MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132505

Total Repeats: 5837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012854	TCG	2	6	274423	274428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554330
5502	NC_012854	CCGGCA	2	12	274624	274635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241554330
5503	NC_012854	CAC	2	6	274644	274649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554330
5504	NC_012854	CCG	2	6	274697	274702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554330
5505	NC_012854	GATC	2	8	274737	274744	25 %	25 %	25 %	25 %	241554330
5506	NC_012854	GC	3	6	274800	274805	0 %	0 %	50 %	50 %	241554330
5507	NC_012854	CCA	2	6	274847	274852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554330
5508	NC_012854	CGA	2	6	274919	274924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554330
5509	NC_012854	GCC	2	6	275066	275071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554330
5510	NC_012854	CG	3	6	275120	275125	0 %	0 %	50 %	50 %	241554330
5511	NC_012854	CGAT	2	8	275143	275150	25 %	25 %	25 %	25 %	241554330
5512	NC_012854	GCTCG	2	10	275178	275187	0 %	20 %	40 %	40 %	241554330
5513	NC_012854	GCGA	2	8	275210	275217	25 %	0 %	50 %	25 %	241554330
5514	NC_012854	GGCC	2	8	275237	275244	0 %	0 %	50 %	50 %	241554330
5515	NC_012854	GGC	2	6	275311	275316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554330
5516	NC_012854	AGC	2	6	275353	275358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554330
5517	NC_012854	CTCAC	2	10	275383	275392	20 %	20 %	0 %	60 %	241554330
5518	NC_012854	CGT	2	6	275394	275399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554330
5519	NC_012854	CAT	2	6	275400	275405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554330
5520	NC_012854	CGG	2	6	275606	275611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554330
5521	NC_012854	CCTGT	2	10	275689	275698	0 %	40 %	20 %	40 %	241554330
5522	NC_012854	TCGT	2	8	275728	275735	0 %	50 %	25 %	25 %	241554330
5523	NC_012854	GGC	2	6	275757	275762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554330
5524	NC_012854	GCGA	2	8	275790	275797	25 %	0 %	50 %	25 %	241554330
5525	NC_012854	GAT	2	6	275813	275818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554330
5526	NC_012854	TCA	2	6	276110	276115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554331
5527	NC_012854	GC	3	6	276118	276123	0 %	0 %	50 %	50 %	241554331
5528	NC_012854	GC	3	6	276198	276203	0 %	0 %	50 %	50 %	241554331
5529	NC_012854	CGC	2	6	276214	276219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554331
5530	NC_012854	TGC	2	6	276242	276247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554331
5531	NC_012854	CGA	2	6	276354	276359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554331
5532	NC_012854	CTG	2	6	276361	276366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554331
5533	NC_012854	CAT	2	6	276419	276424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554331
5534	NC_012854	GCCA	2	8	276432	276439	25 %	0 %	25 %	50 %	241554332
5535	NC_012854	ATG	2	6	276462	276467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554332
5536	NC_012854	TCG	2	6	276499	276504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5537	NC_012854	TCA	2	6	276508	276513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554332
5538	NC_012854	GTCATC	2	12	276564	276575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241554332
5539	NC_012854	CGG	2	6	276620	276625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554332
5540	NC_012854	CGT	2	6	276680	276685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5541	NC_012854	GCT	2	6	276686	276691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5542	NC_012854	CA	3	6	276719	276724	50 %	0 %	0 %	50 %	241554332
5543	NC_012854	AGCG	2	8	276734	276741	25 %	0 %	50 %	25 %	241554332
5544	NC_012854	GA	3	6	276781	276786	50 %	0 %	50 %	0 %	241554332
5545	NC_012854	AAC	2	6	276834	276839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554332
5546	NC_012854	CTT	2	6	276849	276854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554332
5547	NC_012854	TCT	2	6	276875	276880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241554332
5548	NC_012854	CAT	2	6	276920	276925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554332
5549	NC_012854	CCG	2	6	276940	276945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554332
5550	NC_012854	ATC	2	6	276954	276959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554332
5551	NC_012854	CGA	2	6	277151	277156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5552	NC_012854	TGC	3	9	277216	277224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5553	NC_012854	GCCA	3	12	277233	277244	25 %	0 %	25 %	50 %	241554332
5554	NC_012854	GAC	2	6	277245	277250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5555	NC_012854	CCGTG	2	10	277304	277313	0 %	20 %	40 %	40 %	241554332
5556	NC_012854	TGC	2	6	277361	277366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5557	NC_012854	CGG	2	6	277414	277419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554332
5558	NC_012854	AC	3	6	277427	277432	50 %	0 %	0 %	50 %	241554332
5559	NC_012854	GCC	2	6	277532	277537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554332
5560	NC_012854	AGAC	2	8	277538	277545	50 %	0 %	25 %	25 %	241554332
5561	NC_012854	TGG	2	6	277576	277581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554332
5562	NC_012854	GC	3	6	277602	277607	0 %	0 %	50 %	50 %	241554332
5563	NC_012854	CGC	2	6	277618	277623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554332
5564	NC_012854	CGA	2	6	277655	277660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5565	NC_012854	GCC	2	6	277665	277670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554332
5566	NC_012854	TCA	2	6	277754	277759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241554332
5567	NC_012854	GC	3	6	277763	277768	0 %	0 %	50 %	50 %	241554332
5568	NC_012854	GC	3	6	277781	277786	0 %	0 %	50 %	50 %	241554332
5569	NC_012854	TGC	2	6	277813	277818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5570	NC_012854	GTC	2	6	277884	277889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5571	NC_012854	CGG	2	6	277897	277902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554332
5572	NC_012854	CG	3	6	277905	277910	0 %	0 %	50 %	50 %	241554332
5573	NC_012854	AGC	2	6	277945	277950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5574	NC_012854	CGGC	2	8	277955	277962	0 %	0 %	50 %	50 %	241554332
5575	NC_012854	GCT	2	6	277964	277969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5576	NC_012854	CGA	2	6	277976	277981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5577	NC_012854	ATGC	2	8	277992	277999	25 %	25 %	25 %	25 %	241554332
5578	NC_012854	GCT	2	6	278009	278014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554332
5579	NC_012854	GAA	2	6	278247	278252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554333
5580	NC_012854	TCGA	2	8	278275	278282	25 %	25 %	25 %	25 %	241554333
5581	NC_012854	GCA	2	6	278343	278348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554333
5582	NC_012854	CGC	3	9	278512	278520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241554334
5583	NC_012854	CTC	2	6	278521	278526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554334
5584	NC_012854	GC	3	6	278564	278569	0 %	0 %	50 %	50 %	241554334
5585	NC_012854	TGC	2	6	278578	278583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554334
5586	NC_012854	GC	3	6	278597	278602	0 %	0 %	50 %	50 %	241554334
5587	NC_012854	CAGC	2	8	278623	278630	25 %	0 %	25 %	50 %	241554334
5588	NC_012854	GCGT	2	8	278641	278648	0 %	25 %	50 %	25 %	241554334
5589	NC_012854	CTC	2	6	278725	278730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554334
5590	NC_012854	GCG	2	6	278792	278797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554334
5591	NC_012854	GGCAT	2	10	278862	278871	20 %	20 %	40 %	20 %	241554334
5592	NC_012854	ATA	2	6	278896	278901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241554334
5593	NC_012854	TCC	2	6	278911	278916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554334
5594	NC_012854	CGGC	2	8	278951	278958	0 %	0 %	50 %	50 %	241554334
5595	NC_012854	GTC	2	6	279098	279103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554334
5596	NC_012854	GAAC	2	8	279115	279122	50 %	0 %	25 %	25 %	241554334
5597	NC_012854	GAC	2	6	279130	279135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554334
5598	NC_012854	CGT	2	6	279319	279324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554334
5599	NC_012854	GAT	2	6	279367	279372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554334
5600	NC_012854	GATTG	2	10	279408	279417	20 %	40 %	40 %	0 %	241554334
5601	NC_012854	GTC	2	6	279738	279743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5602	NC_012854	GTC	2	6	279912	279917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5603	NC_012854	CTC	2	6	279951	279956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554335
5604	NC_012854	GAT	2	6	280011	280016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554335
5605	NC_012854	TCG	2	6	280033	280038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5606	NC_012854	CAG	2	6	280086	280091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5607	NC_012854	GAT	2	6	280188	280193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554335
5608	NC_012854	AT	3	6	280214	280219	50 %	50 %	0 %	0 %	241554335
5609	NC_012854	GCA	2	6	280268	280273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5610	NC_012854	GGT	2	6	280278	280283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241554335
5611	NC_012854	GC	3	6	280448	280453	0 %	0 %	50 %	50 %	241554335
5612	NC_012854	GGC	2	6	280518	280523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554335
5613	NC_012854	CGA	2	6	280556	280561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554335
5614	NC_012854	AGG	2	6	280756	280761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241554336
5615	NC_012854	CT	3	6	280802	280807	0 %	50 %	0 %	50 %	241554336
5616	NC_012854	CTG	2	6	280876	280881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554336
5617	NC_012854	ACTT	2	8	280882	280889	25 %	50 %	0 %	25 %	241554336
5618	NC_012854	CGG	3	9	281489	281497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554337
5619	NC_012854	CAA	2	6	281541	281546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241554337
5620	NC_012854	GGC	2	6	281574	281579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554337
5621	NC_012854	GCG	2	6	281591	281596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554337
5622	NC_012854	TAG	2	6	281640	281645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554337
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5652	NC_012854	GC	3	6	283575	283580	0 %	0 %	50 %	50 %	241554339
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5681	NC_012854	CGA	2	6	285213	285218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554341
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5683	NC_012854	CGA	2	6	285378	285383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554341
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5694	NC_012854	GCTTGC	2	12	285970	285981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554341
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5699	NC_012854	TAG	2	6	286220	286225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241554341
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5706	NC_012854	CGA	2	6	287092	287097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554342
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5714	NC_012854	CACG	2	8	287388	287395	25 %	0 %	25 %	50 %	241554342
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5721	NC_012854	GTC	2	6	287742	287747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554342
5722	NC_012854	AGC	2	6	288652	288657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554343
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5724	NC_012854	CGTC	2	8	288707	288714	0 %	25 %	25 %	50 %	241554343
5725	NC_012854	CGGC	2	8	288781	288788	0 %	0 %	50 %	50 %	241554343
5726	NC_012854	TCTG	2	8	288789	288796	0 %	50 %	25 %	25 %	241554343
5727	NC_012854	GGC	3	9	288853	288861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241554343
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5731	NC_012854	AG	4	8	289071	289078	50 %	0 %	50 %	0 %	241554343
5732	NC_012854	AAG	2	6	289080	289085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241554343
5733	NC_012854	TCC	2	6	289305	289310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241554343
5734	NC_012854	AATG	2	8	289342	289349	50 %	25 %	25 %	0 %	241554343
5735	NC_012854	TGGA	2	8	289419	289426	25 %	25 %	50 %	0 %	241554343
5736	NC_012854	ACG	2	6	289435	289440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554343
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5742	NC_012854	CAC	2	6	289761	289766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241554343
5743	NC_012854	TGT	2	6	289841	289846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241554343
5744	NC_012854	GAC	2	6	289870	289875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241554343
5745	NC_012854	GCT	2	6	289882	289887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241554343
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5747	NC_012854	AACTC	2	10	290009	290018	40 %	20 %	0 %	40 %	241554343
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.