MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012850	CGC	2	6	270067	270072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5502	NC_012850	TCTCGA	2	12	270086	270097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241203010
5503	NC_012850	ACG	2	6	270115	270120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5504	NC_012850	GCC	2	6	270132	270137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5505	NC_012850	CGC	2	6	270165	270170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5506	NC_012850	TCG	2	6	270172	270177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5507	NC_012850	CGG	2	6	270212	270217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203010
5508	NC_012850	ATC	2	6	270231	270236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203010
5509	NC_012850	TGA	2	6	270247	270252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203010
5510	NC_012850	TGC	2	6	270290	270295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5511	NC_012850	CCG	2	6	270382	270387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5512	NC_012850	GCA	2	6	270439	270444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5513	NC_012850	GCG	2	6	270445	270450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203010
5514	NC_012850	TTC	2	6	270456	270461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203010
5515	NC_012850	TCGAAC	2	12	270502	270513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241203010
5516	NC_012850	TCG	2	6	270562	270567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5517	NC_012850	GAG	2	6	270572	270577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203010
5518	NC_012850	CGT	2	6	270584	270589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5519	NC_012850	CGG	2	6	270673	270678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203010
5520	NC_012850	TC	3	6	270764	270769	0 %	50 %	0 %	50 %	241203010
5521	NC_012850	GC	3	6	270771	270776	0 %	0 %	50 %	50 %	241203010
5522	NC_012850	GCT	2	6	270806	270811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
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5524	NC_012850	TGC	2	6	270916	270921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5525	NC_012850	GC	3	6	270920	270925	0 %	0 %	50 %	50 %	241203010
5526	NC_012850	CGA	2	6	270947	270952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5527	NC_012850	TCGT	2	8	271023	271030	0 %	50 %	25 %	25 %	241203010
5528	NC_012850	TCGA	2	8	271039	271046	25 %	25 %	25 %	25 %	241203010
5529	NC_012850	GCCGCT	2	12	271199	271210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241203010
5530	NC_012850	CGC	2	6	271229	271234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5531	NC_012850	CCGC	2	8	271255	271262	0 %	0 %	25 %	75 %	241203010
5532	NC_012850	TCA	2	6	271380	271385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203011
5533	NC_012850	CGG	2	6	271391	271396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203011
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5535	NC_012850	CGT	2	6	271516	271521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5536	NC_012850	CGG	2	6	271555	271560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203011
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5539	NC_012850	CCT	2	6	271653	271658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203011
5540	NC_012850	GCG	3	9	271701	271709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203011
5541	NC_012850	GCT	2	6	271813	271818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5542	NC_012850	CGCC	2	8	271894	271901	0 %	0 %	25 %	75 %	241203011
5543	NC_012850	TCG	2	6	271922	271927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5544	NC_012850	CGAT	2	8	271941	271948	25 %	25 %	25 %	25 %	241203011
5545	NC_012850	CT	3	6	271950	271955	0 %	50 %	0 %	50 %	241203011
5546	NC_012850	CG	3	6	271965	271970	0 %	0 %	50 %	50 %	241203011
5547	NC_012850	TGC	2	6	271998	272003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
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5550	NC_012850	GAG	2	6	272111	272116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203011
5551	NC_012850	CGC	2	6	272128	272133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203011
5552	NC_012850	TGC	2	6	272148	272153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5553	NC_012850	GCT	2	6	272191	272196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5554	NC_012850	GCCG	2	8	272201	272208	0 %	0 %	50 %	50 %	241203011
5555	NC_012850	CAG	2	6	272209	272214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203011
5556	NC_012850	GCCT	2	8	272252	272259	0 %	25 %	25 %	50 %	241203011
5557	NC_012850	TTC	2	6	272282	272287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203011
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5560	NC_012850	CG	3	6	272477	272482	0 %	0 %	50 %	50 %	241203012
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5604	NC_012850	GCCGGC	2	12	274378	274389	0 %	0 %	50 %	50 %	241203012
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5612	NC_012850	TTCG	2	8	274738	274745	0 %	50 %	25 %	25 %	241203013
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5620	NC_012850	CGT	2	6	275253	275258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203014
5621	NC_012850	TGC	2	6	275285	275290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203014
5622	NC_012850	ACC	2	6	275417	275422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203015
5623	NC_012850	ATT	2	6	275484	275489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241203015
5624	NC_012850	CCT	2	6	275571	275576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203015
5625	NC_012850	CG	3	6	275582	275587	0 %	0 %	50 %	50 %	241203015
5626	NC_012850	CAT	2	6	275599	275604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203015
5627	NC_012850	TCGAGA	2	12	275619	275630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241203015
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5630	NC_012850	CAGCTT	2	12	275926	275937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241203016
5631	NC_012850	CGG	2	6	275946	275951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203016
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5634	NC_012850	GCC	2	6	276002	276007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203016
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5638	NC_012850	TGC	2	6	276669	276674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203017
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5646	NC_012850	CGA	2	6	277311	277316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203018
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5738	NC_012850	ATC	2	6	281604	281609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
5739	NC_012850	GGCC	2	8	281611	281618	0 %	0 %	50 %	50 %	241203023
5740	NC_012850	ACT	2	6	281632	281637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203023
5741	NC_012850	AGA	2	6	281803	281808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203024
5742	NC_012850	ATC	2	6	281888	281893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203024
5743	NC_012850	AAGT	2	8	282008	282015	50 %	25 %	25 %	0 %	241203024
5744	NC_012850	CGA	2	6	282175	282180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203025
5745	NC_012850	GAA	2	6	282187	282192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203025
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5748	NC_012850	GGT	2	6	282310	282315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203025
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5751	NC_012850	TCG	2	6	282456	282461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203025
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5753	NC_012850	TCGAGA	2	12	282495	282506	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241203025
5754	NC_012850	AGGC	2	8	282537	282544	25 %	0 %	50 %	25 %	241203025
5755	NC_012850	AGA	2	6	282582	282587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203025
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5758	NC_012850	TC	3	6	282955	282960	0 %	50 %	0 %	50 %	241203026
5759	NC_012850	GCTG	2	8	282963	282970	0 %	25 %	50 %	25 %	241203026
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5765	NC_012850	CGT	2	6	283822	283827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203027
5766	NC_012850	GCTG	2	8	283897	283904	0 %	25 %	50 %	25 %	241203027
5767	NC_012850	AGG	2	6	283956	283961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241203027
5768	NC_012850	GC	3	6	283992	283997	0 %	0 %	50 %	50 %	241203027
5769	NC_012850	GCC	2	6	284231	284236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203028
5770	NC_012850	CTT	2	6	284260	284265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203028
5771	NC_012850	TCC	2	6	284282	284287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203028
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5775	NC_012850	TCG	2	6	284629	284634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
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5800	NC_012850	CTG	2	6	285851	285856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203029
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5842	NC_012850	GA	3	6	287791	287796	50 %	0 %	50 %	0 %	241203031
5843	NC_012850	CGT	3	9	287806	287814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203031
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5861	NC_012850	GCG	2	6	289248	289253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203032
5862	NC_012850	G	6	6	289276	289281	0 %	0 %	100 %	0 %	241203032
5863	NC_012850	CGG	2	6	289297	289302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203032
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5979	NC_012850	AGC	2	6	294934	294939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203040
5980	NC_012850	CAG	2	6	294940	294945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203040
5981	NC_012850	ACG	2	6	294946	294951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203040
5982	NC_012850	CCG	3	9	295063	295071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203040
5983	NC_012850	GCGCA	2	10	295098	295107	20 %	0 %	40 %	40 %	241203040
5984	NC_012850	TGA	2	6	295118	295123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203040
5985	NC_012850	CGGA	2	8	295143	295150	25 %	0 %	50 %	25 %	241203040
5986	NC_012850	AGA	2	6	295172	295177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203040
5987	NC_012850	GAAG	2	8	295225	295232	50 %	0 %	50 %	0 %	241203040
5988	NC_012850	GCG	2	6	295243	295248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203040
5989	NC_012850	GCG	2	6	295268	295273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203040
5990	NC_012850	ATG	2	6	295291	295296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203040
5991	NC_012850	CTC	2	6	295357	295362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241203040
5992	NC_012850	AGA	2	6	295363	295368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203040
5993	NC_012850	ATG	2	6	295375	295380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203040
5994	NC_012850	TCA	2	6	295397	295402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203040
5995	NC_012850	CGA	2	6	295418	295423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203040
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