MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	GCAC	2	8	553	560	25 %	0 %	25 %	50 %	241114101
2	NC_012849	AGCC	2	8	648	655	25 %	0 %	25 %	50 %	241114101
3	NC_012849	CGTT	2	8	892	899	0 %	50 %	25 %	25 %	241114101
4	NC_012849	TCGC	2	8	923	930	0 %	25 %	25 %	50 %	241114101
5	NC_012849	TGTC	2	8	2191	2198	0 %	50 %	25 %	25 %	241114102
6	NC_012849	AACC	2	8	2684	2691	50 %	0 %	0 %	50 %	241114103
7	NC_012849	GGAC	2	8	2956	2963	25 %	0 %	50 %	25 %	241114103
8	NC_012849	TTTC	2	8	3041	3048	0 %	75 %	0 %	25 %	241114103
9	NC_012849	CCGA	2	8	3120	3127	25 %	0 %	25 %	50 %	241114103
10	NC_012849	ACCT	2	8	3156	3163	25 %	25 %	0 %	50 %	241114103
11	NC_012849	GTCG	2	8	3329	3336	0 %	25 %	50 %	25 %	241114103
12	NC_012849	CAGC	2	8	3725	3732	25 %	0 %	25 %	50 %	241114103
13	NC_012849	CATG	2	8	3824	3831	25 %	25 %	25 %	25 %	241114103
14	NC_012849	CATG	2	8	4109	4116	25 %	25 %	25 %	25 %	241114103
15	NC_012849	CTAC	2	8	4409	4416	25 %	25 %	0 %	50 %	241114104
16	NC_012849	TTGA	2	8	4975	4982	25 %	50 %	25 %	0 %	241114104
17	NC_012849	TGGT	2	8	6303	6310	0 %	50 %	50 %	0 %	241114106
18	NC_012849	TTGC	2	8	6540	6547	0 %	50 %	25 %	25 %	241114106
19	NC_012849	ATTG	2	8	6626	6633	25 %	50 %	25 %	0 %	241114106
20	NC_012849	TGCC	2	8	7045	7052	0 %	25 %	25 %	50 %	241114107
21	NC_012849	GATG	2	8	8106	8113	25 %	25 %	50 %	0 %	241114108
22	NC_012849	CGCT	2	8	8814	8821	0 %	25 %	25 %	50 %	241114108
23	NC_012849	GCAA	2	8	9935	9942	50 %	0 %	25 %	25 %	241114109
24	NC_012849	GCCT	2	8	10244	10251	0 %	25 %	25 %	50 %	241114109
25	NC_012849	GCCT	2	8	11206	11213	0 %	25 %	25 %	50 %	241114111
26	NC_012849	GCTC	2	8	11361	11368	0 %	25 %	25 %	50 %	241114111
27	NC_012849	CGTC	3	12	11461	11472	0 %	25 %	25 %	50 %	241114111
28	NC_012849	ATGG	2	8	11580	11587	25 %	25 %	50 %	0 %	241114111
29	NC_012849	GTTG	2	8	11611	11618	0 %	50 %	50 %	0 %	241114111
30	NC_012849	TCGC	2	8	11931	11938	0 %	25 %	25 %	50 %	241114111
31	NC_012849	GCTT	2	8	11977	11984	0 %	50 %	25 %	25 %	241114111
32	NC_012849	TCTG	2	8	12087	12094	0 %	50 %	25 %	25 %	241114111
33	NC_012849	AATC	2	8	13634	13641	50 %	25 %	0 %	25 %	241114113
34	NC_012849	ATCG	2	8	14706	14713	25 %	25 %	25 %	25 %	241114114
35	NC_012849	CGTG	2	8	15083	15090	0 %	25 %	50 %	25 %	241114115
36	NC_012849	CGGT	2	8	15330	15337	0 %	25 %	50 %	25 %	241114115
37	NC_012849	ACCA	2	8	15783	15790	50 %	0 %	0 %	50 %	241114116
38	NC_012849	TGAA	2	8	16304	16311	50 %	25 %	25 %	0 %	241114116
39	NC_012849	GATC	2	8	16326	16333	25 %	25 %	25 %	25 %	241114116
40	NC_012849	CACG	2	8	16365	16372	25 %	0 %	25 %	50 %	241114116
41	NC_012849	TTTC	2	8	16498	16505	0 %	75 %	0 %	25 %	241114116
42	NC_012849	GATC	2	8	17030	17037	25 %	25 %	25 %	25 %	241114117
43	NC_012849	AAGG	2	8	17815	17822	50 %	0 %	50 %	0 %	241114118
44	NC_012849	TGCT	2	8	18652	18659	0 %	50 %	25 %	25 %	241114119
45	NC_012849	CAGG	2	8	21109	21116	25 %	0 %	50 %	25 %	241114121
46	NC_012849	CAGC	2	8	21346	21353	25 %	0 %	25 %	50 %	241114121
47	NC_012849	GATC	2	8	21667	21674	25 %	25 %	25 %	25 %	241114121
48	NC_012849	TCGA	2	8	21687	21694	25 %	25 %	25 %	25 %	241114121
49	NC_012849	TGCG	2	8	22708	22715	0 %	25 %	50 %	25 %	241114121
50	NC_012849	CACC	2	8	22762	22769	25 %	0 %	0 %	75 %	241114121
51	NC_012849	ATCC	2	8	27256	27263	25 %	25 %	0 %	50 %	241114122
52	NC_012849	CTCA	2	8	27304	27311	25 %	25 %	0 %	50 %	241114123
53	NC_012849	GGGC	2	8	28486	28493	0 %	0 %	75 %	25 %	241114125
54	NC_012849	GAGC	2	8	28624	28631	25 %	0 %	50 %	25 %	241114125
55	NC_012849	GCCG	2	8	29566	29573	0 %	0 %	50 %	50 %	241114128
56	NC_012849	TGCG	2	8	30444	30451	0 %	25 %	50 %	25 %	241114130
57	NC_012849	GCCC	2	8	30468	30475	0 %	0 %	25 %	75 %	241114130
58	NC_012849	CCGA	2	8	30767	30774	25 %	0 %	25 %	50 %	241114130
59	NC_012849	CTGC	2	8	31054	31061	0 %	25 %	25 %	50 %	241114130
60	NC_012849	GGGT	2	8	31103	31110	0 %	25 %	75 %	0 %	241114130
61	NC_012849	CATG	2	8	31302	31309	25 %	25 %	25 %	25 %	241114131
62	NC_012849	CCAG	2	8	31844	31851	25 %	0 %	25 %	50 %	241114132
63	NC_012849	TCAG	2	8	33181	33188	25 %	25 %	25 %	25 %	241114134
64	NC_012849	GCAG	2	8	33437	33444	25 %	0 %	50 %	25 %	241114134
65	NC_012849	AGCG	2	8	33633	33640	25 %	0 %	50 %	25 %	241114134
66	NC_012849	CGGC	2	8	33703	33710	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
67	NC_012849	CATC	2	8	33763	33770	25 %	25 %	0 %	50 %	241114134
68	NC_012849	ACGC	2	8	33832	33839	25 %	0 %	25 %	50 %	241114134
69	NC_012849	GCGT	2	8	33938	33945	0 %	25 %	50 %	25 %	241114134
70	NC_012849	ACGC	2	8	33989	33996	25 %	0 %	25 %	50 %	241114134
71	NC_012849	GCCG	2	8	34769	34776	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
72	NC_012849	GACG	2	8	35835	35842	25 %	0 %	50 %	25 %	241114136
73	NC_012849	CAGC	2	8	36239	36246	25 %	0 %	25 %	50 %	241114136
74	NC_012849	ATCG	2	8	37014	37021	25 %	25 %	25 %	25 %	241114136
75	NC_012849	TCGA	2	8	37141	37148	25 %	25 %	25 %	25 %	241114136
76	NC_012849	CCCT	2	8	37193	37200	0 %	25 %	0 %	75 %	241114136
77	NC_012849	GGCC	2	8	37663	37670	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
78	NC_012849	GCGG	2	8	37907	37914	0 %	0 %	75 %	25 %	241114136
79	NC_012849	GGCG	2	8	38145	38152	0 %	0 %	75 %	25 %	241114136
80	NC_012849	GCCA	2	8	38766	38773	25 %	0 %	25 %	50 %	241114137
81	NC_012849	GCCA	2	8	39564	39571	25 %	0 %	25 %	50 %	241114138
82	NC_012849	GCTG	2	8	40346	40353	0 %	25 %	50 %	25 %	241114139
83	NC_012849	CGGC	2	8	40639	40646	0 %	0 %	50 %	50 %	241114139
84	NC_012849	GACC	2	8	40893	40900	25 %	0 %	25 %	50 %	241114139
85	NC_012849	GGCC	2	8	40982	40989	0 %	0 %	50 %	50 %	241114139
86	NC_012849	ATCT	2	8	41431	41438	25 %	50 %	0 %	25 %	241114140
87	NC_012849	CTCC	2	8	41895	41902	0 %	25 %	0 %	75 %	241114141
88	NC_012849	GCGG	2	8	42468	42475	0 %	0 %	75 %	25 %	241114142
89	NC_012849	TGGC	2	8	44367	44374	0 %	25 %	50 %	25 %	241114143
90	NC_012849	CCGG	2	8	45093	45100	0 %	0 %	50 %	50 %	241114144
91	NC_012849	GCTG	2	8	45533	45540	0 %	25 %	50 %	25 %	241114144
92	NC_012849	CGCC	2	8	45581	45588	0 %	0 %	25 %	75 %	241114144
93	NC_012849	CTGC	2	8	46268	46275	0 %	25 %	25 %	50 %	241114144
94	NC_012849	ATCA	2	8	46605	46612	50 %	25 %	0 %	25 %	241114144
95	NC_012849	GCTC	2	8	47363	47370	0 %	25 %	25 %	50 %	241114144
96	NC_012849	ATTG	2	8	47607	47614	25 %	50 %	25 %	0 %	241114144
97	NC_012849	TCGC	2	8	48533	48540	0 %	25 %	25 %	50 %	241114145
98	NC_012849	CTTG	2	8	49032	49039	0 %	50 %	25 %	25 %	241114145
99	NC_012849	GCCT	2	8	49250	49257	0 %	25 %	25 %	50 %	241114145
100	NC_012849	CACG	2	8	49389	49396	25 %	0 %	25 %	50 %	241114145
101	NC_012849	ACGC	2	8	50288	50295	25 %	0 %	25 %	50 %	241114147
102	NC_012849	GGCT	2	8	51044	51051	0 %	25 %	50 %	25 %	241114147
103	NC_012849	TGGA	2	8	51053	51060	25 %	25 %	50 %	0 %	241114147
104	NC_012849	GCCG	2	8	51167	51174	0 %	0 %	50 %	50 %	241114147
105	NC_012849	TCGA	2	8	51894	51901	25 %	25 %	25 %	25 %	241114149
106	NC_012849	TCGC	2	8	52322	52329	0 %	25 %	25 %	50 %	241114149
107	NC_012849	CGCC	2	8	52406	52413	0 %	0 %	25 %	75 %	241114149
108	NC_012849	GTCT	2	8	53324	53331	0 %	50 %	25 %	25 %	241114150
109	NC_012849	GTCG	2	8	53766	53773	0 %	25 %	50 %	25 %	241114150
110	NC_012849	CCGT	2	8	54144	54151	0 %	25 %	25 %	50 %	241114151
111	NC_012849	GCTG	2	8	54417	54424	0 %	25 %	50 %	25 %	241114151
112	NC_012849	GCCG	2	8	54553	54560	0 %	0 %	50 %	50 %	241114151
113	NC_012849	CCGA	2	8	54612	54619	25 %	0 %	25 %	50 %	241114151
114	NC_012849	GATC	2	8	55179	55186	25 %	25 %	25 %	25 %	241114152
115	NC_012849	CTTC	2	8	55242	55249	0 %	50 %	0 %	50 %	241114152
116	NC_012849	GCCG	2	8	55596	55603	0 %	0 %	50 %	50 %	241114153
117	NC_012849	ATCG	2	8	56499	56506	25 %	25 %	25 %	25 %	241114155
118	NC_012849	CGAT	2	8	56589	56596	25 %	25 %	25 %	25 %	241114155
119	NC_012849	CGCC	2	8	57475	57482	0 %	0 %	25 %	75 %	241114156
120	NC_012849	TCCA	2	8	58555	58562	25 %	25 %	0 %	50 %	241114157
121	NC_012849	CCAC	2	8	58868	58875	25 %	0 %	0 %	75 %	241114157
122	NC_012849	GCGA	2	8	59313	59320	25 %	0 %	50 %	25 %	241114158
123	NC_012849	GAGC	2	8	59752	59759	25 %	0 %	50 %	25 %	241114158
124	NC_012849	GTGC	2	8	59906	59913	0 %	25 %	50 %	25 %	241114158
125	NC_012849	CGCC	2	8	60849	60856	0 %	0 %	25 %	75 %	241114159
126	NC_012849	CCGA	2	8	61686	61693	25 %	0 %	25 %	50 %	241114160
127	NC_012849	GGGC	2	8	61897	61904	0 %	0 %	75 %	25 %	241114160
128	NC_012849	AGCC	2	8	62260	62267	25 %	0 %	25 %	50 %	241114161
129	NC_012849	CAGA	2	8	62288	62295	50 %	0 %	25 %	25 %	241114161
130	NC_012849	GCGT	2	8	62496	62503	0 %	25 %	50 %	25 %	241114161
131	NC_012849	AGCA	2	8	62749	62756	50 %	0 %	25 %	25 %	241114162
132	NC_012849	GACG	2	8	64239	64246	25 %	0 %	50 %	25 %	241114164
133	NC_012849	CACG	2	8	64825	64832	25 %	0 %	25 %	50 %	241114165
134	NC_012849	GCCG	2	8	65016	65023	0 %	0 %	50 %	50 %	241114165
135	NC_012849	GGTG	2	8	65944	65951	0 %	25 %	75 %	0 %	241114165
136	NC_012849	CCTG	2	8	66325	66332	0 %	25 %	25 %	50 %	241114165
137	NC_012849	TTCG	2	8	66469	66476	0 %	50 %	25 %	25 %	241114165
138	NC_012849	CCAA	2	8	66785	66792	50 %	0 %	0 %	50 %	241114165
139	NC_012849	GCAA	2	8	66860	66867	50 %	0 %	25 %	25 %	241114165
140	NC_012849	CCAG	2	8	66884	66891	25 %	0 %	25 %	50 %	241114165
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