MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012848	CCT	2	6	790172	790177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113708
15502	NC_012848	TTG	2	6	790204	790209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113708
15503	NC_012848	CCG	2	6	790250	790255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113708
15504	NC_012848	CTG	2	6	790272	790277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113708
15505	NC_012848	AAC	2	6	790306	790311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113708
15506	NC_012848	CGA	2	6	790334	790339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113708
15507	NC_012848	AGA	2	6	790340	790345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113708
15508	NC_012848	CATC	2	8	790349	790356	25 %	25 %	0 %	50 %	241113708
15509	NC_012848	TGA	2	6	790364	790369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113708
15510	NC_012848	TCTG	2	8	790385	790392	0 %	50 %	25 %	25 %	241113708
15511	NC_012848	CCG	2	6	790420	790425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113708
15512	NC_012848	TCG	2	6	790459	790464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113708
15513	NC_012848	GAA	2	6	790494	790499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113708
15514	NC_012848	GCG	2	6	790516	790521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113708
15515	NC_012848	ACC	3	9	790525	790533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113708
15516	NC_012848	AAG	2	6	790886	790891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113709
15517	NC_012848	TCA	3	9	790918	790926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113709
15518	NC_012848	GC	3	6	790953	790958	0 %	0 %	50 %	50 %	241113709
15519	NC_012848	TGG	2	6	790972	790977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113709
15520	NC_012848	CGC	2	6	791003	791008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113709
15521	NC_012848	TCT	2	6	791029	791034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113709
15522	NC_012848	GGCGA	2	10	791039	791048	20 %	0 %	60 %	20 %	241113709
15523	NC_012848	GTG	2	6	791078	791083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113709
15524	NC_012848	GTC	2	6	791213	791218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113709
15525	NC_012848	ATC	2	6	791313	791318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113709
15526	NC_012848	GGA	2	6	791341	791346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113709
15527	NC_012848	CCCG	2	8	791603	791610	0 %	0 %	25 %	75 %	241113709
15528	NC_012848	AAC	2	6	791642	791647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113709
15529	NC_012848	TCA	2	6	791650	791655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113709
15530	NC_012848	GGC	2	6	791656	791661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113709
15531	NC_012848	TCT	2	6	791727	791732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113709
15532	NC_012848	ACAT	2	8	791754	791761	50 %	25 %	0 %	25 %	241113709
15533	NC_012848	GTCTT	2	10	791904	791913	0 %	60 %	20 %	20 %	241113710
15534	NC_012848	TGC	2	6	791931	791936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15535	NC_012848	TCGA	2	8	791960	791967	25 %	25 %	25 %	25 %	241113710
15536	NC_012848	ATAG	2	8	791980	791987	50 %	25 %	25 %	0 %	241113710
15537	NC_012848	AGC	2	6	792023	792028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15538	NC_012848	CGA	2	6	792055	792060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15539	NC_012848	TGA	2	6	792160	792165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113710
15540	NC_012848	CAG	2	6	792182	792187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15541	NC_012848	GTC	2	6	792218	792223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15542	NC_012848	CGA	2	6	792271	792276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15543	NC_012848	GAT	2	6	792320	792325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113710
15544	NC_012848	TCAGC	2	10	792493	792502	20 %	20 %	20 %	40 %	241113710
15545	NC_012848	TCG	2	6	792520	792525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15546	NC_012848	CG	3	6	792604	792609	0 %	0 %	50 %	50 %	241113710
15547	NC_012848	CGATC	2	10	792643	792652	20 %	20 %	20 %	40 %	241113710
15548	NC_012848	GTTT	2	8	792803	792810	0 %	75 %	25 %	0 %	241113710
15549	NC_012848	CGC	2	6	792826	792831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113710
15550	NC_012848	TCG	2	6	792835	792840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15551	NC_012848	CGG	2	6	792841	792846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113710
15552	NC_012848	GAC	2	6	792851	792856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15553	NC_012848	GTCG	2	8	792899	792906	0 %	25 %	50 %	25 %	241113710
15554	NC_012848	CTG	2	6	792991	792996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15555	NC_012848	CAA	2	6	793087	793092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113710
15556	NC_012848	GC	3	6	793107	793112	0 %	0 %	50 %	50 %	241113710
15557	NC_012848	CGAT	2	8	793224	793231	25 %	25 %	25 %	25 %	241113710
15558	NC_012848	CGA	2	6	793261	793266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15559	NC_012848	CGA	2	6	793276	793281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15560	NC_012848	CGG	2	6	793293	793298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113710
15561	NC_012848	TAG	2	6	793305	793310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113710
15562	NC_012848	GCC	2	6	793334	793339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113710
15563	NC_012848	GCA	2	6	793458	793463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15564	NC_012848	AGT	2	6	793516	793521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113710
15565	NC_012848	GGC	2	6	793524	793529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113710
15566	NC_012848	GT	3	6	793546	793551	0 %	50 %	50 %	0 %	241113710
15567	NC_012848	GAT	2	6	793586	793591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113710
15568	NC_012848	CGG	2	6	793600	793605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113710
15569	NC_012848	TGC	2	6	793637	793642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113710
15570	NC_012848	GAT	2	6	794059	794064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113711
15571	NC_012848	TCGC	2	8	794102	794109	0 %	25 %	25 %	50 %	241113711
15572	NC_012848	ATC	2	6	794111	794116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113711
15573	NC_012848	ACC	2	6	794138	794143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113711
15574	NC_012848	GCGAAC	2	12	794231	794242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15575	NC_012848	TGA	2	6	794281	794286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113711
15576	NC_012848	TCC	2	6	794359	794364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113711
15577	NC_012848	CCGG	2	8	794428	794435	0 %	0 %	50 %	50 %	241113711
15578	NC_012848	ACT	2	6	794454	794459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113711
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15580	NC_012848	ATC	2	6	794504	794509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113711
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15582	NC_012848	GAT	2	6	794795	794800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113711
15583	NC_012848	GGA	2	6	794893	794898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113711
15584	NC_012848	TTG	2	6	794915	794920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113711
15585	NC_012848	TCG	2	6	794934	794939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15586	NC_012848	AGC	2	6	795000	795005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15587	NC_012848	GAA	2	6	795061	795066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113711
15588	NC_012848	CTG	2	6	795089	795094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15589	NC_012848	CAT	2	6	795222	795227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113711
15590	NC_012848	TCG	2	6	795240	795245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15591	NC_012848	CGA	2	6	795283	795288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113711
15592	NC_012848	TGC	2	6	795402	795407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113711
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15594	NC_012848	GGATT	2	10	795453	795462	20 %	40 %	40 %	0 %	241113711
15595	NC_012848	TCAA	2	8	795516	795523	50 %	25 %	0 %	25 %	241113711
15596	NC_012848	GGCGA	2	10	795530	795539	20 %	0 %	60 %	20 %	241113711
15597	NC_012848	ACG	2	6	795927	795932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113712
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15599	NC_012848	CTG	2	6	796020	796025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113712
15600	NC_012848	CCCA	2	8	796067	796074	25 %	0 %	0 %	75 %	241113712
15601	NC_012848	CAC	2	6	796276	796281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113713
15602	NC_012848	GCC	2	6	796319	796324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113713
15603	NC_012848	CG	3	6	796326	796331	0 %	0 %	50 %	50 %	241113713
15604	NC_012848	GCAG	2	8	796395	796402	25 %	0 %	50 %	25 %	241113713
15605	NC_012848	TCC	2	6	796453	796458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113713
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15607	NC_012848	CG	3	6	796536	796541	0 %	0 %	50 %	50 %	241113713
15608	NC_012848	GCC	2	6	796563	796568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113713
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15612	NC_012848	CTG	2	6	796691	796696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113713
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15616	NC_012848	TGGC	2	8	796831	796838	0 %	25 %	50 %	25 %	241113713
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15618	NC_012848	GGA	2	6	796849	796854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113713
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15742	NC_012848	CCG	2	6	802025	802030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113718
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15967	NC_012848	GAT	2	6	811912	811917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113725
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15976	NC_012848	ATC	2	6	812288	812293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113725
15977	NC_012848	CGC	2	6	812322	812327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113725
15978	NC_012848	TTC	2	6	812339	812344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113725
15979	NC_012848	GGC	2	6	812546	812551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113726
15980	NC_012848	CGG	2	6	812848	812853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113726
15981	NC_012848	GCGA	2	8	812869	812876	25 %	0 %	50 %	25 %	241113726
15982	NC_012848	TGA	2	6	812887	812892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113726
15983	NC_012848	AAT	2	6	812899	812904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241113726
15984	NC_012848	TCA	2	6	812932	812937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113726
15985	NC_012848	GGC	2	6	812954	812959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113726
15986	NC_012848	CAGCCG	2	12	812986	812997	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113726
15987	NC_012848	GCC	2	6	813012	813017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113726
15988	NC_012848	GCG	2	6	813053	813058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113726
15989	NC_012848	CGA	2	6	813067	813072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113726
15990	NC_012848	CCA	2	6	813099	813104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113726
15991	NC_012848	CGA	2	6	813253	813258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113726
15992	NC_012848	GAA	2	6	813503	813508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113727
15993	NC_012848	CTG	2	6	813549	813554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113727
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15997	NC_012848	GTC	2	6	813726	813731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113727
15998	NC_012848	GCC	2	6	813741	813746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113727
15999	NC_012848	GGC	2	6	813751	813756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113727
16000	NC_012848	CGA	2	6	813791	813796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113727

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