MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

< Previous12345678910111213...198199Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012850	TC	4	8	96292	96299	0 %	50 %	0 %	50 %	241202854
2003	NC_012850	CCT	2	6	96323	96328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202854
2004	NC_012850	CGA	2	6	96341	96346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2005	NC_012850	CGT	2	6	96355	96360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2006	NC_012850	TC	3	6	96361	96366	0 %	50 %	0 %	50 %	241202854
2007	NC_012850	GCT	2	6	96386	96391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2008	NC_012850	AACC	2	8	96393	96400	50 %	0 %	0 %	50 %	241202854
2009	NC_012850	CGA	2	6	96507	96512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2010	NC_012850	GCC	2	6	96549	96554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202854
2011	NC_012850	CGGA	2	8	96567	96574	25 %	0 %	50 %	25 %	241202854
2012	NC_012850	GGA	2	6	96623	96628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202854
2013	NC_012850	GCG	2	6	96662	96667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202854
2014	NC_012850	GCT	2	6	96771	96776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2015	NC_012850	TGC	2	6	96820	96825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
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2017	NC_012850	T	6	6	96863	96868	0 %	100 %	0 %	0 %	241202854
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2022	NC_012850	T	6	6	97071	97076	0 %	100 %	0 %	0 %	241202854
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2122	NC_012850	GAT	2	6	103588	103593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202865
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2124	NC_012850	CAC	2	6	103759	103764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202865
2125	NC_012850	GC	3	6	103780	103785	0 %	0 %	50 %	50 %	241202865
2126	NC_012850	ATG	2	6	103814	103819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202865
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2128	NC_012850	CGA	2	6	103866	103871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202865
2129	NC_012850	ACT	2	6	103887	103892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202865
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2246	NC_012850	ATGG	2	8	109888	109895	25 %	25 %	50 %	0 %	241202870
2247	NC_012850	CGT	2	6	109938	109943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202870
2248	NC_012850	T	6	6	109959	109964	0 %	100 %	0 %	0 %	241202870
2249	NC_012850	CGGCCA	2	12	109972	109983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241202870
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2272	NC_012850	CTG	3	9	111026	111034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202872
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2355	NC_012850	GAAT	2	8	116083	116090	50 %	25 %	25 %	0 %	241202876
2356	NC_012850	TAG	2	6	116187	116192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202876
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2358	NC_012850	GCT	2	6	116217	116222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202876
2359	NC_012850	ACAT	2	8	116316	116323	50 %	25 %	0 %	25 %	241202876
2360	NC_012850	TGACC	2	10	116344	116353	20 %	20 %	20 %	40 %	241202876
2361	NC_012850	CAA	2	6	116470	116475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202876
2362	NC_012850	GCGCC	2	10	116492	116501	0 %	0 %	40 %	60 %	241202876
2363	NC_012850	AAC	2	6	116504	116509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202876
2364	NC_012850	AG	3	6	116558	116563	50 %	0 %	50 %	0 %	241202876
2365	NC_012850	CTT	2	6	116624	116629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202876
2366	NC_012850	GC	3	6	116695	116700	0 %	0 %	50 %	50 %	241202876
2367	NC_012850	CCTC	2	8	116797	116804	0 %	25 %	0 %	75 %	241202876
2368	NC_012850	GAG	2	6	116867	116872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202876
2369	NC_012850	ATG	2	6	116894	116899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202876
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2371	NC_012850	CGATCT	2	12	116986	116997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241202876
2372	NC_012850	TGGT	2	8	117004	117011	0 %	50 %	50 %	0 %	241202876
2373	NC_012850	GC	3	6	117554	117559	0 %	0 %	50 %	50 %	241202877
2374	NC_012850	GCG	2	6	117565	117570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202877
2375	NC_012850	CGC	2	6	117630	117635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202877
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2485	NC_012850	GCC	2	6	122278	122283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202881
2486	NC_012850	CGT	2	6	122318	122323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202881
2487	NC_012850	CGG	2	6	122370	122375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202881
2488	NC_012850	CGG	2	6	122388	122393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202881
2489	NC_012850	GAT	2	6	122427	122432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202881
2490	NC_012850	CGT	2	6	122439	122444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202881
2491	NC_012850	ATC	2	6	122509	122514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202881
2492	NC_012850	GCC	2	6	122515	122520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202881
2493	NC_012850	CCGC	2	8	122584	122591	0 %	0 %	25 %	75 %	241202882
2494	NC_012850	TCA	2	6	122704	122709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202882
2495	NC_012850	GC	3	6	122793	122798	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
2496	NC_012850	ACA	2	6	122860	122865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241202882
2497	NC_012850	GCTCG	2	10	122900	122909	0 %	20 %	40 %	40 %	241202882
2498	NC_012850	CCGG	2	8	122927	122934	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
2499	NC_012850	GC	3	6	122949	122954	0 %	0 %	50 %	50 %	241202882
2500	NC_012850	TGA	2	6	122977	122982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202882

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