MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012848	ACG	2	6	813808	813813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113727
16002	NC_012848	CAC	2	6	813938	813943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113727
16003	NC_012848	CCT	2	6	813944	813949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113727
16004	NC_012848	TCG	2	6	813964	813969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113727
16005	NC_012848	CCG	2	6	813994	813999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113727
16006	NC_012848	ACG	2	6	814027	814032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113727
16007	NC_012848	CCGG	2	8	814047	814054	0 %	0 %	50 %	50 %	241113727
16008	NC_012848	CAT	2	6	814157	814162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113727
16009	NC_012848	GC	3	6	814166	814171	0 %	0 %	50 %	50 %	241113727
16010	NC_012848	CG	3	6	814185	814190	0 %	0 %	50 %	50 %	241113727
16011	NC_012848	GCT	2	6	814289	814294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113727
16012	NC_012848	GGAC	2	8	814367	814374	25 %	0 %	50 %	25 %	241113727
16013	NC_012848	CCA	2	6	814391	814396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113727
16014	NC_012848	GCC	2	6	814424	814429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113727
16015	NC_012848	CGC	2	6	814499	814504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113727
16016	NC_012848	GAA	2	6	814664	814669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113727
16017	NC_012848	CTT	2	6	814671	814676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113727
16018	NC_012848	ACA	2	6	814726	814731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113727
16019	NC_012848	TAC	2	6	814769	814774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113727
16020	NC_012848	CGA	2	6	814847	814852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113727
16021	NC_012848	GAG	2	6	814869	814874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113727
16022	NC_012848	GCA	2	6	815113	815118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113728
16023	NC_012848	TGA	2	6	815120	815125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113728
16024	NC_012848	CTT	2	6	815133	815138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113728
16025	NC_012848	GCC	2	6	815197	815202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113728
16026	NC_012848	CGTC	2	8	815217	815224	0 %	25 %	25 %	50 %	241113728
16027	NC_012848	TCCC	2	8	815239	815246	0 %	25 %	0 %	75 %	241113728
16028	NC_012848	CGC	2	6	815394	815399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113728
16029	NC_012848	TCA	2	6	815402	815407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113728
16030	NC_012848	CGG	2	6	815433	815438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113728
16031	NC_012848	GCAG	2	8	815469	815476	25 %	0 %	50 %	25 %	241113728
16032	NC_012848	CGG	2	6	815562	815567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113728
16033	NC_012848	GAT	2	6	815646	815651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113728
16034	NC_012848	GC	4	8	815696	815703	0 %	0 %	50 %	50 %	241113728
16035	NC_012848	GGC	2	6	815704	815709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113728
16036	NC_012848	TGCGC	2	10	815727	815736	0 %	20 %	40 %	40 %	241113728
16037	NC_012848	CCT	2	6	815742	815747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113728
16038	NC_012848	GTGACC	2	12	815755	815766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241113728
16039	NC_012848	CGC	2	6	815775	815780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113728
16040	NC_012848	CGG	3	9	815790	815798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113728
16041	NC_012848	CGT	2	6	815802	815807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113728
16042	NC_012848	GTT	2	6	815812	815817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113728
16043	NC_012848	GCT	2	6	815841	815846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113728
16044	NC_012848	CGT	2	6	815907	815912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113728
16045	NC_012848	TCA	2	6	815921	815926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113728
16046	NC_012848	ATCG	2	8	815952	815959	25 %	25 %	25 %	25 %	241113728
16047	NC_012848	CCG	2	6	815992	815997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113729
16048	NC_012848	TCC	2	6	816001	816006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113729
16049	NC_012848	GCC	2	6	816025	816030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113729
16050	NC_012848	TGCG	2	8	816046	816053	0 %	25 %	50 %	25 %	241113729
16051	NC_012848	CGC	2	6	816077	816082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113729
16052	NC_012848	GCT	2	6	816092	816097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16053	NC_012848	TCG	2	6	816100	816105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16054	NC_012848	TCG	2	6	816129	816134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16055	NC_012848	CTG	2	6	816135	816140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16056	NC_012848	GC	3	6	816165	816170	0 %	0 %	50 %	50 %	241113729
16057	NC_012848	GCC	2	6	816176	816181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113729
16058	NC_012848	CTC	2	6	816240	816245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113729
16059	NC_012848	GGC	2	6	816260	816265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113729
16060	NC_012848	CGA	3	9	816268	816276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16061	NC_012848	CGG	2	6	816314	816319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113729
16062	NC_012848	GCT	2	6	816323	816328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16063	NC_012848	CAT	2	6	816356	816361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113729
16064	NC_012848	CAT	2	6	816389	816394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113729
16065	NC_012848	GCT	2	6	816410	816415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16066	NC_012848	TCA	2	6	816463	816468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113729
16067	NC_012848	GCG	2	6	816555	816560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113729
16068	NC_012848	CG	3	6	816559	816564	0 %	0 %	50 %	50 %	241113729
16069	NC_012848	CGG	3	9	816569	816577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113729
16070	NC_012848	GCC	2	6	816707	816712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113729
16071	NC_012848	TGG	2	6	816733	816738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113729
16072	NC_012848	TGG	2	6	816768	816773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113729
16073	NC_012848	T	6	6	816780	816785	0 %	100 %	0 %	0 %	241113729
16074	NC_012848	GCA	2	6	816863	816868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113729
16075	NC_012848	GCCG	2	8	816944	816951	0 %	0 %	50 %	50 %	241113730
16076	NC_012848	GCT	2	6	817006	817011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113730
16077	NC_012848	CAT	2	6	817051	817056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113730
16078	NC_012848	CCG	2	6	817073	817078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113730
16079	NC_012848	ATCA	2	8	817085	817092	50 %	25 %	0 %	25 %	241113730
16080	NC_012848	GATC	2	8	817095	817102	25 %	25 %	25 %	25 %	241113730
16081	NC_012848	GCG	2	6	817144	817149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113730
16082	NC_012848	GCG	2	6	817158	817163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113730
16083	NC_012848	GGT	2	6	817271	817276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113730
16084	NC_012848	GGC	2	6	817364	817369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113730
16085	NC_012848	CAT	2	6	817381	817386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113730
16086	NC_012848	TCA	2	6	817419	817424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113730
16087	NC_012848	CGA	2	6	817437	817442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113730
16088	NC_012848	GGT	2	6	817471	817476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113730
16089	NC_012848	TCT	2	6	817480	817485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113730
16090	NC_012848	CGT	2	6	817543	817548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113730
16091	NC_012848	GCCG	2	8	817583	817590	0 %	0 %	50 %	50 %	241113730
16092	NC_012848	CGT	2	6	817591	817596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113730
16093	NC_012848	TTGC	2	8	817655	817662	0 %	50 %	25 %	25 %	241113730
16094	NC_012848	GTC	2	6	817796	817801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113730
16095	NC_012848	CT	3	6	817804	817809	0 %	50 %	0 %	50 %	241113730
16096	NC_012848	GGGCC	2	10	817820	817829	0 %	0 %	60 %	40 %	241113730
16097	NC_012848	GCC	2	6	817835	817840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113730
16098	NC_012848	CTC	2	6	817914	817919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113731
16099	NC_012848	GTGC	2	8	817927	817934	0 %	25 %	50 %	25 %	241113731
16100	NC_012848	CGA	2	6	817938	817943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113731
16101	NC_012848	GA	3	6	817967	817972	50 %	0 %	50 %	0 %	241113731
16102	NC_012848	TCG	2	6	817982	817987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113731
16103	NC_012848	CAA	2	6	818045	818050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113731
16104	NC_012848	CGG	2	6	818098	818103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113731
16105	NC_012848	GCT	2	6	818256	818261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113731
16106	NC_012848	GC	3	6	818277	818282	0 %	0 %	50 %	50 %	241113731
16107	NC_012848	GGC	2	6	818317	818322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113731
16108	NC_012848	CTT	2	6	818371	818376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113731
16109	NC_012848	CGA	2	6	818382	818387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113731
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16111	NC_012848	CGT	2	6	818496	818501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113731
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16114	NC_012848	CGT	2	6	818641	818646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113731
16115	NC_012848	GCGCA	2	10	818647	818656	20 %	0 %	40 %	40 %	241113731
16116	NC_012848	CGG	2	6	818783	818788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113731
16117	NC_012848	TCT	2	6	818796	818801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113731
16118	NC_012848	TCA	2	6	818811	818816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113731
16119	NC_012848	GTTT	2	8	818976	818983	0 %	75 %	25 %	0 %	241113732
16120	NC_012848	TGC	2	6	819006	819011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
16121	NC_012848	TCG	2	6	819021	819026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16123	NC_012848	GCCT	2	8	819116	819123	0 %	25 %	25 %	50 %	241113732
16124	NC_012848	CAT	2	6	819130	819135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113732
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16127	NC_012848	CAT	2	6	819316	819321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113732
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16138	NC_012848	CTTC	2	8	819886	819893	0 %	50 %	0 %	50 %	241113732
16139	NC_012848	TCG	2	6	819897	819902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16142	NC_012848	TGA	2	6	820090	820095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113732
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16149	NC_012848	TCG	2	6	820312	820317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16151	NC_012848	GCA	2	6	820336	820341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16153	NC_012848	CGT	2	6	820465	820470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16155	NC_012848	CGT	2	6	820540	820545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113732
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16220	NC_012848	CGG	2	6	824126	824131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113736
16221	NC_012848	CGAT	2	8	824134	824141	25 %	25 %	25 %	25 %	241113736
16222	NC_012848	ATG	2	6	824157	824162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113736
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16225	NC_012848	AGGCC	2	10	824281	824290	20 %	0 %	40 %	40 %	241113736
16226	NC_012848	CGC	2	6	824297	824302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113736
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16228	NC_012848	GCG	2	6	824425	824430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113736
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16230	NC_012848	GAA	2	6	824591	824596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113736
16231	NC_012848	CGA	2	6	824605	824610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113736
16232	NC_012848	CGA	2	6	824638	824643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113736
16233	NC_012848	CCAC	2	8	824677	824684	25 %	0 %	0 %	75 %	241113736
16234	NC_012848	TGGGCA	2	12	824715	824726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241113736
16235	NC_012848	CCA	2	6	824798	824803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113737
16236	NC_012848	GCT	2	6	824817	824822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113737
16237	NC_012848	TGT	2	6	824829	824834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113737
16238	NC_012848	CTT	2	6	824848	824853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113737
16239	NC_012848	ATG	2	6	824855	824860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113737
16240	NC_012848	TCGAG	2	10	824895	824904	20 %	20 %	40 %	20 %	241113737
16241	NC_012848	ACG	2	6	824936	824941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113737
16242	NC_012848	TCG	2	6	824957	824962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113737
16243	NC_012848	TTC	2	6	824969	824974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113737
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16254	NC_012848	CGT	2	6	825570	825575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113737
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16275	NC_012848	CGACGC	2	12	826326	826337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113738
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16282	NC_012848	CAT	2	6	826575	826580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113738
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16291	NC_012848	GCCGG	2	10	827133	827142	0 %	0 %	60 %	40 %	241113739
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16294	NC_012848	CGTC	2	8	827188	827195	0 %	25 %	25 %	50 %	241113739
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16304	NC_012848	TCG	2	6	827746	827751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113739
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16309	NC_012848	CGCA	2	8	827999	828006	25 %	0 %	25 %	50 %	241113739
16310	NC_012848	GCA	2	6	828025	828030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113739
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16314	NC_012848	GTC	2	6	828315	828320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113740
16315	NC_012848	GCT	2	6	828356	828361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113740
16316	NC_012848	CGGT	2	8	828415	828422	0 %	25 %	50 %	25 %	241113740
16317	NC_012848	TGC	2	6	828496	828501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113740
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16320	NC_012848	GGC	2	6	828606	828611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113740
16321	NC_012848	CGTA	2	8	828640	828647	25 %	25 %	25 %	25 %	241113740
16322	NC_012848	GC	3	6	828711	828716	0 %	0 %	50 %	50 %	241113740
16323	NC_012848	GTC	2	6	828885	828890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113740
16324	NC_012848	CGA	2	6	828893	828898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113740

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