MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012853	GGT	2	6	150382	150387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518303
2502	NC_012853	CGAT	2	8	150397	150404	25 %	25 %	25 %	25 %	241518303
2503	NC_012853	CCG	2	6	150462	150467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518303
2504	NC_012853	CTCGC	2	10	150468	150477	0 %	20 %	20 %	60 %	241518303
2505	NC_012853	CGA	2	6	150502	150507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518303
2506	NC_012853	AAT	2	6	150518	150523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518303
2507	NC_012853	CCG	2	6	150524	150529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518303
2508	NC_012853	ACG	2	6	150531	150536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518303
2509	NC_012853	CGC	2	6	150644	150649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518304
2510	NC_012853	TCG	2	6	150654	150659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518304
2511	NC_012853	TC	3	6	150755	150760	0 %	50 %	0 %	50 %	241518304
2512	NC_012853	TGC	2	6	150767	150772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518304
2513	NC_012853	TCA	2	6	151182	151187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518305
2514	NC_012853	TC	3	6	151204	151209	0 %	50 %	0 %	50 %	241518305
2515	NC_012853	AAG	2	6	151220	151225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518305
2516	NC_012853	CG	3	6	151234	151239	0 %	0 %	50 %	50 %	241518305
2517	NC_012853	GTC	2	6	151250	151255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518305
2518	NC_012853	CAG	2	6	151258	151263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518305
2519	NC_012853	ATC	2	6	151319	151324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518305
2520	NC_012853	AATG	3	12	151357	151368	50 %	25 %	25 %	0 %	241518305
2521	NC_012853	GCC	2	6	151454	151459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518305
2522	NC_012853	TAT	2	6	151505	151510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241518305
2523	NC_012853	GCC	2	6	151829	151834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518306
2524	NC_012853	CG	3	6	151877	151882	0 %	0 %	50 %	50 %	241518307
2525	NC_012853	TCC	3	9	151910	151918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518307
2526	NC_012853	AGC	2	6	151929	151934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518307
2527	NC_012853	CAG	2	6	152014	152019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518307
2528	NC_012853	CGGCG	2	10	152040	152049	0 %	0 %	60 %	40 %	241518307
2529	NC_012853	ATC	2	6	152090	152095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518307
2530	NC_012853	CCGT	2	8	152099	152106	0 %	25 %	25 %	50 %	241518307
2531	NC_012853	CAAC	2	8	152125	152132	50 %	0 %	0 %	50 %	241518307
2532	NC_012853	CTC	2	6	152143	152148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518307
2533	NC_012853	AGC	2	6	152195	152200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518307
2534	NC_012853	TTC	2	6	152242	152247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518307
2535	NC_012853	CCG	2	6	152330	152335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518307
2536	NC_012853	CGG	2	6	152343	152348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518307
2537	NC_012853	TCCC	2	8	152359	152366	0 %	25 %	0 %	75 %	241518307
2538	NC_012853	CGA	2	6	152370	152375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518307
2539	NC_012853	TCC	2	6	152465	152470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518307
2540	NC_012853	ACG	2	6	153292	153297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518308
2541	NC_012853	GGA	2	6	153312	153317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518308
2542	NC_012853	ATC	2	6	153325	153330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518308
2543	NC_012853	GTC	2	6	153387	153392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518308
2544	NC_012853	AGC	2	6	153399	153404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518308
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2547	NC_012853	GCC	2	6	153500	153505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518308
2548	NC_012853	CATT	2	8	153512	153519	25 %	50 %	0 %	25 %	241518308
2549	NC_012853	CTTC	2	8	153781	153788	0 %	50 %	0 %	50 %	241518309
2550	NC_012853	GCG	2	6	153859	153864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518309
2551	NC_012853	CGA	2	6	153889	153894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518309
2552	NC_012853	CAG	2	6	153959	153964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518310
2553	NC_012853	GGCG	2	8	153980	153987	0 %	0 %	75 %	25 %	241518310
2554	NC_012853	CGT	2	6	154018	154023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518310
2555	NC_012853	AC	3	6	154230	154235	50 %	0 %	0 %	50 %	241518311
2556	NC_012853	GGC	2	6	154430	154435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518311
2557	NC_012853	CTG	2	6	154442	154447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518311
2558	NC_012853	ATG	2	6	154458	154463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518311
2559	NC_012853	CAG	2	6	154535	154540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518311
2560	NC_012853	TC	3	6	154669	154674	0 %	50 %	0 %	50 %	241518311
2561	NC_012853	ACG	2	6	154683	154688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518311
2562	NC_012853	GCC	2	6	154761	154766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518311
2563	NC_012853	GCCG	2	8	154838	154845	0 %	0 %	50 %	50 %	241518311
2564	NC_012853	CGGCG	2	10	154855	154864	0 %	0 %	60 %	40 %	241518311
2565	NC_012853	CGC	2	6	154894	154899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518311
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2568	NC_012853	CGG	2	6	154960	154965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518311
2569	NC_012853	TCC	2	6	155036	155041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518311
2570	NC_012853	TGG	2	6	155145	155150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518311
2571	NC_012853	CG	3	6	155155	155160	0 %	0 %	50 %	50 %	241518311
2572	NC_012853	CGGAG	2	10	155274	155283	20 %	0 %	60 %	20 %	241518311
2573	NC_012853	GGT	2	6	155305	155310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518311
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2577	NC_012853	GC	3	6	155430	155435	0 %	0 %	50 %	50 %	241518311
2578	NC_012853	GCCT	2	8	155454	155461	0 %	25 %	25 %	50 %	241518311
2579	NC_012853	GCG	2	6	155471	155476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518311
2580	NC_012853	GCC	2	6	155480	155485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518311
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2584	NC_012853	CCGGT	2	10	155778	155787	0 %	20 %	40 %	40 %	241518311
2585	NC_012853	GAT	2	6	155821	155826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518311
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2587	NC_012853	GAT	2	6	155935	155940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518311
2588	NC_012853	TGC	2	6	156231	156236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518312
2589	NC_012853	GCGAC	2	10	156248	156257	20 %	0 %	40 %	40 %	241518312
2590	NC_012853	GCC	2	6	156280	156285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518312
2591	NC_012853	CCT	2	6	156293	156298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518312
2592	NC_012853	CGC	2	6	156303	156308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518312
2593	NC_012853	CGG	2	6	157034	157039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518313
2594	NC_012853	CT	3	6	157040	157045	0 %	50 %	0 %	50 %	241518313
2595	NC_012853	CGC	2	6	157053	157058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518313
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2599	NC_012853	GC	3	6	157236	157241	0 %	0 %	50 %	50 %	241518313
2600	NC_012853	GTC	2	6	157244	157249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518313
2601	NC_012853	GAC	2	6	157379	157384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518313
2602	NC_012853	GAC	2	6	157397	157402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518313
2603	NC_012853	CAG	2	6	157403	157408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518313
2604	NC_012853	GCC	2	6	157458	157463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518313
2605	NC_012853	CCG	2	6	157499	157504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518313
2606	NC_012853	CAG	2	6	157508	157513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518313
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2608	NC_012853	CGA	2	6	157663	157668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518314
2609	NC_012853	CG	3	6	157737	157742	0 %	0 %	50 %	50 %	241518314
2610	NC_012853	CAG	2	6	157764	157769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518314
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2617	NC_012853	GCC	2	6	158149	158154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518315
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2619	NC_012853	CGG	2	6	158184	158189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518315
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2621	NC_012853	CCTG	2	8	158300	158307	0 %	25 %	25 %	50 %	241518315
2622	NC_012853	GCC	2	6	158310	158315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518315
2623	NC_012853	TGGCGA	2	12	158361	158372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241518315
2624	NC_012853	CGCTG	2	10	158389	158398	0 %	20 %	40 %	40 %	241518315
2625	NC_012853	GCC	2	6	158407	158412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518315
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2634	NC_012853	GAC	2	6	158815	158820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518315
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2653	NC_012853	GAT	2	6	159591	159596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518316
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2720	NC_012853	GCT	2	6	162865	162870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518318
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2729	NC_012853	AC	3	6	163279	163284	50 %	0 %	0 %	50 %	241518318
2730	NC_012853	GC	3	6	163312	163317	0 %	0 %	50 %	50 %	241518318
2731	NC_012853	TGGGA	2	10	163321	163330	20 %	20 %	60 %	0 %	241518318
2732	NC_012853	CGG	2	6	163376	163381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518318
2733	NC_012853	CCGA	2	8	163382	163389	25 %	0 %	25 %	50 %	241518318
2734	NC_012853	CGA	2	6	163427	163432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518319
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2736	NC_012853	AGCGA	2	10	163568	163577	40 %	0 %	40 %	20 %	241518319
2737	NC_012853	GGC	2	6	163624	163629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518319
2738	NC_012853	CGCC	2	8	163653	163660	0 %	0 %	25 %	75 %	241518319
2739	NC_012853	TC	3	6	163665	163670	0 %	50 %	0 %	50 %	241518319
2740	NC_012853	CTG	2	6	163697	163702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518319
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2742	NC_012853	CGC	2	6	163740	163745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518319
2743	NC_012853	CGT	2	6	163774	163779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518319
2744	NC_012853	C	6	6	163814	163819	0 %	0 %	0 %	100 %	241518319
2745	NC_012853	GCC	2	6	163913	163918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518319
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2755	NC_012853	TCG	2	6	164196	164201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518319
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2853	NC_012853	CCGGCA	2	12	168176	168187	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241518323
2854	NC_012853	CAT	2	6	168211	168216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518323
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2856	NC_012853	CAGA	2	8	168274	168281	50 %	0 %	25 %	25 %	241518323
2857	NC_012853	CG	3	6	168314	168319	0 %	0 %	50 %	50 %	241518323
2858	NC_012853	ACG	2	6	168326	168331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518323
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2860	NC_012853	TGC	2	6	168368	168373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518323
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2983	NC_012853	GGA	2	6	174804	174809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518330
2984	NC_012853	GCA	2	6	174828	174833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518330
2985	NC_012853	CAT	2	6	174930	174935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518330
2986	NC_012853	TGA	2	6	174945	174950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518330
2987	NC_012853	AGC	2	6	175064	175069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518330
2988	NC_012853	AGG	2	6	175079	175084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518330
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2990	NC_012853	CGAC	2	8	175124	175131	25 %	0 %	25 %	50 %	241518330
2991	NC_012853	GC	3	6	175179	175184	0 %	0 %	50 %	50 %	241518330
2992	NC_012853	ATTC	2	8	175449	175456	25 %	50 %	0 %	25 %	241518331
2993	NC_012853	ATGC	2	8	175514	175521	25 %	25 %	25 %	25 %	241518331
2994	NC_012853	CGA	2	6	176189	176194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518332
2995	NC_012853	AGA	2	6	176202	176207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518332
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2997	NC_012853	TGG	2	6	176342	176347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518332
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2999	NC_012853	TCG	2	6	176379	176384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518332
3000	NC_012853	AAC	2	6	176393	176398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518332

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