MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012850	CCTTT	2	10	170735	170744	0 %	60 %	0 %	40 %	241202927
3502	NC_012850	CTG	2	6	170776	170781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202927
3503	NC_012850	CGTTC	2	10	170787	170796	0 %	40 %	20 %	40 %	241202927
3504	NC_012850	CTG	2	6	170825	170830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202927
3505	NC_012850	GC	3	6	171280	171285	0 %	0 %	50 %	50 %	241202928
3506	NC_012850	CGA	2	6	171312	171317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3507	NC_012850	GCC	2	6	171394	171399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202928
3508	NC_012850	CGG	2	6	171462	171467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3509	NC_012850	GGC	2	6	171535	171540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3510	NC_012850	CGA	2	6	171546	171551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3511	NC_012850	GGC	2	6	171565	171570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3512	NC_012850	GCG	2	6	171572	171577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3513	NC_012850	GCG	2	6	171641	171646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3514	NC_012850	GCC	2	6	171655	171660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202928
3515	NC_012850	CAG	3	9	171679	171687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3516	NC_012850	GCC	2	6	171751	171756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202928
3517	NC_012850	GCCG	2	8	171760	171767	0 %	0 %	50 %	50 %	241202928
3518	NC_012850	GCA	2	6	171837	171842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3519	NC_012850	GCC	2	6	171847	171852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202928
3520	NC_012850	CGG	2	6	171864	171869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3521	NC_012850	CGAG	2	8	171891	171898	25 %	0 %	50 %	25 %	241202928
3522	NC_012850	CGGC	2	8	171996	172003	0 %	0 %	50 %	50 %	241202928
3523	NC_012850	GCG	2	6	172016	172021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3524	NC_012850	GGCG	2	8	172026	172033	0 %	0 %	75 %	25 %	241202928
3525	NC_012850	CTC	2	6	172036	172041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202928
3526	NC_012850	GCCA	2	8	172052	172059	25 %	0 %	25 %	50 %	241202928
3527	NC_012850	TCG	2	6	172061	172066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3528	NC_012850	CCGG	2	8	172077	172084	0 %	0 %	50 %	50 %	241202928
3529	NC_012850	CGA	2	6	172107	172112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202928
3530	NC_012850	ATG	2	6	172154	172159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202928
3531	NC_012850	GCG	2	6	172164	172169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202928
3532	NC_012850	CGAG	2	8	172574	172581	25 %	0 %	50 %	25 %	241202929
3533	NC_012850	CACCGA	2	12	172636	172647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241202929
3534	NC_012850	GTC	2	6	172649	172654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3535	NC_012850	CACCGC	2	12	172661	172672	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241202929
3536	NC_012850	GAG	2	6	172703	172708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202929
3537	NC_012850	GCC	2	6	172753	172758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202929
3538	NC_012850	GCC	2	6	172777	172782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202929
3539	NC_012850	CG	3	6	172838	172843	0 %	0 %	50 %	50 %	241202929
3540	NC_012850	CGA	2	6	172864	172869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3541	NC_012850	CGA	2	6	172879	172884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3542	NC_012850	ATC	2	6	172905	172910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202929
3543	NC_012850	GCC	2	6	172916	172921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202929
3544	NC_012850	GAG	2	6	172931	172936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202929
3545	NC_012850	GC	3	6	172954	172959	0 %	0 %	50 %	50 %	241202929
3546	NC_012850	GCGG	2	8	172984	172991	0 %	0 %	75 %	25 %	241202929
3547	NC_012850	GCT	2	6	173026	173031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3548	NC_012850	CTG	2	6	173045	173050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3549	NC_012850	CATCGG	2	12	173056	173067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3550	NC_012850	TGG	2	6	173072	173077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202929
3551	NC_012850	TGA	2	6	173097	173102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202929
3552	NC_012850	CGG	2	6	173103	173108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202929
3553	NC_012850	CCG	2	6	173135	173140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202929
3554	NC_012850	GGA	2	6	173155	173160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202929
3555	NC_012850	GAC	2	6	173174	173179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3556	NC_012850	GC	3	6	173306	173311	0 %	0 %	50 %	50 %	241202929
3557	NC_012850	A	6	6	173316	173321	100 %	0 %	0 %	0 %	241202929
3558	NC_012850	GCC	2	6	173398	173403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202929
3559	NC_012850	TGC	2	6	173409	173414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202929
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3563	NC_012850	CGA	2	6	173467	173472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3564	NC_012850	GCT	2	6	173563	173568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202929
3565	NC_012850	CGCT	2	8	173585	173592	0 %	25 %	25 %	50 %	241202929
3566	NC_012850	GC	3	6	173645	173650	0 %	0 %	50 %	50 %	241202929
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3569	NC_012850	GC	3	6	173860	173865	0 %	0 %	50 %	50 %	241202930
3570	NC_012850	CCG	2	6	173866	173871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202930
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3572	NC_012850	GAA	3	9	174076	174084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202930
3573	NC_012850	GAT	2	6	174100	174105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202930
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3587	NC_012850	TGC	2	6	174899	174904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202931
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3589	NC_012850	GC	3	6	174920	174925	0 %	0 %	50 %	50 %	241202931
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3603	NC_012850	CGC	2	6	175466	175471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202931
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3605	NC_012850	CGA	2	6	175590	175595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202931
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3607	NC_012850	TGA	2	6	175641	175646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202931
3608	NC_012850	GATC	2	8	175650	175657	25 %	25 %	25 %	25 %	241202931
3609	NC_012850	GCT	2	6	175665	175670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202931
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3617	NC_012850	CCGT	2	8	176081	176088	0 %	25 %	25 %	50 %	241202931
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3621	NC_012850	CAA	2	6	176941	176946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202932
3622	NC_012850	CGAAGC	2	12	176950	176961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202932
3623	NC_012850	ACG	2	6	177009	177014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202932
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3640	NC_012850	TCC	2	6	177979	177984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202933
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3724	NC_012850	GAG	2	6	181318	181323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202935
3725	NC_012850	ATCGTC	2	12	181354	181365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241202935
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3728	NC_012850	TCG	2	6	181430	181435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202935
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3741	NC_012850	GAC	2	6	182235	182240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202936
3742	NC_012850	GTT	2	6	182426	182431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202937
3743	NC_012850	CTT	2	6	182456	182461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202937
3744	NC_012850	CGA	2	6	182512	182517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202937
3745	NC_012850	TCT	2	6	182551	182556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202937
3746	NC_012850	TGC	2	6	182571	182576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202937
3747	NC_012850	ATC	2	6	182642	182647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202937
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3749	NC_012850	AG	3	6	182668	182673	50 %	0 %	50 %	0 %	241202937
3750	NC_012850	CGA	2	6	182704	182709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202937
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3754	NC_012850	GTC	2	6	182908	182913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202937
3755	NC_012850	GCCGG	2	10	182914	182923	0 %	0 %	60 %	40 %	241202937
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3770	NC_012850	CGC	2	6	183694	183699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202938
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3774	NC_012850	CGAG	2	8	184341	184348	25 %	0 %	50 %	25 %	241202939
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3776	NC_012850	GCAG	2	8	184464	184471	25 %	0 %	50 %	25 %	241202939
3777	NC_012850	GACG	2	8	184536	184543	25 %	0 %	50 %	25 %	241202939
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3784	NC_012850	CCGCG	2	10	184794	184803	0 %	0 %	40 %	60 %	241202939
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3856	NC_012850	TTGA	2	8	188026	188033	25 %	50 %	25 %	0 %	241202942
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3859	NC_012850	TAG	2	6	188245	188250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202942
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3862	NC_012850	GGA	2	6	188518	188523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202943
3863	NC_012850	GCT	2	6	188556	188561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202943
3864	NC_012850	CGA	2	6	188565	188570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202943
3865	NC_012850	TTG	2	6	188657	188662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202943
3866	NC_012850	TGA	2	6	188664	188669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202943
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3872	NC_012850	GTC	2	6	189191	189196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202944
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3875	NC_012850	CGT	3	9	189281	189289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202944
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3979	NC_012850	CGC	2	6	196647	196652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202948
3980	NC_012850	TCGA	2	8	196664	196671	25 %	25 %	25 %	25 %	241202948
3981	NC_012850	A	6	6	196687	196692	100 %	0 %	0 %	0 %	241202948
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3983	NC_012850	ATC	2	6	196808	196813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202949
3984	NC_012850	CGA	2	6	196971	196976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202949
3985	NC_012850	CCT	2	6	197005	197010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202949
3986	NC_012850	CTTG	2	8	197016	197023	0 %	50 %	25 %	25 %	241202949
3987	NC_012850	GCA	2	6	197223	197228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
3988	NC_012850	CGA	2	6	197410	197415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
3989	NC_012850	CGT	2	6	197599	197604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202950
3990	NC_012850	CCG	2	6	197610	197615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202950
3991	NC_012850	CTA	2	6	197764	197769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202950
3992	NC_012850	CGA	2	6	197818	197823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
3993	NC_012850	TGGT	2	8	197835	197842	0 %	50 %	50 %	0 %	241202950
3994	NC_012850	ACC	2	6	197901	197906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202950
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3998	NC_012850	CGA	2	6	198088	198093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202950
3999	NC_012850	GAG	2	6	198106	198111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202950
4000	NC_012850	GAGCT	2	10	198164	198173	20 %	20 %	40 %	20 %	241202950

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