MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012852	ACC	2	6	49212	49217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258646
1002	NC_012852	GAG	2	6	49366	49371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258646
1003	NC_012852	AGC	2	6	49376	49381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1004	NC_012852	GCT	2	6	49405	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1005	NC_012852	GCT	2	6	49426	49431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1006	NC_012852	TTC	2	6	49451	49456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258646
1007	NC_012852	CCAT	2	8	49644	49651	25 %	25 %	0 %	50 %	241258646
1008	NC_012852	GCA	2	6	49696	49701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258646
1009	NC_012852	TCT	2	6	51055	51060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258647
1010	NC_012852	TCA	2	6	51067	51072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258647
1011	NC_012852	CT	3	6	51085	51090	0 %	50 %	0 %	50 %	241258647
1012	NC_012852	TCGCA	2	10	51110	51119	20 %	20 %	20 %	40 %	241258647
1013	NC_012852	CG	3	6	51130	51135	0 %	0 %	50 %	50 %	241258647
1014	NC_012852	CAC	2	6	51171	51176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258647
1015	NC_012852	CCA	2	6	51195	51200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258647
1016	NC_012852	TCGG	2	8	51224	51231	0 %	25 %	50 %	25 %	241258647
1017	NC_012852	TCC	2	6	51234	51239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258647
1018	NC_012852	CCG	2	6	51294	51299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258647
1019	NC_012852	CACG	2	8	51308	51315	25 %	0 %	25 %	50 %	241258647
1020	NC_012852	GGC	2	6	51437	51442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258647
1021	NC_012852	TCT	2	6	52052	52057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258648
1022	NC_012852	TCG	2	6	52085	52090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258648
1023	NC_012852	AGC	2	6	52105	52110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258648
1024	NC_012852	TCCA	2	8	52119	52126	25 %	25 %	0 %	50 %	241258648
1025	NC_012852	GGC	2	6	52149	52154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258648
1026	NC_012852	GAA	2	6	52162	52167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258648
1027	NC_012852	GAA	2	6	52172	52177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258648
1028	NC_012852	GTTTTC	2	12	52189	52200	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	241258648
1029	NC_012852	CTG	2	6	52210	52215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258648
1030	NC_012852	TCA	2	6	52342	52347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258648
1031	NC_012852	GCC	2	6	52357	52362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258648
1032	NC_012852	GTT	2	6	52403	52408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258648
1033	NC_012852	GCC	2	6	52468	52473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258648
1034	NC_012852	TCGGC	2	10	52481	52490	0 %	20 %	40 %	40 %	241258648
1035	NC_012852	CAT	2	6	52514	52519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258648
1036	NC_012852	CTG	2	6	52542	52547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258648
1037	NC_012852	CCAGC	2	10	52562	52571	20 %	0 %	20 %	60 %	241258648
1038	NC_012852	AAG	2	6	52572	52577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258648
1039	NC_012852	CAG	2	6	52784	52789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258649
1040	NC_012852	AGA	2	6	52824	52829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258649
1041	NC_012852	TCA	2	6	52839	52844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258649
1042	NC_012852	GCC	2	6	52848	52853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258649
1043	NC_012852	TCG	2	6	52918	52923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258649
1044	NC_012852	GCTTT	2	10	52936	52945	0 %	60 %	20 %	20 %	241258649
1045	NC_012852	CGG	2	6	53005	53010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258649
1046	NC_012852	CAC	2	6	53027	53032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258649
1047	NC_012852	CTT	2	6	53033	53038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258649
1048	NC_012852	CTT	2	6	53057	53062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258649
1049	NC_012852	CGG	2	6	53080	53085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258649
1050	NC_012852	TCG	2	6	53118	53123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258649
1051	NC_012852	CGGCC	2	10	53186	53195	0 %	0 %	40 %	60 %	241258649
1052	NC_012852	TTC	3	9	53198	53206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258649
1053	NC_012852	CTT	2	6	53226	53231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258649
1054	NC_012852	GAG	2	6	53236	53241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258649
1055	NC_012852	GAGTT	2	10	53328	53337	20 %	40 %	40 %	0 %	241258649
1056	NC_012852	GCTGC	2	10	53369	53378	0 %	20 %	40 %	40 %	241258649
1057	NC_012852	T	6	6	53381	53386	0 %	100 %	0 %	0 %	241258649
1058	NC_012852	GAG	3	9	53892	53900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258650
1059	NC_012852	GCA	2	6	53905	53910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1060	NC_012852	CGATG	2	10	53937	53946	20 %	20 %	40 %	20 %	241258650
1061	NC_012852	GCC	2	6	54005	54010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258650
1062	NC_012852	CCT	2	6	54014	54019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258650
1063	NC_012852	CCT	2	6	54116	54121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258650
1064	NC_012852	AGC	2	6	54129	54134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1065	NC_012852	GC	4	8	54133	54140	0 %	0 %	50 %	50 %	241258650
1066	NC_012852	TCG	2	6	54187	54192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1067	NC_012852	TGCC	2	8	54194	54201	0 %	25 %	25 %	50 %	241258650
1068	NC_012852	TGG	2	6	54278	54283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258650
1069	NC_012852	AGC	2	6	54313	54318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1070	NC_012852	GAC	2	6	54403	54408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1071	NC_012852	CTTC	2	8	54413	54420	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
1072	NC_012852	GCA	2	6	54463	54468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1073	NC_012852	TG	3	6	54471	54476	0 %	50 %	50 %	0 %	241258650
1074	NC_012852	GCGG	2	8	54500	54507	0 %	0 %	75 %	25 %	241258650
1075	NC_012852	CCTT	2	8	54529	54536	0 %	50 %	0 %	50 %	241258650
1076	NC_012852	ATC	2	6	54667	54672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258650
1077	NC_012852	CGA	2	6	54707	54712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1078	NC_012852	TGA	2	6	54761	54766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258650
1079	NC_012852	CGT	2	6	54852	54857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1080	NC_012852	TCG	2	6	54937	54942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1081	NC_012852	CGA	2	6	55028	55033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1082	NC_012852	TTG	2	6	55093	55098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258650
1083	NC_012852	T	7	7	55104	55110	0 %	100 %	0 %	0 %	241258650
1084	NC_012852	ACG	2	6	55132	55137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1085	NC_012852	TCG	2	6	55148	55153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1086	NC_012852	CGA	2	6	55175	55180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1087	NC_012852	GAC	2	6	55204	55209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1088	NC_012852	TCC	2	6	55222	55227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258650
1089	NC_012852	CGC	2	6	55237	55242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258650
1090	NC_012852	CCA	2	6	55265	55270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258650
1091	NC_012852	AGC	2	6	55332	55337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1092	NC_012852	GC	3	6	55371	55376	0 %	0 %	50 %	50 %	241258650
1093	NC_012852	ATC	2	6	55396	55401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258650
1094	NC_012852	ATGCCG	2	12	55414	55425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1095	NC_012852	CGA	2	6	55433	55438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1096	NC_012852	CCG	2	6	55547	55552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258650
1097	NC_012852	GGA	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258650
1098	NC_012852	CAT	2	6	55608	55613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258650
1099	NC_012852	GCA	2	6	55616	55621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1100	NC_012852	GTC	2	6	55675	55680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258650
1101	NC_012852	CGG	2	6	57074	57079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258651
1102	NC_012852	GCG	2	6	57241	57246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258651
1103	NC_012852	GCAA	2	8	57328	57335	50 %	0 %	25 %	25 %	241258651
1104	NC_012852	CAG	2	6	57365	57370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258651
1105	NC_012852	GCC	2	6	57382	57387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258651
1106	NC_012852	ATA	2	6	57427	57432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241258651
1107	NC_012852	CGA	4	12	57482	57493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258651
1108	NC_012852	ACG	2	6	57622	57627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258651
1109	NC_012852	GGC	2	6	57813	57818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258652
1110	NC_012852	TGA	2	6	57837	57842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258652
1111	NC_012852	TGGAT	2	10	57874	57883	20 %	40 %	40 %	0 %	241258652
1112	NC_012852	TCG	2	6	57915	57920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258652
1113	NC_012852	GGC	2	6	57954	57959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258652
1114	NC_012852	GC	3	6	57993	57998	0 %	0 %	50 %	50 %	241258652
1115	NC_012852	AGC	2	6	58008	58013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258652
1116	NC_012852	ATC	2	6	58042	58047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258652
1117	NC_012852	GAT	2	6	58186	58191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258652
1118	NC_012852	CGA	2	6	58353	58358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258652
1119	NC_012852	GGC	2	6	58370	58375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258652
1120	NC_012852	CAG	2	6	58426	58431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258652
1121	NC_012852	ACG	2	6	58433	58438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258652
1122	NC_012852	GC	3	6	58453	58458	0 %	0 %	50 %	50 %	241258652
1123	NC_012852	CGC	2	6	58526	58531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258653
1124	NC_012852	GC	3	6	58543	58548	0 %	0 %	50 %	50 %	241258653
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1244	NC_012852	CCA	2	6	64359	64364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258659
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1496	NC_012852	GACCT	2	10	76375	76384	20 %	20 %	20 %	40 %	241258666
1497	NC_012852	GTG	2	6	76401	76406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258666
1498	NC_012852	ATG	2	6	76423	76428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258666
1499	NC_012852	CTA	2	6	76431	76436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258666
1500	NC_012852	CAC	2	6	76437	76442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258666

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