MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012848	GTA	2	6	156357	156362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113138
3002	NC_012848	CGTT	2	8	156452	156459	0 %	50 %	25 %	25 %	241113138
3003	NC_012848	CGA	2	6	156715	156720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113139
3004	NC_012848	ATCGA	2	10	156729	156738	40 %	20 %	20 %	20 %	241113139
3005	NC_012848	GTCG	2	8	156752	156759	0 %	25 %	50 %	25 %	241113139
3006	NC_012848	TTC	2	6	156807	156812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113139
3007	NC_012848	GAG	2	6	156855	156860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113139
3008	NC_012848	TGG	2	6	156862	156867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113139
3009	NC_012848	CAGG	2	8	156893	156900	25 %	0 %	50 %	25 %	241113139
3010	NC_012848	GAG	2	6	156996	157001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113139
3011	NC_012848	CT	3	6	157014	157019	0 %	50 %	0 %	50 %	241113139
3012	NC_012848	GCG	2	6	157049	157054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113139
3013	NC_012848	CTA	2	6	157076	157081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113139
3014	NC_012848	TCA	2	6	157138	157143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113139
3015	NC_012848	CGC	2	6	157153	157158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113139
3016	NC_012848	CGC	2	6	157225	157230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113140
3017	NC_012848	CTT	2	6	157232	157237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113140
3018	NC_012848	TCC	2	6	157268	157273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113140
3019	NC_012848	GC	3	6	157297	157302	0 %	0 %	50 %	50 %	241113140
3020	NC_012848	GCG	2	6	157354	157359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113140
3021	NC_012848	CTT	2	6	157395	157400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113140
3022	NC_012848	CCAG	2	8	157402	157409	25 %	0 %	25 %	50 %	241113140
3023	NC_012848	ATG	2	6	157425	157430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113140
3024	NC_012848	CAT	2	6	157445	157450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113140
3025	NC_012848	AGA	2	6	157467	157472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113140
3026	NC_012848	CGG	2	6	157534	157539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113140
3027	NC_012848	CGA	2	6	157579	157584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113140
3028	NC_012848	CGC	2	6	157655	157660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113140
3029	NC_012848	GAC	2	6	157670	157675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113140
3030	NC_012848	GCAC	2	8	157701	157708	25 %	0 %	25 %	50 %	241113140
3031	NC_012848	CCT	2	6	157711	157716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113140
3032	NC_012848	CGA	2	6	157762	157767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113140
3033	NC_012848	CGG	2	6	157795	157800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113140
3034	NC_012848	TTC	2	6	157805	157810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113140
3035	NC_012848	TCAG	2	8	157875	157882	25 %	25 %	25 %	25 %	241113140
3036	NC_012848	CGA	2	6	157921	157926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113140
3037	NC_012848	CGT	2	6	158367	158372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113141
3038	NC_012848	CAC	2	6	158397	158402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113141
3039	NC_012848	CAT	2	6	158411	158416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113141
3040	NC_012848	CGC	2	6	158448	158453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113141
3041	NC_012848	TGC	2	6	158481	158486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113141
3042	NC_012848	GTC	2	6	158554	158559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113141
3043	NC_012848	GA	3	6	158590	158595	50 %	0 %	50 %	0 %	241113141
3044	NC_012848	CTG	2	6	158628	158633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113141
3045	NC_012848	GAA	2	6	158817	158822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113141
3046	NC_012848	ATC	2	6	158842	158847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113141
3047	NC_012848	GAA	2	6	158926	158931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113142
3048	NC_012848	GAC	2	6	158935	158940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3049	NC_012848	GTC	2	6	159028	159033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3050	NC_012848	GGC	2	6	159049	159054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113142
3051	NC_012848	CGA	2	6	159055	159060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3052	NC_012848	CAG	2	6	159088	159093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3053	NC_012848	AGC	2	6	159102	159107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3054	NC_012848	GGA	2	6	159166	159171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113142
3055	NC_012848	GAA	2	6	159238	159243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113142
3056	NC_012848	ATG	2	6	159275	159280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113142
3057	NC_012848	GCA	2	6	159314	159319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113142
3058	NC_012848	GGC	2	6	159342	159347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113142
3059	NC_012848	CGGA	2	8	159388	159395	25 %	0 %	50 %	25 %	241113143
3060	NC_012848	ATG	2	6	159547	159552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113143
3061	NC_012848	CCA	2	6	159553	159558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113143
3062	NC_012848	TGG	2	6	159659	159664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113143
3063	NC_012848	GCG	2	6	159704	159709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113143
3064	NC_012848	TTG	2	6	159742	159747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113143
3065	NC_012848	CCGT	2	8	159796	159803	0 %	25 %	25 %	50 %	241113143
3066	NC_012848	CAG	2	6	159804	159809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113143
3067	NC_012848	GCG	2	6	159824	159829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113143
3068	NC_012848	CCGTC	2	10	159839	159848	0 %	20 %	20 %	60 %	241113143
3069	NC_012848	CCCG	2	8	159849	159856	0 %	0 %	25 %	75 %	241113143
3070	NC_012848	GC	3	6	159957	159962	0 %	0 %	50 %	50 %	241113143
3071	NC_012848	TA	3	6	160016	160021	50 %	50 %	0 %	0 %	241113143
3072	NC_012848	TGA	2	6	160039	160044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113143
3073	NC_012848	GC	3	6	160105	160110	0 %	0 %	50 %	50 %	241113143
3074	NC_012848	GTT	3	9	160143	160151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113143
3075	NC_012848	TTG	2	6	160159	160164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113143
3076	NC_012848	GGCC	2	8	160232	160239	0 %	0 %	50 %	50 %	241113143
3077	NC_012848	GTT	2	6	160240	160245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113143
3078	NC_012848	AGG	2	6	160298	160303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113143
3079	NC_012848	GGCC	2	8	160305	160312	0 %	0 %	50 %	50 %	241113143
3080	NC_012848	TCA	2	6	160364	160369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113143
3081	NC_012848	CGT	2	6	160371	160376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113143
3082	NC_012848	CGT	2	6	160505	160510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113143
3083	NC_012848	GCG	2	6	160531	160536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113143
3084	NC_012848	CGA	2	6	160616	160621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113143
3085	NC_012848	ACG	2	6	160645	160650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113143
3086	NC_012848	GCC	2	6	160662	160667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113143
3087	NC_012848	ACC	2	6	160741	160746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113143
3088	NC_012848	CAT	2	6	161141	161146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113145
3089	NC_012848	GCG	2	6	161165	161170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113145
3090	NC_012848	TCGA	2	8	161249	161256	25 %	25 %	25 %	25 %	241113145
3091	NC_012848	CAT	2	6	161263	161268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113145
3092	NC_012848	GC	3	6	161272	161277	0 %	0 %	50 %	50 %	241113145
3093	NC_012848	AGG	2	6	161322	161327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113145
3094	NC_012848	CCT	2	6	161331	161336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113145
3095	NC_012848	GCA	2	6	161361	161366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3096	NC_012848	TCG	2	6	161396	161401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3097	NC_012848	GAG	2	6	161413	161418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113145
3098	NC_012848	CGT	2	6	161506	161511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3099	NC_012848	GGT	2	6	161536	161541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113145
3100	NC_012848	GGC	2	6	161656	161661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113145
3101	NC_012848	CAT	2	6	161685	161690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113145
3102	NC_012848	GC	4	8	161702	161709	0 %	0 %	50 %	50 %	241113145
3103	NC_012848	TCG	2	6	161762	161767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3104	NC_012848	CTG	2	6	161815	161820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113145
3105	NC_012848	CGG	2	6	162002	162007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113146
3106	NC_012848	AT	3	6	162055	162060	50 %	50 %	0 %	0 %	241113146
3107	NC_012848	GGC	2	6	162105	162110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113146
3108	NC_012848	GGTGAT	2	12	162128	162139	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113146
3109	NC_012848	GCC	2	6	162150	162155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113146
3110	NC_012848	GCCC	2	8	162170	162177	0 %	0 %	25 %	75 %	241113146
3111	NC_012848	CAG	2	6	162191	162196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113146
3112	NC_012848	TCA	2	6	162214	162219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113146
3113	NC_012848	GCAT	2	8	162267	162274	25 %	25 %	25 %	25 %	241113147
3114	NC_012848	CAG	2	6	162308	162313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3115	NC_012848	CGT	2	6	162364	162369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3116	NC_012848	CGC	2	6	162419	162424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3117	NC_012848	CGT	2	6	162443	162448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113147
3118	NC_012848	CTT	2	6	162515	162520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113147
3119	NC_012848	CTT	2	6	162605	162610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113147
3120	NC_012848	CCG	2	6	162646	162651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3121	NC_012848	TCGG	2	8	162678	162685	0 %	25 %	50 %	25 %	241113147
3122	NC_012848	CGG	2	6	162694	162699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113147
3123	NC_012848	GCC	2	6	162723	162728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113147
3124	NC_012848	CTC	2	6	163006	163011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113148
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3128	NC_012848	GTC	2	6	163207	163212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113148
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3152	NC_012848	CTT	2	6	164776	164781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113150
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3161	NC_012848	GCGG	2	8	165035	165042	0 %	0 %	75 %	25 %	241113150
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3229	NC_012848	CAG	2	6	167935	167940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113153
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3237	NC_012848	CG	3	6	168250	168255	0 %	0 %	50 %	50 %	241113153
3238	NC_012848	GAA	2	6	168277	168282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113153
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3240	NC_012848	CAT	2	6	168316	168321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113153
3241	NC_012848	GCGA	2	8	168398	168405	25 %	0 %	50 %	25 %	241113153
3242	NC_012848	CAG	2	6	168433	168438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113153
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3244	NC_012848	GCC	2	6	168490	168495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113153
3245	NC_012848	GCA	2	6	168525	168530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113153
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3251	NC_012848	TGA	2	6	168657	168662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113153
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3253	NC_012848	CAG	2	6	168721	168726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113153
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3256	NC_012848	CGA	2	6	168911	168916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113154
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3264	NC_012848	CGAT	2	8	169135	169142	25 %	25 %	25 %	25 %	241113154
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3341	NC_012848	TGGCC	2	10	172006	172015	0 %	20 %	40 %	40 %	241113157
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3357	NC_012848	ATA	2	6	172614	172619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113157
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3361	NC_012848	CGC	2	6	172778	172783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113157
3362	NC_012848	GGC	2	6	172817	172822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113157
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3364	NC_012848	GCC	2	6	172923	172928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113157
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3445	NC_012848	CG	3	6	177275	177280	0 %	0 %	50 %	50 %	241113162
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3481	NC_012848	CG	3	6	179037	179042	0 %	0 %	50 %	50 %	241113163
3482	NC_012848	TCG	2	6	179072	179077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113163
3483	NC_012848	GC	3	6	179106	179111	0 %	0 %	50 %	50 %	241113163
3484	NC_012848	GAC	2	6	179128	179133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113163
3485	NC_012848	CGC	3	9	179163	179171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113163
3486	NC_012848	TGCA	2	8	179221	179228	25 %	25 %	25 %	25 %	241113163
3487	NC_012848	TGG	2	6	179261	179266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113163
3488	NC_012848	AGCG	2	8	179278	179285	25 %	0 %	50 %	25 %	241113163
3489	NC_012848	GAC	2	6	179323	179328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113163
3490	NC_012848	GCC	2	6	179360	179365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113163
3491	NC_012848	CAG	2	6	179561	179566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113164
3492	NC_012848	TCG	2	6	179577	179582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113164
3493	NC_012848	CG	3	6	179581	179586	0 %	0 %	50 %	50 %	241113164
3494	NC_012848	GCT	2	6	179605	179610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113164
3495	NC_012848	CG	3	6	179637	179642	0 %	0 %	50 %	50 %	241113164
3496	NC_012848	CGG	2	6	179685	179690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113164
3497	NC_012848	CAT	2	6	179750	179755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113164
3498	NC_012848	CGGT	2	8	179763	179770	0 %	25 %	50 %	25 %	241113164
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3500	NC_012848	CAGC	2	8	179833	179840	25 %	0 %	25 %	50 %	241113164

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