MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132503

Total Repeats: 8295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012853	GCG	2	6	265485	265490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518408
4502	NC_012853	CG	3	6	265523	265528	0 %	0 %	50 %	50 %	241518408
4503	NC_012853	GCCG	2	8	265644	265651	0 %	0 %	50 %	50 %	241518408
4504	NC_012853	GCG	2	6	265709	265714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518408
4505	NC_012853	TCC	2	6	265783	265788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518408
4506	NC_012853	CGG	2	6	265835	265840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518408
4507	NC_012853	ATG	2	6	265879	265884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518408
4508	NC_012853	TCACG	2	10	265956	265965	20 %	20 %	20 %	40 %	241518409
4509	NC_012853	CGCC	2	8	266027	266034	0 %	0 %	25 %	75 %	241518409
4510	NC_012853	TCG	2	6	266039	266044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518409
4511	NC_012853	CG	3	6	266094	266099	0 %	0 %	50 %	50 %	241518409
4512	NC_012853	ACG	2	6	266159	266164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518409
4513	NC_012853	TCG	2	6	266204	266209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518409
4514	NC_012853	GCC	2	6	266236	266241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518409
4515	NC_012853	CTC	3	9	266356	266364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518409
4516	NC_012853	CG	3	6	266367	266372	0 %	0 %	50 %	50 %	241518409
4517	NC_012853	CGA	2	6	266442	266447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518409
4518	NC_012853	TTC	2	6	266456	266461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518409
4519	NC_012853	GCG	2	6	266586	266591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518409
4520	NC_012853	CGTC	2	8	266630	266637	0 %	25 %	25 %	50 %	241518409
4521	NC_012853	CTC	2	6	266662	266667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518409
4522	NC_012853	G	6	6	266723	266728	0 %	0 %	100 %	0 %	241518409
4523	NC_012853	TCA	2	6	266778	266783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518409
4524	NC_012853	CGA	2	6	266810	266815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4525	NC_012853	CG	3	6	266875	266880	0 %	0 %	50 %	50 %	241518410
4526	NC_012853	GC	4	8	266981	266988	0 %	0 %	50 %	50 %	241518410
4527	NC_012853	GAT	2	6	267003	267008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518410
4528	NC_012853	AGC	2	6	267076	267081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4529	NC_012853	GAT	2	6	267084	267089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518410
4530	NC_012853	CGGA	2	8	267253	267260	25 %	0 %	50 %	25 %	241518410
4531	NC_012853	GCC	2	6	267262	267267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518410
4532	NC_012853	ACC	2	6	267298	267303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518410
4533	NC_012853	TGA	2	6	267394	267399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518410
4534	NC_012853	CGA	2	6	267497	267502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4535	NC_012853	CTTCGG	2	12	267515	267526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4536	NC_012853	CGG	2	6	267542	267547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518410
4537	NC_012853	CG	3	6	267554	267559	0 %	0 %	50 %	50 %	241518410
4538	NC_012853	GTC	2	6	267606	267611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4539	NC_012853	GGGC	2	8	267629	267636	0 %	0 %	75 %	25 %	241518410
4540	NC_012853	GAC	2	6	267729	267734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518410
4541	NC_012853	AAG	2	6	267807	267812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518410
4542	NC_012853	GCC	2	6	267868	267873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518411
4543	NC_012853	AGG	2	6	267881	267886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241518411
4544	NC_012853	ACGA	2	8	267899	267906	50 %	0 %	25 %	25 %	241518411
4545	NC_012853	CGA	2	6	267913	267918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518411
4546	NC_012853	GGC	4	12	267928	267939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518411
4547	NC_012853	TCA	2	6	267947	267952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518411
4548	NC_012853	GCC	2	6	268001	268006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518411
4549	NC_012853	GCA	2	6	268026	268031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518411
4550	NC_012853	TGCGA	2	10	268181	268190	20 %	20 %	40 %	20 %	241518411
4551	NC_012853	GAC	2	6	268195	268200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518411
4552	NC_012853	CCG	3	9	268205	268213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518411
4553	NC_012853	ATC	2	6	268220	268225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518411
4554	NC_012853	GTCGA	2	10	268357	268366	20 %	20 %	40 %	20 %	241518411
4555	NC_012853	CG	3	6	268393	268398	0 %	0 %	50 %	50 %	241518411
4556	NC_012853	ACCG	2	8	268399	268406	25 %	0 %	25 %	50 %	241518411
4557	NC_012853	GCG	2	6	268528	268533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518411
4558	NC_012853	ACC	2	6	268577	268582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518411
4559	NC_012853	ATG	2	6	268613	268618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518411
4560	NC_012853	TGC	2	6	268639	268644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4561	NC_012853	TTC	2	6	268700	268705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518412
4562	NC_012853	CGT	2	6	268706	268711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4563	NC_012853	ATG	2	6	268741	268746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518412
4564	NC_012853	GAC	2	6	268758	268763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4565	NC_012853	AGTC	2	8	268784	268791	25 %	25 %	25 %	25 %	241518412
4566	NC_012853	TGC	2	6	268823	268828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4567	NC_012853	CGG	2	6	268919	268924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518412
4568	NC_012853	GCC	2	6	268956	268961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518412
4569	NC_012853	CAG	2	6	268970	268975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4570	NC_012853	GCCC	2	8	269045	269052	0 %	0 %	25 %	75 %	241518412
4571	NC_012853	GAA	2	6	269089	269094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518412
4572	NC_012853	A	6	6	269093	269098	100 %	0 %	0 %	0 %	241518412
4573	NC_012853	GGC	3	9	269158	269166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518412
4574	NC_012853	GA	3	6	269188	269193	50 %	0 %	50 %	0 %	241518412
4575	NC_012853	GCG	2	6	269277	269282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518412
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4578	NC_012853	TCG	2	6	269542	269547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4579	NC_012853	TCG	2	6	269617	269622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4580	NC_012853	CGA	2	6	269648	269653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4581	NC_012853	GC	3	6	269692	269697	0 %	0 %	50 %	50 %	241518412
4582	NC_012853	CGA	2	6	269711	269716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
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4584	NC_012853	CCTTC	2	10	269822	269831	0 %	40 %	0 %	60 %	241518412
4585	NC_012853	GCT	2	6	269837	269842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4586	NC_012853	CGC	2	6	269867	269872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518412
4587	NC_012853	GCA	2	6	269876	269881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4588	NC_012853	TCTG	2	8	269972	269979	0 %	50 %	25 %	25 %	241518412
4589	NC_012853	ACG	2	6	270006	270011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518412
4590	NC_012853	GGCG	2	8	270033	270040	0 %	0 %	75 %	25 %	241518412
4591	NC_012853	TCC	2	6	270050	270055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518413
4592	NC_012853	CAAGG	2	10	270061	270070	40 %	0 %	40 %	20 %	241518413
4593	NC_012853	TGG	2	6	270073	270078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241518413
4594	NC_012853	GCAG	2	8	270107	270114	25 %	0 %	50 %	25 %	241518413
4595	NC_012853	CGC	2	6	270133	270138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518413
4596	NC_012853	GAAG	2	8	270148	270155	50 %	0 %	50 %	0 %	241518413
4597	NC_012853	GCG	2	6	270189	270194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518413
4598	NC_012853	ATG	2	6	270207	270212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518413
4599	NC_012853	AGC	2	6	270231	270236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4600	NC_012853	GGC	2	6	270262	270267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518413
4601	NC_012853	ACCG	2	8	270296	270303	25 %	0 %	25 %	50 %	241518413
4602	NC_012853	TGC	2	6	270386	270391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4603	NC_012853	GAGC	2	8	270475	270482	25 %	0 %	50 %	25 %	241518413
4604	NC_012853	GCC	2	6	270485	270490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518413
4605	NC_012853	CACCGC	2	12	270515	270526	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241518413
4606	NC_012853	GAC	2	6	270608	270613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4607	NC_012853	CGA	2	6	270631	270636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4608	NC_012853	GCC	2	6	270637	270642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518413
4609	NC_012853	AAG	2	6	270752	270757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518413
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4613	NC_012853	GCAG	2	8	270961	270968	25 %	0 %	50 %	25 %	241518413
4614	NC_012853	AGC	2	6	271016	271021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4615	NC_012853	GAC	2	6	271064	271069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
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4619	NC_012853	CGA	2	6	271207	271212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518413
4620	NC_012853	CAT	2	6	271295	271300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518413
4621	NC_012853	GGC	2	6	271336	271341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518414
4622	NC_012853	TGC	2	6	271422	271427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4623	NC_012853	CGG	2	6	271464	271469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518414
4624	NC_012853	CG	3	6	271515	271520	0 %	0 %	50 %	50 %	241518414
4625	NC_012853	GA	3	6	271553	271558	50 %	0 %	50 %	0 %	241518414
4626	NC_012853	TGA	2	6	271686	271691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518414
4627	NC_012853	GAA	2	6	271728	271733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518414
4628	NC_012853	CGA	2	6	271788	271793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4629	NC_012853	CCG	2	6	271806	271811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518414
4630	NC_012853	GCT	2	6	271836	271841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4631	NC_012853	CCG	2	6	271847	271852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518414
4632	NC_012853	ACG	2	6	271972	271977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518414
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4635	NC_012853	GCCA	2	8	272098	272105	25 %	0 %	25 %	50 %	241518414
4636	NC_012853	GC	3	6	272149	272154	0 %	0 %	50 %	50 %	241518414
4637	NC_012853	CGG	2	6	272252	272257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518414
4638	NC_012853	ATC	2	6	272312	272317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518414
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4640	NC_012853	AGCG	2	8	272518	272525	25 %	0 %	50 %	25 %	241518414
4641	NC_012853	CG	3	6	272574	272579	0 %	0 %	50 %	50 %	241518414
4642	NC_012853	CGGC	2	8	272593	272600	0 %	0 %	50 %	50 %	241518414
4643	NC_012853	ATG	2	6	272648	272653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518414
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4646	NC_012853	TCG	2	6	272792	272797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4647	NC_012853	AGC	2	6	272798	272803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4648	NC_012853	AGCA	2	8	272818	272825	50 %	0 %	25 %	25 %	241518414
4649	NC_012853	TCA	2	6	272886	272891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518414
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4651	NC_012853	GCC	2	6	273060	273065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518414
4652	NC_012853	GGC	2	6	273091	273096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518414
4653	NC_012853	TGC	2	6	273126	273131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518414
4654	NC_012853	CAA	2	6	273138	273143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518414
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4657	NC_012853	GA	3	6	273248	273253	50 %	0 %	50 %	0 %	241518414
4658	NC_012853	ACC	2	6	273266	273271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518414
4659	NC_012853	CGAT	2	8	273329	273336	25 %	25 %	25 %	25 %	241518414
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4662	NC_012853	GGC	2	6	273541	273546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518415
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4681	NC_012853	AAG	2	6	274119	274124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241518415
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4728	NC_012853	GTC	2	6	276670	276675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518417
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4741	NC_012853	CG	3	6	277609	277614	0 %	0 %	50 %	50 %	241518418
4742	NC_012853	TGC	2	6	277638	277643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518418
4743	NC_012853	CAT	2	6	277680	277685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518418
4744	NC_012853	CGA	2	6	277707	277712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518418
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4746	NC_012853	GTC	2	6	277743	277748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241518418
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4846	NC_012853	CTGG	2	8	283007	283014	0 %	25 %	50 %	25 %	241518423
4847	NC_012853	AAT	2	6	283027	283032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241518423
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4849	NC_012853	GCGGA	2	10	283053	283062	20 %	0 %	60 %	20 %	241518423
4850	NC_012853	CAC	2	6	283063	283068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518423
4851	NC_012853	AGCGCT	2	12	283074	283085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241518423
4852	NC_012853	CAA	2	6	283093	283098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518423
4853	NC_012853	CAAGC	2	10	283229	283238	40 %	0 %	20 %	40 %	241518424
4854	NC_012853	CGC	2	6	283255	283260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518424
4855	NC_012853	G	6	6	283360	283365	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
4856	NC_012853	GCA	2	6	283386	283391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518424
4857	NC_012853	GGC	2	6	283447	283452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518424
4858	NC_012853	GAT	2	6	283453	283458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518424
4859	NC_012853	TCA	2	6	283569	283574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241518424
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4861	NC_012853	GGAT	2	8	283694	283701	25 %	25 %	50 %	0 %	241518424
4862	NC_012853	GCG	2	6	283746	283751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518424
4863	NC_012853	G	6	6	283866	283871	0 %	0 %	100 %	0 %	241518424
4864	NC_012853	GC	3	6	283903	283908	0 %	0 %	50 %	50 %	241518424
4865	NC_012853	TCCG	2	8	283923	283930	0 %	25 %	25 %	50 %	241518424
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4982	NC_012853	CAC	2	6	291472	291477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241518431
4983	NC_012853	GCG	2	6	291490	291495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518431
4984	NC_012853	GAC	3	9	291590	291598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518431
4985	NC_012853	GAT	2	6	291637	291642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518431
4986	NC_012853	CGG	2	6	291697	291702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518431
4987	NC_012853	GCC	2	6	291744	291749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518431
4988	NC_012853	CGG	2	6	291759	291764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241518431
4989	NC_012853	CTT	2	6	292008	292013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241518432
4990	NC_012853	GGCG	2	8	292065	292072	0 %	0 %	75 %	25 %	241518432
4991	NC_012853	CGAG	2	8	292112	292119	25 %	0 %	50 %	25 %	241518432
4992	NC_012853	CGC	2	6	292124	292129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518432
4993	NC_012853	AAC	2	6	292133	292138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241518432
4994	NC_012853	CGA	2	6	292232	292237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518432
4995	NC_012853	CCT	2	6	292242	292247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518432
4996	NC_012853	GAC	2	6	292288	292293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241518432
4997	NC_012853	GC	3	6	292322	292327	0 %	0 %	50 %	50 %	241518432
4998	NC_012853	GCC	2	6	292338	292343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241518432
4999	NC_012853	ATG	2	6	292399	292404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241518432
5000	NC_012853	CCT	2	6	292436	292441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241518432

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