MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012849	CGA	2	6	83979	83984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114181
1502	NC_012849	CGA	2	6	84042	84047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114181
1503	NC_012849	CGC	2	6	84166	84171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1504	NC_012849	GCC	2	6	84178	84183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1505	NC_012849	CGC	2	6	84195	84200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1506	NC_012849	CGAA	2	8	84249	84256	50 %	0 %	25 %	25 %	241114182
1507	NC_012849	CAG	2	6	84262	84267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114182
1508	NC_012849	ACG	2	6	84351	84356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114182
1509	NC_012849	AG	3	6	84398	84403	50 %	0 %	50 %	0 %	241114182
1510	NC_012849	CGA	3	9	84483	84491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114182
1511	NC_012849	CGAG	2	8	84516	84523	25 %	0 %	50 %	25 %	241114182
1512	NC_012849	AGC	2	6	84572	84577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114182
1513	NC_012849	CAGGGC	2	12	84586	84597	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241114182
1514	NC_012849	TCT	2	6	84606	84611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114182
1515	NC_012849	GCCG	2	8	84661	84668	0 %	0 %	50 %	50 %	241114182
1516	NC_012849	CGC	2	6	84699	84704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1517	NC_012849	GTG	2	6	84838	84843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114182
1518	NC_012849	GCC	2	6	84863	84868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1519	NC_012849	TGA	2	6	84879	84884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114182
1520	NC_012849	GCC	2	6	84893	84898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1521	NC_012849	GGC	2	6	84907	84912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114182
1522	NC_012849	ACCG	2	8	84937	84944	25 %	0 %	25 %	50 %	241114182
1523	NC_012849	TGA	2	6	84951	84956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114182
1524	NC_012849	CTT	2	6	84979	84984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114182
1525	NC_012849	GC	3	6	84987	84992	0 %	0 %	50 %	50 %	241114182
1526	NC_012849	CTGC	2	8	85119	85126	0 %	25 %	25 %	50 %	241114182
1527	NC_012849	CGC	2	6	85147	85152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114182
1528	NC_012849	TGC	3	9	85229	85237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1529	NC_012849	CTGG	2	8	85278	85285	0 %	25 %	50 %	25 %	241114183
1530	NC_012849	GCC	2	6	85303	85308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114183
1531	NC_012849	T	6	6	85310	85315	0 %	100 %	0 %	0 %	241114183
1532	NC_012849	TGA	2	6	85382	85387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114183
1533	NC_012849	CTGG	2	8	85398	85405	0 %	25 %	50 %	25 %	241114183
1534	NC_012849	ATTG	2	8	85421	85428	25 %	50 %	25 %	0 %	241114183
1535	NC_012849	GAC	2	6	85487	85492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1536	NC_012849	GCGT	2	8	85577	85584	0 %	25 %	50 %	25 %	241114183
1537	NC_012849	ACC	3	9	85621	85629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114183
1538	NC_012849	AAG	2	6	85648	85653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114183
1539	NC_012849	GCT	2	6	85682	85687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1540	NC_012849	TCA	2	6	85762	85767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114183
1541	NC_012849	CTG	2	6	85779	85784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1542	NC_012849	CAT	2	6	85797	85802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114183
1543	NC_012849	GAT	2	6	85815	85820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114183
1544	NC_012849	ACG	2	6	85936	85941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1545	NC_012849	ACG	2	6	85954	85959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114183
1546	NC_012849	GTGC	2	8	86717	86724	0 %	25 %	50 %	25 %	241114184
1547	NC_012849	GGT	2	6	86788	86793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114184
1548	NC_012849	GCGG	2	8	86870	86877	0 %	0 %	75 %	25 %	241114184
1549	NC_012849	GC	3	6	86929	86934	0 %	0 %	50 %	50 %	241114184
1550	NC_012849	A	7	7	86971	86977	100 %	0 %	0 %	0 %	241114184
1551	NC_012849	GT	3	6	87053	87058	0 %	50 %	50 %	0 %	241114185
1552	NC_012849	CGA	2	6	87150	87155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1553	NC_012849	CTG	2	6	87232	87237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1554	NC_012849	GCA	3	9	87282	87290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1555	NC_012849	CAC	2	6	87327	87332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114185
1556	NC_012849	CAG	2	6	87336	87341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1557	NC_012849	GCG	2	6	87375	87380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114185
1558	NC_012849	GAG	2	6	87391	87396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114185
1559	NC_012849	CGA	2	6	87438	87443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1560	NC_012849	GCTG	2	8	87446	87453	0 %	25 %	50 %	25 %	241114185
1561	NC_012849	GGT	2	6	87489	87494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114185
1562	NC_012849	GTG	2	6	87555	87560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114185
1563	NC_012849	CCT	2	6	87574	87579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114185
1564	NC_012849	CAG	2	6	87631	87636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1565	NC_012849	GAA	2	6	87642	87647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114185
1566	NC_012849	ATC	2	6	87660	87665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114185
1567	NC_012849	GGC	2	6	87719	87724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114185
1568	NC_012849	AGC	2	6	87860	87865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114185
1569	NC_012849	TGA	2	6	88004	88009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114186
1570	NC_012849	GTT	2	6	88017	88022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114186
1571	NC_012849	ACG	2	6	88087	88092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1572	NC_012849	CGAGC	2	10	88143	88152	20 %	0 %	40 %	40 %	241114186
1573	NC_012849	GTT	2	6	88203	88208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114186
1574	NC_012849	CGT	2	6	88232	88237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1575	NC_012849	TGAA	2	8	88255	88262	50 %	25 %	25 %	0 %	241114186
1576	NC_012849	CGC	2	6	88274	88279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114186
1577	NC_012849	CTT	2	6	88353	88358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114186
1578	NC_012849	AGA	2	6	88372	88377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114186
1579	NC_012849	GAT	2	6	88428	88433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114186
1580	NC_012849	GGT	2	6	88476	88481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114186
1581	NC_012849	CGA	2	6	88505	88510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1582	NC_012849	CGT	2	6	88559	88564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1583	NC_012849	CGGG	2	8	88574	88581	0 %	0 %	75 %	25 %	241114186
1584	NC_012849	GAT	2	6	88584	88589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114186
1585	NC_012849	TCG	2	6	88594	88599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1586	NC_012849	GC	3	6	88608	88613	0 %	0 %	50 %	50 %	241114186
1587	NC_012849	GAA	2	6	88618	88623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114186
1588	NC_012849	GCG	2	6	88726	88731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114186
1589	NC_012849	TGA	2	6	88757	88762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114186
1590	NC_012849	CCG	2	6	88784	88789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114186
1591	NC_012849	CGA	2	6	88800	88805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114186
1592	NC_012849	GC	3	6	88811	88816	0 %	0 %	50 %	50 %	241114186
1593	NC_012849	CTT	2	6	88833	88838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114186
1594	NC_012849	TGT	2	6	88895	88900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114186
1595	NC_012849	TGAT	2	8	88903	88910	25 %	50 %	25 %	0 %	241114186
1596	NC_012849	GCG	2	6	88997	89002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114186
1597	NC_012849	CTT	2	6	89604	89609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114187
1598	NC_012849	CG	3	6	89645	89650	0 %	0 %	50 %	50 %	241114187
1599	NC_012849	GTG	2	6	89665	89670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114187
1600	NC_012849	TGC	2	6	89720	89725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114187
1601	NC_012849	TCA	2	6	89774	89779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114187
1602	NC_012849	GGT	2	6	89814	89819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114187
1603	NC_012849	CGC	2	6	89978	89983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114187
1604	NC_012849	ACA	2	6	89990	89995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114187
1605	NC_012849	CCGTCG	2	12	89996	90007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241114187
1606	NC_012849	CGA	3	9	90017	90025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114187
1607	NC_012849	GAA	2	6	90028	90033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114187
1608	NC_012849	TCT	2	6	90143	90148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114187
1609	NC_012849	AGA	2	6	90158	90163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114187
1610	NC_012849	GCTG	2	8	90227	90234	0 %	25 %	50 %	25 %	241114188
1611	NC_012849	GCT	2	6	90252	90257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114188
1612	NC_012849	GC	3	6	90275	90280	0 %	0 %	50 %	50 %	241114188
1613	NC_012849	C	6	6	90293	90298	0 %	0 %	0 %	100 %	241114188
1614	NC_012849	TCG	2	6	90391	90396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114188
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1616	NC_012849	ATC	2	6	90544	90549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114188
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1618	NC_012849	C	6	6	90637	90642	0 %	0 %	0 %	100 %	241114188
1619	NC_012849	TCT	2	6	90652	90657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114188
1620	NC_012849	TGA	2	6	90836	90841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114188
1621	NC_012849	TCG	2	6	90919	90924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114188
1622	NC_012849	TGC	2	6	90958	90963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114188
1623	NC_012849	TCGG	2	8	90989	90996	0 %	25 %	50 %	25 %	241114188
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1625	NC_012849	CTT	2	6	91034	91039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114188
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1751	NC_012849	GCAG	2	8	97464	97471	25 %	0 %	50 %	25 %	241114195
1752	NC_012849	GTT	2	6	97483	97488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114195
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1754	NC_012849	TGGC	2	8	97662	97669	0 %	25 %	50 %	25 %	241114195
1755	NC_012849	GCAA	2	8	97712	97719	50 %	0 %	25 %	25 %	241114195
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1861	NC_012849	CGG	2	6	103825	103830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114201
1862	NC_012849	GAT	2	6	103841	103846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114201
1863	NC_012849	CGA	2	6	103879	103884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114201
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1867	NC_012849	TGGA	2	8	104174	104181	25 %	25 %	50 %	0 %	241114202
1868	NC_012849	CGA	2	6	104182	104187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114202
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1872	NC_012849	TGG	2	6	104371	104376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114202
1873	NC_012849	CAAC	2	8	104386	104393	50 %	0 %	0 %	50 %	241114202
1874	NC_012849	GCG	3	9	104635	104643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114202
1875	NC_012849	CAC	2	6	104768	104773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114203
1876	NC_012849	GCGGT	2	10	104863	104872	0 %	20 %	60 %	20 %	241114203
1877	NC_012849	CGG	2	6	105050	105055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114203
1878	NC_012849	CGA	2	6	105074	105079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114203
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1881	NC_012849	CAA	2	6	105214	105219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114203
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1883	NC_012849	GTA	2	6	105320	105325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114203
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1885	NC_012849	AGCC	2	8	105361	105368	25 %	0 %	25 %	50 %	241114203
1886	NC_012849	CG	3	6	105374	105379	0 %	0 %	50 %	50 %	241114203
1887	NC_012849	CCG	2	6	105415	105420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114203
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1889	NC_012849	TGC	2	6	105571	105576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114203
1890	NC_012849	GTC	2	6	105588	105593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114203
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1892	NC_012849	GCC	2	6	105632	105637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114203
1893	NC_012849	CACCGC	2	12	105670	105681	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241114203
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1898	NC_012849	TTG	2	6	105967	105972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114204
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1900	NC_012849	CGA	2	6	106208	106213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114204
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1904	NC_012849	CAG	2	6	106266	106271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114204
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1973	NC_012849	TC	3	6	111239	111244	0 %	50 %	0 %	50 %	241114210
1974	NC_012849	GGT	2	6	111277	111282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114210
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1979	NC_012849	GTG	2	6	111678	111683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114210
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1983	NC_012849	GCATC	2	10	111933	111942	20 %	20 %	20 %	40 %	241114211
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1985	NC_012849	GAA	2	6	111984	111989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114211
1986	NC_012849	TCG	2	6	111994	111999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114211
1987	NC_012849	GTC	2	6	112013	112018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114211
1988	NC_012849	GCAGAT	2	12	112080	112091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241114211
1989	NC_012849	GGC	2	6	112096	112101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114211
1990	NC_012849	GGT	2	6	112114	112119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114211
1991	NC_012849	GGT	3	9	112132	112140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114211
1992	NC_012849	CG	3	6	112145	112150	0 %	0 %	50 %	50 %	241114211
1993	NC_012849	GAT	2	6	112156	112161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114211
1994	NC_012849	GGA	2	6	112198	112203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114211
1995	NC_012849	CGCAG	2	10	112210	112219	20 %	0 %	40 %	40 %	241114211
1996	NC_012849	AGT	2	6	112237	112242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114211
1997	NC_012849	CGT	2	6	112246	112251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114211
1998	NC_012849	GAC	2	6	112285	112290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114211
1999	NC_012849	GAA	2	6	112548	112553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114212
2000	NC_012849	CGG	2	6	112619	112624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114212

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