MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012848	AAT	2	6	80754	80759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113069
1502	NC_012848	ACG	2	6	80794	80799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113069
1503	NC_012848	TCG	2	6	80994	80999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113069
1504	NC_012848	GCA	2	6	81109	81114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1505	NC_012848	T	6	6	81170	81175	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
1506	NC_012848	CAC	2	6	81248	81253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113070
1507	NC_012848	CGA	2	6	81496	81501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1508	NC_012848	T	6	6	81513	81518	0 %	100 %	0 %	0 %	241113070
1509	NC_012848	CAGAA	2	10	81621	81630	60 %	0 %	20 %	20 %	241113070
1510	NC_012848	GCCT	3	12	81720	81731	0 %	25 %	25 %	50 %	241113070
1511	NC_012848	GC	3	6	81770	81775	0 %	0 %	50 %	50 %	241113070
1512	NC_012848	GGA	2	6	81783	81788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113070
1513	NC_012848	TGG	2	6	81869	81874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113070
1514	NC_012848	ATCG	2	8	81913	81920	25 %	25 %	25 %	25 %	241113070
1515	NC_012848	GTT	3	9	81937	81945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113070
1516	NC_012848	CCG	2	6	81951	81956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113070
1517	NC_012848	GC	3	6	82020	82025	0 %	0 %	50 %	50 %	241113070
1518	NC_012848	TTTC	2	8	82045	82052	0 %	75 %	0 %	25 %	241113070
1519	NC_012848	GGA	2	6	82057	82062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113070
1520	NC_012848	TTG	2	6	82086	82091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113070
1521	NC_012848	GAC	2	6	82154	82159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1522	NC_012848	ATT	2	6	82209	82214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113070
1523	NC_012848	GA	3	6	82311	82316	50 %	0 %	50 %	0 %	241113070
1524	NC_012848	TGAG	2	8	82341	82348	25 %	25 %	50 %	0 %	241113070
1525	NC_012848	TGC	2	6	82368	82373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1526	NC_012848	CGA	2	6	82374	82379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1527	NC_012848	CGA	2	6	82387	82392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1528	NC_012848	TCG	2	6	82413	82418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1529	NC_012848	GCA	2	6	82488	82493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1530	NC_012848	GCG	2	6	82512	82517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113070
1531	NC_012848	TC	3	6	82552	82557	0 %	50 %	0 %	50 %	241113070
1532	NC_012848	GAC	2	6	82574	82579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1533	NC_012848	TCG	2	6	82647	82652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1534	NC_012848	GCT	2	6	82773	82778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113070
1535	NC_012848	A	6	6	82951	82956	100 %	0 %	0 %	0 %	241113071
1536	NC_012848	TCG	2	6	82996	83001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113071
1537	NC_012848	ACG	2	6	83011	83016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113071
1538	NC_012848	CCTG	2	8	83080	83087	0 %	25 %	25 %	50 %	241113071
1539	NC_012848	ATC	2	6	83108	83113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113071
1540	NC_012848	TGGT	2	8	83328	83335	0 %	50 %	50 %	0 %	241113072
1541	NC_012848	CCG	2	6	83389	83394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1542	NC_012848	CCG	2	6	83467	83472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1543	NC_012848	GCCACC	2	12	83528	83539	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	241113072
1544	NC_012848	CGC	2	6	83719	83724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1545	NC_012848	ATC	2	6	83732	83737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113072
1546	NC_012848	CGC	2	6	83749	83754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1547	NC_012848	GGA	2	6	83767	83772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113072
1548	NC_012848	CGC	2	6	83788	83793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1549	NC_012848	CGA	2	6	83799	83804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1550	NC_012848	CG	3	6	83806	83811	0 %	0 %	50 %	50 %	241113072
1551	NC_012848	GAT	2	6	83893	83898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113072
1552	NC_012848	CAT	2	6	83899	83904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113072
1553	NC_012848	CGA	3	9	83905	83913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1554	NC_012848	CGGG	2	8	83966	83973	0 %	0 %	75 %	25 %	241113072
1555	NC_012848	CGT	2	6	84022	84027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1556	NC_012848	CTG	2	6	84077	84082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1557	NC_012848	CGC	2	6	84102	84107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113072
1558	NC_012848	ATC	2	6	84155	84160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113072
1559	NC_012848	CGT	2	6	84187	84192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1560	NC_012848	CGA	2	6	84270	84275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1561	NC_012848	GCG	4	12	84324	84335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113072
1562	NC_012848	CTC	2	6	84353	84358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113072
1563	NC_012848	TGC	3	9	84375	84383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113072
1564	NC_012848	GCCT	2	8	84385	84392	0 %	25 %	25 %	50 %	241113072
1565	NC_012848	GCC	2	6	84482	84487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113073
1566	NC_012848	GCCC	2	8	84514	84521	0 %	0 %	25 %	75 %	241113073
1567	NC_012848	ATC	2	6	84644	84649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113073
1568	NC_012848	TCGA	2	8	84650	84657	25 %	25 %	25 %	25 %	241113073
1569	NC_012848	GCC	2	6	84704	84709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113073
1570	NC_012848	CG	3	6	84836	84841	0 %	0 %	50 %	50 %	241113073
1571	NC_012848	ATG	2	6	84873	84878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113073
1572	NC_012848	CGA	2	6	84885	84890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113073
1573	NC_012848	GC	3	6	84912	84917	0 %	0 %	50 %	50 %	241113073
1574	NC_012848	CTT	2	6	84931	84936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113073
1575	NC_012848	GCC	2	6	84942	84947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113073
1576	NC_012848	CCGA	2	8	84985	84992	25 %	0 %	25 %	50 %	241113073
1577	NC_012848	CCAG	2	8	84993	85000	25 %	0 %	25 %	50 %	241113073
1578	NC_012848	GGGC	2	8	85077	85084	0 %	0 %	75 %	25 %	241113073
1579	NC_012848	AGA	2	6	85188	85193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113073
1580	NC_012848	CGT	2	6	85222	85227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113073
1581	NC_012848	GTG	2	6	85231	85236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113073
1582	NC_012848	GAC	2	6	85357	85362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113073
1583	NC_012848	CGC	2	6	85368	85373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113073
1584	NC_012848	ACG	2	6	85376	85381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113073
1585	NC_012848	GGC	2	6	85408	85413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113073
1586	NC_012848	GCC	2	6	85429	85434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113073
1587	NC_012848	TCC	2	6	85463	85468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113073
1588	NC_012848	CAT	2	6	85824	85829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113074
1589	NC_012848	TCG	2	6	85949	85954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1590	NC_012848	ACGA	2	8	85963	85970	50 %	0 %	25 %	25 %	241113074
1591	NC_012848	CAA	2	6	85977	85982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113074
1592	NC_012848	TCG	2	6	86021	86026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1593	NC_012848	TCA	2	6	86030	86035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113074
1594	NC_012848	AGG	2	6	86219	86224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113074
1595	NC_012848	TGG	3	9	86290	86298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113074
1596	NC_012848	CAA	2	6	86325	86330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113074
1597	NC_012848	CGC	2	6	86348	86353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113074
1598	NC_012848	GAC	2	6	86362	86367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1599	NC_012848	CCA	2	6	86390	86395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113074
1600	NC_012848	AGG	2	6	86396	86401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113074
1601	NC_012848	GGCG	2	8	86425	86432	0 %	0 %	75 %	25 %	241113074
1602	NC_012848	ACG	2	6	86443	86448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1603	NC_012848	ATT	2	6	86465	86470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113074
1604	NC_012848	GGC	2	6	86479	86484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113074
1605	NC_012848	CGA	2	6	86493	86498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1606	NC_012848	ATT	2	6	86558	86563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113074
1607	NC_012848	TCG	2	6	86573	86578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1608	NC_012848	TGC	2	6	86634	86639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1609	NC_012848	GCC	2	6	86641	86646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113074
1610	NC_012848	GCG	2	6	86647	86652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113074
1611	NC_012848	ACG	2	6	86653	86658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1612	NC_012848	CT	3	6	86660	86665	0 %	50 %	0 %	50 %	241113074
1613	NC_012848	CGG	2	6	86670	86675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113074
1614	NC_012848	CGA	2	6	86709	86714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1615	NC_012848	CAA	2	6	86724	86729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113074
1616	NC_012848	ACCGGC	2	12	86776	86787	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113074
1617	NC_012848	CCT	2	6	86801	86806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113074
1618	NC_012848	GCA	3	9	86883	86891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113074
1619	NC_012848	TCT	2	6	86930	86935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113074
1620	NC_012848	CAA	2	6	86946	86951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113074
1621	NC_012848	CCAGAT	2	12	87021	87032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241113074
1622	NC_012848	ATG	2	6	87034	87039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113074
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1624	NC_012848	CCCTG	2	10	87270	87279	0 %	20 %	20 %	60 %	241113075
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1873	NC_012848	ATGG	2	8	99265	99272	25 %	25 %	50 %	0 %	241113086
1874	NC_012848	CCGTAT	2	12	99276	99287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113086
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1989	NC_012848	CG	3	6	104353	104358	0 %	0 %	50 %	50 %	241113092
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1992	NC_012848	TCG	2	6	104457	104462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113092
1993	NC_012848	CT	3	6	104518	104523	0 %	50 %	0 %	50 %	241113092
1994	NC_012848	CCGG	2	8	104542	104549	0 %	0 %	50 %	50 %	241113092
1995	NC_012848	CAG	2	6	104574	104579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113092
1996	NC_012848	TGCC	2	8	104584	104591	0 %	25 %	25 %	50 %	241113092
1997	NC_012848	ACG	2	6	104598	104603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113092
1998	NC_012848	GCCT	2	8	104606	104613	0 %	25 %	25 %	50 %	241113092
1999	NC_012848	GCT	2	6	104684	104689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113092
2000	NC_012848	CAA	2	6	104863	104868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113092

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