MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012853	GAG	2	6	292444	292449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518432
5002	NC_012853	TGG	2	6	292470	292475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518432
5003	NC_012853	GGA	2	6	292590	292595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518432
5004	NC_012853	GGCC	2	8	292626	292633	0 %	0 %	50 %	50 %	241518432
5005	NC_012853	CGA	2	6	292650	292655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518432
5006	NC_012853	CAGA	2	8	292813	292820	50 %	0 %	25 %	25 %	241518433
5007	NC_012853	CCCG	2	8	292849	292856	0 %	0 %	25 %	75 %	241518433
5008	NC_012853	CGC	2	6	292866	292871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518433
5009	NC_012853	CGC	2	6	292878	292883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518433
5010	NC_012853	TCA	2	6	292901	292906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518433
5011	NC_012853	CCAA	2	8	293046	293053	50 %	0 %	0 %	50 %	241518433
5012	NC_012853	TCG	2	6	293063	293068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518433
5013	NC_012853	AAC	2	6	293129	293134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518433
5014	NC_012853	TCA	2	6	293333	293338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518433
5015	NC_012853	TCT	2	6	293342	293347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518433
5016	NC_012853	ACA	2	6	293378	293383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518433
5017	NC_012853	CCGA	2	8	293389	293396	25 %	0 %	25 %	50 %	241518433
5018	NC_012853	GCG	2	6	293695	293700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518434
5019	NC_012853	GTCACG	2	12	293713	293724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518434
5020	NC_012853	CCA	2	6	293733	293738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518434
5021	NC_012853	GAA	2	6	293752	293757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518434
5022	NC_012853	AAG	2	6	293767	293772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518434
5023	NC_012853	GTC	2	6	293797	293802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518434
5024	NC_012853	GGCG	2	8	293811	293818	0 %	0 %	75 %	25 %	241518434
5025	NC_012853	AAG	2	6	293891	293896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518434
5026	NC_012853	GTC	2	6	293902	293907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518434
5027	NC_012853	TACGG	2	10	294053	294062	20 %	20 %	40 %	20 %	241518434
5028	NC_012853	GCG	2	6	294076	294081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518434
5029	NC_012853	GAT	2	6	294087	294092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518434
5030	NC_012853	TGGCCG	2	12	294113	294124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241518434
5031	NC_012853	CGA	2	6	294162	294167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518434
5032	NC_012853	TGGC	2	8	294238	294245	0 %	25 %	50 %	25 %	241518434
5033	NC_012853	CGC	2	6	294251	294256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518434
5034	NC_012853	GGC	2	6	294265	294270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518434
5035	NC_012853	CGC	2	6	294315	294320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518434
5036	NC_012853	TCG	2	6	294359	294364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518434
5037	NC_012853	AAG	2	6	294457	294462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518434
5038	NC_012853	AGG	2	6	294494	294499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518434
5039	NC_012853	CTGCG	2	10	294693	294702	0 %	20 %	40 %	40 %	241518435
5040	NC_012853	TCA	2	6	294882	294887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518435
5041	NC_012853	AAG	2	6	294925	294930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518435
5042	NC_012853	ATC	2	6	294947	294952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518435
5043	NC_012853	CG	3	6	295153	295158	0 %	0 %	50 %	50 %	241518435
5044	NC_012853	CGA	2	6	295260	295265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518435
5045	NC_012853	CAT	3	9	295338	295346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518435
5046	NC_012853	CCTC	2	8	295370	295377	0 %	25 %	0 %	75 %	241518435
5047	NC_012853	CGG	3	9	295392	295400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518435
5048	NC_012853	AGC	2	6	295658	295663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518436
5049	NC_012853	CAA	2	6	295777	295782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518436
5050	NC_012853	GCA	2	6	295905	295910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518436
5051	NC_012853	CCG	2	6	295976	295981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518436
5052	NC_012853	CG	4	8	296094	296101	0 %	0 %	50 %	50 %	241518436
5053	NC_012853	TGA	2	6	296118	296123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518436
5054	NC_012853	GCG	2	6	296234	296239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518436
5055	NC_012853	GTC	2	6	296254	296259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518436
5056	NC_012853	ATGACG	2	12	296420	296431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241518436
5057	NC_012853	ACA	2	6	296471	296476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518436
5058	NC_012853	GGA	2	6	297171	297176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518437
5059	NC_012853	CGA	2	6	297232	297237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518437
5060	NC_012853	TCA	2	6	297302	297307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518437
5061	NC_012853	TTC	2	6	298896	298901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518438
5062	NC_012853	CAC	2	6	298921	298926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518438
5063	NC_012853	GCT	2	6	298941	298946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5064	NC_012853	ATTT	2	8	298998	299005	25 %	75 %	0 %	0 %	241518438
5065	NC_012853	TCG	2	6	299020	299025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5066	NC_012853	TGG	2	6	299090	299095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518438
5067	NC_012853	CTCTC	2	10	299228	299237	0 %	40 %	0 %	60 %	241518438
5068	NC_012853	CCG	2	6	299323	299328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518438
5069	NC_012853	TCA	2	6	299331	299336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518438
5070	NC_012853	CGG	3	9	299339	299347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518438
5071	NC_012853	GGC	2	6	299348	299353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518438
5072	NC_012853	ATC	2	6	299400	299405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518438
5073	NC_012853	CAA	2	6	299411	299416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518438
5074	NC_012853	CGG	2	6	299451	299456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518438
5075	NC_012853	GCT	2	6	299489	299494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5076	NC_012853	CGT	2	6	299511	299516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5077	NC_012853	TC	3	6	299624	299629	0 %	50 %	0 %	50 %	241518438
5078	NC_012853	GAA	2	6	299703	299708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518438
5079	NC_012853	GC	3	6	299954	299959	0 %	0 %	50 %	50 %	241518438
5080	NC_012853	GAT	2	6	299975	299980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518438
5081	NC_012853	CTA	2	6	299990	299995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518438
5082	NC_012853	CAG	2	6	300028	300033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5083	NC_012853	GAT	2	6	300059	300064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518438
5084	NC_012853	TCG	2	6	300070	300075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518438
5085	NC_012853	GGT	2	6	300083	300088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518438
5086	NC_012853	TGT	2	6	300098	300103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518438
5087	NC_012853	TCC	2	6	300112	300117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518438
5088	NC_012853	AG	3	6	300140	300145	50 %	0 %	50 %	0 %	241518438
5089	NC_012853	ACC	2	6	300650	300655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518439
5090	NC_012853	TCG	2	6	300720	300725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518439
5091	NC_012853	GC	3	6	300827	300832	0 %	0 %	50 %	50 %	241518439
5092	NC_012853	CGC	2	6	300862	300867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518439
5093	NC_012853	AAG	2	6	300872	300877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518439
5094	NC_012853	GAT	2	6	301270	301275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518440
5095	NC_012853	CGA	2	6	301294	301299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518440
5096	NC_012853	GGA	2	6	301415	301420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518440
5097	NC_012853	CGC	2	6	301448	301453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518440
5098	NC_012853	TTG	2	6	301734	301739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241518441
5099	NC_012853	TCC	2	6	301747	301752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518441
5100	NC_012853	AGC	2	6	301756	301761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518441
5101	NC_012853	AGC	2	6	301796	301801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518441
5102	NC_012853	GTC	2	6	302205	302210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5103	NC_012853	GTC	2	6	302226	302231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5104	NC_012853	ATC	2	6	302379	302384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518442
5105	NC_012853	GGTCA	2	10	302406	302415	20 %	20 %	40 %	20 %	241518442
5106	NC_012853	GAT	2	6	302478	302483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518442
5107	NC_012853	TCG	2	6	302500	302505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5108	NC_012853	CAG	2	6	302553	302558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5109	NC_012853	GAG	2	6	302578	302583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518442
5110	NC_012853	GAT	2	6	302655	302660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518442
5111	NC_012853	AT	3	6	302681	302686	50 %	50 %	0 %	0 %	241518442
5112	NC_012853	GCA	2	6	302735	302740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5113	NC_012853	GGT	2	6	302745	302750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518442
5114	NC_012853	CCCTG	2	10	302871	302880	0 %	20 %	20 %	60 %	241518442
5115	NC_012853	CGA	2	6	303023	303028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518442
5116	NC_012853	GAC	2	6	303168	303173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518443
5117	NC_012853	TC	4	8	303190	303197	0 %	50 %	0 %	50 %	241518443
5118	NC_012853	GATC	2	8	303223	303230	25 %	25 %	25 %	25 %	241518443
5119	NC_012853	GA	3	6	303251	303256	50 %	0 %	50 %	0 %	241518443
5120	NC_012853	CG	3	6	303347	303352	0 %	0 %	50 %	50 %	241518443
5121	NC_012853	CCAAAG	2	12	303353	303364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	241518443
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5152	NC_012853	CG	3	6	305894	305899	0 %	0 %	50 %	50 %	241518444
5153	NC_012853	TGC	2	6	305956	305961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518444
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5241	NC_012853	ACT	2	6	311752	311757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518447
5242	NC_012853	GCA	2	6	311789	311794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518447
5243	NC_012853	GCGA	2	8	311856	311863	25 %	0 %	50 %	25 %	241518447
5244	NC_012853	GC	3	6	311893	311898	0 %	0 %	50 %	50 %	241518447
5245	NC_012853	GGC	2	6	311936	311941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518447
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5351	NC_012853	CCTGC	2	10	317131	317140	0 %	20 %	20 %	60 %	241518451
5352	NC_012853	CGA	2	6	317143	317148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518451
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5356	NC_012853	CAT	2	6	317224	317229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
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5359	NC_012853	CTA	2	6	317392	317397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518451
5360	NC_012853	CGT	2	6	317398	317403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518451
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5362	NC_012853	CA	3	6	317540	317545	50 %	0 %	0 %	50 %	241518452
5363	NC_012853	CGT	2	6	317583	317588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518452
5364	NC_012853	CG	3	6	317640	317645	0 %	0 %	50 %	50 %	241518452
5365	NC_012853	GCGAG	2	10	317655	317664	20 %	0 %	60 %	20 %	241518452
5366	NC_012853	TCA	2	6	317693	317698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518452
5367	NC_012853	CAT	3	9	317804	317812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518453
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5369	NC_012853	CCTT	2	8	317875	317882	0 %	50 %	0 %	50 %	241518453
5370	NC_012853	ACA	2	6	317911	317916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518453
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5379	NC_012853	ATG	2	6	318267	318272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518453
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5382	NC_012853	CCG	2	6	318453	318458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518454
5383	NC_012853	GTC	2	6	318491	318496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518454
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5385	NC_012853	GGT	2	6	318545	318550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518455
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5387	NC_012853	CGT	2	6	318691	318696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518455
5388	NC_012853	TGC	2	6	318773	318778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518455
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5392	NC_012853	C	6	6	320516	320521	0 %	0 %	0 %	100 %	241518456
5393	NC_012853	GGA	2	6	320578	320583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518456
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5395	NC_012853	A	6	6	320666	320671	100 %	0 %	0 %	0 %	241518456
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5400	NC_012853	CGA	2	6	320785	320790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518456
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5483	NC_012853	TCGC	2	8	327924	327931	0 %	25 %	25 %	50 %	241518461
5484	NC_012853	CGT	2	6	328019	328024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5485	NC_012853	CG	3	6	328046	328051	0 %	0 %	50 %	50 %	241518461
5486	NC_012853	GCA	2	6	328079	328084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5487	NC_012853	CCG	2	6	328174	328179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518461
5488	NC_012853	AGG	2	6	328240	328245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5489	NC_012853	GGA	2	6	328265	328270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5490	NC_012853	GCG	2	6	328311	328316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518461
5491	NC_012853	CGA	2	6	328337	328342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518461
5492	NC_012853	CAGC	2	8	328361	328368	25 %	0 %	25 %	50 %	241518461
5493	NC_012853	GAG	2	6	328401	328406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518461
5494	NC_012853	CTG	2	6	328431	328436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
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5496	NC_012853	GCT	2	6	328505	328510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518461
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5499	NC_012853	GGCT	2	8	328615	328622	0 %	25 %	50 %	25 %	241518461
5500	NC_012853	CT	3	6	328639	328644	0 %	50 %	0 %	50 %	241518461

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