MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012850	TGG	2	6	73431	73436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202830
1502	NC_012850	CATG	2	8	73463	73470	25 %	25 %	25 %	25 %	241202830
1503	NC_012850	CCG	2	6	73471	73476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202830
1504	NC_012850	CGC	2	6	73517	73522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202830
1505	NC_012850	TTC	2	6	73618	73623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202830
1506	NC_012850	TGA	2	6	73685	73690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202830
1507	NC_012850	GGC	2	6	73697	73702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202830
1508	NC_012850	GC	3	6	73710	73715	0 %	0 %	50 %	50 %	241202830
1509	NC_012850	GCC	2	6	73742	73747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202830
1510	NC_012850	ACCGAT	2	12	73812	73823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241202830
1511	NC_012850	TGC	2	6	73888	73893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1512	NC_012850	ATC	2	6	73909	73914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202831
1513	NC_012850	AGC	2	6	73924	73929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1514	NC_012850	TCA	2	6	73949	73954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202831
1515	NC_012850	ATC	2	6	73972	73977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202831
1516	NC_012850	AGC	4	12	74023	74034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1517	NC_012850	CAGG	2	8	74054	74061	25 %	0 %	50 %	25 %	241202831
1518	NC_012850	CAG	3	9	74076	74084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1519	NC_012850	GAC	3	9	74127	74135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1520	NC_012850	AGC	2	6	74167	74172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1521	NC_012850	CGA	2	6	74216	74221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1522	NC_012850	CGG	2	6	74262	74267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202831
1523	NC_012850	GCC	2	6	74288	74293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202831
1524	NC_012850	CGG	2	6	74316	74321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202831
1525	NC_012850	CGC	2	6	74357	74362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202831
1526	NC_012850	CG	3	6	74390	74395	0 %	0 %	50 %	50 %	241202831
1527	NC_012850	CAG	2	6	74409	74414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202831
1528	NC_012850	GGCC	2	8	74420	74427	0 %	0 %	50 %	50 %	241202831
1529	NC_012850	CAGCGA	2	12	74514	74525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1530	NC_012850	TCG	2	6	74531	74536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1531	NC_012850	CGA	2	6	74571	74576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1532	NC_012850	AAT	2	6	74583	74588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241202832
1533	NC_012850	TGA	2	6	74592	74597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202832
1534	NC_012850	GC	3	6	74599	74604	0 %	0 %	50 %	50 %	241202832
1535	NC_012850	GCC	2	6	74614	74619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202832
1536	NC_012850	GGT	2	6	74620	74625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202832
1537	NC_012850	TTG	2	6	74690	74695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202832
1538	NC_012850	CGGCC	2	10	74756	74765	0 %	0 %	40 %	60 %	241202832
1539	NC_012850	CGG	3	9	74781	74789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1540	NC_012850	CGG	2	6	74965	74970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1541	NC_012850	GCA	2	6	74994	74999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1542	NC_012850	GGC	2	6	75034	75039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1543	NC_012850	GCCG	2	8	75087	75094	0 %	0 %	50 %	50 %	241202832
1544	NC_012850	AGGC	2	8	75143	75150	25 %	0 %	50 %	25 %	241202832
1545	NC_012850	CGC	2	6	75162	75167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202832
1546	NC_012850	GCC	2	6	75173	75178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202832
1547	NC_012850	GCA	2	6	75183	75188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1548	NC_012850	TCG	2	6	75221	75226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1549	NC_012850	GGC	2	6	75257	75262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1550	NC_012850	GGCG	2	8	75279	75286	0 %	0 %	75 %	25 %	241202832
1551	NC_012850	CGG	2	6	75288	75293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1552	NC_012850	CGA	2	6	75294	75299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1553	NC_012850	GCC	2	6	75310	75315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202832
1554	NC_012850	TCG	2	6	75395	75400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202832
1555	NC_012850	TCGC	2	8	75497	75504	0 %	25 %	25 %	50 %	241202832
1556	NC_012850	GCG	2	6	75531	75536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1557	NC_012850	GC	3	6	75561	75566	0 %	0 %	50 %	50 %	241202832
1558	NC_012850	CGG	2	6	75573	75578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202832
1559	NC_012850	ACGG	2	8	75584	75591	25 %	0 %	50 %	25 %	241202832
1560	NC_012850	TCA	2	6	75738	75743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202833
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1562	NC_012850	GCG	2	6	75824	75829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202833
1563	NC_012850	TCG	2	6	75848	75853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202833
1564	NC_012850	CGA	3	9	75878	75886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202833
1565	NC_012850	GGC	2	6	75895	75900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202833
1566	NC_012850	CGA	2	6	75935	75940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202833
1567	NC_012850	GAT	2	6	75993	75998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202833
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1569	NC_012850	GAT	2	6	76047	76052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202833
1570	NC_012850	CGC	2	6	76082	76087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202833
1571	NC_012850	CCG	2	6	76099	76104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202833
1572	NC_012850	GA	3	6	76105	76110	50 %	0 %	50 %	0 %	241202833
1573	NC_012850	AGG	2	6	76202	76207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202833
1574	NC_012850	GCG	2	6	76242	76247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202833
1575	NC_012850	ACG	2	6	76249	76254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202833
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1582	NC_012850	GCT	2	6	76489	76494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202833
1583	NC_012850	TCG	2	6	76520	76525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202833
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1589	NC_012850	CGC	2	6	76897	76902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202834
1590	NC_012850	GCCT	2	8	76913	76920	0 %	25 %	25 %	50 %	241202834
1591	NC_012850	GAG	2	6	76959	76964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202834
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1603	NC_012850	CGG	2	6	77423	77428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202834
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1607	NC_012850	CGA	2	6	77576	77581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202834
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1611	NC_012850	TTG	2	6	77796	77801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202835
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1613	NC_012850	CAT	2	6	77888	77893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202835
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1619	NC_012850	GCGTC	2	10	77995	78004	0 %	20 %	40 %	40 %	241202835
1620	NC_012850	TC	3	6	78051	78056	0 %	50 %	0 %	50 %	241202835
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1622	NC_012850	CGG	2	6	78154	78159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202835
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1624	NC_012850	TTG	2	6	78189	78194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202835
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1873	NC_012850	TGA	2	6	90320	90325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202849
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1996	NC_012850	GGGGA	2	10	96069	96078	20 %	0 %	80 %	0 %	241202854
1997	NC_012850	TCG	2	6	96082	96087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
1998	NC_012850	TGC	2	6	96106	96111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202854
1999	NC_012850	GAC	2	6	96128	96133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202854
2000	NC_012850	CGG	2	6	96145	96150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202854

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