MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012854	CCT	2	6	59238	59243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554129
1002	NC_012854	TCT	2	6	59254	59259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554129
1003	NC_012854	CAC	2	6	59291	59296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554129
1004	NC_012854	CAC	2	6	59336	59341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554129
1005	NC_012854	GCC	2	6	59345	59350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554129
1006	NC_012854	T	6	6	59425	59430	0 %	100 %	0 %	0 %	241554129
1007	NC_012854	CGT	2	6	59495	59500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554129
1008	NC_012854	CCGC	2	8	59533	59540	0 %	0 %	25 %	75 %	241554129
1009	NC_012854	GAA	2	6	59570	59575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554129
1010	NC_012854	GCT	2	6	59597	59602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554129
1011	NC_012854	GCC	3	9	59606	59614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554129
1012	NC_012854	GCC	2	6	59621	59626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554129
1013	NC_012854	TA	3	6	59629	59634	50 %	50 %	0 %	0 %	241554129
1014	NC_012854	TGC	2	6	59635	59640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554129
1015	NC_012854	CTG	2	6	59650	59655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554129
1016	NC_012854	GGT	2	6	59699	59704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554129
1017	NC_012854	GCC	2	6	59714	59719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554129
1018	NC_012854	GATG	2	8	59812	59819	25 %	25 %	50 %	0 %	241554129
1019	NC_012854	GCGA	2	8	59969	59976	25 %	0 %	50 %	25 %	241554130
1020	NC_012854	CG	3	6	59985	59990	0 %	0 %	50 %	50 %	241554130
1021	NC_012854	AAG	2	6	60027	60032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554130
1022	NC_012854	T	8	8	60046	60053	0 %	100 %	0 %	0 %	241554130
1023	NC_012854	GCC	2	6	60059	60064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554130
1024	NC_012854	GC	3	6	60099	60104	0 %	0 %	50 %	50 %	241554130
1025	NC_012854	GTTTG	2	10	60109	60118	0 %	60 %	40 %	0 %	241554130
1026	NC_012854	CGA	2	6	60220	60225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1027	NC_012854	CGG	2	6	60241	60246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554130
1028	NC_012854	GCG	2	6	60286	60291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554130
1029	NC_012854	ATC	2	6	60323	60328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554130
1030	NC_012854	AAC	2	6	60363	60368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554130
1031	NC_012854	GTT	2	6	60383	60388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554130
1032	NC_012854	GAT	2	6	60425	60430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554130
1033	NC_012854	GTC	2	6	60449	60454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1034	NC_012854	AGC	2	6	60537	60542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1035	NC_012854	TGAC	2	8	60643	60650	25 %	25 %	25 %	25 %	241554130
1036	NC_012854	TGT	2	6	60691	60696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554130
1037	NC_012854	GC	3	6	60713	60718	0 %	0 %	50 %	50 %	241554130
1038	NC_012854	GCC	2	6	60722	60727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554130
1039	NC_012854	ACG	2	6	60738	60743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1040	NC_012854	AGCC	2	8	60763	60770	25 %	0 %	25 %	50 %	241554130
1041	NC_012854	CAA	2	6	60779	60784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554130
1042	NC_012854	CCG	2	6	60862	60867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554130
1043	NC_012854	AGC	2	6	60876	60881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1044	NC_012854	TCA	2	6	60930	60935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554130
1045	NC_012854	AGC	2	6	60954	60959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1046	NC_012854	GAA	2	6	60972	60977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554130
1047	NC_012854	AT	3	6	61056	61061	50 %	50 %	0 %	0 %	241554130
1048	NC_012854	AGCGC	2	10	61114	61123	20 %	0 %	40 %	40 %	241554130
1049	NC_012854	ACATCG	2	12	61131	61142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241554130
1050	NC_012854	TC	3	6	61297	61302	0 %	50 %	0 %	50 %	241554130
1051	NC_012854	CAA	2	6	61394	61399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554130
1052	NC_012854	GTT	2	6	61418	61423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554130
1053	NC_012854	CGTC	2	8	61446	61453	0 %	25 %	25 %	50 %	241554130
1054	NC_012854	CGG	2	6	61480	61485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554130
1055	NC_012854	GCG	2	6	61521	61526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554130
1056	NC_012854	CGA	2	6	61537	61542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1057	NC_012854	GCC	2	6	61657	61662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554130
1058	NC_012854	GAT	2	6	61697	61702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554130
1059	NC_012854	CCG	2	6	61713	61718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554130
1060	NC_012854	CGA	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554130
1061	NC_012854	CCA	2	6	61763	61768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554130
1062	NC_012854	AGCA	2	8	61845	61852	50 %	0 %	25 %	25 %	241554130
1063	NC_012854	TGT	2	6	62040	62045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554131
1064	NC_012854	CAC	2	6	62167	62172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1065	NC_012854	CCA	2	6	62173	62178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1066	NC_012854	TCC	2	6	62186	62191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1067	NC_012854	GT	4	8	62192	62199	0 %	50 %	50 %	0 %	241554131
1068	NC_012854	TCC	2	6	62234	62239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1069	NC_012854	CTC	2	6	62326	62331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1070	NC_012854	GAA	2	6	62410	62415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554131
1071	NC_012854	CTC	2	6	62416	62421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1072	NC_012854	TTC	2	6	62425	62430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554131
1073	NC_012854	CG	3	6	62595	62600	0 %	0 %	50 %	50 %	241554131
1074	NC_012854	GCCG	2	8	62641	62648	0 %	0 %	50 %	50 %	241554131
1075	NC_012854	ACC	2	6	62672	62677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554131
1076	NC_012854	CTT	2	6	62683	62688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554131
1077	NC_012854	TGC	2	6	62723	62728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554131
1078	NC_012854	TCTGC	2	10	62769	62778	0 %	40 %	20 %	40 %	241554131
1079	NC_012854	TCC	2	6	62822	62827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554131
1080	NC_012854	CG	3	6	63044	63049	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1081	NC_012854	TCA	2	6	63060	63065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554132
1082	NC_012854	CAT	2	6	63090	63095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554132
1083	NC_012854	GAA	2	6	63172	63177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554132
1084	NC_012854	GTC	2	6	63236	63241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554132
1085	NC_012854	GAG	2	6	63277	63282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554132
1086	NC_012854	CT	3	6	63331	63336	0 %	50 %	0 %	50 %	241554132
1087	NC_012854	TCC	2	6	63368	63373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554132
1088	NC_012854	CCGG	2	8	63398	63405	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1089	NC_012854	GCA	2	6	63420	63425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554132
1090	NC_012854	GCC	2	6	63446	63451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554132
1091	NC_012854	GAA	2	6	63469	63474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554132
1092	NC_012854	GCGTC	2	10	63480	63489	0 %	20 %	40 %	40 %	241554132
1093	NC_012854	GAC	2	6	63499	63504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554132
1094	NC_012854	TTTCA	2	10	63583	63592	20 %	60 %	0 %	20 %	241554132
1095	NC_012854	TCG	2	6	63596	63601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554132
1096	NC_012854	CGG	2	6	63633	63638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554132
1097	NC_012854	GCA	2	6	63693	63698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554132
1098	NC_012854	GGC	2	6	63705	63710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554132
1099	NC_012854	GA	3	6	63773	63778	50 %	0 %	50 %	0 %	241554132
1100	NC_012854	CG	3	6	63795	63800	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1101	NC_012854	GC	3	6	63812	63817	0 %	0 %	50 %	50 %	241554132
1102	NC_012854	CAG	2	6	63977	63982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554133
1103	NC_012854	AGA	2	6	64014	64019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554133
1104	NC_012854	TCA	2	6	64026	64031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554133
1105	NC_012854	TCG	3	9	64055	64063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554133
1106	NC_012854	GCC	2	6	64102	64107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554133
1107	NC_012854	CGT	2	6	64125	64130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554133
1108	NC_012854	GC	3	6	64160	64165	0 %	0 %	50 %	50 %	241554133
1109	NC_012854	GTC	2	6	64328	64333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554133
1110	NC_012854	TCG	2	6	64335	64340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554133
1111	NC_012854	ATGA	2	8	64657	64664	50 %	25 %	25 %	0 %	241554134
1112	NC_012854	GGT	3	9	64677	64685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554134
1113	NC_012854	CGG	3	9	64686	64694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554134
1114	NC_012854	GCC	2	6	64711	64716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554134
1115	NC_012854	T	7	7	64718	64724	0 %	100 %	0 %	0 %	241554134
1116	NC_012854	GCCG	2	8	64732	64739	0 %	0 %	50 %	50 %	241554134
1117	NC_012854	CGG	2	6	64758	64763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554134
1118	NC_012854	CAG	2	6	64826	64831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554134
1119	NC_012854	CCGT	2	8	64859	64866	0 %	25 %	25 %	50 %	241554134
1120	NC_012854	TCCAT	2	10	64895	64904	20 %	40 %	0 %	40 %	241554134
1121	NC_012854	GCA	2	6	64957	64962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554134
1122	NC_012854	GAC	2	6	64993	64998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554134
1123	NC_012854	CCA	2	6	65002	65007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554134
1124	NC_012854	CGTG	2	8	65040	65047	0 %	25 %	50 %	25 %	241554134
1125	NC_012854	GTG	2	6	65092	65097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554134
1126	NC_012854	CAT	2	6	65226	65231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554134
1127	NC_012854	TTG	2	6	65273	65278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554134
1128	NC_012854	GCG	3	9	65294	65302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554134
1129	NC_012854	TGCGA	2	10	65314	65323	20 %	20 %	40 %	20 %	241554134
1130	NC_012854	CGG	2	6	65333	65338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554134
1131	NC_012854	CGC	2	6	65361	65366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554134
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1134	NC_012854	GGCA	2	8	65493	65500	25 %	0 %	50 %	25 %	241554134
1135	NC_012854	GTG	2	6	65515	65520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554134
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1142	NC_012854	TTC	2	6	65983	65988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554135
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1157	NC_012854	AT	3	6	66497	66502	50 %	50 %	0 %	0 %	241554135
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1244	NC_012854	GAAGA	2	10	70024	70033	60 %	0 %	40 %	0 %	241554138
1245	NC_012854	CGA	2	6	70142	70147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554138
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1250	NC_012854	CTG	2	6	70404	70409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554139
1251	NC_012854	GC	3	6	70510	70515	0 %	0 %	50 %	50 %	241554139
1252	NC_012854	GAACC	2	10	70520	70529	40 %	0 %	20 %	40 %	241554139
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1499	NC_012854	GCA	2	6	82168	82173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554152
1500	NC_012854	CG	3	6	82180	82185	0 %	0 %	50 %	50 %	241554152

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