MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012853	CGA	2	6	328649	328654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5502	NC_012853	GCT	2	6	328659	328664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5503	NC_012853	GCG	2	6	328692	328697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5504	NC_012853	CGG	2	6	328720	328725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5505	NC_012853	GCA	2	6	328745	328750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5506	NC_012853	CGC	2	6	328768	328773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518461
5507	NC_012853	CGA	2	6	328781	328786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5508	NC_012853	GAG	2	6	328842	328847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5509	NC_012853	TGA	2	6	328864	328869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518461
5510	NC_012853	TCC	2	6	328881	328886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518461
5511	NC_012853	TCGGT	2	10	329075	329084	0 %	40 %	40 %	20 %	241518461
5512	NC_012853	TCG	2	6	329101	329106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5513	NC_012853	GCG	2	6	329207	329212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5514	NC_012853	CG	3	6	329211	329216	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5515	NC_012853	GCG	2	6	329236	329241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5516	NC_012853	CTG	2	6	329286	329291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5517	NC_012853	AGCA	2	8	329323	329330	50 %	0 %	25 %	25 %	241518461
5518	NC_012853	CG	4	8	329348	329355	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5519	NC_012853	GC	3	6	329389	329394	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5520	NC_012853	GAC	3	9	329448	329456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5521	NC_012853	TTC	2	6	329547	329552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518461
5522	NC_012853	GGC	2	6	329567	329572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5523	NC_012853	GAA	2	6	329628	329633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518461
5524	NC_012853	CAT	2	6	329643	329648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518461
5525	NC_012853	GC	4	8	329664	329671	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5526	NC_012853	TGC	2	6	329676	329681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5527	NC_012853	GCT	2	6	329723	329728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5528	NC_012853	CAC	2	6	329733	329738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518461
5529	NC_012853	GAA	2	6	329759	329764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518461
5530	NC_012853	GC	3	6	329844	329849	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5531	NC_012853	GC	4	8	329874	329881	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5532	NC_012853	TCA	2	6	329894	329899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518461
5533	NC_012853	CGC	2	6	329921	329926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518461
5534	NC_012853	CG	3	6	329981	329986	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5535	NC_012853	GCT	2	6	329989	329994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5536	NC_012853	GAA	2	6	330060	330065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518461
5537	NC_012853	AAC	2	6	330106	330111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518461
5538	NC_012853	TTC	2	6	330163	330168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518461
5539	NC_012853	GGCG	2	8	330209	330216	0 %	0 %	75 %	25 %	241518461
5540	NC_012853	TTG	2	6	330228	330233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518461
5541	NC_012853	ACG	2	6	330276	330281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5542	NC_012853	GGC	2	6	330282	330287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5543	NC_012853	GGT	3	9	330293	330301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518461
5544	NC_012853	CGT	2	6	330380	330385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5545	NC_012853	CGA	2	6	330389	330394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5546	NC_012853	CAC	2	6	330438	330443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518461
5547	NC_012853	AAC	2	6	330513	330518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518461
5548	NC_012853	GCT	2	6	330563	330568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5549	NC_012853	CAT	2	6	330662	330667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518461
5550	NC_012853	ACG	2	6	330712	330717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5551	NC_012853	TCC	2	6	330721	330726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518461
5552	NC_012853	TGG	2	6	330730	330735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518461
5553	NC_012853	GGAC	2	8	330775	330782	25 %	0 %	50 %	25 %	241518461
5554	NC_012853	GCCG	2	8	330788	330795	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5555	NC_012853	GGTC	2	8	330844	330851	0 %	25 %	50 %	25 %	241518461
5556	NC_012853	AGA	2	6	330923	330928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518461
5557	NC_012853	GAG	2	6	331005	331010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5558	NC_012853	CGC	2	6	331109	331114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518461
5559	NC_012853	GGC	2	6	331133	331138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5560	NC_012853	CCG	2	6	331161	331166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518461
5561	NC_012853	GGA	2	6	331172	331177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5562	NC_012853	AAG	2	6	331257	331262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518461
5563	NC_012853	CGA	2	6	331372	331377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5564	NC_012853	GAT	2	6	331454	331459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518461
5565	NC_012853	GTC	2	6	331524	331529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5566	NC_012853	ACC	2	6	331596	331601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518461
5567	NC_012853	ATC	2	6	331644	331649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518461
5568	NC_012853	GCG	2	6	331698	331703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5569	NC_012853	CT	3	6	332123	332128	0 %	50 %	0 %	50 %	241518462
5570	NC_012853	TCC	2	6	332150	332155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518462
5571	NC_012853	AGG	2	6	332257	332262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518462
5572	NC_012853	GCTTG	3	15	332270	332284	0 %	40 %	40 %	20 %	241518462
5573	NC_012853	TCA	2	6	332295	332300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518462
5574	NC_012853	GGC	2	6	332342	332347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518462
5575	NC_012853	TCGATT	2	12	332423	332434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	241518462
5576	NC_012853	CGG	2	6	333187	333192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518463
5577	NC_012853	GCC	2	6	333237	333242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518463
5578	NC_012853	CA	3	6	333292	333297	50 %	0 %	0 %	50 %	241518463
5579	NC_012853	GGC	2	6	333864	333869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518464
5580	NC_012853	CAT	2	6	333870	333875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518464
5581	NC_012853	CCG	2	6	333902	333907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518464
5582	NC_012853	AGG	2	6	333908	333913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518464
5583	NC_012853	GATC	2	8	334411	334418	25 %	25 %	25 %	25 %	241518465
5584	NC_012853	ATCA	2	8	334441	334448	50 %	25 %	0 %	25 %	241518465
5585	NC_012853	CGT	2	6	334456	334461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518465
5586	NC_012853	TCC	2	6	334508	334513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518465
5587	NC_012853	CGGCGC	2	12	334548	334559	0 %	0 %	50 %	50 %	241518465
5588	NC_012853	GC	4	8	334556	334563	0 %	0 %	50 %	50 %	241518465
5589	NC_012853	GCA	2	6	334614	334619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518465
5590	NC_012853	GCGCCA	2	12	334656	334667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241518465
5591	NC_012853	TGA	2	6	334752	334757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518465
5592	NC_012853	GAA	2	6	334801	334806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518465
5593	NC_012853	TCA	2	6	334827	334832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518465
5594	NC_012853	AGC	2	6	334843	334848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518465
5595	NC_012853	CG	3	6	334934	334939	0 %	0 %	50 %	50 %	241518465
5596	NC_012853	GCC	2	6	334970	334975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518465
5597	NC_012853	CCCT	2	8	335099	335106	0 %	25 %	0 %	75 %	241518465
5598	NC_012853	CG	3	6	335139	335144	0 %	0 %	50 %	50 %	241518465
5599	NC_012853	CCG	2	6	335421	335426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518466
5600	NC_012853	CT	3	6	335428	335433	0 %	50 %	0 %	50 %	241518466
5601	NC_012853	AGG	2	6	335452	335457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518466
5602	NC_012853	GCC	2	6	335503	335508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518466
5603	NC_012853	CGG	2	6	335623	335628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518466
5604	NC_012853	GCA	2	6	335633	335638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518466
5605	NC_012853	CGG	2	6	335671	335676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518466
5606	NC_012853	ACCGAT	2	12	335754	335765	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241518466
5607	NC_012853	CG	3	6	335771	335776	0 %	0 %	50 %	50 %	241518466
5608	NC_012853	GAT	2	6	335849	335854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518466
5609	NC_012853	TTC	2	6	335977	335982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518467
5610	NC_012853	CATC	2	8	336015	336022	25 %	25 %	0 %	50 %	241518467
5611	NC_012853	ATC	2	6	336032	336037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518467
5612	NC_012853	CCA	2	6	336045	336050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518467
5613	NC_012853	CGA	2	6	336254	336259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518468
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5615	NC_012853	TCA	2	6	336311	336316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518468
5616	NC_012853	GC	3	6	336360	336365	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
5617	NC_012853	GC	3	6	336376	336381	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
5618	NC_012853	GCG	2	6	336400	336405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518468
5619	NC_012853	AGCG	2	8	336493	336500	25 %	0 %	50 %	25 %	241518468
5620	NC_012853	CG	3	6	336499	336504	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
5621	NC_012853	GC	3	6	336624	336629	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
5622	NC_012853	GC	3	6	336669	336674	0 %	0 %	50 %	50 %	241518468
5623	NC_012853	GAAG	2	8	336765	336772	50 %	0 %	50 %	0 %	241518468
5624	NC_012853	CGT	2	6	336779	336784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
5625	NC_012853	GCT	2	6	336809	336814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518468
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5740	NC_012853	CGA	2	6	343951	343956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518475
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5745	NC_012853	TGC	2	6	344377	344382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518475
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5974	NC_012853	CGGCGC	2	12	360663	360674	0 %	0 %	50 %	50 %	241518491
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5979	NC_012853	GCC	2	6	360829	360834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518491
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5981	NC_012853	AGG	2	6	360851	360856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518491
5982	NC_012853	AGC	2	6	360865	360870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518492
5983	NC_012853	GCC	2	6	360876	360881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518492
5984	NC_012853	GCC	2	6	360958	360963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518492
5985	NC_012853	CAG	2	6	361027	361032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518492
5986	NC_012853	CAT	2	6	361060	361065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518493
5987	NC_012853	CATC	2	8	361071	361078	25 %	25 %	0 %	50 %	241518493
5988	NC_012853	GGC	2	6	361092	361097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518493
5989	NC_012853	AGC	2	6	361116	361121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518493
5990	NC_012853	CGC	2	6	361126	361131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518493
5991	NC_012853	A	6	6	361139	361144	100 %	0 %	0 %	0 %	241518493
5992	NC_012853	CGG	2	6	361150	361155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518493
5993	NC_012853	GCG	2	6	361177	361182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518493
5994	NC_012853	GAG	2	6	361189	361194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518493
5995	NC_012853	CCA	2	6	361211	361216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518493
5996	NC_012853	ATG	3	9	361222	361230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518493
5997	NC_012853	CTT	2	6	361709	361714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518494
5998	NC_012853	TCC	2	6	361801	361806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518494
5999	NC_012853	CGG	2	6	361867	361872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518494
6000	NC_012853	A	6	6	361879	361884	100 %	0 %	0 %	0 %	241518494

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