MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012849	G	7	7	30733	30739	0 %	0 %	100 %	0 %	241114130
502	NC_012849	CTT	2	6	30743	30748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114130
503	NC_012849	CCGA	2	8	30767	30774	25 %	0 %	25 %	50 %	241114130
504	NC_012849	CAT	2	6	30811	30816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114130
505	NC_012849	CCG	2	6	30876	30881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114130
506	NC_012849	TGGGAA	2	12	30934	30945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241114130
507	NC_012849	TC	3	6	30988	30993	0 %	50 %	0 %	50 %	241114130
508	NC_012849	CCT	2	6	31015	31020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114130
509	NC_012849	CTGC	2	8	31054	31061	0 %	25 %	25 %	50 %	241114130
510	NC_012849	GAT	2	6	31066	31071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114130
511	NC_012849	GGGT	2	8	31103	31110	0 %	25 %	75 %	0 %	241114130
512	NC_012849	GTGCT	2	10	31193	31202	0 %	40 %	40 %	20 %	241114131
513	NC_012849	TGA	2	6	31215	31220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114131
514	NC_012849	CGG	2	6	31280	31285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114131
515	NC_012849	CATG	2	8	31302	31309	25 %	25 %	25 %	25 %	241114131
516	NC_012849	AAC	2	6	31423	31428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114131
517	NC_012849	CTC	2	6	31479	31484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114132
518	NC_012849	CGC	3	9	31503	31511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114132
519	NC_012849	GAC	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114132
520	NC_012849	GTC	2	6	31582	31587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114132
521	NC_012849	TC	3	6	31715	31720	0 %	50 %	0 %	50 %	241114132
522	NC_012849	TGA	2	6	31778	31783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
523	NC_012849	AGTTG	2	10	31793	31802	20 %	40 %	40 %	0 %	241114132
524	NC_012849	TGC	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114132
525	NC_012849	GC	4	8	31834	31841	0 %	0 %	50 %	50 %	241114132
526	NC_012849	CCAG	2	8	31844	31851	25 %	0 %	25 %	50 %	241114132
527	NC_012849	CCA	2	6	31904	31909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114132
528	NC_012849	GAT	2	6	31974	31979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
529	NC_012849	ACG	2	6	32033	32038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114132
530	NC_012849	AGT	2	6	32084	32089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114132
531	NC_012849	ATG	2	6	32533	32538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114133
532	NC_012849	GCG	2	6	32596	32601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114133
533	NC_012849	GCT	2	6	32621	32626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114133
534	NC_012849	GCG	2	6	32634	32639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114133
535	NC_012849	GTG	2	6	32643	32648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114133
536	NC_012849	C	6	6	32733	32738	0 %	0 %	0 %	100 %	241114133
537	NC_012849	CG	3	6	32850	32855	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
538	NC_012849	GCC	2	6	32890	32895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
539	NC_012849	GTC	2	6	32901	32906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
540	NC_012849	CTCGCG	2	12	32934	32945	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241114134
541	NC_012849	CAA	2	6	32956	32961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114134
542	NC_012849	AGC	2	6	32972	32977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
543	NC_012849	TGC	3	9	32998	33006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
544	NC_012849	AGC	2	6	33040	33045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
545	NC_012849	CG	3	6	33062	33067	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
546	NC_012849	CGG	2	6	33146	33151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
547	NC_012849	TCAG	2	8	33181	33188	25 %	25 %	25 %	25 %	241114134
548	NC_012849	GGC	2	6	33201	33206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
549	NC_012849	GGC	2	6	33323	33328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
550	NC_012849	GGC	2	6	33334	33339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
551	NC_012849	GCA	2	6	33348	33353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
552	NC_012849	CGA	2	6	33374	33379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
553	NC_012849	CG	4	8	33389	33396	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
554	NC_012849	GCAG	2	8	33437	33444	25 %	0 %	50 %	25 %	241114134
555	NC_012849	TGCCGC	2	12	33452	33463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241114134
556	NC_012849	GC	3	6	33476	33481	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
557	NC_012849	GCC	3	9	33483	33491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
558	NC_012849	CGA	2	6	33602	33607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
559	NC_012849	AGCG	2	8	33633	33640	25 %	0 %	50 %	25 %	241114134
560	NC_012849	GCG	2	6	33674	33679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114134
561	NC_012849	CGGC	2	8	33703	33710	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
562	NC_012849	CATC	2	8	33763	33770	25 %	25 %	0 %	50 %	241114134
563	NC_012849	GTT	2	6	33773	33778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114134
564	NC_012849	CGC	3	9	33800	33808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
565	NC_012849	GC	3	6	33807	33812	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
566	NC_012849	GCC	2	6	33825	33830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
567	NC_012849	ACGC	2	8	33832	33839	25 %	0 %	25 %	50 %	241114134
568	NC_012849	GGCGCA	2	12	33881	33892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241114134
569	NC_012849	CTG	2	6	33894	33899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
570	NC_012849	GCT	2	6	33921	33926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
571	NC_012849	GCGT	2	8	33938	33945	0 %	25 %	50 %	25 %	241114134
572	NC_012849	CCG	2	6	33946	33951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114134
573	NC_012849	ACG	2	6	33979	33984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114134
574	NC_012849	ACGC	2	8	33989	33996	25 %	0 %	25 %	50 %	241114134
575	NC_012849	GCT	2	6	34007	34012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
576	NC_012849	TCG	2	6	34019	34024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114134
577	NC_012849	CG	3	6	34058	34063	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
578	NC_012849	GC	3	6	34068	34073	0 %	0 %	50 %	50 %	241114134
579	NC_012849	CGCAGG	2	12	34096	34107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241114134
580	NC_012849	CGC	2	6	34180	34185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
581	NC_012849	GCC	3	9	34250	34258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
582	NC_012849	AAG	2	6	34292	34297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114135
583	NC_012849	CGG	2	6	34320	34325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114135
584	NC_012849	CCG	2	6	34335	34340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
585	NC_012849	GCC	2	6	34430	34435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
586	NC_012849	GTG	2	6	34436	34441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114135
587	NC_012849	GCC	2	6	34476	34481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
588	NC_012849	AGGTG	2	10	34501	34510	20 %	20 %	60 %	0 %	241114135
589	NC_012849	GCC	2	6	34535	34540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
590	NC_012849	CCG	2	6	34555	34560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
591	NC_012849	GC	3	6	34586	34591	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
592	NC_012849	GCTGAG	2	12	34679	34690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241114135
593	NC_012849	GCT	2	6	34703	34708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114135
594	NC_012849	CG	4	8	34720	34727	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
595	NC_012849	GCCG	2	8	34769	34776	0 %	0 %	50 %	50 %	241114135
596	NC_012849	GCCGGT	2	12	34942	34953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241114135
597	NC_012849	CCA	2	6	34986	34991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114135
598	NC_012849	CGG	2	6	35022	35027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114135
599	NC_012849	CTC	2	6	35045	35050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114135
600	NC_012849	CGC	2	6	35097	35102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114135
601	NC_012849	TCC	2	6	35160	35165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114135
602	NC_012849	CAG	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114135
603	NC_012849	CAG	2	6	35255	35260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114135
604	NC_012849	CTG	2	6	35282	35287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114135
605	NC_012849	GAA	2	6	35299	35304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114135
606	NC_012849	GAC	2	6	35315	35320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114135
607	NC_012849	TCG	2	6	35387	35392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
608	NC_012849	TGC	2	6	35420	35425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
609	NC_012849	CAG	2	6	35644	35649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114136
610	NC_012849	GGT	2	6	35736	35741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114136
611	NC_012849	CG	3	6	35768	35773	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
612	NC_012849	AAGGC	2	10	35798	35807	40 %	0 %	40 %	20 %	241114136
613	NC_012849	GACG	2	8	35835	35842	25 %	0 %	50 %	25 %	241114136
614	NC_012849	GGC	2	6	35959	35964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114136
615	NC_012849	CGT	2	6	35979	35984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
616	NC_012849	CTGGA	2	10	36019	36028	20 %	20 %	40 %	20 %	241114136
617	NC_012849	CG	3	6	36040	36045	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
618	NC_012849	ACT	2	6	36077	36082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114136
619	NC_012849	CGCAA	2	10	36164	36173	40 %	0 %	20 %	40 %	241114136
620	NC_012849	CGG	2	6	36216	36221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114136
621	NC_012849	CAGC	2	8	36239	36246	25 %	0 %	25 %	50 %	241114136
622	NC_012849	GTC	2	6	36265	36270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
623	NC_012849	GC	3	6	36275	36280	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
624	NC_012849	GCC	3	9	36313	36321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114136
625	NC_012849	GA	3	6	36338	36343	50 %	0 %	50 %	0 %	241114136
626	NC_012849	AAG	2	6	36346	36351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114136
627	NC_012849	CGT	2	6	36366	36371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
628	NC_012849	TGG	3	9	36401	36409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114136
629	NC_012849	CCA	2	6	36410	36415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114136
630	NC_012849	GCT	2	6	36450	36455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
631	NC_012849	CTG	2	6	36478	36483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
632	NC_012849	GC	3	6	36492	36497	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
633	NC_012849	GCT	2	6	36531	36536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114136
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643	NC_012849	GGC	3	9	37041	37049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114136
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659	NC_012849	GC	3	6	37606	37611	0 %	0 %	50 %	50 %	241114136
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753	NC_012849	ACG	2	6	41857	41862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114141
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755	NC_012849	GCTCAA	2	12	42020	42031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241114141
756	NC_012849	CG	3	6	42072	42077	0 %	0 %	50 %	50 %	241114141
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999	NC_012849	ATCG	2	8	56499	56506	25 %	25 %	25 %	25 %	241114155
1000	NC_012849	CGAT	2	8	56589	56596	25 %	25 %	25 %	25 %	241114155

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