MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012852	CGC	2	6	179383	179388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3502	NC_012852	CACC	2	8	179389	179396	25 %	0 %	0 %	75 %	241258757
3503	NC_012852	GCG	2	6	179406	179411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3504	NC_012852	CCG	2	6	179421	179426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3505	NC_012852	CGGCG	2	10	179454	179463	0 %	0 %	60 %	40 %	241258757
3506	NC_012852	AGC	2	6	179493	179498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3507	NC_012852	TGC	2	6	179557	179562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3508	NC_012852	GCG	2	6	179622	179627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3509	NC_012852	CAT	2	6	179638	179643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258757
3510	NC_012852	GCCGCG	2	12	179649	179660	0 %	0 %	50 %	50 %	241258757
3511	NC_012852	GCC	2	6	179668	179673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258757
3512	NC_012852	CAT	2	6	179680	179685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258757
3513	NC_012852	GAC	2	6	179693	179698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3514	NC_012852	GGC	2	6	179716	179721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258757
3515	NC_012852	CTG	2	6	179780	179785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3516	NC_012852	TCG	2	6	179796	179801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258757
3517	NC_012852	AGA	2	6	179849	179854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258757
3518	NC_012852	TGA	2	6	179864	179869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258757
3519	NC_012852	CGC	3	9	179883	179891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258758
3520	NC_012852	GC	3	6	179978	179983	0 %	0 %	50 %	50 %	241258758
3521	NC_012852	AGG	2	6	180031	180036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258758
3522	NC_012852	GCT	2	6	180060	180065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3523	NC_012852	AG	3	6	180099	180104	50 %	0 %	50 %	0 %	241258758
3524	NC_012852	GGC	2	6	180124	180129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258758
3525	NC_012852	GTC	2	6	180136	180141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3526	NC_012852	GTC	2	6	180208	180213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3527	NC_012852	ACG	2	6	180242	180247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3528	NC_012852	CCG	2	6	180248	180253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258758
3529	NC_012852	CGG	3	9	180279	180287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258758
3530	NC_012852	CCG	2	6	180326	180331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258758
3531	NC_012852	CGA	2	6	180381	180386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3532	NC_012852	CGC	2	6	180433	180438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258758
3533	NC_012852	TCGT	2	8	180461	180468	0 %	50 %	25 %	25 %	241258758
3534	NC_012852	TGC	2	6	180480	180485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3535	NC_012852	GTCG	2	8	180576	180583	0 %	25 %	50 %	25 %	241258758
3536	NC_012852	GCT	2	6	180588	180593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258758
3537	NC_012852	TAGA	2	8	180673	180680	50 %	25 %	25 %	0 %	241258758
3538	NC_012852	CAA	2	6	180747	180752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258759
3539	NC_012852	CGC	2	6	180775	180780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258759
3540	NC_012852	GAC	2	6	180964	180969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258759
3541	NC_012852	CGC	2	6	180978	180983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258759
3542	NC_012852	GA	3	6	181068	181073	50 %	0 %	50 %	0 %	241258759
3543	NC_012852	GTC	2	6	181075	181080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258759
3544	NC_012852	GC	3	6	181271	181276	0 %	0 %	50 %	50 %	241258759
3545	NC_012852	TAG	2	6	181319	181324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258759
3546	NC_012852	TGG	2	6	181382	181387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258759
3547	NC_012852	T	6	6	181390	181395	0 %	100 %	0 %	0 %	241258759
3548	NC_012852	GCC	2	6	181400	181405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258759
3549	NC_012852	AGAT	2	8	181454	181461	50 %	25 %	25 %	0 %	241258759
3550	NC_012852	GCC	2	6	181483	181488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258759
3551	NC_012852	AGC	2	6	181514	181519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258759
3552	NC_012852	TTG	2	6	181550	181555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258759
3553	NC_012852	TGC	2	6	181583	181588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258759
3554	NC_012852	TTC	2	6	181786	181791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258759
3555	NC_012852	CG	3	6	181811	181816	0 %	0 %	50 %	50 %	241258759
3556	NC_012852	AT	3	6	181817	181822	50 %	50 %	0 %	0 %	241258759
3557	NC_012852	GCC	2	6	181840	181845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258759
3558	NC_012852	CCA	2	6	181858	181863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258759
3559	NC_012852	TC	3	6	181909	181914	0 %	50 %	0 %	50 %	241258759
3560	NC_012852	TCA	2	6	181917	181922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258759
3561	NC_012852	TGTT	2	8	181940	181947	0 %	75 %	25 %	0 %	241258759
3562	NC_012852	AGA	2	6	181953	181958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258759
3563	NC_012852	TGG	2	6	181974	181979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258759
3564	NC_012852	CG	3	6	182026	182031	0 %	0 %	50 %	50 %	241258759
3565	NC_012852	CTT	2	6	182037	182042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258759
3566	NC_012852	TCC	2	6	182051	182056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258759
3567	NC_012852	CGCC	2	8	182146	182153	0 %	0 %	25 %	75 %	241258759
3568	NC_012852	GCG	2	6	182225	182230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258759
3569	NC_012852	TCG	2	6	182237	182242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258759
3570	NC_012852	CAA	2	6	182259	182264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258759
3571	NC_012852	CAA	2	6	182370	182375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258759
3572	NC_012852	GCG	2	6	182539	182544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258760
3573	NC_012852	TCG	2	6	182573	182578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3574	NC_012852	GTG	2	6	182579	182584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258760
3575	NC_012852	GGC	2	6	182734	182739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258760
3576	NC_012852	AGAT	2	8	182762	182769	50 %	25 %	25 %	0 %	241258760
3577	NC_012852	GC	3	6	182801	182806	0 %	0 %	50 %	50 %	241258760
3578	NC_012852	TTG	2	6	182858	182863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258760
3579	NC_012852	CGA	2	6	182910	182915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3580	NC_012852	CGC	2	6	182931	182936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258760
3581	NC_012852	GGC	2	6	182950	182955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258760
3582	NC_012852	GCA	2	6	183033	183038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3583	NC_012852	CAT	2	6	183061	183066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258760
3584	NC_012852	GGC	2	6	183067	183072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258760
3585	NC_012852	GTC	2	6	183167	183172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3586	NC_012852	GCA	2	6	183195	183200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3587	NC_012852	CGA	2	6	183201	183206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3588	NC_012852	CCG	2	6	183209	183214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258760
3589	NC_012852	CTG	2	6	183252	183257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258760
3590	NC_012852	AAC	2	6	183287	183292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258760
3591	NC_012852	GGC	2	6	183495	183500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258761
3592	NC_012852	AT	3	6	183503	183508	50 %	50 %	0 %	0 %	241258761
3593	NC_012852	GCCT	3	12	183519	183530	0 %	25 %	25 %	50 %	241258761
3594	NC_012852	GCG	2	6	183535	183540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258761
3595	NC_012852	GCG	2	6	183577	183582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258761
3596	NC_012852	CG	3	6	183581	183586	0 %	0 %	50 %	50 %	241258761
3597	NC_012852	CCGGCA	2	12	183698	183709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241258761
3598	NC_012852	GCC	2	6	183793	183798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3599	NC_012852	GCGA	2	8	183807	183814	25 %	0 %	50 %	25 %	241258761
3600	NC_012852	GAA	2	6	183867	183872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258761
3601	NC_012852	GCCG	2	8	183905	183912	0 %	0 %	50 %	50 %	241258761
3602	NC_012852	CG	3	6	183956	183961	0 %	0 %	50 %	50 %	241258761
3603	NC_012852	CCG	2	6	184030	184035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3604	NC_012852	GCC	2	6	184098	184103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3605	NC_012852	GAC	2	6	184131	184136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258761
3606	NC_012852	TCGATC	2	12	184261	184272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241258761
3607	NC_012852	CGA	2	6	184289	184294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258761
3608	NC_012852	CGAC	2	8	184301	184308	25 %	0 %	25 %	50 %	241258761
3609	NC_012852	CGC	2	6	184318	184323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3610	NC_012852	GCC	2	6	184341	184346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3611	NC_012852	TGA	2	6	184358	184363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258761
3612	NC_012852	GC	3	6	184386	184391	0 %	0 %	50 %	50 %	241258761
3613	NC_012852	GCC	3	9	184402	184410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258761
3614	NC_012852	CCA	2	6	184418	184423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258761
3615	NC_012852	AT	3	6	184445	184450	50 %	50 %	0 %	0 %	241258761
3616	NC_012852	AGG	2	6	184514	184519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258761
3617	NC_012852	CCAA	2	8	184539	184546	50 %	0 %	0 %	50 %	241258761
3618	NC_012852	CTTC	2	8	184562	184569	0 %	50 %	0 %	50 %	241258762
3619	NC_012852	GC	3	6	184609	184614	0 %	0 %	50 %	50 %	241258762
3620	NC_012852	GGC	2	6	184616	184621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258762
3621	NC_012852	CCG	2	6	184645	184650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258762
3622	NC_012852	CGA	2	6	184666	184671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258762
3623	NC_012852	TCCG	2	8	184672	184679	0 %	25 %	25 %	50 %	241258762
3624	NC_012852	GC	3	6	184710	184715	0 %	0 %	50 %	50 %	241258762
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3864	NC_012852	CGA	2	6	193892	193897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258770
3865	NC_012852	CCG	3	9	193925	193933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258770
3866	NC_012852	TTCATT	2	12	193942	193953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	241258770
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3977	NC_012852	CGA	2	6	198971	198976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258774
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3980	NC_012852	ACG	2	6	199119	199124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258774
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3983	NC_012852	GC	3	6	199419	199424	0 %	0 %	50 %	50 %	241258775
3984	NC_012852	ACC	2	6	199443	199448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258775
3985	NC_012852	AGATCA	2	12	199519	199530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	241258775
3986	NC_012852	CCG	2	6	199531	199536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258775
3987	NC_012852	CAG	2	6	199556	199561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258775
3988	NC_012852	GCC	2	6	199569	199574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258775
3989	NC_012852	GCC	2	6	199580	199585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258775
3990	NC_012852	CGAG	2	8	199612	199619	25 %	0 %	50 %	25 %	241258775
3991	NC_012852	CTCG	2	8	199691	199698	0 %	25 %	25 %	50 %	241258775
3992	NC_012852	CGG	2	6	199719	199724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258775
3993	NC_012852	GATC	2	8	199780	199787	25 %	25 %	25 %	25 %	241258775
3994	NC_012852	TTG	2	6	199797	199802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258775
3995	NC_012852	CGA	2	6	199825	199830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258775
3996	NC_012852	GAT	2	6	199889	199894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258775
3997	NC_012852	CATCG	2	10	199895	199904	20 %	20 %	20 %	40 %	241258775
3998	NC_012852	GCGCC	2	10	199910	199919	0 %	0 %	40 %	60 %	241258775
3999	NC_012852	TCG	2	6	199950	199955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258775
4000	NC_012852	GGGCA	2	10	199959	199968	20 %	0 %	60 %	20 %	241258775

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