MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D02

Total Repeats: 5017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012849	CCA	2	6	243930	243935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114347
4502	NC_012849	CCTT	2	8	243983	243990	0 %	50 %	0 %	50 %	241114347
4503	NC_012849	CGTCAT	2	12	244027	244038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241114347
4504	NC_012849	GGCC	2	8	244149	244156	0 %	0 %	50 %	50 %	241114347
4505	NC_012849	CCAT	2	8	244172	244179	25 %	25 %	0 %	50 %	241114347
4506	NC_012849	AGTG	2	8	244210	244217	25 %	25 %	50 %	0 %	241114347
4507	NC_012849	GTGG	2	8	244275	244282	0 %	25 %	75 %	0 %	241114348
4508	NC_012849	GTG	2	6	244286	244291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114348
4509	NC_012849	GCC	2	6	244304	244309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4510	NC_012849	CAG	2	6	244317	244322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4511	NC_012849	GAC	2	6	244335	244340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4512	NC_012849	GCC	2	6	244371	244376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4513	NC_012849	GGC	2	6	244386	244391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4514	NC_012849	GGCC	2	8	244445	244452	0 %	0 %	50 %	50 %	241114348
4515	NC_012849	CAG	2	6	244518	244523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4516	NC_012849	CCT	2	6	244547	244552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114348
4517	NC_012849	AGC	2	6	244582	244587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4518	NC_012849	GCC	2	6	244606	244611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4519	NC_012849	CGA	2	6	244634	244639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4520	NC_012849	CAG	2	6	244665	244670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4521	NC_012849	AGC	2	6	244675	244680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4522	NC_012849	CCG	2	6	244687	244692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4523	NC_012849	ATG	2	6	244717	244722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4524	NC_012849	AGC	2	6	244723	244728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4525	NC_012849	TCG	2	6	244732	244737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4526	NC_012849	CAG	2	6	244758	244763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4527	NC_012849	GAT	2	6	244770	244775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4528	NC_012849	ACG	2	6	244792	244797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4529	NC_012849	TGGCGC	2	12	244808	244819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241114348
4530	NC_012849	CCG	2	6	244862	244867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4531	NC_012849	CCG	2	6	244889	244894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4532	NC_012849	CGG	2	6	244986	244991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4533	NC_012849	CAC	2	6	244998	245003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114348
4534	NC_012849	CTG	2	6	245034	245039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4535	NC_012849	CGGT	2	8	245044	245051	0 %	25 %	50 %	25 %	241114348
4536	NC_012849	C	6	6	245161	245166	0 %	0 %	0 %	100 %	241114348
4537	NC_012849	TGA	2	6	245172	245177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4538	NC_012849	CGAT	2	8	245230	245237	25 %	25 %	25 %	25 %	241114348
4539	NC_012849	CCG	2	6	245257	245262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4540	NC_012849	CCT	2	6	245312	245317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114348
4541	NC_012849	CGG	2	6	245424	245429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4542	NC_012849	TCC	2	6	245476	245481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241114348
4543	NC_012849	GGT	2	6	245493	245498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114348
4544	NC_012849	GCC	2	6	245507	245512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4545	NC_012849	CG	3	6	245519	245524	0 %	0 %	50 %	50 %	241114348
4546	NC_012849	TGG	2	6	245537	245542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114348
4547	NC_012849	GCCT	2	8	245589	245596	0 %	25 %	25 %	50 %	241114348
4548	NC_012849	AC	3	6	245603	245608	50 %	0 %	0 %	50 %	241114348
4549	NC_012849	TGA	2	6	245630	245635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4550	NC_012849	CGGT	2	8	245638	245645	0 %	25 %	50 %	25 %	241114348
4551	NC_012849	TGC	2	6	245647	245652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4552	NC_012849	GCC	2	6	245662	245667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4553	NC_012849	CGG	2	6	245672	245677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4554	NC_012849	CAG	2	6	245706	245711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4555	NC_012849	GCG	2	6	245726	245731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4556	NC_012849	CAG	2	6	245778	245783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4557	NC_012849	CGG	2	6	245786	245791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4558	NC_012849	CAGC	2	8	245856	245863	25 %	0 %	25 %	50 %	241114348
4559	NC_012849	GCT	2	6	245953	245958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4560	NC_012849	GCG	2	6	245987	245992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4561	NC_012849	GAAT	2	8	246032	246039	50 %	25 %	25 %	0 %	241114348
4562	NC_012849	TGA	2	6	246047	246052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4563	NC_012849	CAG	2	6	246054	246059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4564	NC_012849	GAA	2	6	246063	246068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241114348
4565	NC_012849	CGG	2	6	246197	246202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4566	NC_012849	GGCGAT	2	12	246222	246233	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241114348
4567	NC_012849	GCC	2	6	246234	246239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4568	NC_012849	ATG	2	6	246247	246252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4569	NC_012849	GCC	2	6	246289	246294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4570	NC_012849	GGAACA	2	12	246344	246355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	241114348
4571	NC_012849	AC	3	6	246360	246365	50 %	0 %	0 %	50 %	241114348
4572	NC_012849	CGA	3	9	246371	246379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4573	NC_012849	CG	3	6	246417	246422	0 %	0 %	50 %	50 %	241114348
4574	NC_012849	CGC	2	6	246557	246562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4575	NC_012849	CGC	2	6	246601	246606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4576	NC_012849	CGT	2	6	246662	246667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4577	NC_012849	TCG	2	6	246668	246673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4578	NC_012849	GTC	2	6	246693	246698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4579	NC_012849	GCC	2	6	246762	246767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4580	NC_012849	GCC	2	6	246793	246798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4581	NC_012849	CTTGG	2	10	246804	246813	0 %	40 %	40 %	20 %	241114348
4582	NC_012849	GAC	2	6	246849	246854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4583	NC_012849	CCG	2	6	246874	246879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114348
4584	NC_012849	GC	4	8	246944	246951	0 %	0 %	50 %	50 %	241114348
4585	NC_012849	GCTG	2	8	246953	246960	0 %	25 %	50 %	25 %	241114348
4586	NC_012849	CCA	2	6	246983	246988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114348
4587	NC_012849	GGC	3	9	247044	247052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4588	NC_012849	GGTC	2	8	247112	247119	0 %	25 %	50 %	25 %	241114348
4589	NC_012849	TGG	3	9	247202	247210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114348
4590	NC_012849	GCG	2	6	247244	247249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4591	NC_012849	GAT	2	6	247272	247277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114348
4592	NC_012849	GCG	2	6	247313	247318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114348
4593	NC_012849	CAG	2	6	247365	247370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114348
4594	NC_012849	CGG	2	6	247441	247446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114349
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4596	NC_012849	CGG	2	6	247537	247542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114349
4597	NC_012849	CGAC	2	8	247638	247645	25 %	0 %	25 %	50 %	241114349
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4600	NC_012849	CGGC	2	8	247687	247694	0 %	0 %	50 %	50 %	241114349
4601	NC_012849	GCC	2	6	247695	247700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114349
4602	NC_012849	GGT	2	6	247709	247714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114349
4603	NC_012849	GCC	2	6	247805	247810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114349
4604	NC_012849	CCA	2	6	247864	247869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114349
4605	NC_012849	TGC	2	6	247876	247881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114349
4606	NC_012849	CGC	2	6	247936	247941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114349
4607	NC_012849	TTG	2	6	247989	247994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114349
4608	NC_012849	CGGT	2	8	248086	248093	0 %	25 %	50 %	25 %	241114349
4609	NC_012849	GAT	2	6	248120	248125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114349
4610	NC_012849	GCCG	2	8	248284	248291	0 %	0 %	50 %	50 %	241114349
4611	NC_012849	CTGAC	2	10	248307	248316	20 %	20 %	20 %	40 %	241114349
4612	NC_012849	GCA	2	6	248335	248340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114349
4613	NC_012849	GC	3	6	248342	248347	0 %	0 %	50 %	50 %	241114349
4614	NC_012849	GCC	2	6	248418	248423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114349
4615	NC_012849	TGCC	2	8	248453	248460	0 %	25 %	25 %	50 %	241114349
4616	NC_012849	CGC	2	6	248463	248468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114349
4617	NC_012849	GC	3	6	248519	248524	0 %	0 %	50 %	50 %	241114349
4618	NC_012849	TCG	2	6	248547	248552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114349
4619	NC_012849	CCGG	2	8	248591	248598	0 %	0 %	50 %	50 %	241114349
4620	NC_012849	CAGTA	2	10	248763	248772	40 %	20 %	20 %	20 %	241114349
4621	NC_012849	CTT	2	6	248774	248779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241114349
4622	NC_012849	CGA	2	6	248837	248842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114349
4623	NC_012849	T	6	6	248939	248944	0 %	100 %	0 %	0 %	241114349
4624	NC_012849	CGGCCA	2	12	249084	249095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241114350
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4650	NC_012849	GC	3	6	250203	250208	0 %	0 %	50 %	50 %	241114350
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4689	NC_012849	CGA	2	6	252399	252404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114353
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4721	NC_012849	ATC	2	6	254442	254447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114354
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4724	NC_012849	GATGC	2	10	254571	254580	20 %	20 %	40 %	20 %	241114354
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4727	NC_012849	GCGCTT	2	12	254815	254826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114355
4728	NC_012849	TGGA	2	8	254844	254851	25 %	25 %	50 %	0 %	241114355
4729	NC_012849	ATG	3	9	254920	254928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114355
4730	NC_012849	ATG	2	6	254935	254940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114355
4731	NC_012849	CGG	2	6	254943	254948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114355
4732	NC_012849	GAT	2	6	254949	254954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114355
4733	NC_012849	GAT	2	6	254967	254972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114355
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4735	NC_012849	GATGCA	2	12	255006	255017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241114355
4736	NC_012849	ATG	2	6	255025	255030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114355
4737	NC_012849	TGG	2	6	255185	255190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114356
4738	NC_012849	TGA	3	9	255293	255301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114356
4739	NC_012849	GCG	2	6	255327	255332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114356
4740	NC_012849	GA	3	6	255339	255344	50 %	0 %	50 %	0 %	241114356
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4742	NC_012849	CAT	2	6	255551	255556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114357
4743	NC_012849	AGT	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241114357
4744	NC_012849	TTGG	2	8	255603	255610	0 %	50 %	50 %	0 %	241114357
4745	NC_012849	GGT	2	6	255611	255616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114357
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4747	NC_012849	GCT	2	6	255806	255811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114357
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4824	NC_012849	AATG	2	8	259304	259311	50 %	25 %	25 %	0 %	241114360
4825	NC_012849	GCGG	2	8	259327	259334	0 %	0 %	75 %	25 %	241114360
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4832	NC_012849	CTTGC	2	10	259760	259769	0 %	40 %	20 %	40 %	241114361
4833	NC_012849	GGC	2	6	259779	259784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114361
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4843	NC_012849	CATG	2	8	260303	260310	25 %	25 %	25 %	25 %	241114362
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4845	NC_012849	CCA	2	6	261335	261340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241114363
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4847	NC_012849	TGC	2	6	261374	261379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114363
4848	NC_012849	ACG	2	6	261386	261391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114363
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4850	NC_012849	GC	3	6	261619	261624	0 %	0 %	50 %	50 %	241114363
4851	NC_012849	CG	3	6	261661	261666	0 %	0 %	50 %	50 %	241114363
4852	NC_012849	TTG	2	6	261674	261679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114363
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4855	NC_012849	GC	3	6	261882	261887	0 %	0 %	50 %	50 %	241114363
4856	NC_012849	GCT	3	9	261927	261935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114363
4857	NC_012849	GCTT	2	8	262061	262068	0 %	50 %	25 %	25 %	241114363
4858	NC_012849	CCGG	2	8	262087	262094	0 %	0 %	50 %	50 %	241114363
4859	NC_012849	GCG	2	6	262234	262239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114364
4860	NC_012849	CCG	2	6	262249	262254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241114364
4861	NC_012849	GCG	2	6	262320	262325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241114364
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4863	NC_012849	ACT	2	6	262345	262350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114364
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4865	NC_012849	TTG	2	6	262434	262439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114364
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4986	NC_012849	CAA	2	6	271567	271572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241114373
4987	NC_012849	C	6	6	271619	271624	0 %	0 %	0 %	100 %	241114373
4988	NC_012849	ACG	2	6	271672	271677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241114373
4989	NC_012849	CG	3	6	271693	271698	0 %	0 %	50 %	50 %	241114373
4990	NC_012849	GTT	2	6	271720	271725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114373
4991	NC_012849	CAT	2	6	271727	271732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241114373
4992	NC_012849	TAGCGG	2	12	271819	271830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241114374
4993	NC_012849	GGA	2	6	271874	271879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241114374
4994	NC_012849	TGC	2	6	271954	271959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114374
4995	NC_012849	TTCGC	2	10	271969	271978	0 %	40 %	20 %	40 %	241114374
4996	NC_012849	GC	3	6	271986	271991	0 %	0 %	50 %	50 %	241114374
4997	NC_012849	TTG	2	6	272031	272036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241114374
4998	NC_012849	TGC	2	6	272120	272125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241114374
4999	NC_012849	A	6	6	272212	272217	100 %	0 %	0 %	0 %	241114374
5000	NC_012849	TGG	2	6	272357	272362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241114375

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