MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012848	GTC	2	6	132649	132654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2502	NC_012848	AGC	2	6	132707	132712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2503	NC_012848	CG	3	6	132759	132764	0 %	0 %	50 %	50 %	241113117
2504	NC_012848	GCA	2	6	132795	132800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2505	NC_012848	GCC	2	6	132832	132837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2506	NC_012848	GAC	2	6	132859	132864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2507	NC_012848	GCC	2	6	132874	132879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2508	NC_012848	CGA	2	6	132888	132893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2509	NC_012848	CAT	2	6	132907	132912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113117
2510	NC_012848	TCG	2	6	132914	132919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2511	NC_012848	CTT	2	6	132955	132960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113117
2512	NC_012848	TCT	2	6	132966	132971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113117
2513	NC_012848	CGC	2	6	133000	133005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2514	NC_012848	GCG	2	6	133020	133025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113117
2515	NC_012848	TCA	2	6	133038	133043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113117
2516	NC_012848	TGA	2	6	133059	133064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113117
2517	NC_012848	CGA	2	6	133092	133097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2518	NC_012848	CCG	2	6	133101	133106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2519	NC_012848	GAT	2	6	133150	133155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113117
2520	NC_012848	GGCC	2	8	133157	133164	0 %	0 %	50 %	50 %	241113117
2521	NC_012848	GGC	3	9	133179	133187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113117
2522	NC_012848	GC	3	6	133218	133223	0 %	0 %	50 %	50 %	241113117
2523	NC_012848	CGA	2	6	133251	133256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113117
2524	NC_012848	CGC	2	6	133290	133295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113117
2525	NC_012848	TCA	2	6	133308	133313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113117
2526	NC_012848	GCG	2	6	133377	133382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113117
2527	NC_012848	CGGA	2	8	133429	133436	25 %	0 %	50 %	25 %	241113117
2528	NC_012848	GCG	2	6	133451	133456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113117
2529	NC_012848	TCGC	2	8	133517	133524	0 %	25 %	25 %	50 %	241113117
2530	NC_012848	ATG	2	6	133764	133769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113118
2531	NC_012848	CCG	2	6	133793	133798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113118
2532	NC_012848	CT	3	6	133803	133808	0 %	50 %	0 %	50 %	241113118
2533	NC_012848	CGA	2	6	133865	133870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113118
2534	NC_012848	CGGC	3	12	133910	133921	0 %	0 %	50 %	50 %	241113118
2535	NC_012848	CAA	2	6	133949	133954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113118
2536	NC_012848	TCG	2	6	134061	134066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113118
2537	NC_012848	GC	4	8	134089	134096	0 %	0 %	50 %	50 %	241113118
2538	NC_012848	TCT	2	6	134098	134103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113118
2539	NC_012848	GC	3	6	134118	134123	0 %	0 %	50 %	50 %	241113118
2540	NC_012848	CAT	2	6	134171	134176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113118
2541	NC_012848	GGCCG	2	10	134199	134208	0 %	0 %	60 %	40 %	241113118
2542	NC_012848	ACG	2	6	134371	134376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113118
2543	NC_012848	TCG	2	6	134380	134385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113118
2544	NC_012848	GCT	2	6	134426	134431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113118
2545	NC_012848	AAT	2	6	134467	134472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113118
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2548	NC_012848	GCG	3	9	134767	134775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113119
2549	NC_012848	CCA	2	6	134818	134823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113119
2550	NC_012848	CGA	2	6	134824	134829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113119
2551	NC_012848	GATG	2	8	134936	134943	25 %	25 %	50 %	0 %	241113119
2552	NC_012848	CAA	2	6	134960	134965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113119
2553	NC_012848	CGG	2	6	135713	135718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113120
2554	NC_012848	TCC	2	6	135724	135729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113120
2555	NC_012848	GTTC	2	8	135803	135810	0 %	50 %	25 %	25 %	241113120
2556	NC_012848	GCG	2	6	135822	135827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113120
2557	NC_012848	CAGC	2	8	135903	135910	25 %	0 %	25 %	50 %	241113120
2558	NC_012848	CATG	2	8	135923	135930	25 %	25 %	25 %	25 %	241113120
2559	NC_012848	AT	3	6	135985	135990	50 %	50 %	0 %	0 %	241113120
2560	NC_012848	GGA	2	6	135992	135997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113120
2561	NC_012848	CCCG	2	8	136031	136038	0 %	0 %	25 %	75 %	241113120
2562	NC_012848	CAG	2	6	136056	136061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113120
2563	NC_012848	AAC	2	6	136116	136121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113120
2564	NC_012848	TCG	2	6	136184	136189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113120
2565	NC_012848	CCA	2	6	136190	136195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113120
2566	NC_012848	CGA	2	6	136214	136219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113120
2567	NC_012848	GTTC	2	8	136229	136236	0 %	50 %	25 %	25 %	241113120
2568	NC_012848	CGG	2	6	136292	136297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113120
2569	NC_012848	CAG	2	6	136299	136304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113120
2570	NC_012848	GCC	2	6	136568	136573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113121
2571	NC_012848	CTG	2	6	136602	136607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2572	NC_012848	TCCG	2	8	136668	136675	0 %	25 %	25 %	50 %	241113121
2573	NC_012848	CAT	2	6	136688	136693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113121
2574	NC_012848	TCG	2	6	136714	136719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2575	NC_012848	GC	4	8	136726	136733	0 %	0 %	50 %	50 %	241113121
2576	NC_012848	ACGC	2	8	136840	136847	25 %	0 %	25 %	50 %	241113121
2577	NC_012848	GCC	2	6	136879	136884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113121
2578	NC_012848	TGC	2	6	136885	136890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2579	NC_012848	CG	3	6	136988	136993	0 %	0 %	50 %	50 %	241113121
2580	NC_012848	CCT	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113121
2581	NC_012848	GCA	2	6	137108	137113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2582	NC_012848	TGA	2	6	137185	137190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113121
2583	NC_012848	GC	3	6	137194	137199	0 %	0 %	50 %	50 %	241113121
2584	NC_012848	ATCC	2	8	137234	137241	25 %	25 %	0 %	50 %	241113121
2585	NC_012848	TCGT	2	8	137256	137263	0 %	50 %	25 %	25 %	241113121
2586	NC_012848	TGCG	2	8	137351	137358	0 %	25 %	50 %	25 %	241113121
2587	NC_012848	TGA	2	6	137420	137425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113121
2588	NC_012848	ATCG	2	8	137460	137467	25 %	25 %	25 %	25 %	241113121
2589	NC_012848	GC	3	6	137503	137508	0 %	0 %	50 %	50 %	241113121
2590	NC_012848	CTG	2	6	137520	137525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2591	NC_012848	GGTCC	2	10	137535	137544	0 %	20 %	40 %	40 %	241113121
2592	NC_012848	CCCA	2	8	137571	137578	25 %	0 %	0 %	75 %	241113121
2593	NC_012848	CGT	2	6	137579	137584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2594	NC_012848	CAT	2	6	137595	137600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113121
2595	NC_012848	TGC	2	6	137621	137626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2596	NC_012848	GTC	2	6	137652	137657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2597	NC_012848	GGT	2	6	137667	137672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113121
2598	NC_012848	GCG	2	6	137696	137701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113121
2599	NC_012848	GAT	2	6	137730	137735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113121
2600	NC_012848	ATC	2	6	137752	137757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113121
2601	NC_012848	GC	3	6	137849	137854	0 %	0 %	50 %	50 %	241113121
2602	NC_012848	CGA	2	6	137858	137863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2603	NC_012848	TCG	2	6	137884	137889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113121
2604	NC_012848	GGAA	2	8	137894	137901	50 %	0 %	50 %	0 %	241113121
2605	NC_012848	ATG	2	6	138556	138561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113122
2606	NC_012848	GCCG	2	8	138597	138604	0 %	0 %	50 %	50 %	241113122
2607	NC_012848	TGC	2	6	138729	138734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113122
2608	NC_012848	GGC	2	6	138825	138830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113122
2609	NC_012848	GTG	2	6	138887	138892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113122
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2611	NC_012848	CGA	2	6	139052	139057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113122
2612	NC_012848	CGCGA	2	10	139093	139102	20 %	0 %	40 %	40 %	241113122
2613	NC_012848	CGC	2	6	139104	139109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113122
2614	NC_012848	GCC	2	6	139117	139122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113122
2615	NC_012848	GC	3	6	139140	139145	0 %	0 %	50 %	50 %	241113122
2616	NC_012848	AGA	2	6	139163	139168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113122
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2619	NC_012848	AGC	2	6	139332	139337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113123
2620	NC_012848	AGA	2	6	139424	139429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113123
2621	NC_012848	CAA	2	6	139433	139438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113123
2622	NC_012848	CAT	3	9	139535	139543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113123
2623	NC_012848	ACTT	2	8	139590	139597	25 %	50 %	0 %	25 %	241113123
2624	NC_012848	AAGAC	2	10	139678	139687	60 %	0 %	20 %	20 %	241113123
2625	NC_012848	CG	3	6	139819	139824	0 %	0 %	50 %	50 %	241113123
2626	NC_012848	ACGGT	2	10	139882	139891	20 %	20 %	40 %	20 %	241113123
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2630	NC_012848	CAT	2	6	139955	139960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113123
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2643	NC_012848	TCG	2	6	140705	140710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113124
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2654	NC_012848	TCG	2	6	141069	141074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113125
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2742	NC_012848	TCG	2	6	145293	145298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113129
2743	NC_012848	CGGC	2	8	145364	145371	0 %	0 %	50 %	50 %	241113129
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2852	NC_012848	CGC	2	6	150395	150400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113133
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2856	NC_012848	GCCGA	2	10	150547	150556	20 %	0 %	40 %	40 %	241113133
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2860	NC_012848	CGT	2	6	151105	151110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113134
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2862	NC_012848	ACG	2	6	151147	151152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113134
2863	NC_012848	GAC	2	6	151187	151192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113134
2864	NC_012848	TGT	2	6	151204	151209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113134
2865	NC_012848	GAC	2	6	151358	151363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113134
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2868	NC_012848	CGA	2	6	151432	151437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113134
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2966	NC_012848	CGA	2	6	155177	155182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
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2973	NC_012848	CGA	2	6	155363	155368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2974	NC_012848	AGGC	2	8	155373	155380	25 %	0 %	50 %	25 %	241113138
2975	NC_012848	CCT	2	6	155399	155404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113138
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2977	NC_012848	CAG	2	6	155436	155441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
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2981	NC_012848	AGT	2	6	155654	155659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113138
2982	NC_012848	TGA	2	6	155696	155701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113138
2983	NC_012848	TCG	2	6	155704	155709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2984	NC_012848	CAG	2	6	155715	155720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2985	NC_012848	CGG	2	6	155735	155740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113138
2986	NC_012848	GC	3	6	155743	155748	0 %	0 %	50 %	50 %	241113138
2987	NC_012848	GCAG	2	8	155770	155777	25 %	0 %	50 %	25 %	241113138
2988	NC_012848	GAC	2	6	155778	155783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2989	NC_012848	CTG	2	6	155786	155791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2990	NC_012848	CGA	2	6	155807	155812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
2991	NC_012848	GTT	2	6	155973	155978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113138
2992	NC_012848	CCG	2	6	155986	155991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113138
2993	NC_012848	GCC	2	6	156000	156005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113138
2994	NC_012848	GAT	2	6	156039	156044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113138
2995	NC_012848	GGCGAT	2	12	156081	156092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113138
2996	NC_012848	CCGAGC	2	12	156116	156127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113138
2997	NC_012848	GAA	2	6	156132	156137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113138
2998	NC_012848	TCT	2	6	156278	156283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113138
2999	NC_012848	GCA	2	6	156303	156308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113138
3000	NC_012848	GCCGT	2	10	156319	156328	0 %	20 %	40 %	40 %	241113138

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