MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012852	CCT	2	6	134751	134756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258720
2502	NC_012852	GAG	2	6	134771	134776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258720
2503	NC_012852	TATC	2	8	134854	134861	25 %	50 %	0 %	25 %	241258720
2504	NC_012852	ATC	2	6	134869	134874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258720
2505	NC_012852	CAT	2	6	134893	134898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258720
2506	NC_012852	CCGC	2	8	134907	134914	0 %	0 %	25 %	75 %	241258720
2507	NC_012852	CGC	2	6	135028	135033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258720
2508	NC_012852	CGA	2	6	135055	135060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2509	NC_012852	CTT	3	9	135079	135087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258720
2510	NC_012852	CTT	2	6	135103	135108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258720
2511	NC_012852	GC	3	6	135127	135132	0 %	0 %	50 %	50 %	241258720
2512	NC_012852	CGCC	2	8	135133	135140	0 %	0 %	25 %	75 %	241258720
2513	NC_012852	GAA	2	6	135175	135180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258720
2514	NC_012852	TGC	2	6	135195	135200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2515	NC_012852	GCAGGA	2	12	135232	135243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241258720
2516	NC_012852	AAC	2	6	135251	135256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258720
2517	NC_012852	ATC	2	6	135257	135262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258720
2518	NC_012852	CGG	2	6	135295	135300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2519	NC_012852	CGA	2	6	135328	135333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2520	NC_012852	GCA	2	6	135394	135399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2521	NC_012852	GTC	2	6	135419	135424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2522	NC_012852	CTA	2	6	135442	135447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258720
2523	NC_012852	TGA	2	6	135492	135497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258720
2524	NC_012852	CGG	2	6	135514	135519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2525	NC_012852	CGC	2	6	135578	135583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258720
2526	NC_012852	GGC	2	6	135586	135591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2527	NC_012852	GAG	2	6	135605	135610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258720
2528	NC_012852	TCG	2	6	135615	135620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2529	NC_012852	AGC	2	6	135648	135653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2530	NC_012852	ACA	2	6	135675	135680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258720
2531	NC_012852	GCG	3	9	135724	135732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2532	NC_012852	GGC	2	6	135760	135765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2533	NC_012852	GCC	2	6	135809	135814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258720
2534	NC_012852	GGC	2	6	135820	135825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2535	NC_012852	GATGC	2	10	135857	135866	20 %	20 %	40 %	20 %	241258720
2536	NC_012852	GCC	2	6	135887	135892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258720
2537	NC_012852	GTG	2	6	135899	135904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258720
2538	NC_012852	GGA	2	6	136120	136125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258720
2539	NC_012852	GCC	2	6	136127	136132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258720
2540	NC_012852	CGT	2	6	136159	136164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2541	NC_012852	TCG	2	6	136172	136177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2542	NC_012852	GGC	2	6	136180	136185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2543	NC_012852	GCT	2	6	136198	136203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2544	NC_012852	GGT	2	6	136238	136243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258720
2545	NC_012852	CAT	2	6	136246	136251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258720
2546	NC_012852	CGT	2	6	136252	136257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2547	NC_012852	GCG	3	9	136260	136268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2548	NC_012852	GGC	2	6	136348	136353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258720
2549	NC_012852	CTG	2	6	136370	136375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258720
2550	NC_012852	AGA	2	6	136405	136410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258721
2551	NC_012852	TCA	2	6	136430	136435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258721
2552	NC_012852	GGGC	2	8	136458	136465	0 %	0 %	75 %	25 %	241258721
2553	NC_012852	TGA	2	6	136490	136495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258721
2554	NC_012852	GC	3	6	136496	136501	0 %	0 %	50 %	50 %	241258721
2555	NC_012852	CGA	2	6	136523	136528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258721
2556	NC_012852	TGA	2	6	136627	136632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258721
2557	NC_012852	TCGG	2	8	136660	136667	0 %	25 %	50 %	25 %	241258721
2558	NC_012852	CAT	2	6	136757	136762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258721
2559	NC_012852	AGG	2	6	136811	136816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258721
2560	NC_012852	AGC	3	9	136840	136848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258721
2561	NC_012852	CGT	2	6	136880	136885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258721
2562	NC_012852	CGC	2	6	136910	136915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258721
2563	NC_012852	GGA	2	6	137001	137006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258721
2564	NC_012852	TCG	2	6	137080	137085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258721
2565	NC_012852	GGC	2	6	137181	137186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258721
2566	NC_012852	GCCG	2	8	137199	137206	0 %	0 %	50 %	50 %	241258721
2567	NC_012852	ATC	2	6	137230	137235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258721
2568	NC_012852	CGC	2	6	137252	137257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258721
2569	NC_012852	CTGC	2	8	137267	137274	0 %	25 %	25 %	50 %	241258721
2570	NC_012852	GGC	2	6	137331	137336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258721
2571	NC_012852	TGC	2	6	137370	137375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258721
2572	NC_012852	GGC	2	6	137388	137393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258721
2573	NC_012852	CG	3	6	137432	137437	0 %	0 %	50 %	50 %	241258721
2574	NC_012852	CGAC	2	8	137509	137516	25 %	0 %	25 %	50 %	241258721
2575	NC_012852	GCG	2	6	137533	137538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258721
2576	NC_012852	CGT	2	6	137943	137948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258722
2577	NC_012852	GGC	2	6	138001	138006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258722
2578	NC_012852	TCG	2	6	138011	138016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258722
2579	NC_012852	CGC	2	6	138080	138085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258722
2580	NC_012852	CGA	2	6	138108	138113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258722
2581	NC_012852	TCGA	2	8	138118	138125	25 %	25 %	25 %	25 %	241258722
2582	NC_012852	CG	3	6	138149	138154	0 %	0 %	50 %	50 %	241258722
2583	NC_012852	TGA	2	6	138200	138205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258722
2584	NC_012852	AAG	2	6	138250	138255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258722
2585	NC_012852	TGCG	2	8	138307	138314	0 %	25 %	50 %	25 %	241258722
2586	NC_012852	CCG	2	6	138317	138322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258722
2587	NC_012852	AAG	2	6	138344	138349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258722
2588	NC_012852	CCGG	2	8	138411	138418	0 %	0 %	50 %	50 %	241258722
2589	NC_012852	TTC	2	6	138424	138429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258722
2590	NC_012852	CGG	2	6	138444	138449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258722
2591	NC_012852	CAT	2	6	138450	138455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258722
2592	NC_012852	GGC	2	6	138606	138611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258722
2593	NC_012852	AT	3	6	138714	138719	50 %	50 %	0 %	0 %	241258722
2594	NC_012852	CCGG	3	12	138728	138739	0 %	0 %	50 %	50 %	241258722
2595	NC_012852	GCG	2	6	138794	138799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258722
2596	NC_012852	ATT	2	6	138809	138814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241258722
2597	NC_012852	CAC	2	6	138825	138830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258722
2598	NC_012852	GCC	2	6	138887	138892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258722
2599	NC_012852	GAG	2	6	138938	138943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258722
2600	NC_012852	TGCTC	2	10	139047	139056	0 %	40 %	20 %	40 %	241258723
2601	NC_012852	GAG	2	6	139064	139069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258723
2602	NC_012852	CAT	2	6	139153	139158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258723
2603	NC_012852	CGC	2	6	139170	139175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258723
2604	NC_012852	CGA	2	6	139267	139272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2605	NC_012852	AAG	2	6	139304	139309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258723
2606	NC_012852	GAAGCT	2	12	139351	139362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241258723
2607	NC_012852	TGGCC	2	10	139375	139384	0 %	20 %	40 %	40 %	241258723
2608	NC_012852	TGG	2	6	139418	139423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258723
2609	NC_012852	ATT	2	6	139434	139439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241258723
2610	NC_012852	TGCCG	2	10	139441	139450	0 %	20 %	40 %	40 %	241258723
2611	NC_012852	GCGA	2	8	139466	139473	25 %	0 %	50 %	25 %	241258723
2612	NC_012852	CGG	2	6	139477	139482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258723
2613	NC_012852	TCGAGG	2	12	139584	139595	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241258723
2614	NC_012852	TCG	2	6	139704	139709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2615	NC_012852	CAT	2	6	139717	139722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258723
2616	NC_012852	TCG	2	6	139758	139763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2617	NC_012852	CGA	2	6	139792	139797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2618	NC_012852	CGC	2	6	139804	139809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258723
2619	NC_012852	TCG	2	6	139866	139871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2620	NC_012852	GCCGAT	2	12	139966	139977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241258723
2621	NC_012852	CGC	2	6	139978	139983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258723
2622	NC_012852	ATC	2	6	139986	139991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258723
2623	NC_012852	TGC	2	6	140157	140162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258724
2624	NC_012852	GGC	3	9	140207	140215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258724
2625	NC_012852	GCC	2	6	140233	140238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258724
2626	NC_012852	CGG	2	6	140239	140244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258724
2627	NC_012852	CGG	2	6	140253	140258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258724
2628	NC_012852	CGGC	2	8	140277	140284	0 %	0 %	50 %	50 %	241258724
2629	NC_012852	CACCT	2	10	140291	140300	20 %	20 %	0 %	60 %	241258724
2630	NC_012852	CGCC	2	8	140329	140336	0 %	0 %	25 %	75 %	241258724
2631	NC_012852	TTCG	2	8	140411	140418	0 %	50 %	25 %	25 %	241258724
2632	NC_012852	TCG	2	6	140436	140441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258724
2633	NC_012852	TGC	2	6	140483	140488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258725
2634	NC_012852	GCGG	2	8	140502	140509	0 %	0 %	75 %	25 %	241258725
2635	NC_012852	GCA	2	6	140522	140527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258725
2636	NC_012852	GATC	2	8	140528	140535	25 %	25 %	25 %	25 %	241258725
2637	NC_012852	GCC	2	6	140554	140559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258725
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2640	NC_012852	TCT	2	6	140726	140731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258726
2641	NC_012852	CGGC	2	8	140753	140760	0 %	0 %	50 %	50 %	241258726
2642	NC_012852	GACCTC	2	12	140769	140780	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241258726
2643	NC_012852	GCA	2	6	140810	140815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258726
2644	NC_012852	CGG	2	6	140826	140831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258726
2645	NC_012852	CGCC	2	8	140893	140900	0 %	0 %	25 %	75 %	241258726
2646	NC_012852	CGA	2	6	140948	140953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258726
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2649	NC_012852	TCG	2	6	141082	141087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258726
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2651	NC_012852	CCGG	2	8	141142	141149	0 %	0 %	50 %	50 %	241258726
2652	NC_012852	GGC	2	6	141203	141208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258726
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2677	NC_012852	CG	3	6	142224	142229	0 %	0 %	50 %	50 %	241258726
2678	NC_012852	TGA	2	6	142253	142258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258726
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2727	NC_012852	CGGTT	2	10	144094	144103	0 %	40 %	40 %	20 %	241258727
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2730	NC_012852	CGAGC	2	10	144193	144202	20 %	0 %	40 %	40 %	241258727
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2733	NC_012852	GC	3	6	144242	144247	0 %	0 %	50 %	50 %	241258727
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2735	NC_012852	CCGGC	2	10	144523	144532	0 %	0 %	40 %	60 %	241258727
2736	NC_012852	GC	3	6	144552	144557	0 %	0 %	50 %	50 %	241258727
2737	NC_012852	CGA	2	6	144573	144578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258727
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2739	NC_012852	AGC	2	6	144635	144640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258727
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2862	NC_012852	GAC	2	6	149628	149633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258732
2863	NC_012852	GCG	2	6	149659	149664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258732
2864	NC_012852	GAC	2	6	149688	149693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258732
2865	NC_012852	GC	3	6	149729	149734	0 %	0 %	50 %	50 %	241258732
2866	NC_012852	CGA	2	6	149765	149770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258732
2867	NC_012852	CAT	2	6	149828	149833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258732
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2883	NC_012852	TGCGGG	2	12	150939	150950	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	241258733
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2980	NC_012852	GCG	2	6	154992	154997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258737
2981	NC_012852	TGA	2	6	155036	155041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258737
2982	NC_012852	AGC	2	6	155054	155059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258737
2983	NC_012852	CGG	2	6	155064	155069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258737
2984	NC_012852	CAGCGC	2	12	155071	155082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241258737
2985	NC_012852	CGA	2	6	155130	155135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258737
2986	NC_012852	AAG	2	6	155200	155205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258737
2987	NC_012852	ACG	2	6	155212	155217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258737
2988	NC_012852	TCG	2	6	155270	155275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258737
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2991	NC_012852	GC	3	6	155306	155311	0 %	0 %	50 %	50 %	241258737
2992	NC_012852	GAT	2	6	155326	155331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258737
2993	NC_012852	TCG	2	6	155345	155350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258737
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3000	NC_012852	TCG	2	6	155657	155662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258737

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