MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012853	GCA	2	6	94869	94874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518247
1502	NC_012853	GAG	2	6	94900	94905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518247
1503	NC_012853	AGG	2	6	94914	94919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518247
1504	NC_012853	CGGCCG	2	12	94992	95003	0 %	0 %	50 %	50 %	241518247
1505	NC_012853	GAC	3	9	95104	95112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518247
1506	NC_012853	GCCGA	2	10	95165	95174	20 %	0 %	40 %	40 %	241518247
1507	NC_012853	GAT	2	6	95221	95226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518247
1508	NC_012853	GCC	2	6	95254	95259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518247
1509	NC_012853	G	6	6	95292	95297	0 %	0 %	100 %	0 %	241518247
1510	NC_012853	GCTTT	2	10	95338	95347	0 %	60 %	20 %	20 %	241518247
1511	NC_012853	CA	3	6	95902	95907	50 %	0 %	0 %	50 %	241518248
1512	NC_012853	GCC	2	6	95925	95930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518248
1513	NC_012853	TCG	2	6	95983	95988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518248
1514	NC_012853	CGTC	2	8	95994	96001	0 %	25 %	25 %	50 %	241518248
1515	NC_012853	GATC	2	8	96067	96074	25 %	25 %	25 %	25 %	241518248
1516	NC_012853	CGA	2	6	96146	96151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518248
1517	NC_012853	ATC	2	6	96159	96164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518248
1518	NC_012853	CG	3	6	96170	96175	0 %	0 %	50 %	50 %	241518248
1519	NC_012853	CG	4	8	96194	96201	0 %	0 %	50 %	50 %	241518248
1520	NC_012853	CGG	2	6	96254	96259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518248
1521	NC_012853	TCG	2	6	96340	96345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518248
1522	NC_012853	TGG	2	6	96373	96378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518248
1523	NC_012853	GTC	2	6	96500	96505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518248
1524	NC_012853	TCG	2	6	96648	96653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518249
1525	NC_012853	AAC	2	6	96677	96682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518249
1526	NC_012853	CGA	3	9	96847	96855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518249
1527	NC_012853	CCG	2	6	96858	96863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518249
1528	NC_012853	CTG	2	6	96878	96883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518249
1529	NC_012853	GATC	2	8	96934	96941	25 %	25 %	25 %	25 %	241518250
1530	NC_012853	GC	3	6	97003	97008	0 %	0 %	50 %	50 %	241518250
1531	NC_012853	TGTCGG	2	12	97009	97020	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241518250
1532	NC_012853	CGGG	2	8	97036	97043	0 %	0 %	75 %	25 %	241518250
1533	NC_012853	CAC	2	6	97196	97201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518250
1534	NC_012853	CGG	2	6	97291	97296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518250
1535	NC_012853	ACC	2	6	97320	97325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518250
1536	NC_012853	GAG	2	6	97434	97439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518250
1537	NC_012853	GCC	2	6	97443	97448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518250
1538	NC_012853	ATC	2	6	97503	97508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518250
1539	NC_012853	TGAA	2	8	97546	97553	50 %	25 %	25 %	0 %	241518251
1540	NC_012853	CGA	2	6	97612	97617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518251
1541	NC_012853	CCA	2	6	97634	97639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518251
1542	NC_012853	CGA	2	6	97654	97659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518251
1543	NC_012853	GGGC	2	8	97690	97697	0 %	0 %	75 %	25 %	241518251
1544	NC_012853	GCG	2	6	97726	97731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518251
1545	NC_012853	GAC	2	6	97751	97756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518251
1546	NC_012853	A	6	6	97769	97774	100 %	0 %	0 %	0 %	241518251
1547	NC_012853	CG	5	10	97778	97787	0 %	0 %	50 %	50 %	241518251
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1549	NC_012853	GCC	2	6	97859	97864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518251
1550	NC_012853	CCA	2	6	97879	97884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518251
1551	NC_012853	ACC	2	6	97929	97934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518251
1552	NC_012853	TGG	2	6	97978	97983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518251
1553	NC_012853	GAA	2	6	98103	98108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518251
1554	NC_012853	CGC	2	6	98125	98130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518251
1555	NC_012853	CAC	2	6	98265	98270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518251
1556	NC_012853	CGCC	2	8	98290	98297	0 %	0 %	25 %	75 %	241518251
1557	NC_012853	AGC	2	6	98448	98453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518251
1558	NC_012853	CGC	2	6	98546	98551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518251
1559	NC_012853	ATA	2	6	98575	98580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518251
1560	NC_012853	GGCAAG	2	12	98642	98653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241518251
1561	NC_012853	CGA	2	6	98888	98893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518252
1562	NC_012853	CGG	2	6	99027	99032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518252
1563	NC_012853	GAC	2	6	99042	99047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518252
1564	NC_012853	TGC	2	6	99075	99080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518252
1565	NC_012853	CGG	4	12	99134	99145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518252
1566	NC_012853	GACAA	2	10	99151	99160	60 %	0 %	20 %	20 %	241518252
1567	NC_012853	AAT	2	6	99181	99186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518252
1568	NC_012853	CGG	2	6	99194	99199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518252
1569	NC_012853	T	6	6	99206	99211	0 %	100 %	0 %	0 %	241518252
1570	NC_012853	GT	3	6	99213	99218	0 %	50 %	50 %	0 %	241518252
1571	NC_012853	TC	3	6	99314	99319	0 %	50 %	0 %	50 %	241518253
1572	NC_012853	GCT	2	6	99331	99336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
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1574	NC_012853	TC	3	6	99418	99423	0 %	50 %	0 %	50 %	241518253
1575	NC_012853	CGG	2	6	99544	99549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518253
1576	NC_012853	ATC	2	6	99554	99559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518253
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1578	NC_012853	TTTGC	2	10	99592	99601	0 %	60 %	20 %	20 %	241518253
1579	NC_012853	AG	3	6	99608	99613	50 %	0 %	50 %	0 %	241518253
1580	NC_012853	CG	3	6	99647	99652	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1581	NC_012853	TCC	2	6	99654	99659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518253
1582	NC_012853	TCC	2	6	99942	99947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518253
1583	NC_012853	T	6	6	99953	99958	0 %	100 %	0 %	0 %	241518253
1584	NC_012853	CTG	2	6	99970	99975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1585	NC_012853	GGC	2	6	100082	100087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518253
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1587	NC_012853	GCC	2	6	100110	100115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518253
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1589	NC_012853	CGT	2	6	100271	100276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
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1591	NC_012853	TCG	3	9	100462	100470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1592	NC_012853	TTG	2	6	100488	100493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518253
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1596	NC_012853	TTC	2	6	100620	100625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518253
1597	NC_012853	GCCG	2	8	100643	100650	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1598	NC_012853	GCT	2	6	100778	100783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1599	NC_012853	CGAG	2	8	100918	100925	25 %	0 %	50 %	25 %	241518253
1600	NC_012853	CGA	2	6	101047	101052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518253
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1603	NC_012853	ACG	2	6	101191	101196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1604	NC_012853	CTTC	2	8	101221	101228	0 %	50 %	0 %	50 %	241518253
1605	NC_012853	GCT	2	6	101241	101246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
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1607	NC_012853	CGA	2	6	101266	101271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1608	NC_012853	CG	3	6	101299	101304	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1609	NC_012853	TCA	2	6	101311	101316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518253
1610	NC_012853	TCG	2	6	101317	101322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1611	NC_012853	CCGGCG	2	12	101328	101339	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1612	NC_012853	CGG	2	6	101350	101355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518253
1613	NC_012853	CGC	2	6	101365	101370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518253
1614	NC_012853	GC	3	6	101420	101425	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1615	NC_012853	GC	3	6	101466	101471	0 %	0 %	50 %	50 %	241518253
1616	NC_012853	ATC	2	6	101517	101522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518253
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1619	NC_012853	TGA	2	6	101710	101715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518253
1620	NC_012853	GCG	2	6	101765	101770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518253
1621	NC_012853	CGA	2	6	101813	101818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1622	NC_012853	GATG	2	8	101872	101879	25 %	25 %	50 %	0 %	241518253
1623	NC_012853	GGCAAG	2	12	101942	101953	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241518253
1624	NC_012853	AACC	2	8	101973	101980	50 %	0 %	0 %	50 %	241518253
1625	NC_012853	TCT	2	6	102085	102090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518253
1626	NC_012853	CGT	2	6	102125	102130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1627	NC_012853	CGT	2	6	102160	102165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518253
1628	NC_012853	TGCTC	2	10	102235	102244	0 %	40 %	20 %	40 %	241518253
1629	NC_012853	AG	3	6	102248	102253	50 %	0 %	50 %	0 %	241518253
1630	NC_012853	CTC	2	6	102413	102418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518253
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1645	NC_012853	TGC	2	6	103230	103235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518255
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1648	NC_012853	GATCG	2	10	103303	103312	20 %	20 %	40 %	20 %	241518255
1649	NC_012853	TGA	2	6	103369	103374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518256
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1654	NC_012853	CGA	2	6	103579	103584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518256
1655	NC_012853	CGC	2	6	103592	103597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518256
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1659	NC_012853	CG	3	6	103757	103762	0 %	0 %	50 %	50 %	241518256
1660	NC_012853	GC	3	6	103790	103795	0 %	0 %	50 %	50 %	241518256
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1726	NC_012853	GCCT	2	8	108312	108319	0 %	25 %	25 %	50 %	241518261
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1732	NC_012853	TCA	2	6	108517	108522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518261
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1740	NC_012853	CGGCAG	2	12	108821	108832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241518261
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1742	NC_012853	TCG	2	6	108886	108891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518261
1743	NC_012853	GCAA	2	8	108898	108905	50 %	0 %	25 %	25 %	241518261
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1745	NC_012853	AC	3	6	109154	109159	50 %	0 %	0 %	50 %	241518262
1746	NC_012853	GTC	2	6	109246	109251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518262
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1749	NC_012853	GTA	2	6	109434	109439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518262
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1751	NC_012853	ATC	2	6	109492	109497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518262
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1844	NC_012853	CA	3	6	114785	114790	50 %	0 %	0 %	50 %	241518267
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1852	NC_012853	TC	3	6	115338	115343	0 %	50 %	0 %	50 %	241518268
1853	NC_012853	GAGGC	2	10	115395	115404	20 %	0 %	60 %	20 %	241518268
1854	NC_012853	AGC	2	6	115406	115411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518268
1855	NC_012853	GC	3	6	115419	115424	0 %	0 %	50 %	50 %	241518268
1856	NC_012853	ACG	2	6	115427	115432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518268
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1865	NC_012853	CGA	2	6	115825	115830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518268
1866	NC_012853	GAC	2	6	115852	115857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518268
1867	NC_012853	CCTC	2	8	115941	115948	0 %	25 %	0 %	75 %	241518268
1868	NC_012853	GCC	2	6	116015	116020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518268
1869	NC_012853	TGA	2	6	116061	116066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518268
1870	NC_012853	CACC	2	8	116095	116102	25 %	0 %	0 %	75 %	241518268
1871	NC_012853	GCC	2	6	116129	116134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518268
1872	NC_012853	TCGA	2	8	116140	116147	25 %	25 %	25 %	25 %	241518268
1873	NC_012853	CGG	2	6	116152	116157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518268
1874	NC_012853	C	6	6	116167	116172	0 %	0 %	0 %	100 %	241518268
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1882	NC_012853	GAGATC	2	12	116488	116499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241518268
1883	NC_012853	TGA	2	6	116517	116522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518268
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1895	NC_012853	TGC	2	6	117157	117162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518269
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1984	NC_012853	CGA	2	6	121983	121988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518273
1985	NC_012853	GC	3	6	122002	122007	0 %	0 %	50 %	50 %	241518273
1986	NC_012853	TCC	2	6	122122	122127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518273
1987	NC_012853	GCA	2	6	122147	122152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518273
1988	NC_012853	TGGT	2	8	122167	122174	0 %	50 %	50 %	0 %	241518273
1989	NC_012853	GC	3	6	122182	122187	0 %	0 %	50 %	50 %	241518273
1990	NC_012853	AGCGGT	2	12	122204	122215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241518273
1991	NC_012853	GAG	2	6	122242	122247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518273
1992	NC_012853	GCG	2	6	122254	122259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518273
1993	NC_012853	GCCG	2	8	122268	122275	0 %	0 %	50 %	50 %	241518273
1994	NC_012853	GAT	2	6	122286	122291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518273
1995	NC_012853	GGT	2	6	122301	122306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518273
1996	NC_012853	GCCC	2	8	122349	122356	0 %	0 %	25 %	75 %	241518274
1997	NC_012853	CG	3	6	122421	122426	0 %	0 %	50 %	50 %	241518274
1998	NC_012853	AAG	2	6	122431	122436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518274
1999	NC_012853	ATG	2	6	122438	122443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518274
2000	NC_012853	CAG	2	6	122467	122472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518274

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