MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 chromosome

Total Repeats: 99371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_012850	GGC	2	6	225979	225984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202968
4503	NC_012850	TCGCGG	2	12	226050	226061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241202968
4504	NC_012850	CGCT	2	8	226062	226069	0 %	25 %	25 %	50 %	241202968
4505	NC_012850	GC	4	8	226095	226102	0 %	0 %	50 %	50 %	241202968
4506	NC_012850	GC	3	6	226113	226118	0 %	0 %	50 %	50 %	241202968
4507	NC_012850	TCG	2	6	226170	226175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202968
4508	NC_012850	GCGCAG	2	12	226232	226243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241202968
4509	NC_012850	CGA	2	6	226276	226281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202968
4510	NC_012850	CGG	2	6	226297	226302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202968
4511	NC_012850	AGA	2	6	226333	226338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202968
4512	NC_012850	CGC	2	6	226372	226377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202968
4513	NC_012850	CAT	2	6	226394	226399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202968
4514	NC_012850	CAT	2	6	226402	226407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202968
4515	NC_012850	ATC	2	6	226416	226421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202968
4516	NC_012850	GC	3	6	226471	226476	0 %	0 %	50 %	50 %	241202968
4517	NC_012850	GAT	2	6	226505	226510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202968
4518	NC_012850	ATCG	2	8	226556	226563	25 %	25 %	25 %	25 %	241202968
4519	NC_012850	CCAGCG	2	12	226582	226593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241202968
4520	NC_012850	GCA	2	6	226696	226701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202968
4521	NC_012850	CCG	2	6	226711	226716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202968
4522	NC_012850	GC	5	10	226725	226734	0 %	0 %	50 %	50 %	241202968
4523	NC_012850	CGG	2	6	226791	226796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202968
4524	NC_012850	GAT	2	6	227471	227476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202969
4525	NC_012850	CAG	2	6	227568	227573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202969
4526	NC_012850	GC	3	6	227604	227609	0 %	0 %	50 %	50 %	241202969
4527	NC_012850	TC	3	6	227630	227635	0 %	50 %	0 %	50 %	241202969
4528	NC_012850	GTCG	2	8	227663	227670	0 %	25 %	50 %	25 %	241202969
4529	NC_012850	CGC	2	6	227816	227821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202969
4530	NC_012850	CCG	2	6	227870	227875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202969
4531	NC_012850	TCT	2	6	227884	227889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202969
4532	NC_012850	TGC	2	6	227905	227910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202969
4533	NC_012850	GC	3	6	227913	227918	0 %	0 %	50 %	50 %	241202969
4534	NC_012850	CGGT	2	8	227980	227987	0 %	25 %	50 %	25 %	241202969
4535	NC_012850	GTC	2	6	227988	227993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202969
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4537	NC_012850	CTG	2	6	228072	228077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202969
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4540	NC_012850	TTC	2	6	228143	228148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202969
4541	NC_012850	TGC	2	6	228165	228170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202969
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4543	NC_012850	TGC	2	6	228229	228234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202969
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4545	NC_012850	ATCT	2	8	228312	228319	25 %	50 %	0 %	25 %	241202969
4546	NC_012850	CGC	2	6	228419	228424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202970
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4551	NC_012850	CGG	2	6	228502	228507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202970
4552	NC_012850	ACG	2	6	228582	228587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202970
4553	NC_012850	AGC	2	6	228609	228614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202970
4554	NC_012850	CG	3	6	228625	228630	0 %	0 %	50 %	50 %	241202970
4555	NC_012850	GTC	2	6	228647	228652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202970
4556	NC_012850	CGG	2	6	228733	228738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202970
4557	NC_012850	CCATCA	2	12	228742	228753	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	241202970
4558	NC_012850	CAT	2	6	228766	228771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202970
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4560	NC_012850	GTC	2	6	228911	228916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202971
4561	NC_012850	CGG	2	6	228952	228957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202971
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4563	NC_012850	GCG	2	6	228967	228972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202971
4564	NC_012850	CTG	2	6	228979	228984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202971
4565	NC_012850	GGCA	2	8	229039	229046	25 %	0 %	50 %	25 %	241202971
4566	NC_012850	TTCCA	2	10	229062	229071	20 %	40 %	0 %	40 %	241202971
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4587	NC_012850	CAG	2	6	229702	229707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202972
4588	NC_012850	TCGA	2	8	229709	229716	25 %	25 %	25 %	25 %	241202972
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4604	NC_012850	CTG	2	6	230032	230037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202972
4605	NC_012850	CGGC	2	8	230040	230047	0 %	0 %	50 %	50 %	241202972
4606	NC_012850	CGAT	2	8	230127	230134	25 %	25 %	25 %	25 %	241202972
4607	NC_012850	GCC	2	6	230154	230159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202972
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4610	NC_012850	CGGCG	2	10	230208	230217	0 %	0 %	60 %	40 %	241202972
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4620	NC_012850	CGT	2	6	230798	230803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202973
4621	NC_012850	GACGAT	2	12	230814	230825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241202973
4622	NC_012850	AGC	2	6	230899	230904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202973
4623	NC_012850	CGG	2	6	230930	230935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202973
4624	NC_012850	GC	3	6	230940	230945	0 %	0 %	50 %	50 %	241202973
4625	NC_012850	CGA	2	6	230966	230971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202973
4626	NC_012850	GAT	2	6	231029	231034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202973
4627	NC_012850	ATG	3	9	231043	231051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202973
4628	NC_012850	ATCAG	2	10	231152	231161	40 %	20 %	20 %	20 %	241202974
4629	NC_012850	TCT	2	6	231163	231168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202974
4630	NC_012850	TCA	2	6	231229	231234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241202974
4631	NC_012850	ATG	2	6	231243	231248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202974
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4633	NC_012850	GCC	2	6	231357	231362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202974
4634	NC_012850	TCG	2	6	231366	231371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202974
4635	NC_012850	GCC	2	6	231372	231377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202974
4636	NC_012850	CGC	2	6	231457	231462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202974
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4638	NC_012850	CGGC	2	8	231480	231487	0 %	0 %	50 %	50 %	241202974
4639	NC_012850	GCC	2	6	231498	231503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202974
4640	NC_012850	GCC	2	6	231507	231512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202974
4641	NC_012850	A	7	7	231522	231528	100 %	0 %	0 %	0 %	241202974
4642	NC_012850	ATG	2	6	231689	231694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202975
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4644	NC_012850	CCG	2	6	231834	231839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202975
4645	NC_012850	CTG	3	9	231866	231874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202975
4646	NC_012850	TGG	2	6	231886	231891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202975
4647	NC_012850	CG	3	6	231924	231929	0 %	0 %	50 %	50 %	241202975
4648	NC_012850	GCG	3	9	231927	231935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202975
4649	NC_012850	GCC	2	6	231971	231976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202975
4650	NC_012850	GCCGCT	2	12	231991	232002	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241202975
4651	NC_012850	CGA	2	6	232003	232008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202975
4652	NC_012850	GATC	2	8	232044	232051	25 %	25 %	25 %	25 %	241202975
4653	NC_012850	CGC	2	6	232119	232124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202976
4654	NC_012850	GCC	2	6	232222	232227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202976
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4727	NC_012850	CGG	2	6	235041	235046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241202979
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4862	NC_012850	CCT	2	6	241167	241172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241202986
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4980	NC_012850	CGAG	2	8	245760	245767	25 %	0 %	50 %	25 %	241202991
4981	NC_012850	CGA	2	6	245800	245805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202991
4982	NC_012850	CGCGAC	2	12	245830	245841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241202991
4983	NC_012850	CGGG	2	8	245844	245851	0 %	0 %	75 %	25 %	241202991
4984	NC_012850	TGT	2	6	245853	245858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202991
4985	NC_012850	AGA	2	6	245859	245864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241202991
4986	NC_012850	TGA	2	6	245877	245882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202991
4987	NC_012850	GCC	3	9	245887	245895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202991
4988	NC_012850	GCC	2	6	245927	245932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202991
4989	NC_012850	ATG	2	6	245945	245950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241202991
4990	NC_012850	AGAT	2	8	245981	245988	50 %	25 %	25 %	0 %	241202991
4991	NC_012850	TTG	2	6	246331	246336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202992
4992	NC_012850	AGC	2	6	246343	246348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241202992
4993	NC_012850	CCGA	2	8	246391	246398	25 %	0 %	25 %	50 %	241202992
4994	NC_012850	TTG	2	6	246475	246480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241202992
4995	NC_012850	CTT	2	6	246507	246512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241202992
4996	NC_012850	TCG	2	6	246553	246558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
4997	NC_012850	GGT	2	6	246581	246586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241202992
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4999	NC_012850	TCG	2	6	246664	246669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241202992
5000	NC_012850	CGC	2	6	246692	246697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241202992

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