MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_012850	CTG	2	6	27326	27331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202783
503	NC_012850	CAG	2	6	27357	27362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202783
504	NC_012850	GAC	2	6	27503	27508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202784
505	NC_012850	CGA	2	6	27571	27576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202784
506	NC_012850	CGC	2	6	27589	27594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202784
507	NC_012850	GC	3	6	27635	27640	0 %	0 %	50 %	50 %	241202784
508	NC_012850	CGT	2	6	27683	27688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
509	NC_012850	TCG	2	6	27699	27704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
510	NC_012850	GAT	2	6	27707	27712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
511	NC_012850	GGC	2	6	27713	27718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
512	NC_012850	GCG	2	6	27751	27756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
513	NC_012850	GAT	2	6	27920	27925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
514	NC_012850	CCGCG	2	10	27934	27943	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
515	NC_012850	GGC	2	6	27956	27961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
516	NC_012850	GCCG	2	8	27992	27999	0 %	0 %	50 %	50 %	241202784
517	NC_012850	GAT	2	6	28070	28075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
518	NC_012850	TCT	2	6	28078	28083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202784
519	NC_012850	GCTGA	2	10	28139	28148	20 %	20 %	40 %	20 %	241202784
520	NC_012850	TCG	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202784
521	NC_012850	GCG	2	6	28155	28160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202784
522	NC_012850	GCC	2	6	28205	28210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202784
523	NC_012850	GCGCC	2	10	28244	28253	0 %	0 %	40 %	60 %	241202784
524	NC_012850	TGGT	2	8	28254	28261	0 %	50 %	50 %	0 %	241202784
525	NC_012850	TGA	2	6	28279	28284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202784
526	NC_012850	GTT	2	6	28324	28329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202784
527	NC_012850	AGC	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202784
528	NC_012850	GTT	2	6	28382	28387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202784
529	NC_012850	GAA	3	9	28443	28451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202784
530	NC_012850	TGTT	2	8	28525	28532	0 %	75 %	25 %	0 %	241202785
531	NC_012850	GTT	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202785
532	NC_012850	CTG	3	9	28700	28708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202785
533	NC_012850	CCT	2	6	28840	28845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
534	NC_012850	TGA	2	6	28900	28905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202785
535	NC_012850	CGG	2	6	28969	28974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202785
536	NC_012850	GTC	2	6	29084	29089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202785
537	NC_012850	CG	3	6	29095	29100	0 %	0 %	50 %	50 %	241202785
538	NC_012850	CCT	2	6	29269	29274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
539	NC_012850	CGA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
540	NC_012850	CCT	2	6	29356	29361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202785
541	NC_012850	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202785
542	NC_012850	CGA	2	6	29458	29463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
543	NC_012850	GGT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202785
544	NC_012850	GAC	2	6	29528	29533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202785
545	NC_012850	CGG	2	6	29539	29544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202785
546	NC_012850	GCG	2	6	29549	29554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202785
547	NC_012850	ATC	3	9	29601	29609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202785
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549	NC_012850	CGC	2	6	29621	29626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202785
550	NC_012850	CTT	3	9	29627	29635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202785
551	NC_012850	GCC	2	6	29679	29684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202785
552	NC_012850	CGTC	2	8	29737	29744	0 %	25 %	25 %	50 %	241202785
553	NC_012850	TGA	2	6	29821	29826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202785
554	NC_012850	TGC	2	6	29842	29847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202785
555	NC_012850	CGT	2	6	29848	29853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202785
556	NC_012850	CCCG	2	8	30243	30250	0 %	0 %	25 %	75 %	241202786
557	NC_012850	GGC	2	6	30255	30260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202786
558	NC_012850	AGG	2	6	30266	30271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202786
559	NC_012850	TCG	2	6	30291	30296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202786
560	NC_012850	CCT	2	6	30303	30308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202786
561	NC_012850	GGC	2	6	30424	30429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202786
562	NC_012850	GCC	2	6	30432	30437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202786
563	NC_012850	CAC	2	6	30496	30501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202786
564	NC_012850	CGG	2	6	30537	30542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202786
565	NC_012850	CAG	2	6	30568	30573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202786
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568	NC_012850	ACG	2	6	30686	30691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202786
569	NC_012850	GAC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202786
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571	NC_012850	GAGCA	2	10	30818	30827	40 %	0 %	40 %	20 %	241202786
572	NC_012850	CGGC	2	8	30832	30839	0 %	0 %	50 %	50 %	241202786
573	NC_012850	GACGCG	2	12	30859	30870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202786
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578	NC_012850	TTC	2	6	31219	31224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202787
579	NC_012850	CGTC	2	8	31247	31254	0 %	25 %	25 %	50 %	241202787
580	NC_012850	GGCG	2	8	31266	31273	0 %	0 %	75 %	25 %	241202787
581	NC_012850	ATG	2	6	31274	31279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202787
582	NC_012850	TCGAGA	2	12	31317	31328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241202787
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584	NC_012850	TTC	2	6	31363	31368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202787
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594	NC_012850	CAG	2	6	31925	31930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202788
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599	NC_012850	GC	3	6	32170	32175	0 %	0 %	50 %	50 %	241202789
600	NC_012850	CGC	2	6	32208	32213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202789
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614	NC_012850	TCG	2	6	33063	33068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202790
615	NC_012850	GAAAT	2	10	33198	33207	60 %	20 %	20 %	0 %	241202790
616	NC_012850	AGCG	2	8	33257	33264	25 %	0 %	50 %	25 %	241202790
617	NC_012850	CCT	2	6	33277	33282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202790
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622	NC_012850	GCA	2	6	33634	33639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202791
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624	NC_012850	CGGC	2	8	33669	33676	0 %	0 %	50 %	50 %	241202791
625	NC_012850	GAG	2	6	33681	33686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241202791
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627	NC_012850	CGG	2	6	33718	33723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202791
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