MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012852	GACCG	2	10	22113	22122	20 %	0 %	40 %	40 %	241258622
502	NC_012852	TCA	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
503	NC_012852	GGCC	2	8	22154	22161	0 %	0 %	50 %	50 %	241258622
504	NC_012852	TCG	2	6	22225	22230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
505	NC_012852	GCT	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
506	NC_012852	ATC	2	6	22249	22254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258622
507	NC_012852	CAA	2	6	22289	22294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258622
508	NC_012852	TCT	2	6	22301	22306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258622
509	NC_012852	GCT	2	6	22358	22363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258622
510	NC_012852	CCG	2	6	22605	22610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258623
511	NC_012852	CG	3	6	22680	22685	0 %	0 %	50 %	50 %	241258623
512	NC_012852	GCC	2	6	22728	22733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258623
513	NC_012852	TTC	2	6	22815	22820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258623
514	NC_012852	CAA	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258623
515	NC_012852	TCC	2	6	23075	23080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258624
516	NC_012852	TCG	2	6	23184	23189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
517	NC_012852	CGT	2	6	23365	23370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
518	NC_012852	CGG	2	6	23403	23408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258624
519	NC_012852	CGT	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258624
520	NC_012852	GGC	2	6	23552	23557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258624
521	NC_012852	TCA	2	6	23559	23564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258624
522	NC_012852	GCCCT	2	10	23573	23582	0 %	20 %	20 %	60 %	241258624
523	NC_012852	GCCG	2	8	23594	23601	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
524	NC_012852	GAT	2	6	23638	23643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258624
525	NC_012852	GC	3	6	23751	23756	0 %	0 %	50 %	50 %	241258624
526	NC_012852	G	6	6	23800	23805	0 %	0 %	100 %	0 %	241258624
527	NC_012852	CGAG	2	8	23808	23815	25 %	0 %	50 %	25 %	241258624
528	NC_012852	CCA	2	6	23961	23966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258625
529	NC_012852	GAC	2	6	24074	24079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
530	NC_012852	TGC	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
531	NC_012852	GAT	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
532	NC_012852	TGCCG	2	10	24260	24269	0 %	20 %	40 %	40 %	241258625
533	NC_012852	GCC	2	6	24275	24280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
534	NC_012852	GCA	2	6	24289	24294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
535	NC_012852	GGC	3	9	24311	24319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258625
536	NC_012852	GTG	2	6	24345	24350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258625
537	NC_012852	AGC	2	6	24457	24462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
538	NC_012852	TCA	3	9	24517	24525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258625
539	NC_012852	AGC	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
540	NC_012852	GCT	2	6	24700	24705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
541	NC_012852	CGA	2	6	24763	24768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
542	NC_012852	GAG	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258625
543	NC_012852	TCC	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258625
544	NC_012852	TTG	2	6	24828	24833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258625
545	NC_012852	CTT	2	6	24835	24840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258625
546	NC_012852	TGA	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
547	NC_012852	GCT	2	6	24928	24933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
548	NC_012852	ATG	2	6	24963	24968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
549	NC_012852	TGA	2	6	24985	24990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258625
550	NC_012852	AGA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258625
551	NC_012852	GCCA	2	8	25003	25010	25 %	0 %	25 %	50 %	241258625
552	NC_012852	CCG	2	6	25029	25034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
553	NC_012852	GCT	2	6	25096	25101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
554	NC_012852	CGC	2	6	25153	25158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
555	NC_012852	GCA	2	6	25180	25185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
556	NC_012852	ATC	2	6	25188	25193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258625
557	NC_012852	GCG	2	6	25265	25270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258625
558	NC_012852	AGA	2	6	25276	25281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258625
559	NC_012852	ACG	2	6	25311	25316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258625
560	NC_012852	AGG	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258625
561	NC_012852	GCC	2	6	25376	25381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258625
562	NC_012852	TGC	2	6	25517	25522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258625
563	NC_012852	TGG	2	6	25525	25530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258625
564	NC_012852	GGAC	2	8	25595	25602	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
565	NC_012852	CGG	2	6	25628	25633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
566	NC_012852	GAC	2	6	25671	25676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
567	NC_012852	GGC	2	6	25705	25710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
568	NC_012852	AGC	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
569	NC_012852	GGCC	2	8	25808	25815	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
570	NC_012852	GTC	2	6	25867	25872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
571	NC_012852	CGAC	2	8	25877	25884	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
572	NC_012852	GGC	2	6	26022	26027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
573	NC_012852	CAG	2	6	26052	26057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258626
574	NC_012852	CGG	2	6	26072	26077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
575	NC_012852	CGAG	2	8	26081	26088	25 %	0 %	50 %	25 %	241258626
576	NC_012852	GGC	2	6	26115	26120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
577	NC_012852	GGC	2	6	26133	26138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
578	NC_012852	CTG	2	6	26139	26144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
579	NC_012852	TGG	2	6	26171	26176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258626
580	NC_012852	TTG	2	6	26194	26199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258626
581	NC_012852	CG	3	6	26244	26249	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
582	NC_012852	GGC	3	9	26250	26258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
583	NC_012852	TCG	2	6	26261	26266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
584	NC_012852	CTG	2	6	26268	26273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
585	NC_012852	GA	3	6	26280	26285	50 %	0 %	50 %	0 %	241258626
586	NC_012852	CGG	2	6	26312	26317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
587	NC_012852	TCG	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
588	NC_012852	TGT	2	6	26462	26467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258626
589	NC_012852	TCG	2	6	26485	26490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258626
590	NC_012852	AT	3	6	26495	26500	50 %	50 %	0 %	0 %	241258626
591	NC_012852	CGAC	2	8	26506	26513	25 %	0 %	25 %	50 %	241258626
592	NC_012852	CGG	2	6	26543	26548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
593	NC_012852	GCC	2	6	26589	26594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258626
594	NC_012852	CGG	2	6	26603	26608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
595	NC_012852	GGC	2	6	26628	26633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258626
596	NC_012852	CG	3	6	26645	26650	0 %	0 %	50 %	50 %	241258626
597	NC_012852	TTG	2	6	26710	26715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258626
598	NC_012852	CAA	2	6	26889	26894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258627
599	NC_012852	GGCC	2	8	26913	26920	0 %	0 %	50 %	50 %	241258627
600	NC_012852	GAC	3	9	26934	26942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258627
601	NC_012852	TCG	2	6	26956	26961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258627
602	NC_012852	CGG	2	6	26998	27003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258627
603	NC_012852	AGG	2	6	27025	27030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258627
604	NC_012852	GA	3	6	27161	27166	50 %	0 %	50 %	0 %	241258627
605	NC_012852	CAT	2	6	27227	27232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258627
606	NC_012852	CGA	2	6	27365	27370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258627
607	NC_012852	TGC	2	6	27391	27396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258627
608	NC_012852	ATG	2	6	27402	27407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258627
609	NC_012852	GC	3	6	27422	27427	0 %	0 %	50 %	50 %	241258627
610	NC_012852	GCC	3	9	27446	27454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258627
611	NC_012852	CCG	2	6	27490	27495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258627
612	NC_012852	GC	3	6	27514	27519	0 %	0 %	50 %	50 %	241258627
613	NC_012852	CGG	2	6	27783	27788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258628
614	NC_012852	GAC	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258628
615	NC_012852	GTC	2	6	27879	27884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258628
616	NC_012852	GCG	3	9	27936	27944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258628
617	NC_012852	GC	3	6	28001	28006	0 %	0 %	50 %	50 %	241258628
618	NC_012852	CG	3	6	28034	28039	0 %	0 %	50 %	50 %	241258628
619	NC_012852	CGC	2	6	28152	28157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258628
620	NC_012852	AG	3	6	28175	28180	50 %	0 %	50 %	0 %	241258628
621	NC_012852	GTC	2	6	28188	28193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258628
622	NC_012852	CGG	2	6	28233	28238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258628
623	NC_012852	ATC	2	6	28239	28244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258628
624	NC_012852	CGC	2	6	28265	28270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258628
625	NC_012852	CGA	2	6	28352	28357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258628
626	NC_012852	GGT	2	6	28392	28397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258628
627	NC_012852	TGA	2	6	28418	28423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258628
628	NC_012852	TCG	2	6	28444	28449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258628
629	NC_012852	TGC	2	6	28504	28509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258628
630	NC_012852	CGGT	2	8	28586	28593	0 %	25 %	50 %	25 %	241258628
631	NC_012852	AGTCC	2	10	28617	28626	20 %	20 %	20 %	40 %	241258628
632	NC_012852	ACC	2	6	28627	28632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258628
633	NC_012852	GGC	2	6	28668	28673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258628
634	NC_012852	ACC	2	6	28765	28770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258628
635	NC_012852	CGT	2	6	28800	28805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258628
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641	NC_012852	CG	4	8	29029	29036	0 %	0 %	50 %	50 %	241258629
642	NC_012852	TCG	2	6	29041	29046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258629
643	NC_012852	GAT	2	6	29069	29074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258629
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645	NC_012852	CAT	2	6	29102	29107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258629
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647	NC_012852	GAT	2	6	29127	29132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258629
648	NC_012852	TCC	2	6	29281	29286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258629
649	NC_012852	ATG	2	6	29338	29343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258629
650	NC_012852	CGT	2	6	29397	29402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258629
651	NC_012852	ACG	2	6	29464	29469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258629
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655	NC_012852	GGC	2	6	29593	29598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258629
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659	NC_012852	GCG	2	6	30133	30138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258630
660	NC_012852	GCA	2	6	30147	30152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258630
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662	NC_012852	GCA	2	6	30263	30268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258630
663	NC_012852	TCC	2	6	30284	30289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258630
664	NC_012852	GCA	2	6	30297	30302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258630
665	NC_012852	CG	3	6	30316	30321	0 %	0 %	50 %	50 %	241258630
666	NC_012852	CG	3	6	30391	30396	0 %	0 %	50 %	50 %	241258630
667	NC_012852	AGC	2	6	30513	30518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258631
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669	NC_012852	CA	3	6	30606	30611	50 %	0 %	0 %	50 %	241258631
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685	NC_012852	CTTT	2	8	31466	31473	0 %	75 %	0 %	25 %	241258632
686	NC_012852	GA	3	6	31503	31508	50 %	0 %	50 %	0 %	241258632
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702	NC_012852	TTCT	2	8	32574	32581	0 %	75 %	0 %	25 %	241258633
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749	NC_012852	CGG	2	6	35885	35890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258635
750	NC_012852	GGC	2	6	35974	35979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258635
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752	NC_012852	GAC	2	6	36004	36009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258635
753	NC_012852	CGAG	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	241258636
754	NC_012852	CAG	2	6	36531	36536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258636
755	NC_012852	GTCG	2	8	36588	36595	0 %	25 %	50 %	25 %	241258636
756	NC_012852	CCGG	2	8	36609	36616	0 %	0 %	50 %	50 %	241258636
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877	NC_012852	AAC	2	6	41392	41397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258639
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