MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132504

Total Repeats: 6929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012852	CGA	2	6	296912	296917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258857
6002	NC_012852	GGC	2	6	297013	297018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258857
6003	NC_012852	ATCG	2	8	297053	297060	25 %	25 %	25 %	25 %	241258857
6004	NC_012852	CCG	2	6	297145	297150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258857
6005	NC_012852	GA	3	6	297182	297187	50 %	0 %	50 %	0 %	241258857
6006	NC_012852	TGA	2	6	297247	297252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258857
6007	NC_012852	CGG	2	6	297272	297277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258857
6008	NC_012852	CGC	2	6	297362	297367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258857
6009	NC_012852	TGC	2	6	297382	297387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258857
6010	NC_012852	TG	3	6	297466	297471	0 %	50 %	50 %	0 %	241258857
6011	NC_012852	CAT	2	6	297491	297496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258857
6012	NC_012852	GCC	2	6	297594	297599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258857
6013	NC_012852	GC	3	6	297628	297633	0 %	0 %	50 %	50 %	241258857
6014	NC_012852	AGAA	2	8	297677	297684	75 %	0 %	25 %	0 %	241258857
6015	NC_012852	TGG	2	6	297688	297693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258857
6016	NC_012852	CG	3	6	297755	297760	0 %	0 %	50 %	50 %	241258857
6017	NC_012852	ATAA	2	8	297783	297790	75 %	25 %	0 %	0 %	241258857
6018	NC_012852	AACA	2	8	297801	297808	75 %	0 %	0 %	25 %	241258857
6019	NC_012852	CGC	2	6	298198	298203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258858
6020	NC_012852	CCT	2	6	298294	298299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258858
6021	NC_012852	AGA	2	6	298311	298316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258858
6022	NC_012852	GCG	2	6	298556	298561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258858
6023	NC_012852	TGC	2	6	298659	298664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258858
6024	NC_012852	GGA	2	6	298678	298683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258858
6025	NC_012852	GTTC	2	8	298715	298722	0 %	50 %	25 %	25 %	241258858
6026	NC_012852	GATT	2	8	298759	298766	25 %	50 %	25 %	0 %	241258858
6027	NC_012852	GT	3	6	298816	298821	0 %	50 %	50 %	0 %	241258858
6028	NC_012852	GATC	2	8	298828	298835	25 %	25 %	25 %	25 %	241258858
6029	NC_012852	TCT	2	6	298864	298869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258858
6030	NC_012852	CGA	2	6	298881	298886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258858
6031	NC_012852	TTGG	2	8	298902	298909	0 %	50 %	50 %	0 %	241258858
6032	NC_012852	CG	3	6	298952	298957	0 %	0 %	50 %	50 %	241258858
6033	NC_012852	GTCG	2	8	298987	298994	0 %	25 %	50 %	25 %	241258858
6034	NC_012852	TGG	2	6	299077	299082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258859
6035	NC_012852	GCG	2	6	299096	299101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258859
6036	NC_012852	GCT	2	6	299217	299222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258859
6037	NC_012852	CGG	2	6	299231	299236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258859
6038	NC_012852	AATG	2	8	299430	299437	50 %	25 %	25 %	0 %	241258859
6039	NC_012852	AGC	2	6	299617	299622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258859
6040	NC_012852	CGC	2	6	299650	299655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258859
6041	NC_012852	GCCT	2	8	299691	299698	0 %	25 %	25 %	50 %	241258859
6042	NC_012852	CCG	2	6	299719	299724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258859
6043	NC_012852	TCCT	2	8	299937	299944	0 %	50 %	0 %	50 %	241258859
6044	NC_012852	CAT	2	6	299952	299957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258859
6045	NC_012852	CAT	2	6	300069	300074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258859
6046	NC_012852	CTG	2	6	301457	301462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6047	NC_012852	CGC	2	6	301655	301660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6048	NC_012852	CGA	2	6	301669	301674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6049	NC_012852	ATC	2	6	301700	301705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258860
6050	NC_012852	GCA	2	6	301714	301719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6051	NC_012852	CGG	2	6	301731	301736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
6052	NC_012852	CGA	2	6	301753	301758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6053	NC_012852	CGT	2	6	302026	302031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6054	NC_012852	GCG	2	6	302041	302046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
6055	NC_012852	GCT	2	6	302050	302055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6056	NC_012852	CCG	2	6	302137	302142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6057	NC_012852	GCC	2	6	302213	302218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6058	NC_012852	TGC	2	6	302227	302232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6059	NC_012852	CGG	2	6	302249	302254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
6060	NC_012852	CGT	2	6	302282	302287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6061	NC_012852	CCT	2	6	302305	302310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258860
6062	NC_012852	TCC	2	6	302358	302363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258860
6063	NC_012852	CGT	2	6	302402	302407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6064	NC_012852	TCG	3	9	302536	302544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6065	NC_012852	TCG	2	6	302593	302598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6066	NC_012852	CGC	2	6	302785	302790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6067	NC_012852	TTG	2	6	302811	302816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258860
6068	NC_012852	CTC	2	6	302831	302836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258860
6069	NC_012852	ATC	2	6	302843	302848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258860
6070	NC_012852	CTT	2	6	302862	302867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258860
6071	NC_012852	CCG	2	6	302930	302935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6072	NC_012852	GCA	2	6	303051	303056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6073	NC_012852	GC	3	6	303187	303192	0 %	0 %	50 %	50 %	241258860
6074	NC_012852	TCG	2	6	303261	303266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6075	NC_012852	GAC	2	6	303283	303288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6076	NC_012852	GCC	2	6	303299	303304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258860
6077	NC_012852	TCG	2	6	303306	303311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6078	NC_012852	CCGGCA	2	12	303507	303518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241258860
6079	NC_012852	CAC	2	6	303527	303532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258860
6080	NC_012852	GATC	2	8	303620	303627	25 %	25 %	25 %	25 %	241258860
6081	NC_012852	GC	3	6	303683	303688	0 %	0 %	50 %	50 %	241258860
6082	NC_012852	CCA	2	6	303730	303735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258860
6083	NC_012852	CGA	2	6	303802	303807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6084	NC_012852	TCG	2	6	303858	303863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6085	NC_012852	GC	4	8	303998	304005	0 %	0 %	50 %	50 %	241258860
6086	NC_012852	GA	3	6	304006	304011	50 %	0 %	50 %	0 %	241258860
6087	NC_012852	CGAT	2	8	304026	304033	25 %	25 %	25 %	25 %	241258860
6088	NC_012852	GCTCG	2	10	304061	304070	0 %	20 %	40 %	40 %	241258860
6089	NC_012852	GCGA	2	8	304093	304100	25 %	0 %	50 %	25 %	241258860
6090	NC_012852	GGC	2	6	304194	304199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
6091	NC_012852	AGC	2	6	304236	304241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6092	NC_012852	CTCAC	2	10	304266	304275	20 %	20 %	0 %	60 %	241258860
6093	NC_012852	CGT	2	6	304277	304282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258860
6094	NC_012852	CAT	2	6	304283	304288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258860
6095	NC_012852	CGG	2	6	304489	304494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
6096	NC_012852	CCTGT	2	10	304572	304581	0 %	40 %	20 %	40 %	241258860
6097	NC_012852	TCGT	2	8	304611	304618	0 %	50 %	25 %	25 %	241258860
6098	NC_012852	GGC	2	6	304640	304645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258860
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6100	NC_012852	GC	3	6	305001	305006	0 %	0 %	50 %	50 %	241258861
6101	NC_012852	GC	3	6	305081	305086	0 %	0 %	50 %	50 %	241258861
6102	NC_012852	CGC	2	6	305097	305102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258861
6103	NC_012852	TGC	2	6	305125	305130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258861
6104	NC_012852	CGA	2	6	305237	305242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258861
6105	NC_012852	CTG	2	6	305244	305249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258861
6106	NC_012852	CAT	2	6	305302	305307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258861
6107	NC_012852	GCC	2	6	305782	305787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258862
6108	NC_012852	ATGT	2	8	305797	305804	25 %	50 %	25 %	0 %	241258862
6109	NC_012852	GGC	2	6	305809	305814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258862
6110	NC_012852	GAA	2	6	305862	305867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258862
6111	NC_012852	GA	3	6	305879	305884	50 %	0 %	50 %	0 %	241258862
6112	NC_012852	GGC	3	9	305886	305894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258862
6113	NC_012852	CGA	2	6	305913	305918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258862
6114	NC_012852	AACG	2	8	305920	305927	50 %	0 %	25 %	25 %	241258862
6115	NC_012852	CTG	2	6	305984	305989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258862
6116	NC_012852	GCT	2	6	306086	306091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258862
6117	NC_012852	CTT	2	6	306109	306114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258862
6118	NC_012852	CTT	2	6	306148	306153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241258862
6119	NC_012852	GGT	2	6	306244	306249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258862
6120	NC_012852	AACG	2	8	306309	306316	50 %	0 %	25 %	25 %	241258862
6121	NC_012852	CAC	2	6	306354	306359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241258862
6122	NC_012852	CGG	2	6	306471	306476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258862
6123	NC_012852	AGC	2	6	306535	306540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258862
6124	NC_012852	GAC	2	6	306586	306591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258862
6125	NC_012852	ACG	2	6	306596	306601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258862
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6129	NC_012852	GTC	2	6	307424	307429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258863
6130	NC_012852	ATC	2	6	307577	307582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258863
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6132	NC_012852	GTC	2	6	307697	307702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258863
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6138	NC_012852	GAT	2	6	307853	307858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241258863
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6158	NC_012852	CAGC	2	8	309695	309702	25 %	0 %	25 %	50 %	241258865
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6224	NC_012852	CGT	2	6	313850	313855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258868
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6226	NC_012852	CCGAC	2	10	313889	313898	20 %	0 %	20 %	60 %	241258868
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6230	NC_012852	CTG	2	6	314071	314076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258869
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6232	NC_012852	CGCC	2	8	314165	314172	0 %	0 %	25 %	75 %	241258869
6233	NC_012852	TCC	2	6	314185	314190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241258869
6234	NC_012852	CTG	2	6	314199	314204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258869
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6241	NC_012852	GCC	2	6	314780	314785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258869
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6254	NC_012852	TCG	2	6	315448	315453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258870
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6362	NC_012852	GGA	2	6	321926	321931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241258875
6363	NC_012852	CCG	2	6	321940	321945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241258875
6364	NC_012852	GCG	2	6	322093	322098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258875
6365	NC_012852	GC	3	6	322107	322112	0 %	0 %	50 %	50 %	241258875
6366	NC_012852	GGC	2	6	322149	322154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258875
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6368	NC_012852	GCT	2	6	322344	322349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258876
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6370	NC_012852	TCG	2	6	322484	322489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258876
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6373	NC_012852	GAC	2	6	322693	322698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258876
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6386	NC_012852	CT	3	6	323525	323530	0 %	50 %	0 %	50 %	241258877
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6475	NC_012852	GATC	2	8	327927	327934	25 %	25 %	25 %	25 %	241258881
6476	NC_012852	CAAT	2	8	328004	328011	50 %	25 %	0 %	25 %	241258881
6477	NC_012852	CGT	2	6	328122	328127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258881
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6480	NC_012852	CAAC	2	8	328453	328460	50 %	0 %	0 %	50 %	241258882
6481	NC_012852	CAA	2	6	328472	328477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241258882
6482	NC_012852	ATC	2	6	328479	328484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258882
6483	NC_012852	GC	3	6	328491	328496	0 %	0 %	50 %	50 %	241258882
6484	NC_012852	TG	3	6	328542	328547	0 %	50 %	50 %	0 %	241258882
6485	NC_012852	CAG	2	6	328557	328562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258882
6486	NC_012852	GGC	2	6	328565	328570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258882
6487	NC_012852	ATC	2	6	328593	328598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241258882
6488	NC_012852	CGG	2	6	328679	328684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258882
6489	NC_012852	GCG	2	6	328754	328759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258882
6490	NC_012852	CG	3	6	328906	328911	0 %	0 %	50 %	50 %	241258882
6491	NC_012852	CTG	2	6	329010	329015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258882
6492	NC_012852	CAACAT	2	12	329036	329047	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	241258882
6493	NC_012852	AGA	2	6	329048	329053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241258882
6494	NC_012852	GTC	2	6	329184	329189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241258882
6495	NC_012852	GGC	2	6	329199	329204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241258882
6496	NC_012852	TGT	2	6	329236	329241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241258882
6497	NC_012852	CGA	2	6	329267	329272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241258882
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6499	NC_012852	TGG	2	6	329517	329522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241258883
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