MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012849	CGAT	2	8	112686	112693	25 %	25 %	25 %	25 %	241114212
2003	NC_012849	ACA	2	6	112703	112708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114212
2004	NC_012849	GT	3	6	112783	112788	0 %	50 %	50 %	0 %	241114212
2005	NC_012849	CG	3	6	112789	112794	0 %	0 %	50 %	50 %	241114212
2006	NC_012849	AAG	2	6	112891	112896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114212
2007	NC_012849	GAA	2	6	112914	112919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114212
2008	NC_012849	TC	3	6	112954	112959	0 %	50 %	0 %	50 %	241114212
2009	NC_012849	ACT	2	6	112982	112987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114212
2010	NC_012849	CAT	2	6	113091	113096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114212
2011	NC_012849	CAT	2	6	113178	113183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114212
2012	NC_012849	CGG	2	6	113244	113249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114212
2013	NC_012849	TGA	2	6	113261	113266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114212
2014	NC_012849	TGCG	2	8	113501	113508	0 %	25 %	50 %	25 %	241114212
2015	NC_012849	CATC	2	8	113526	113533	25 %	25 %	0 %	50 %	241114212
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2018	NC_012849	GCC	2	6	113614	113619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114212
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2022	NC_012849	TCG	2	6	113890	113895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114213
2023	NC_012849	TCTG	2	8	113902	113909	0 %	50 %	25 %	25 %	241114213
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2032	NC_012849	TGC	2	6	114435	114440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114215
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2055	NC_012849	CCGAT	2	10	115227	115236	20 %	20 %	20 %	40 %	241114216
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2082	NC_012849	GGCC	2	8	117472	117479	0 %	0 %	50 %	50 %	241114217
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2122	NC_012849	GCT	2	6	119059	119064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114218
2123	NC_012849	TGCCGG	4	24	119076	119099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241114218
2124	NC_012849	GCT	2	6	119133	119138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114218
2125	NC_012849	GAA	2	6	119196	119201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114218
2126	NC_012849	CGG	2	6	119291	119296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114219
2127	NC_012849	ACG	2	6	119360	119365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114219
2128	NC_012849	GTT	2	6	119392	119397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114219
2129	NC_012849	CGG	2	6	119441	119446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114220
2130	NC_012849	GCC	2	6	119465	119470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114220
2131	NC_012849	GC	3	6	119528	119533	0 %	0 %	50 %	50 %	241114220
2132	NC_012849	GGT	2	6	119553	119558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114220
2133	NC_012849	GCG	2	6	119594	119599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114220
2134	NC_012849	CG	3	6	119618	119623	0 %	0 %	50 %	50 %	241114220
2135	NC_012849	CGGC	2	8	119627	119634	0 %	0 %	50 %	50 %	241114220
2136	NC_012849	ACC	2	6	119686	119691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114220
2137	NC_012849	GCT	2	6	119728	119733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114220
2138	NC_012849	CCGT	2	8	119812	119819	0 %	25 %	25 %	50 %	241114220
2139	NC_012849	CAC	2	6	119835	119840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114220
2140	NC_012849	GGC	2	6	119867	119872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114220
2141	NC_012849	GCG	2	6	119901	119906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114220
2142	NC_012849	GAC	2	6	119928	119933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114220
2143	NC_012849	GCGG	2	8	120051	120058	0 %	0 %	75 %	25 %	241114220
2144	NC_012849	GAA	2	6	120081	120086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114220
2145	NC_012849	CG	3	6	120095	120100	0 %	0 %	50 %	50 %	241114220
2146	NC_012849	AGCAG	2	10	120200	120209	40 %	0 %	40 %	20 %	241114220
2147	NC_012849	TGGC	2	8	120211	120218	0 %	25 %	50 %	25 %	241114220
2148	NC_012849	TGCT	2	8	120226	120233	0 %	50 %	25 %	25 %	241114220
2149	NC_012849	GC	3	6	120251	120256	0 %	0 %	50 %	50 %	241114220
2150	NC_012849	GGA	2	6	120305	120310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114220
2151	NC_012849	AG	3	6	120315	120320	50 %	0 %	50 %	0 %	241114220
2152	NC_012849	T	7	7	120338	120344	0 %	100 %	0 %	0 %	241114220
2153	NC_012849	CG	3	6	120626	120631	0 %	0 %	50 %	50 %	241114221
2154	NC_012849	GC	3	6	120646	120651	0 %	0 %	50 %	50 %	241114221
2155	NC_012849	TTC	2	6	120661	120666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114221
2156	NC_012849	CCGG	2	8	120769	120776	0 %	0 %	50 %	50 %	241114221
2157	NC_012849	CGG	3	9	120810	120818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114221
2158	NC_012849	CTG	2	6	120830	120835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114221
2159	NC_012849	GGC	2	6	120841	120846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114221
2160	NC_012849	CAG	2	6	120907	120912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114221
2161	NC_012849	CG	3	6	120944	120949	0 %	0 %	50 %	50 %	241114221
2162	NC_012849	TCG	2	6	121016	121021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114221
2163	NC_012849	CTT	2	6	121029	121034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114221
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2166	NC_012849	GGC	2	6	121296	121301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114222
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2171	NC_012849	GAT	2	6	121437	121442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114222
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2174	NC_012849	CTG	2	6	121475	121480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114222
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2177	NC_012849	TGC	2	6	121863	121868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114223
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2180	NC_012849	CTT	2	6	122067	122072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114223
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2182	NC_012849	GCG	2	6	122281	122286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114223
2183	NC_012849	CGT	2	6	122307	122312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114223
2184	NC_012849	TTG	2	6	122360	122365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114223
2185	NC_012849	TTGCCG	2	12	122457	122468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114223
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2188	NC_012849	GGCGG	2	10	122527	122536	0 %	0 %	80 %	20 %	241114223
2189	NC_012849	GCCC	2	8	122563	122570	0 %	0 %	25 %	75 %	241114223
2190	NC_012849	AGC	2	6	122600	122605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114223
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2192	NC_012849	CTG	2	6	122653	122658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114223
2193	NC_012849	CGT	3	9	122672	122680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114224
2194	NC_012849	TGCTG	2	10	122681	122690	0 %	40 %	40 %	20 %	241114224
2195	NC_012849	TG	3	6	122689	122694	0 %	50 %	50 %	0 %	241114224
2196	NC_012849	GCG	2	6	122787	122792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114224
2197	NC_012849	CCTTG	2	10	122828	122837	0 %	40 %	20 %	40 %	241114224
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2199	NC_012849	GAGC	2	8	122873	122880	25 %	0 %	50 %	25 %	241114224
2200	NC_012849	GTC	2	6	122912	122917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114224
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2204	NC_012849	CGT	2	6	123120	123125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
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2208	NC_012849	CCGG	2	8	123225	123232	0 %	0 %	50 %	50 %	241114225
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2211	NC_012849	CGT	2	6	123351	123356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
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2214	NC_012849	CTG	2	6	123370	123375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
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2218	NC_012849	TGA	2	6	123443	123448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114225
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2224	NC_012849	CTG	2	6	123841	123846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
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2228	NC_012849	TCG	2	6	123921	123926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
2229	NC_012849	CAG	2	6	123944	123949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114225
2230	NC_012849	CGC	3	9	123964	123972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114225
2231	NC_012849	ACT	2	6	123976	123981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114225
2232	NC_012849	CGG	2	6	123999	124004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114225
2233	NC_012849	AGG	2	6	124168	124173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114225
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2235	NC_012849	GC	3	6	124295	124300	0 %	0 %	50 %	50 %	241114225
2236	NC_012849	CGA	2	6	124365	124370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114225
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2239	NC_012849	CTG	2	6	124437	124442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
2240	NC_012849	CGC	2	6	124478	124483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114225
2241	NC_012849	GAAG	2	8	124500	124507	50 %	0 %	50 %	0 %	241114225
2242	NC_012849	ACC	2	6	124622	124627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114225
2243	NC_012849	CAT	2	6	124665	124670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114225
2244	NC_012849	CGG	2	6	124674	124679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114225
2245	NC_012849	CTG	2	6	124781	124786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114225
2246	NC_012849	CG	3	6	124822	124827	0 %	0 %	50 %	50 %	241114225
2247	NC_012849	GGA	2	6	124864	124869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114225
2248	NC_012849	GGT	2	6	124981	124986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114226
2249	NC_012849	GCC	2	6	125092	125097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114226
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2251	NC_012849	ATC	2	6	125175	125180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114226
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2253	NC_012849	GCCA	2	8	125250	125257	25 %	0 %	25 %	50 %	241114226
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2257	NC_012849	GGA	2	6	125459	125464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114226
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2345	NC_012849	GA	3	6	129884	129889	50 %	0 %	50 %	0 %	241114230
2346	NC_012849	CG	3	6	129890	129895	0 %	0 %	50 %	50 %	241114230
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2349	NC_012849	CGG	2	6	129927	129932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114230
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2352	NC_012849	GTT	2	6	129974	129979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114230
2353	NC_012849	GTG	2	6	129984	129989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114230
2354	NC_012849	GCC	2	6	130035	130040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114230
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2356	NC_012849	GC	4	8	130090	130097	0 %	0 %	50 %	50 %	241114230
2357	NC_012849	ACG	2	6	130121	130126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114230
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2359	NC_012849	GCGA	2	8	130220	130227	25 %	0 %	50 %	25 %	241114230
2360	NC_012849	ATCG	2	8	130253	130260	25 %	25 %	25 %	25 %	241114230
2361	NC_012849	GTA	2	6	130262	130267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114230
2362	NC_012849	GGC	2	6	130482	130487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114231
2363	NC_012849	CG	3	6	130565	130570	0 %	0 %	50 %	50 %	241114231
2364	NC_012849	TCT	2	6	130585	130590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114231
2365	NC_012849	TGC	2	6	130609	130614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114231
2366	NC_012849	GC	3	6	130623	130628	0 %	0 %	50 %	50 %	241114231
2367	NC_012849	TGG	2	6	130663	130668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114231
2368	NC_012849	GTT	2	6	130671	130676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114231
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2394	NC_012849	ATCGAT	2	12	132260	132271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	241114233
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2483	NC_012849	CCGG	2	8	137657	137664	0 %	0 %	50 %	50 %	241114239
2484	NC_012849	TGC	2	6	137665	137670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114239
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2489	NC_012849	TG	3	6	137900	137905	0 %	50 %	50 %	0 %	241114239
2490	NC_012849	TGAT	2	8	138423	138430	25 %	50 %	25 %	0 %	241114240
2491	NC_012849	GGA	2	6	138472	138477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114240
2492	NC_012849	TGCGC	2	10	138478	138487	0 %	20 %	40 %	40 %	241114240
2493	NC_012849	TCA	2	6	138501	138506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114240
2494	NC_012849	GT	3	6	138579	138584	0 %	50 %	50 %	0 %	241114240
2495	NC_012849	GCC	2	6	138682	138687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114240
2496	NC_012849	TGC	2	6	138694	138699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114240
2497	NC_012849	TTGA	2	8	138700	138707	25 %	50 %	25 %	0 %	241114240
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2499	NC_012849	T	6	6	138734	138739	0 %	100 %	0 %	0 %	241114240
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