MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_012850	GCC	3	9	123054	123062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202882
2503	NC_012850	TCA	3	9	123076	123084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202882
2504	NC_012850	GCC	2	6	123121	123126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202882
2505	NC_012850	GC	3	6	123152	123157	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
2506	NC_012850	CGGC	2	8	123239	123246	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
2507	NC_012850	GATC	2	8	123257	123264	25 %	25 %	25 %	25 %	241202882
2508	NC_012850	CGC	2	6	123335	123340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202882
2509	NC_012850	CCG	2	6	123425	123430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202883
2510	NC_012850	GATG	2	8	123508	123515	25 %	25 %	50 %	0 %	241202883
2511	NC_012850	CTG	2	6	123554	123559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202883
2512	NC_012850	GC	3	6	123560	123565	0 %	0 %	50 %	50 %	241202883
2513	NC_012850	ATC	2	6	123608	123613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202883
2514	NC_012850	AGG	2	6	123636	123641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202883
2515	NC_012850	TCA	2	6	123717	123722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202883
2516	NC_012850	TCG	2	6	123723	123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202883
2517	NC_012850	GCC	2	6	123805	123810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202883
2518	NC_012850	GAG	2	6	123824	123829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202883
2519	NC_012850	GC	3	6	123839	123844	0 %	0 %	50 %	50 %	241202883
2520	NC_012850	GAG	2	6	123866	123871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202883
2521	NC_012850	GCC	2	6	123872	123877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202883
2522	NC_012850	CGGC	2	8	123910	123917	0 %	0 %	50 %	50 %	241202883
2523	NC_012850	CCG	2	6	123931	123936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202883
2524	NC_012850	CCG	2	6	124102	124107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202884
2525	NC_012850	TGA	2	6	124111	124116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202884
2526	NC_012850	CAT	3	9	124192	124200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202884
2527	NC_012850	GCC	2	6	124213	124218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202884
2528	NC_012850	GTC	2	6	124220	124225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202884
2529	NC_012850	TGA	2	6	124299	124304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202884
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2532	NC_012850	TCA	2	6	124365	124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202884
2533	NC_012850	CCG	2	6	124371	124376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202884
2534	NC_012850	CCG	2	6	124389	124394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202884
2535	NC_012850	GGC	2	6	124415	124420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202884
2536	NC_012850	GAC	2	6	124501	124506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202884
2537	NC_012850	GAC	2	6	124609	124614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202884
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2539	NC_012850	CCA	2	6	124675	124680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202884
2540	NC_012850	ATC	2	6	124685	124690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202884
2541	NC_012850	TCG	2	6	124707	124712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202884
2542	NC_012850	CCGC	2	8	124720	124727	0 %	0 %	25 %	75 %	241202884
2543	NC_012850	CTGC	2	8	124735	124742	0 %	25 %	25 %	50 %	241202884
2544	NC_012850	ACC	2	6	124761	124766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202884
2545	NC_012850	TGCG	2	8	124776	124783	0 %	25 %	50 %	25 %	241202884
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2549	NC_012850	GAG	2	6	125000	125005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202884
2550	NC_012850	AGGC	2	8	125021	125028	25 %	0 %	50 %	25 %	241202884
2551	NC_012850	GTC	2	6	125036	125041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202884
2552	NC_012850	GGT	2	6	125113	125118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202884
2553	NC_012850	CAG	2	6	125120	125125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202884
2554	NC_012850	ATG	2	6	125305	125310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202885
2555	NC_012850	CTCC	2	8	125322	125329	0 %	25 %	0 %	75 %	241202885
2556	NC_012850	GCCT	2	8	125353	125360	0 %	25 %	25 %	50 %	241202885
2557	NC_012850	TGC	2	6	125408	125413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202885
2558	NC_012850	TCG	2	6	125438	125443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202885
2559	NC_012850	CCA	2	6	125534	125539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202885
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2561	NC_012850	CCGG	2	8	125567	125574	0 %	0 %	50 %	50 %	241202885
2562	NC_012850	TC	3	6	125578	125583	0 %	50 %	0 %	50 %	241202885
2563	NC_012850	CG	3	6	125599	125604	0 %	0 %	50 %	50 %	241202885
2564	NC_012850	GCG	2	6	125608	125613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202885
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2570	NC_012850	GGC	2	6	125936	125941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202885
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2589	NC_012850	GTT	2	6	127454	127459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202887
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2605	NC_012850	GCCG	2	8	128053	128060	0 %	0 %	50 %	50 %	241202887
2606	NC_012850	GAC	2	6	128160	128165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202887
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2611	NC_012850	TTG	2	6	128290	128295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202887
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2617	NC_012850	GGC	2	6	129111	129116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202888
2618	NC_012850	GC	3	6	129119	129124	0 %	0 %	50 %	50 %	241202888
2619	NC_012850	CCGTC	2	10	129174	129183	0 %	20 %	20 %	60 %	241202888
2620	NC_012850	GAA	2	6	129234	129239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202888
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2622	NC_012850	AAG	2	6	129283	129288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202888
2623	NC_012850	TCG	2	6	129346	129351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202888
2624	NC_012850	ATC	2	6	129629	129634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202889
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2626	NC_012850	GAT	2	6	129790	129795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202889
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2628	NC_012850	CGC	2	6	129858	129863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202889
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2654	NC_012850	TCC	2	6	130798	130803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202890
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2727	NC_012850	GGCT	2	8	133821	133828	0 %	25 %	50 %	25 %	241202894
2728	NC_012850	GA	3	6	133879	133884	50 %	0 %	50 %	0 %	241202894
2729	NC_012850	CGGCG	2	10	133900	133909	0 %	0 %	60 %	40 %	241202894
2730	NC_012850	GCG	2	6	133939	133944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202894
2731	NC_012850	CTG	2	6	134007	134012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202894
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2735	NC_012850	TCGG	2	8	134359	134366	0 %	25 %	50 %	25 %	241202895
2736	NC_012850	GCT	2	6	134376	134381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202895
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2739	NC_012850	CGG	2	6	134539	134544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202895
2740	NC_012850	TCTT	2	8	134545	134552	0 %	75 %	0 %	25 %	241202895
2741	NC_012850	TGCAT	2	10	134573	134582	20 %	40 %	20 %	20 %	241202895
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2743	NC_012850	GAG	2	6	134617	134622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202895
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2859	NC_012850	ACG	2	6	140335	140340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202898
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2982	NC_012850	CGT	2	6	146136	146141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202903
2983	NC_012850	CGA	2	6	146142	146147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202903
2984	NC_012850	GAA	2	6	146259	146264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202904
2985	NC_012850	GAAGAT	2	12	146322	146333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	241202904
2986	NC_012850	GCC	4	12	146340	146351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202904
2987	NC_012850	GCG	2	6	146359	146364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202904
2988	NC_012850	CAA	2	6	146447	146452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202904
2989	NC_012850	GCCG	2	8	146478	146485	0 %	0 %	50 %	50 %	241202904
2990	NC_012850	CGA	2	6	146522	146527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2991	NC_012850	CGA	2	6	146537	146542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2992	NC_012850	GCA	2	6	146546	146551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2993	NC_012850	GGCG	2	8	146577	146584	0 %	0 %	75 %	25 %	241202904
2994	NC_012850	GCG	3	9	146611	146619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202904
2995	NC_012850	GCA	2	6	146651	146656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2996	NC_012850	GCA	2	6	146711	146716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2997	NC_012850	AAC	2	6	146772	146777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202904
2998	NC_012850	AGC	2	6	146803	146808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202904
2999	NC_012850	GGA	2	6	146889	146894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202904
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