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554152
1504	NC_012854	CGA	2	6	82315	82320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554152
1505	NC_012854	TCG	2	6	82338	82343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554152
1506	NC_012854	TGG	2	6	82395	82400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554152
1507	NC_012854	CG	3	6	82401	82406	0 %	0 %	50 %	50 %	241554152
1508	NC_012854	TCA	2	6	82419	82424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554152
1509	NC_012854	TCG	2	6	82430	82435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554152
1510	NC_012854	CGG	2	6	82456	82461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554152
1511	NC_012854	CCA	2	6	82479	82484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554152
1512	NC_012854	CCGG	2	8	82563	82570	0 %	0 %	50 %	50 %	241554152
1513	NC_012854	AGC	2	6	82690	82695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554152
1514	NC_012854	GGC	2	6	82751	82756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554152
1515	NC_012854	GCG	2	6	82781	82786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554152
1516	NC_012854	TGC	3	9	82868	82876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554153
1517	NC_012854	TCA	2	6	82895	82900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554153
1518	NC_012854	CGATGG	2	12	82919	82930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241554153
1519	NC_012854	CTG	3	9	82942	82950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554153
1520	NC_012854	TTTCG	2	10	82969	82978	0 %	60 %	20 %	20 %	241554153
1521	NC_012854	GCT	2	6	82993	82998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554153
1522	NC_012854	ACC	2	6	83009	83014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554153
1523	NC_012854	TGGC	2	8	83092	83099	0 %	25 %	50 %	25 %	241554153
1524	NC_012854	TCGGGC	2	12	83132	83143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241554153
1525	NC_012854	GGC	2	6	83151	83156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554153
1526	NC_012854	TTCG	2	8	83174	83181	0 %	50 %	25 %	25 %	241554153
1527	NC_012854	GCAG	2	8	83211	83218	25 %	0 %	50 %	25 %	241554153
1528	NC_012854	CG	3	6	83221	83226	0 %	0 %	50 %	50 %	241554153
1529	NC_012854	TCA	2	6	83261	83266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554153
1530	NC_012854	GCC	2	6	83292	83297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554153
1531	NC_012854	TCA	2	6	83300	83305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554153
1532	NC_012854	CAG	2	6	83331	83336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554153
1533	NC_012854	CGT	2	6	83343	83348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554153
1534	NC_012854	CTT	2	6	83445	83450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554153
1535	NC_012854	CTCG	2	8	83451	83458	0 %	25 %	25 %	50 %	241554153
1536	NC_012854	ACT	2	6	83551	83556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554154
1537	NC_012854	GCT	4	12	83558	83569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1538	NC_012854	CGC	2	6	83692	83697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554154
1539	NC_012854	TGC	2	6	83698	83703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1540	NC_012854	GCT	2	6	83786	83791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1541	NC_012854	GAC	2	6	83828	83833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1542	NC_012854	CGTG	2	8	83870	83877	0 %	25 %	50 %	25 %	241554154
1543	NC_012854	TCA	2	6	83956	83961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554154
1544	NC_012854	ACA	2	6	83980	83985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554154
1545	NC_012854	CAT	2	6	83996	84001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554154
1546	NC_012854	ACG	2	6	84030	84035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1547	NC_012854	CAA	2	6	84086	84091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554154
1548	NC_012854	CTG	2	6	84152	84157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1549	NC_012854	CGG	2	6	84201	84206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554154
1550	NC_012854	GCC	3	9	84231	84239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554154
1551	NC_012854	AGC	2	6	84268	84273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554154
1552	NC_012854	CG	3	6	84381	84386	0 %	0 %	50 %	50 %	241554155
1553	NC_012854	GAG	2	6	84458	84463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554155
1554	NC_012854	GCC	2	6	84506	84511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554155
1555	NC_012854	TGCGC	2	10	84532	84541	0 %	20 %	40 %	40 %	241554155
1556	NC_012854	GGT	2	6	84592	84597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554155
1557	NC_012854	CAG	3	9	84734	84742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554155
1558	NC_012854	CCG	2	6	84776	84781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554155
1559	NC_012854	CGA	2	6	84793	84798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554155
1560	NC_012854	GC	3	6	84807	84812	0 %	0 %	50 %	50 %	241554155
1561	NC_012854	CG	4	8	84907	84914	0 %	0 %	50 %	50 %	241554155
1562	NC_012854	CTT	2	6	84979	84984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554155
1563	NC_012854	CCG	2	6	85096	85101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554156
1564	NC_012854	GGC	2	6	85115	85120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554156
1565	NC_012854	ACA	2	6	85150	85155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554156
1566	NC_012854	CTGCG	2	10	85173	85182	0 %	20 %	40 %	40 %	241554156
1567	NC_012854	TCC	2	6	85199	85204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554156
1568	NC_012854	GCG	2	6	85261	85266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554156
1569	NC_012854	GC	3	6	85320	85325	0 %	0 %	50 %	50 %	241554156
1570	NC_012854	TAT	2	6	85419	85424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241554156
1571	NC_012854	CGG	2	6	85450	85455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554156
1572	NC_012854	AAG	3	9	85467	85475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554156
1573	NC_012854	CAA	2	6	85541	85546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554156
1574	NC_012854	CAG	2	6	85596	85601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554156
1575	NC_012854	GC	3	6	85608	85613	0 %	0 %	50 %	50 %	241554156
1576	NC_012854	TGG	2	6	85618	85623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554156
1577	NC_012854	GAC	3	9	85634	85642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554156
1578	NC_012854	GCAAGG	2	12	85666	85677	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241554156
1579	NC_012854	GAT	2	6	85685	85690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554156
1580	NC_012854	GAG	2	6	85692	85697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554156
1581	NC_012854	ATCGGC	2	12	85716	85727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241554156
1582	NC_012854	CAA	2	6	85802	85807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554156
1583	NC_012854	CGA	2	6	86072	86077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554157
1584	NC_012854	TCC	2	6	86110	86115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554157
1585	NC_012854	CGGCC	2	10	86151	86160	0 %	0 %	40 %	60 %	241554157
1586	NC_012854	GC	3	6	86174	86179	0 %	0 %	50 %	50 %	241554157
1587	NC_012854	ACA	2	6	86186	86191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554157
1588	NC_012854	TGC	2	6	86195	86200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554157
1589	NC_012854	ATC	2	6	86233	86238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554157
1590	NC_012854	CGG	2	6	86246	86251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554157
1591	NC_012854	TGCC	2	8	86295	86302	0 %	25 %	25 %	50 %	241554157
1592	NC_012854	CGG	2	6	86316	86321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554157
1593	NC_012854	TCT	2	6	86381	86386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554157
1594	NC_012854	CGG	2	6	86429	86434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554157
1595	NC_012854	ATC	2	6	86446	86451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554157
1596	NC_012854	CGG	2	6	86454	86459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554157
1597	NC_012854	ATC	2	6	86464	86469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554157
1598	NC_012854	CAT	2	6	86481	86486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554157
1599	NC_012854	TGG	2	6	86507	86512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554157
1600	NC_012854	TCG	3	9	86657	86665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554157
1601	NC_012854	GCA	2	6	86895	86900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1602	NC_012854	CGC	2	6	86903	86908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554158
1603	NC_012854	CCT	2	6	86953	86958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554158
1604	NC_012854	GCCG	2	8	86964	86971	0 %	0 %	50 %	50 %	241554158
1605	NC_012854	GCA	2	6	86993	86998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1606	NC_012854	GGACG	2	10	87017	87026	20 %	0 %	60 %	20 %	241554158
1607	NC_012854	CCGG	2	8	87035	87042	0 %	0 %	50 %	50 %	241554158
1608	NC_012854	GCG	2	6	87103	87108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554158
1609	NC_012854	CTG	2	6	87161	87166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1610	NC_012854	CTGC	2	8	87173	87180	0 %	25 %	25 %	50 %	241554158
1611	NC_012854	TGC	2	6	87199	87204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1612	NC_012854	CGG	2	6	87271	87276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554158
1613	NC_012854	TGG	2	6	87334	87339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554158
1614	NC_012854	ATC	2	6	87379	87384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554158
1615	NC_012854	CTG	2	6	87426	87431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1616	NC_012854	GC	4	8	87459	87466	0 %	0 %	50 %	50 %	241554158
1617	NC_012854	GC	4	8	87493	87500	0 %	0 %	50 %	50 %	241554158
1618	NC_012854	CG	3	6	87509	87514	0 %	0 %	50 %	50 %	241554158
1619	NC_012854	GCC	2	6	87573	87578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554158
1620	NC_012854	CGA	2	6	87656	87661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554158
1621	NC_012854	GGC	2	6	87668	87673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554158
1622	NC_012854	GGCT	2	8	87717	87724	0 %	25 %	50 %	25 %	241554158
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1624	NC_012854	CTG	2	6	87776	87781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554158
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1873	NC_012854	GCC	2	6	98113	98118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
1874	NC_012854	TGT	2	6	98130	98135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554168
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1876	NC_012854	TCT	2	6	98195	98200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554168
1877	NC_012854	CGC	2	6	98279	98284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
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1885	NC_012854	CGG	2	6	98577	98582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554168
1886	NC_012854	CCG	2	6	98623	98628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
1887	NC_012854	GCC	2	6	98631	98636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
1888	NC_012854	GCC	2	6	98654	98659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554168
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1965	NC_012854	GCT	2	6	101645	101650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554171
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1972	NC_012854	CTGG	2	8	102009	102016	0 %	25 %	50 %	25 %	241554172
1973	NC_012854	CAGAG	2	10	102037	102046	40 %	0 %	40 %	20 %	241554172
1974	NC_012854	ACG	2	6	102061	102066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
1975	NC_012854	GCCT	2	8	102074	102081	0 %	25 %	25 %	50 %	241554172
1976	NC_012854	ACC	2	6	102091	102096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554172
1977	NC_012854	GC	3	6	102202	102207	0 %	0 %	50 %	50 %	241554172
1978	NC_012854	CGG	2	6	102256	102261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554172
1979	NC_012854	TCT	2	6	102266	102271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554172
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1981	NC_012854	CCA	2	6	102317	102322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554172
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1984	NC_012854	CAT	2	6	102417	102422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554172
1985	NC_012854	CGC	2	6	102423	102428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554172
1986	NC_012854	AGC	2	6	102436	102441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
1987	NC_012854	GACC	2	8	102476	102483	25 %	0 %	25 %	50 %	241554172
1988	NC_012854	CCG	2	6	102499	102504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554172
1989	NC_012854	GAG	2	6	102510	102515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554172
1990	NC_012854	CGA	2	6	102543	102548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
1991	NC_012854	GAT	2	6	102564	102569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554172
1992	NC_012854	CAG	2	6	102579	102584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
1993	NC_012854	AGC	2	6	102607	102612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
1994	NC_012854	GTT	2	6	102615	102620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554172
1995	NC_012854	GAT	2	6	102633	102638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554172
1996	NC_012854	GCC	2	6	102675	102680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554172
1997	NC_012854	CCG	2	6	102697	102702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554172
1998	NC_012854	CCA	2	6	102711	102716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554172
1999	NC_012854	AGC	2	6	102763	102768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554172
2000	NC_012854	GTC	2	6	102769	102774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554172

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