MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012850	CTT	2	6	295896	295901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203041
6002	NC_012850	GCC	2	6	295910	295915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6003	NC_012850	AGA	2	6	295965	295970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203041
6004	NC_012850	G	6	6	296011	296016	0 %	0 %	100 %	0 %	241203041
6005	NC_012850	CGT	2	6	296037	296042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6006	NC_012850	GCC	2	6	296062	296067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6007	NC_012850	TCG	2	6	296099	296104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6008	NC_012850	TTG	2	6	296114	296119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241203041
6009	NC_012850	GCG	2	6	296132	296137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203041
6010	NC_012850	CAG	2	6	296185	296190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6011	NC_012850	GCC	2	6	296233	296238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6012	NC_012850	GTA	2	6	296242	296247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203041
6013	NC_012850	CGT	2	6	296274	296279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6014	NC_012850	GCG	2	6	296298	296303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203041
6015	NC_012850	ACC	2	6	296327	296332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203041
6016	NC_012850	GGA	2	6	296453	296458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203041
6017	NC_012850	GGCCTT	2	12	296494	296505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6018	NC_012850	GCC	2	6	296521	296526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6019	NC_012850	CGC	2	6	296539	296544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6020	NC_012850	GAA	2	6	296605	296610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203041
6021	NC_012850	GGT	2	6	296650	296655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203041
6022	NC_012850	GAA	2	6	296695	296700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203041
6023	NC_012850	GT	3	6	296725	296730	0 %	50 %	50 %	0 %	241203041
6024	NC_012850	CTT	2	6	296761	296766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203041
6025	NC_012850	CGC	2	6	296856	296861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203041
6026	NC_012850	TCG	2	6	296903	296908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6027	NC_012850	CGA	2	6	296958	296963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203041
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6029	NC_012850	CGT	2	6	297079	297084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203041
6030	NC_012850	TCT	2	6	297108	297113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203041
6031	NC_012850	AGCA	2	8	297127	297134	50 %	0 %	25 %	25 %	241203041
6032	NC_012850	CAGG	2	8	297230	297237	25 %	0 %	50 %	25 %	241203041
6033	NC_012850	GGC	2	6	297247	297252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203041
6034	NC_012850	GC	3	6	297273	297278	0 %	0 %	50 %	50 %	241203041
6035	NC_012850	CATT	2	8	297616	297623	25 %	50 %	0 %	25 %	241203042
6036	NC_012850	GGC	2	6	297634	297639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203042
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6038	NC_012850	TCGA	2	8	297737	297744	25 %	25 %	25 %	25 %	241203042
6039	NC_012850	CGAG	2	8	297818	297825	25 %	0 %	50 %	25 %	241203042
6040	NC_012850	CCG	2	6	297842	297847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203042
6041	NC_012850	CGG	2	6	297891	297896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203042
6042	NC_012850	CAA	2	6	297897	297902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241203042
6043	NC_012850	CGA	2	6	297950	297955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203042
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6045	NC_012850	CGC	2	6	297987	297992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203042
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6047	NC_012850	CTG	2	6	298063	298068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203042
6048	NC_012850	TCG	2	6	298094	298099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203042
6049	NC_012850	TCA	2	6	298253	298258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203042
6050	NC_012850	GATCT	2	10	298264	298273	20 %	40 %	20 %	20 %	241203042
6051	NC_012850	CGA	2	6	298328	298333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203042
6052	NC_012850	TCGC	2	8	298354	298361	0 %	25 %	25 %	50 %	241203042
6053	NC_012850	GGA	2	6	298386	298391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203042
6054	NC_012850	GCG	2	6	298405	298410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203042
6055	NC_012850	GCC	2	6	298454	298459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203042
6056	NC_012850	CG	3	6	298470	298475	0 %	0 %	50 %	50 %	241203042
6057	NC_012850	CGC	2	6	298573	298578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203043
6058	NC_012850	TCG	2	6	298600	298605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203043
6059	NC_012850	GA	3	6	298690	298695	50 %	0 %	50 %	0 %	241203043
6060	NC_012850	TCG	2	6	298696	298701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203043
6061	NC_012850	GTTC	2	8	298721	298728	0 %	50 %	25 %	25 %	241203043
6062	NC_012850	AGC	2	6	298750	298755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203043
6063	NC_012850	TTC	2	6	298818	298823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203043
6064	NC_012850	TC	3	6	298871	298876	0 %	50 %	0 %	50 %	241203043
6065	NC_012850	GAT	2	6	298985	298990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203043
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6067	NC_012850	CAT	2	6	299063	299068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203043
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6092	NC_012850	CAG	2	6	300148	300153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203044
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6102	NC_012850	CCGGCG	2	12	300580	300591	0 %	0 %	50 %	50 %	241203044
6103	NC_012850	TGG	2	6	300599	300604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203044
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6107	NC_012850	CCCAT	2	10	300843	300852	20 %	20 %	0 %	60 %	241203045
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6121	NC_012850	GCC	3	9	301294	301302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203045
6122	NC_012850	CGG	2	6	301341	301346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203045
6123	NC_012850	GCG	2	6	301352	301357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203045
6124	NC_012850	CCG	2	6	301378	301383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203045
6125	NC_012850	GCA	2	6	301488	301493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203045
6126	NC_012850	GAG	2	6	301523	301528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203045
6127	NC_012850	TGG	2	6	301590	301595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203045
6128	NC_012850	GGTC	2	8	301618	301625	0 %	25 %	50 %	25 %	241203045
6129	NC_012850	GCG	2	6	301718	301723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203045
6130	NC_012850	GCC	2	6	301761	301766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203045
6131	NC_012850	GCTG	2	8	301794	301801	0 %	25 %	50 %	25 %	241203045
6132	NC_012850	TAT	2	6	301832	301837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203045
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6134	NC_012850	GCCG	2	8	301930	301937	0 %	0 %	50 %	50 %	241203045
6135	NC_012850	TC	3	6	302002	302007	0 %	50 %	0 %	50 %	241203045
6136	NC_012850	CGC	2	6	302017	302022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203045
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6142	NC_012850	TGG	2	6	302178	302183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203046
6143	NC_012850	GC	3	6	302230	302235	0 %	0 %	50 %	50 %	241203046
6144	NC_012850	CGG	2	6	302350	302355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203046
6145	NC_012850	ATCG	2	8	302384	302391	25 %	25 %	25 %	25 %	241203046
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6150	NC_012850	GGA	2	6	302656	302661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203046
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6157	NC_012850	CTG	2	6	302886	302891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203047
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6165	NC_012850	ATG	2	6	303154	303159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203047
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6228	NC_012850	CGT	2	6	305948	305953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203050
6229	NC_012850	GCT	2	6	305987	305992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203050
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6233	NC_012850	CGC	2	6	306089	306094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203050
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6235	NC_012850	GGA	2	6	306122	306127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203050
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6238	NC_012850	ACC	2	6	306226	306231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203050
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6240	NC_012850	ACG	2	6	306289	306294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203050
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6361	NC_012850	GCA	2	6	311948	311953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203056
6362	NC_012850	CAT	2	6	311955	311960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203056
6363	NC_012850	ATGA	2	8	311974	311981	50 %	25 %	25 %	0 %	241203056
6364	NC_012850	TTC	2	6	312160	312165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203056
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6372	NC_012850	GC	3	6	312546	312551	0 %	0 %	50 %	50 %	241203056
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6374	NC_012850	GAC	2	6	312710	312715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
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6393	NC_012850	GCA	2	6	313605	313610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203057
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6441	NC_012850	CGA	2	6	315633	315638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203059
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6467	NC_012850	GATCC	2	10	316726	316735	20 %	20 %	20 %	40 %	241203060
6468	NC_012850	GAT	2	6	316752	316757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203060
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6480	NC_012850	CGA	2	6	317197	317202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6481	NC_012850	TCT	2	6	317224	317229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203061
6482	NC_012850	CGA	2	6	317269	317274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6483	NC_012850	GGC	2	6	317276	317281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203061
6484	NC_012850	TCG	2	6	317437	317442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6485	NC_012850	CGA	2	6	317443	317448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6486	NC_012850	GTC	2	6	317453	317458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6487	NC_012850	CGGA	2	8	317462	317469	25 %	0 %	50 %	25 %	241203061
6488	NC_012850	CAG	2	6	317471	317476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6489	NC_012850	TCG	2	6	317574	317579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6490	NC_012850	ATA	2	6	317591	317596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241203061
6491	NC_012850	TCG	2	6	317691	317696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6492	NC_012850	CGA	2	6	317782	317787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203061
6493	NC_012850	TGA	2	6	317821	317826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203061
6494	NC_012850	GGA	3	9	317846	317854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203061
6495	NC_012850	CGG	2	6	317857	317862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203061
6496	NC_012850	CATCGC	2	12	318033	318044	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241203062
6497	NC_012850	TCT	2	6	318048	318053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203062
6498	NC_012850	GCG	2	6	318062	318067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203062
6499	NC_012850	GAT	2	6	318079	318084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203062
6500	NC_012850	GT	3	6	318117	318122	0 %	50 %	50 %	0 %	241203062

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