MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012849	AAG	2	6	292	297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114101
2	NC_012849	GCA	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
3	NC_012849	CGT	2	6	341	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
4	NC_012849	TCC	2	6	367	372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114101
5	NC_012849	ACA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114101
6	NC_012849	CGC	2	6	473	478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114101
7	NC_012849	TCG	2	6	562	567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
8	NC_012849	ATC	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114101
9	NC_012849	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114101
10	NC_012849	GGC	2	6	999	1004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114101
11	NC_012849	CCA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114101
12	NC_012849	CTG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
13	NC_012849	GGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114101
14	NC_012849	GCA	2	6	1190	1195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
15	NC_012849	TGC	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
16	NC_012849	CGT	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114101
17	NC_012849	ACT	2	6	1329	1334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114101
18	NC_012849	ACC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114101
19	NC_012849	TCC	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114101
20	NC_012849	CAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114101
21	NC_012849	GAC	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114101
22	NC_012849	TCC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114102
23	NC_012849	GCA	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114102
24	NC_012849	CGG	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114102
25	NC_012849	CGC	2	6	1756	1761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114102
26	NC_012849	CGG	2	6	1770	1775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114102
27	NC_012849	TCG	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114102
28	NC_012849	CAA	3	9	2110	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114102
29	NC_012849	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114102
30	NC_012849	ACA	2	6	2175	2180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114102
31	NC_012849	GCA	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
32	NC_012849	GTG	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114103
33	NC_012849	TGC	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
34	NC_012849	CCA	3	9	2611	2619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114103
35	NC_012849	TGC	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
36	NC_012849	CAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
37	NC_012849	CAG	2	6	2817	2822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
38	NC_012849	ACT	2	6	3007	3012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
39	NC_012849	TCA	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114103
40	NC_012849	GGT	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114103
41	NC_012849	ATG	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114103
42	NC_012849	AAG	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114103
43	NC_012849	CGA	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114103
44	NC_012849	CAA	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114103
45	NC_012849	CGG	2	6	3923	3928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114103
46	NC_012849	TGC	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
47	NC_012849	TCG	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114103
48	NC_012849	CGC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114104
49	NC_012849	GGC	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
50	NC_012849	CCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114104
51	NC_012849	ATG	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114104
52	NC_012849	CGC	2	6	5016	5021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114104
53	NC_012849	GAG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114104
54	NC_012849	ACG	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114104
55	NC_012849	GGC	2	6	5214	5219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
56	NC_012849	TGC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114104
57	NC_012849	GGC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114104
58	NC_012849	GCT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
59	NC_012849	CTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
60	NC_012849	CGC	2	6	5740	5745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
61	NC_012849	ACG	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114105
62	NC_012849	CGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
63	NC_012849	CGC	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114105
64	NC_012849	CGA	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114105
65	NC_012849	TCA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114105
66	NC_012849	TGA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114105
67	NC_012849	TCG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114105
68	NC_012849	GAC	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
69	NC_012849	ATC	2	6	6115	6120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114106
70	NC_012849	CGC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114106
71	NC_012849	GCC	2	6	6231	6236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114106
72	NC_012849	AGC	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
73	NC_012849	ATG	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114106
74	NC_012849	GGC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
75	NC_012849	ATC	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114106
76	NC_012849	ACG	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
77	NC_012849	GCA	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114106
78	NC_012849	GGC	2	6	6560	6565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
79	NC_012849	GCT	2	6	6641	6646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
80	NC_012849	CGT	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
81	NC_012849	CAA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114106
82	NC_012849	TGT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114106
83	NC_012849	GGC	2	6	6767	6772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
84	NC_012849	GCG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114106
85	NC_012849	CGT	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114106
86	NC_012849	TGC	2	6	7119	7124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114107
87	NC_012849	CCA	2	6	8030	8035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114108
88	NC_012849	GAC	2	6	8169	8174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
89	NC_012849	CGC	2	6	8252	8257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114108
90	NC_012849	GGC	2	6	8267	8272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114108
91	NC_012849	TCG	2	6	8359	8364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
92	NC_012849	AGG	2	6	8393	8398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114108
93	NC_012849	GCG	2	6	8465	8470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114108
94	NC_012849	CAG	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
95	NC_012849	CAG	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
96	NC_012849	AGT	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114108
97	NC_012849	CAG	2	6	8694	8699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
98	NC_012849	CTG	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
99	NC_012849	GCA	2	6	8781	8786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
100	NC_012849	GCA	2	6	8798	8803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114108
101	NC_012849	GAT	2	6	8822	8827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114108
102	NC_012849	GCT	2	6	8906	8911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114108
103	NC_012849	ACC	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114108
104	NC_012849	TTG	2	6	9986	9991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114109
105	NC_012849	GTG	2	6	10025	10030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114109
106	NC_012849	CAT	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114109
107	NC_012849	CGC	2	6	10298	10303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114109
108	NC_012849	GGC	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114109
109	NC_012849	GGC	2	6	10808	10813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114110
110	NC_012849	GGC	2	6	10870	10875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114110
111	NC_012849	AGC	2	6	10950	10955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114110
112	NC_012849	ACT	2	6	11136	11141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114110
113	NC_012849	GCC	3	9	11219	11227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
114	NC_012849	GCC	2	6	11288	11293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
115	NC_012849	TCT	2	6	11319	11324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114111
116	NC_012849	CGC	2	6	11341	11346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114111
117	NC_012849	TTC	2	6	11405	11410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114111
118	NC_012849	TCG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
119	NC_012849	CGT	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
120	NC_012849	CGT	2	6	11564	11569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
121	NC_012849	ACC	2	6	11603	11608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114111
122	NC_012849	TCA	2	6	11657	11662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114111
123	NC_012849	GCG	2	6	11663	11668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114111
124	NC_012849	GGC	2	6	11767	11772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114111
125	NC_012849	CTG	2	6	11863	11868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114111
126	NC_012849	GAT	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114111
127	NC_012849	ACA	2	6	12200	12205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114112
128	NC_012849	TCG	2	6	12221	12226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
129	NC_012849	ACG	2	6	12284	12289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114112
130	NC_012849	GTT	2	6	12316	12321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114112
131	NC_012849	CTG	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
132	NC_012849	TGG	2	6	12483	12488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114112
133	NC_012849	GCC	2	6	12566	12571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
134	NC_012849	CGA	2	6	12579	12584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114112
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136	NC_012849	CGC	2	6	12664	12669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
137	NC_012849	CGG	2	6	12792	12797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114112
138	NC_012849	TCG	2	6	12893	12898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
139	NC_012849	TGC	2	6	12915	12920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114112
140	NC_012849	GCC	2	6	12996	13001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114112
141	NC_012849	GGC	2	6	13178	13183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114112
142	NC_012849	ACT	2	6	13397	13402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114113
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148	NC_012849	CAT	2	6	13904	13909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114113
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151	NC_012849	TGC	2	6	14074	14079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114113
152	NC_012849	GAC	2	6	14085	14090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114113
153	NC_012849	AAG	2	6	14100	14105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114113
154	NC_012849	TGG	2	6	14107	14112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114113
155	NC_012849	CGC	2	6	14123	14128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114113
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161	NC_012849	TGT	2	6	14414	14419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114114
162	NC_012849	CGC	2	6	14528	14533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114114
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243	NC_012849	CCT	2	6	21202	21207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114121
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245	NC_012849	GCA	2	6	21316	21321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114121
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247	NC_012849	CCG	2	6	21402	21407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114121
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249	NC_012849	GTT	2	6	21452	21457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114121
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251	NC_012849	TCT	2	6	21475	21480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114121
252	NC_012849	GGC	2	6	21573	21578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114121
253	NC_012849	CGG	2	6	21586	21591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114121
254	NC_012849	TCA	2	6	21643	21648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114121
255	NC_012849	CGA	2	6	21713	21718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114121
256	NC_012849	CGC	2	6	21776	21781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114121
257	NC_012849	GCT	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114121
258	NC_012849	GGC	2	6	21872	21877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114121
259	NC_012849	CCT	2	6	21892	21897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114121
260	NC_012849	GCA	2	6	21916	21921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114121
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262	NC_012849	GGC	2	6	22177	22182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114121
263	NC_012849	CGA	2	6	22195	22200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114121
264	NC_012849	TGA	2	6	22201	22206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114121
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272	NC_012849	CGG	2	6	22472	22477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114121
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361	NC_012849	TGA	2	6	31778	31783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
362	NC_012849	TGC	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114132
363	NC_012849	CCA	2	6	31904	31909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114132
364	NC_012849	GAT	2	6	31974	31979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
365	NC_012849	ACG	2	6	32033	32038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114132
366	NC_012849	AGT	2	6	32084	32089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
367	NC_012849	ATG	2	6	32533	32538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114133
368	NC_012849	GCG	2	6	32596	32601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114133
369	NC_012849	GCT	2	6	32621	32626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114133
370	NC_012849	GCG	2	6	32634	32639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114133
371	NC_012849	GTG	2	6	32643	32648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114133
372	NC_012849	GCC	2	6	32890	32895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
373	NC_012849	GTC	2	6	32901	32906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
374	NC_012849	CAA	2	6	32956	32961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114134
375	NC_012849	AGC	2	6	32972	32977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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377	NC_012849	AGC	2	6	33040	33045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
378	NC_012849	CGG	2	6	33146	33151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
379	NC_012849	GGC	2	6	33201	33206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
380	NC_012849	GGC	2	6	33323	33328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
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382	NC_012849	GCA	2	6	33348	33353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
383	NC_012849	CGA	2	6	33374	33379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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389	NC_012849	GCC	2	6	33825	33830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
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391	NC_012849	GCT	2	6	33921	33926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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395	NC_012849	TCG	2	6	34019	34024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
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400	NC_012849	CCG	2	6	34335	34340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
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492	NC_012849	TTC	2	6	39763	39768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114138
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494	NC_012849	TTC	2	6	39927	39932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114139
495	NC_012849	CTG	2	6	39984	39989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114139
496	NC_012849	TGG	2	6	40051	40056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114139
497	NC_012849	TGC	2	6	40159	40164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114139
498	NC_012849	CGA	2	6	40249	40254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114139
499	NC_012849	TGC	2	6	40264	40269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114139
500	NC_012849	AGG	2	6	40273	40278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114139

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