MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 6006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012853	GCG	2	6	226	231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518162
2	NC_012853	GCG	2	6	249	254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518162
3	NC_012853	GCC	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518162
4	NC_012853	TCT	2	6	351	356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518162
5	NC_012853	CTC	2	6	529	534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518162
6	NC_012853	GTG	2	6	581	586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518162
7	NC_012853	GAC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
8	NC_012853	GGC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518163
9	NC_012853	CAG	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
10	NC_012853	CAC	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518163
11	NC_012853	TCG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518163
12	NC_012853	GAC	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518163
13	NC_012853	GCT	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518163
14	NC_012853	GCG	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518164
15	NC_012853	TCG	2	6	1666	1671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518164
16	NC_012853	GAC	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518164
17	NC_012853	TGA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518164
18	NC_012853	GTC	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518164
19	NC_012853	GAC	2	6	1872	1877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518164
20	NC_012853	GAG	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518164
21	NC_012853	CAC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518165
22	NC_012853	CCG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518165
23	NC_012853	TCC	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518166
24	NC_012853	GAC	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518166
25	NC_012853	CCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518166
26	NC_012853	GCT	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518166
27	NC_012853	CGT	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518166
28	NC_012853	CGA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518166
29	NC_012853	CGT	2	6	3363	3368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518168
30	NC_012853	GCC	3	9	3483	3491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518168
31	NC_012853	GAA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518169
32	NC_012853	TGA	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
33	NC_012853	CGC	2	6	3707	3712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518169
34	NC_012853	CGA	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518169
35	NC_012853	CGG	2	6	3738	3743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
36	NC_012853	GCG	2	6	3756	3761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
37	NC_012853	ACG	2	6	3829	3834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518169
38	NC_012853	CGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518169
39	NC_012853	GGC	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518169
40	NC_012853	CGT	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518169
41	NC_012853	TGA	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
42	NC_012853	TGG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518169
43	NC_012853	GAT	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518169
44	NC_012853	GCC	2	6	4547	4552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
45	NC_012853	GCC	2	6	4786	4791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
46	NC_012853	CGC	2	6	4923	4928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518170
47	NC_012853	ACA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518170
48	NC_012853	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518170
49	NC_012853	ACT	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518171
50	NC_012853	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518171
51	NC_012853	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518171
52	NC_012853	TCG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518171
53	NC_012853	ACC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518172
54	NC_012853	CGC	2	6	5915	5920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
55	NC_012853	TCA	2	6	6019	6024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
56	NC_012853	CAT	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
57	NC_012853	CCT	2	6	6151	6156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518172
58	NC_012853	GAG	2	6	6197	6202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518172
59	NC_012853	GCC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
60	NC_012853	GCT	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
61	NC_012853	GTA	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518172
62	NC_012853	AAG	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518172
63	NC_012853	TGA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518172
64	NC_012853	CAT	2	6	6851	6856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518172
65	NC_012853	TCG	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
66	NC_012853	GGC	2	6	7028	7033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518172
67	NC_012853	GCT	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
68	NC_012853	CGA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
69	NC_012853	TGC	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
70	NC_012853	ACG	2	6	7497	7502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
71	NC_012853	ACG	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
72	NC_012853	TCG	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
73	NC_012853	GCA	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
74	NC_012853	GCG	2	6	7702	7707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518172
75	NC_012853	ACC	2	6	7731	7736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518172
76	NC_012853	ACA	2	6	7738	7743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518172
77	NC_012853	CGC	2	6	7820	7825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518172
78	NC_012853	GAC	2	6	7856	7861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
79	NC_012853	CGA	3	9	7864	7872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518172
80	NC_012853	TCG	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518172
81	NC_012853	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518172
82	NC_012853	CCG	2	6	8166	8171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518173
83	NC_012853	GTC	2	6	8190	8195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518173
84	NC_012853	CAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518173
85	NC_012853	GCT	2	6	8363	8368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518173
86	NC_012853	TCA	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518173
87	NC_012853	TCT	2	6	8725	8730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518174
88	NC_012853	CAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518174
89	NC_012853	TCA	2	6	8821	8826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518174
90	NC_012853	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518174
91	NC_012853	CGG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518174
92	NC_012853	AGT	2	6	10774	10779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518175
93	NC_012853	CGC	2	6	10782	10787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518175
94	NC_012853	ATC	2	6	10818	10823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518175
95	NC_012853	TGG	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518175
96	NC_012853	GCT	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518175
97	NC_012853	ATT	2	6	10928	10933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241518175
98	NC_012853	GGC	2	6	10934	10939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518175
99	NC_012853	ACA	2	6	11025	11030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518175
100	NC_012853	GCC	2	6	11635	11640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518176
101	NC_012853	GCT	2	6	11856	11861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518176
102	NC_012853	TGA	2	6	12114	12119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518177
103	NC_012853	ACG	2	6	12261	12266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518177
104	NC_012853	GAT	2	6	12274	12279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518177
105	NC_012853	ACG	2	6	12312	12317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518177
106	NC_012853	TCG	2	6	12333	12338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518177
107	NC_012853	CGG	2	6	12394	12399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518177
108	NC_012853	GGC	2	6	12430	12435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518177
109	NC_012853	GAT	2	6	12493	12498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518177
110	NC_012853	CGA	2	6	12544	12549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518177
111	NC_012853	TGA	2	6	12685	12690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518177
112	NC_012853	AAG	2	6	12822	12827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518177
113	NC_012853	TCG	2	6	12963	12968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518177
114	NC_012853	AAT	2	6	13067	13072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518177
115	NC_012853	GAT	2	6	13105	13110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518177
116	NC_012853	CTG	2	6	13540	13545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518178
117	NC_012853	CGG	2	6	13552	13557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518178
118	NC_012853	CAA	2	6	13880	13885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518179
119	NC_012853	GTG	2	6	13894	13899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518179
120	NC_012853	CGT	2	6	13926	13931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518179
121	NC_012853	CAC	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518179
122	NC_012853	CTT	2	6	14172	14177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518179
123	NC_012853	ATC	2	6	14179	14184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518179
124	NC_012853	GCC	2	6	14214	14219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518180
125	NC_012853	ACC	2	6	14236	14241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518180
126	NC_012853	TGA	3	9	14263	14271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518180
127	NC_012853	CGA	2	6	14275	14280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518180
128	NC_012853	TGA	2	6	14281	14286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518180
129	NC_012853	CAG	2	6	14287	14292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518180
130	NC_012853	AGC	2	6	14307	14312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518180
131	NC_012853	CAA	2	6	15230	15235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518181
132	NC_012853	GCG	2	6	15263	15268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518181
133	NC_012853	CCT	2	6	15270	15275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518181
134	NC_012853	TCA	2	6	15287	15292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518181
135	NC_012853	TCC	2	6	15299	15304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518181
136	NC_012853	ACC	2	6	16436	16441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518182
137	NC_012853	GAC	2	6	16460	16465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518182
138	NC_012853	GCT	2	6	16651	16656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518182
139	NC_012853	GTC	2	6	16686	16691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518182
140	NC_012853	ACC	2	6	16701	16706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518182
141	NC_012853	CAT	2	6	16843	16848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518182
142	NC_012853	CGG	2	6	16883	16888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518182
143	NC_012853	AGC	2	6	16897	16902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518182
144	NC_012853	CAT	2	6	17277	17282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518183
145	NC_012853	GAC	2	6	17283	17288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518183
146	NC_012853	GCC	2	6	17404	17409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518183
147	NC_012853	ATC	2	6	17419	17424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518183
148	NC_012853	GAT	2	6	17634	17639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518184
149	NC_012853	CGG	2	6	17859	17864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518184
150	NC_012853	TGC	2	6	17906	17911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
151	NC_012853	TGC	2	6	17928	17933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
152	NC_012853	CTG	2	6	18013	18018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
153	NC_012853	GCA	2	6	18061	18066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518184
154	NC_012853	CTG	2	6	18070	18075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
155	NC_012853	CTG	2	6	18151	18156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
156	NC_012853	TGC	3	9	18179	18187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
157	NC_012853	GTT	2	6	18253	18258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518184
158	NC_012853	CTG	2	6	18262	18267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518184
159	NC_012853	AAG	2	6	18286	18291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518184
160	NC_012853	GAC	2	6	18339	18344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518184
161	NC_012853	CAT	2	6	18952	18957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518185
162	NC_012853	ACC	2	6	18983	18988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518185
163	NC_012853	CGT	2	6	19051	19056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518185
164	NC_012853	CTT	2	6	19063	19068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518185
165	NC_012853	CTC	2	6	19121	19126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518185
166	NC_012853	CTC	2	6	19648	19653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518186
167	NC_012853	CAC	2	6	19658	19663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518186
168	NC_012853	AGC	2	6	19677	19682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518186
169	NC_012853	GCC	2	6	19723	19728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518186
170	NC_012853	TTC	2	6	19756	19761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518186
171	NC_012853	CAA	2	6	19778	19783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518186
172	NC_012853	TCG	2	6	19819	19824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518186
173	NC_012853	CAG	2	6	20290	20295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518187
174	NC_012853	TCG	2	6	20297	20302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518187
175	NC_012853	CGA	2	6	20324	20329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518187
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177	NC_012853	CGC	2	6	21031	21036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518188
178	NC_012853	ACC	2	6	21067	21072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518188
179	NC_012853	GCG	2	6	21131	21136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518188
180	NC_012853	GCA	2	6	21331	21336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518188
181	NC_012853	CGA	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518188
182	NC_012853	GCA	2	6	21449	21454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518189
183	NC_012853	TCA	2	6	21544	21549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518189
184	NC_012853	TCA	2	6	21636	21641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518190
185	NC_012853	GTT	2	6	21698	21703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518190
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187	NC_012853	TCG	2	6	21734	21739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518190
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189	NC_012853	CGA	2	6	22431	22436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518190
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199	NC_012853	GAC	2	6	24339	24344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518192
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201	NC_012853	CAA	2	6	24392	24397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518192
202	NC_012853	TGT	2	6	24421	24426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518192
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204	NC_012853	CAT	2	6	24464	24469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518192
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220	NC_012853	TCG	3	9	25415	25423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518193
221	NC_012853	TTC	2	6	25485	25490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518193
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229	NC_012853	AAG	2	6	26291	26296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518193
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231	NC_012853	ATC	2	6	26372	26377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518193
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235	NC_012853	AGC	2	6	26730	26735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518194
236	NC_012853	CGA	2	6	26772	26777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518194
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239	NC_012853	ACC	2	6	27100	27105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518194
240	NC_012853	AGG	2	6	27155	27160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518194
241	NC_012853	GAT	2	6	27178	27183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518194
242	NC_012853	CAA	2	6	27241	27246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518194
243	NC_012853	CTG	2	6	27247	27252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518194
244	NC_012853	TCA	2	6	27488	27493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518194
245	NC_012853	GGC	2	6	27601	27606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518194
246	NC_012853	ACG	2	6	27616	27621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518194
247	NC_012853	TGC	2	6	27699	27704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518194
248	NC_012853	AGG	2	6	27705	27710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518194
249	NC_012853	ACG	2	6	27910	27915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518195
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251	NC_012853	CAA	2	6	28182	28187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518195
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498	NC_012853	GTG	2	6	50739	50744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518210
499	NC_012853	GAG	2	6	50815	50820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518210
500	NC_012853	GAT	3	9	50932	50940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518210

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