MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012848	CTC	2	6	179861	179866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113164
3502	NC_012848	CAG	2	6	179924	179929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113164
3503	NC_012848	GCCG	2	8	179938	179945	0 %	0 %	50 %	50 %	241113164
3504	NC_012848	TCGT	2	8	180013	180020	0 %	50 %	25 %	25 %	241113164
3505	NC_012848	TCG	2	6	180240	180245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3506	NC_012848	GAT	2	6	180267	180272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113165
3507	NC_012848	CCA	2	6	180328	180333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113165
3508	NC_012848	CAGCT	2	10	180339	180348	20 %	20 %	20 %	40 %	241113165
3509	NC_012848	CTG	2	6	180387	180392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3510	NC_012848	GC	3	6	180408	180413	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3511	NC_012848	G	6	6	180420	180425	0 %	0 %	100 %	0 %	241113165
3512	NC_012848	CTG	2	6	180435	180440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3513	NC_012848	GC	3	6	180441	180446	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3514	NC_012848	TTGCCT	2	12	180469	180480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	241113165
3515	NC_012848	CGC	2	6	180527	180532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3516	NC_012848	ACG	2	6	180580	180585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3517	NC_012848	CGG	2	6	180649	180654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3518	NC_012848	CCGG	2	8	180660	180667	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3519	NC_012848	CGC	2	6	180671	180676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3520	NC_012848	CCG	2	6	180712	180717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3521	NC_012848	ACG	2	6	180756	180761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3522	NC_012848	CGT	2	6	180776	180781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3523	NC_012848	CGC	2	6	180789	180794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3524	NC_012848	T	7	7	180800	180806	0 %	100 %	0 %	0 %	241113165
3525	NC_012848	GCC	2	6	180807	180812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3526	NC_012848	CGT	2	6	180824	180829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3527	NC_012848	GA	3	6	180832	180837	50 %	0 %	50 %	0 %	241113165
3528	NC_012848	TTC	2	6	180873	180878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113165
3529	NC_012848	CG	3	6	180902	180907	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3530	NC_012848	CAC	2	6	180908	180913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113165
3531	NC_012848	GGC	2	6	180924	180929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3532	NC_012848	TTG	2	6	180934	180939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113165
3533	NC_012848	GC	3	6	180960	180965	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3534	NC_012848	ATT	2	6	181006	181011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113165
3535	NC_012848	TCG	2	6	181093	181098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3536	NC_012848	GCG	2	6	181099	181104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3537	NC_012848	CGC	2	6	181105	181110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3538	NC_012848	CGA	2	6	181139	181144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3539	NC_012848	TGC	2	6	181192	181197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3540	NC_012848	GC	3	6	181214	181219	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3541	NC_012848	TCG	2	6	181276	181281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3542	NC_012848	GAC	2	6	181302	181307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3543	NC_012848	CGG	2	6	181339	181344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3544	NC_012848	GCC	2	6	181383	181388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3545	NC_012848	TCG	2	6	181453	181458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3546	NC_012848	GCG	3	9	181483	181491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113165
3547	NC_012848	CCG	2	6	181504	181509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3548	NC_012848	GTC	2	6	181557	181562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3549	NC_012848	TGC	2	6	181609	181614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3550	NC_012848	CGC	2	6	181670	181675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113165
3551	NC_012848	GC	3	6	181689	181694	0 %	0 %	50 %	50 %	241113165
3552	NC_012848	TCG	2	6	181702	181707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113165
3553	NC_012848	CCGG	2	8	181907	181914	0 %	0 %	50 %	50 %	241113166
3554	NC_012848	CGA	2	6	181967	181972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3555	NC_012848	CGA	2	6	181982	181987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3556	NC_012848	GCG	2	6	181993	181998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3557	NC_012848	GCG	2	6	182011	182016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3558	NC_012848	CCG	2	6	182032	182037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113166
3559	NC_012848	GAC	2	6	182070	182075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3560	NC_012848	GGCGC	2	10	182099	182108	0 %	0 %	60 %	40 %	241113166
3561	NC_012848	TGG	2	6	182121	182126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113166
3562	NC_012848	CGA	2	6	182152	182157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3563	NC_012848	CGG	2	6	182183	182188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3564	NC_012848	CGC	2	6	182197	182202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113166
3565	NC_012848	CGC	2	6	182225	182230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113166
3566	NC_012848	GAG	2	6	182232	182237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113166
3567	NC_012848	GGC	2	6	182280	182285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3568	NC_012848	CT	3	6	182329	182334	0 %	50 %	0 %	50 %	241113166
3569	NC_012848	CAT	2	6	182339	182344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113166
3570	NC_012848	CGG	2	6	182360	182365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113166
3571	NC_012848	GCC	2	6	182481	182486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113166
3572	NC_012848	CGA	2	6	182531	182536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3573	NC_012848	CGA	2	6	182591	182596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3574	NC_012848	CGA	2	6	182615	182620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113166
3575	NC_012848	TGC	2	6	182716	182721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3576	NC_012848	GGA	2	6	182770	182775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113167
3577	NC_012848	CG	3	6	182778	182783	0 %	0 %	50 %	50 %	241113167
3578	NC_012848	CGT	2	6	182803	182808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3579	NC_012848	TCG	2	6	182901	182906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3580	NC_012848	CGGGC	2	10	182914	182923	0 %	0 %	60 %	40 %	241113167
3581	NC_012848	GAG	2	6	183002	183007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113167
3582	NC_012848	TTC	2	6	183023	183028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113167
3583	NC_012848	CTT	2	6	183037	183042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113167
3584	NC_012848	TCC	2	6	183116	183121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113167
3585	NC_012848	GCCA	2	8	183125	183132	25 %	0 %	25 %	50 %	241113167
3586	NC_012848	GCT	2	6	183187	183192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3587	NC_012848	GCC	2	6	183302	183307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113167
3588	NC_012848	GGC	2	6	183313	183318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113167
3589	NC_012848	TCG	2	6	183324	183329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3590	NC_012848	ATC	2	6	183341	183346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113167
3591	NC_012848	GCG	2	6	183380	183385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113167
3592	NC_012848	CGAC	2	8	183396	183403	25 %	0 %	25 %	50 %	241113167
3593	NC_012848	GCGA	2	8	183419	183426	25 %	0 %	50 %	25 %	241113167
3594	NC_012848	CCGGCG	2	12	183453	183464	0 %	0 %	50 %	50 %	241113167
3595	NC_012848	ATT	2	6	183468	183473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113167
3596	NC_012848	CGAT	2	8	183474	183481	25 %	25 %	25 %	25 %	241113167
3597	NC_012848	CCG	2	6	183495	183500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113167
3598	NC_012848	GTGC	2	8	183511	183518	0 %	25 %	50 %	25 %	241113167
3599	NC_012848	CG	3	6	183531	183536	0 %	0 %	50 %	50 %	241113167
3600	NC_012848	TCG	2	6	183549	183554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3601	NC_012848	CGGG	2	8	183606	183613	0 %	0 %	75 %	25 %	241113167
3602	NC_012848	TCG	2	6	183630	183635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113167
3603	NC_012848	GTT	2	6	183667	183672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113167
3604	NC_012848	TCA	2	6	183714	183719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113167
3605	NC_012848	GGA	2	6	183754	183759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113167
3606	NC_012848	GCCG	2	8	183799	183806	0 %	0 %	50 %	50 %	241113167
3607	NC_012848	GCT	2	6	183886	183891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113168
3608	NC_012848	CGT	2	6	183906	183911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113168
3609	NC_012848	CCG	2	6	183926	183931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113168
3610	NC_012848	ATCG	2	8	183947	183954	25 %	25 %	25 %	25 %	241113168
3611	NC_012848	CTT	2	6	183974	183979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113168
3612	NC_012848	CGC	2	6	184000	184005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113168
3613	NC_012848	GGA	2	6	184015	184020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113168
3614	NC_012848	AGC	2	6	184125	184130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113168
3615	NC_012848	CGC	2	6	184252	184257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113168
3616	NC_012848	CGA	2	6	184339	184344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113168
3617	NC_012848	ACC	2	6	184410	184415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113168
3618	NC_012848	CGG	2	6	184426	184431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113168
3619	NC_012848	CAT	2	6	184445	184450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113168
3620	NC_012848	GC	3	6	184456	184461	0 %	0 %	50 %	50 %	241113168
3621	NC_012848	GGC	2	6	184462	184467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113168
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3734	NC_012848	GATCG	2	10	189777	189786	20 %	20 %	40 %	20 %	241113170
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3863	NC_012848	GAC	2	6	196883	196888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113176
3864	NC_012848	CGATGG	2	12	196996	197007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113176
3865	NC_012848	ATC	2	6	197028	197033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113176
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3975	NC_012848	CAT	2	6	201587	201592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113180
3976	NC_012848	GAAC	2	8	201613	201620	50 %	0 %	25 %	25 %	241113180
3977	NC_012848	CGA	2	6	201632	201637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113180
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3979	NC_012848	TCG	2	6	201841	201846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113180
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3981	NC_012848	GCA	2	6	201881	201886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113180
3982	NC_012848	TCG	2	6	201901	201906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113180
3983	NC_012848	CGA	2	6	201929	201934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113180
3984	NC_012848	CTT	2	6	201993	201998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113180
3985	NC_012848	CGC	2	6	202070	202075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113180
3986	NC_012848	CGC	2	6	202263	202268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113181
3987	NC_012848	GCG	2	6	202287	202292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113181
3988	NC_012848	GC	3	6	202311	202316	0 %	0 %	50 %	50 %	241113181
3989	NC_012848	GGGA	2	8	202321	202328	25 %	0 %	75 %	0 %	241113181
3990	NC_012848	TCGA	2	8	202368	202375	25 %	25 %	25 %	25 %	241113181
3991	NC_012848	ATGCCA	2	12	202495	202506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113181
3992	NC_012848	GGA	2	6	202529	202534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113181
3993	NC_012848	GAG	2	6	202608	202613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113181
3994	NC_012848	CAG	2	6	202644	202649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113181
3995	NC_012848	GGGAA	2	10	202651	202660	40 %	0 %	60 %	0 %	241113181
3996	NC_012848	CGG	2	6	202679	202684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113181
3997	NC_012848	CGC	2	6	202735	202740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113181
3998	NC_012848	CAG	2	6	202774	202779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113181
3999	NC_012848	CGA	2	6	202917	202922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113182
4000	NC_012848	GAA	2	6	202933	202938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113182

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