MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012850	CCG	2	6	246740	246745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5003	NC_012850	CGG	2	6	246830	246835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5004	NC_012850	CTG	2	6	246849	246854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5005	NC_012850	GC	3	6	246860	246865	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5006	NC_012850	GCC	2	6	246919	246924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5007	NC_012850	TGC	2	6	246986	246991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5008	NC_012850	CCG	2	6	247025	247030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5009	NC_012850	CGC	2	6	247047	247052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5010	NC_012850	CG	3	6	247096	247101	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5011	NC_012850	CGC	2	6	247127	247132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5012	NC_012850	CGC	2	6	247137	247142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5013	NC_012850	GCC	2	6	247198	247203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5014	NC_012850	GCG	2	6	247295	247300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5015	NC_012850	CGG	3	9	247358	247366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5016	NC_012850	GCG	2	6	247405	247410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5017	NC_012850	GCG	2	6	247445	247450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5018	NC_012850	GCA	2	6	247462	247467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5019	NC_012850	GGC	2	6	247492	247497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5020	NC_012850	GCG	2	6	247499	247504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5021	NC_012850	CG	3	6	247503	247508	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5022	NC_012850	CGC	2	6	247511	247516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5023	NC_012850	ATG	2	6	247546	247551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202992
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5025	NC_012850	CAG	2	6	247575	247580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5026	NC_012850	GCC	2	6	247586	247591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5027	NC_012850	CTGC	2	8	247682	247689	0 %	25 %	25 %	50 %	241202992
5028	NC_012850	GCC	2	6	247717	247722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5029	NC_012850	GC	3	6	247734	247739	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5030	NC_012850	AGC	2	6	247740	247745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5031	NC_012850	CTGG	2	8	247797	247804	0 %	25 %	50 %	25 %	241202992
5032	NC_012850	TCT	2	6	247823	247828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202992
5033	NC_012850	GC	3	6	247838	247843	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5034	NC_012850	CAC	2	6	247884	247889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202992
5035	NC_012850	GATC	2	8	247898	247905	25 %	25 %	25 %	25 %	241202992
5036	NC_012850	ATC	2	6	247921	247926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202992
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5038	NC_012850	CGT	2	6	248040	248045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
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5040	NC_012850	CGG	2	6	248117	248122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5041	NC_012850	CCA	2	6	248201	248206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202992
5042	NC_012850	CGGC	2	8	248262	248269	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5043	NC_012850	TGCG	2	8	248341	248348	0 %	25 %	50 %	25 %	241202992
5044	NC_012850	CGG	2	6	248420	248425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202992
5045	NC_012850	GCC	2	6	248445	248450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5046	NC_012850	GCC	2	6	248482	248487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992
5047	NC_012850	GAT	2	6	248502	248507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202992
5048	NC_012850	AT	3	6	248506	248511	50 %	50 %	0 %	0 %	241202992
5049	NC_012850	TCG	2	6	248512	248517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5050	NC_012850	TCG	2	6	248519	248524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5051	NC_012850	G	6	6	248565	248570	0 %	0 %	100 %	0 %	241202992
5052	NC_012850	CG	3	6	248585	248590	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5053	NC_012850	GC	3	6	248591	248596	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5054	NC_012850	TCA	2	6	248597	248602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202992
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5056	NC_012850	TCGG	2	8	248653	248660	0 %	25 %	50 %	25 %	241202992
5057	NC_012850	TCC	2	6	248677	248682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202992
5058	NC_012850	GGCG	2	8	248684	248691	0 %	0 %	75 %	25 %	241202992
5059	NC_012850	GTC	2	6	248733	248738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
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5061	NC_012850	CTG	3	9	248763	248771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5062	NC_012850	TCG	2	6	248782	248787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5063	NC_012850	CGT	2	6	248825	248830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
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5065	NC_012850	TGCG	2	8	248914	248921	0 %	25 %	50 %	25 %	241202992
5066	NC_012850	CAG	2	6	248925	248930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202992
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5070	NC_012850	CAT	2	6	249059	249064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202992
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5082	NC_012850	GTC	2	6	249591	249596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
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5088	NC_012850	CGGG	2	8	249902	249909	0 %	0 %	75 %	25 %	241202992
5089	NC_012850	CGTG	2	8	249966	249973	0 %	25 %	50 %	25 %	241202992
5090	NC_012850	GC	3	6	250011	250016	0 %	0 %	50 %	50 %	241202992
5091	NC_012850	CGAG	2	8	250049	250056	25 %	0 %	50 %	25 %	241202992
5092	NC_012850	TCT	2	6	250100	250105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202992
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5099	NC_012850	GCCGCG	2	12	251191	251202	0 %	0 %	50 %	50 %	241202994
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5106	NC_012850	CAC	2	6	251335	251340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241202994
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5108	NC_012850	GCG	2	6	251357	251362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202994
5109	NC_012850	TGC	2	6	251380	251385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202994
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5112	NC_012850	CGA	2	6	251544	251549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202994
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5114	NC_012850	GA	3	6	251846	251851	50 %	0 %	50 %	0 %	241202995
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5117	NC_012850	CT	3	6	252005	252010	0 %	50 %	0 %	50 %	241202995
5118	NC_012850	ACG	2	6	252053	252058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202995
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5122	NC_012850	CCG	2	6	252182	252187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202995
5123	NC_012850	CCG	2	6	252203	252208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202995
5124	NC_012850	TGA	2	6	252221	252226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202995
5125	NC_012850	CGC	2	6	252255	252260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202995
5126	NC_012850	CTC	2	6	252262	252267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202995
5127	NC_012850	CGA	2	6	252279	252284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202995
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5129	NC_012850	TGC	2	6	252377	252382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202995
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5132	NC_012850	TCAT	2	8	252476	252483	25 %	50 %	0 %	25 %	241202995
5133	NC_012850	TCG	2	6	252557	252562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202995
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5152	NC_012850	CCGCG	2	10	253233	253242	0 %	0 %	40 %	60 %	241202995
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5234	NC_012850	ACG	2	6	257055	257060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202998
5235	NC_012850	ATCTC	2	10	257145	257154	20 %	40 %	0 %	40 %	241202998
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5240	NC_012850	GCAG	2	8	257275	257282	25 %	0 %	50 %	25 %	241202998
5241	NC_012850	CG	3	6	257376	257381	0 %	0 %	50 %	50 %	241202998
5242	NC_012850	CGG	2	6	257428	257433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202998
5243	NC_012850	CGC	2	6	257526	257531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202998
5244	NC_012850	GCC	2	6	257546	257551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202998
5245	NC_012850	CGGT	2	8	257569	257576	0 %	25 %	50 %	25 %	241202998
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5247	NC_012850	CCGAT	2	10	257759	257768	20 %	20 %	20 %	40 %	241202999
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5275	NC_012850	GGCGA	2	10	259357	259366	20 %	0 %	60 %	20 %	241203001
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5343	NC_012850	CCA	2	6	263175	263180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241203006
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5347	NC_012850	GGC	2	6	263527	263532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203006
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5350	NC_012850	CG	3	6	263610	263615	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
5351	NC_012850	GCT	2	6	263670	263675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
5352	NC_012850	GAT	2	6	263785	263790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203006
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5355	NC_012850	GTG	2	6	263897	263902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241203006
5356	NC_012850	GCA	2	6	264045	264050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
5357	NC_012850	CTCG	2	8	264073	264080	0 %	25 %	25 %	50 %	241203006
5358	NC_012850	AGC	2	6	264089	264094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
5359	NC_012850	TCT	2	6	264123	264128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203006
5360	NC_012850	AGC	2	6	264182	264187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
5361	NC_012850	CGGC	2	8	264216	264223	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
5362	NC_012850	GTC	2	6	264263	264268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
5363	NC_012850	CGC	2	6	264310	264315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203006
5364	NC_012850	CG	3	6	264351	264356	0 %	0 %	50 %	50 %	241203006
5365	NC_012850	CGA	3	9	264441	264449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203006
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5367	NC_012850	GTC	2	6	264524	264529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203006
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5470	NC_012850	GCA	2	6	268890	268895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203009
5471	NC_012850	GCTC	2	8	268913	268920	0 %	25 %	25 %	50 %	241203009
5472	NC_012850	GCGCC	3	15	269014	269028	0 %	0 %	40 %	60 %	241203009
5473	NC_012850	CGT	2	6	269043	269048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203009
5474	NC_012850	TCGC	2	8	269059	269066	0 %	25 %	25 %	50 %	241203009
5475	NC_012850	CGA	2	6	269163	269168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203009
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5477	NC_012850	CTTC	2	8	269201	269208	0 %	50 %	0 %	50 %	241203009
5478	NC_012850	AGA	2	6	269314	269319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203010
5479	NC_012850	GAA	2	6	269321	269326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241203010
5480	NC_012850	CTG	2	6	269370	269375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5481	NC_012850	GTC	2	6	269393	269398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5482	NC_012850	TCA	2	6	269428	269433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203010
5483	NC_012850	CACC	2	8	269453	269460	25 %	0 %	0 %	75 %	241203010
5484	NC_012850	C	6	6	269470	269475	0 %	0 %	0 %	100 %	241203010
5485	NC_012850	CGT	2	6	269510	269515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5486	NC_012850	CTG	2	6	269531	269536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5487	NC_012850	CCG	2	6	269566	269571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5488	NC_012850	TGA	2	6	269587	269592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241203010
5489	NC_012850	CAG	2	6	269676	269681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5490	NC_012850	TCG	2	6	269701	269706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5491	NC_012850	GGC	2	6	269750	269755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241203010
5492	NC_012850	TCA	2	6	269770	269775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241203010
5493	NC_012850	CTT	2	6	269798	269803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203010
5494	NC_012850	TCG	2	6	269824	269829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5495	NC_012850	TCG	2	6	269899	269904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010
5496	NC_012850	GAAGCA	2	12	269930	269941	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241203010
5497	NC_012850	CGC	2	6	270015	270020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241203010
5498	NC_012850	CTT	2	6	270023	270028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241203010
5499	NC_012850	TC	3	6	270029	270034	0 %	50 %	0 %	50 %	241203010
5500	NC_012850	TCG	2	6	270060	270065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241203010

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