MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012853	ACG	2	6	37224	37229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518200
502	NC_012853	CGG	2	6	37319	37324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518200
503	NC_012853	CGC	2	6	37393	37398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518200
504	NC_012853	CCA	2	6	37441	37446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518200
505	NC_012853	CAA	2	6	37489	37494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518200
506	NC_012853	A	7	7	37557	37563	100 %	0 %	0 %	0 %	241518201
507	NC_012853	GAA	2	6	37571	37576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518201
508	NC_012853	CCG	2	6	37579	37584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518201
509	NC_012853	CGG	2	6	37609	37614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518201
510	NC_012853	GAC	2	6	37622	37627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518201
511	NC_012853	GGC	2	6	37628	37633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518201
512	NC_012853	CTGG	2	8	37688	37695	0 %	25 %	50 %	25 %	241518201
513	NC_012853	GCGCT	2	10	37762	37771	0 %	20 %	40 %	40 %	241518201
514	NC_012853	ACA	2	6	37773	37778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518201
515	NC_012853	CAT	2	6	37928	37933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518201
516	NC_012853	CGG	2	6	37975	37980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518201
517	NC_012853	GC	3	6	38001	38006	0 %	0 %	50 %	50 %	241518201
518	NC_012853	TGA	2	6	38018	38023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518201
519	NC_012853	GA	3	6	38130	38135	50 %	0 %	50 %	0 %	241518201
520	NC_012853	GCC	2	6	38235	38240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518201
521	NC_012853	CGC	2	6	38246	38251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518201
522	NC_012853	G	6	6	38270	38275	0 %	0 %	100 %	0 %	241518201
523	NC_012853	CATG	2	8	38318	38325	25 %	25 %	25 %	25 %	241518201
524	NC_012853	CG	3	6	38337	38342	0 %	0 %	50 %	50 %	241518201
525	NC_012853	GCA	2	6	38347	38352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518201
526	NC_012853	CTG	2	6	38358	38363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
527	NC_012853	TGC	2	6	38444	38449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
528	NC_012853	CA	3	6	38528	38533	50 %	0 %	0 %	50 %	241518201
529	NC_012853	TGC	2	6	38546	38551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
530	NC_012853	AACC	2	8	38571	38578	50 %	0 %	0 %	50 %	241518201
531	NC_012853	TCG	2	6	38608	38613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
532	NC_012853	CCA	2	6	38620	38625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518201
533	NC_012853	GTC	2	6	38652	38657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
534	NC_012853	CTC	2	6	38685	38690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518201
535	NC_012853	CGT	2	6	38735	38740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
536	NC_012853	TGG	2	6	38762	38767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518201
537	NC_012853	CTC	2	6	38780	38785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518201
538	NC_012853	TCG	2	6	38788	38793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
539	NC_012853	CCGTG	2	10	38831	38840	0 %	20 %	40 %	40 %	241518201
540	NC_012853	GCAA	2	8	38850	38857	50 %	0 %	25 %	25 %	241518201
541	NC_012853	CAA	2	6	39104	39109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518201
542	NC_012853	TGCGGT	2	12	39169	39180	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241518201
543	NC_012853	CGA	2	6	39224	39229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518201
544	NC_012853	CA	3	6	39267	39272	50 %	0 %	0 %	50 %	241518201
545	NC_012853	GATC	2	8	39277	39284	25 %	25 %	25 %	25 %	241518201
546	NC_012853	GTC	2	6	39296	39301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518201
547	NC_012853	TGG	2	6	39307	39312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518201
548	NC_012853	ACG	2	6	39319	39324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518201
549	NC_012853	GACG	2	8	39378	39385	25 %	0 %	50 %	25 %	241518201
550	NC_012853	GCG	2	6	39448	39453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518201
551	NC_012853	CGAC	2	8	39604	39611	25 %	0 %	25 %	50 %	241518201
552	NC_012853	GGA	3	9	39841	39849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518202
553	NC_012853	CGA	2	6	40150	40155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
554	NC_012853	TAC	2	6	40156	40161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518203
555	NC_012853	CAG	2	6	40175	40180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
556	NC_012853	CGA	2	6	40186	40191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
557	NC_012853	GTC	2	6	40250	40255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518203
558	NC_012853	AAG	2	6	40304	40309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518203
559	NC_012853	GCCA	2	8	40313	40320	25 %	0 %	25 %	50 %	241518203
560	NC_012853	CG	3	6	40337	40342	0 %	0 %	50 %	50 %	241518203
561	NC_012853	CCG	2	6	40443	40448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518203
562	NC_012853	CGAT	2	8	40491	40498	25 %	25 %	25 %	25 %	241518203
563	NC_012853	CGG	2	6	40707	40712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518203
564	NC_012853	AAG	2	6	40727	40732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518203
565	NC_012853	CCG	2	6	40789	40794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518203
566	NC_012853	CAGC	2	8	40876	40883	25 %	0 %	25 %	50 %	241518203
567	NC_012853	CAT	2	6	40954	40959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518203
568	NC_012853	CAT	2	6	40999	41004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518203
569	NC_012853	CGA	2	6	41044	41049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
570	NC_012853	GTT	2	6	41054	41059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518203
571	NC_012853	GGA	2	6	41068	41073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518203
572	NC_012853	TGC	2	6	41134	41139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518203
573	NC_012853	GCG	2	6	41230	41235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518203
574	NC_012853	GGT	2	6	41252	41257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518203
575	NC_012853	ATCT	2	8	41270	41277	25 %	50 %	0 %	25 %	241518203
576	NC_012853	CAA	2	6	41479	41484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518203
577	NC_012853	CAG	2	6	41518	41523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
578	NC_012853	TCAT	2	8	41574	41581	25 %	50 %	0 %	25 %	241518203
579	NC_012853	AAC	2	6	41644	41649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518203
580	NC_012853	CGA	3	9	41653	41661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518203
581	NC_012853	TCA	2	6	42023	42028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518204
582	NC_012853	AAG	2	6	42034	42039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518204
583	NC_012853	CAC	2	6	42240	42245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518204
584	NC_012853	CGAC	2	8	42269	42276	25 %	0 %	25 %	50 %	241518204
585	NC_012853	TCT	2	6	42348	42353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518204
586	NC_012853	GGC	2	6	42379	42384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518204
587	NC_012853	GGTC	2	8	42530	42537	0 %	25 %	50 %	25 %	241518204
588	NC_012853	TCC	2	6	42596	42601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518204
589	NC_012853	GC	3	6	42622	42627	0 %	0 %	50 %	50 %	241518204
590	NC_012853	ATC	2	6	42784	42789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518204
591	NC_012853	CCG	2	6	42848	42853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518204
592	NC_012853	GGC	2	6	42855	42860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518204
593	NC_012853	GC	3	6	42879	42884	0 %	0 %	50 %	50 %	241518204
594	NC_012853	CTGGAC	2	12	42961	42972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518204
595	NC_012853	CAG	2	6	42985	42990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518204
596	NC_012853	CAC	2	6	43061	43066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518204
597	NC_012853	ACGC	2	8	43069	43076	25 %	0 %	25 %	50 %	241518204
598	NC_012853	TC	3	6	43153	43158	0 %	50 %	0 %	50 %	241518204
599	NC_012853	CAT	2	6	43249	43254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518204
600	NC_012853	G	6	6	43316	43321	0 %	0 %	100 %	0 %	241518204
601	NC_012853	CAT	2	6	43323	43328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518204
602	NC_012853	CT	3	6	43337	43342	0 %	50 %	0 %	50 %	241518204
603	NC_012853	AAT	2	6	43366	43371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518204
604	NC_012853	GCC	2	6	43440	43445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518204
605	NC_012853	CTT	2	6	43446	43451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518204
606	NC_012853	CA	3	6	43456	43461	50 %	0 %	0 %	50 %	241518204
607	NC_012853	TGA	2	6	43472	43477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518204
608	NC_012853	CAGA	2	8	43489	43496	50 %	0 %	25 %	25 %	241518204
609	NC_012853	CGC	2	6	43659	43664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518205
610	NC_012853	GCAG	2	8	43690	43697	25 %	0 %	50 %	25 %	241518205
611	NC_012853	CAAA	2	8	43756	43763	75 %	0 %	0 %	25 %	241518205
612	NC_012853	ATC	2	6	43826	43831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518205
613	NC_012853	TGG	2	6	43863	43868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518205
614	NC_012853	AAC	2	6	43884	43889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518205
615	NC_012853	TGCC	2	8	43898	43905	0 %	25 %	25 %	50 %	241518205
616	NC_012853	GAT	2	6	43955	43960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518205
617	NC_012853	CG	3	6	43995	44000	0 %	0 %	50 %	50 %	241518205
618	NC_012853	GACC	2	8	44058	44065	25 %	0 %	25 %	50 %	241518205
619	NC_012853	CAG	2	6	44102	44107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518205
620	NC_012853	CTC	2	6	44139	44144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518205
621	NC_012853	CAG	2	6	44169	44174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518205
622	NC_012853	CGC	2	6	44315	44320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518205
623	NC_012853	AGC	2	6	44382	44387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518205
624	NC_012853	A	6	6	44470	44475	100 %	0 %	0 %	0 %	241518205
625	NC_012853	AGA	2	6	44522	44527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518205
626	NC_012853	CGA	2	6	44553	44558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518205
627	NC_012853	GGCT	2	8	44643	44650	0 %	25 %	50 %	25 %	241518205
628	NC_012853	TGC	2	6	44653	44658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518205
629	NC_012853	CGT	2	6	44729	44734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518205
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643	NC_012853	GCG	2	6	45473	45478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518205
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863	NC_012853	TCCC	2	8	58024	58031	0 %	25 %	0 %	75 %	241518214
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