MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012848	CGG	2	6	588629	588634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
11502	NC_012848	CGG	2	6	588659	588664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
11503	NC_012848	TCGA	2	8	588666	588673	25 %	25 %	25 %	25 %	241113516
11504	NC_012848	CG	3	6	588691	588696	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11505	NC_012848	GTC	2	6	588755	588760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11506	NC_012848	TCG	2	6	588793	588798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11507	NC_012848	GC	4	8	588837	588844	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11508	NC_012848	GCT	2	6	588857	588862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11509	NC_012848	CGG	2	6	588923	588928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
11510	NC_012848	GC	3	6	588938	588943	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11511	NC_012848	GAT	2	6	588944	588949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113516
11512	NC_012848	GCT	2	6	588977	588982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11513	NC_012848	CGA	2	6	588989	588994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11514	NC_012848	GAC	2	6	589016	589021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11515	NC_012848	TCA	2	6	589084	589089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
11516	NC_012848	CGT	2	6	589103	589108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11517	NC_012848	GAT	2	6	589122	589127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113516
11518	NC_012848	GAC	2	6	589197	589202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11519	NC_012848	GC	3	6	589263	589268	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11520	NC_012848	CCG	2	6	589269	589274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113516
11521	NC_012848	ACG	2	6	589281	589286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11522	NC_012848	TCG	2	6	589390	589395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11523	NC_012848	GAC	2	6	589415	589420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11524	NC_012848	GATC	2	8	589445	589452	25 %	25 %	25 %	25 %	241113516
11525	NC_012848	CAT	2	6	589493	589498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
11526	NC_012848	CGG	2	6	589539	589544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
11527	NC_012848	CT	3	6	589577	589582	0 %	50 %	0 %	50 %	241113516
11528	NC_012848	ATC	2	6	589608	589613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
11529	NC_012848	GCT	2	6	589622	589627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11530	NC_012848	GGA	2	6	589658	589663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113516
11531	NC_012848	GC	3	6	589707	589712	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11532	NC_012848	CGG	2	6	589736	589741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113516
11533	NC_012848	CCAGCG	2	12	589742	589753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241113516
11534	NC_012848	CG	3	6	589786	589791	0 %	0 %	50 %	50 %	241113516
11535	NC_012848	TCA	2	6	589897	589902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113516
11536	NC_012848	TCG	2	6	589966	589971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113516
11537	NC_012848	GAA	2	6	590108	590113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113516
11538	NC_012848	CATG	2	8	590158	590165	25 %	25 %	25 %	25 %	241113517
11539	NC_012848	CAG	2	6	590209	590214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11540	NC_012848	CGG	2	6	590233	590238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
11541	NC_012848	CGA	2	6	590272	590277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11542	NC_012848	CG	3	6	590313	590318	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
11543	NC_012848	TCG	2	6	590319	590324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11544	NC_012848	AGA	2	6	590394	590399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113517
11545	NC_012848	ATG	2	6	590411	590416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113517
11546	NC_012848	AAGGC	2	10	590487	590496	40 %	0 %	40 %	20 %	241113517
11547	NC_012848	TGC	2	6	590517	590522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11548	NC_012848	CGG	2	6	590524	590529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
11549	NC_012848	GC	4	8	590578	590585	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
11550	NC_012848	GCG	3	9	590622	590630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
11551	NC_012848	CGC	2	6	590653	590658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11552	NC_012848	GAC	2	6	590678	590683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11553	NC_012848	GCC	2	6	590710	590715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11554	NC_012848	TGCC	2	8	590734	590741	0 %	25 %	25 %	50 %	241113517
11555	NC_012848	GCA	2	6	590834	590839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11556	NC_012848	GCC	2	6	590852	590857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11557	NC_012848	CCGG	2	8	590934	590941	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
11558	NC_012848	CGG	2	6	590944	590949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113517
11559	NC_012848	GAA	2	6	590962	590967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113517
11560	NC_012848	CAT	2	6	590990	590995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113517
11561	NC_012848	CGC	2	6	591061	591066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11562	NC_012848	CGA	3	9	591097	591105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11563	NC_012848	GCC	3	9	591114	591122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11564	NC_012848	CGA	2	6	591199	591204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113517
11565	NC_012848	GC	3	6	591215	591220	0 %	0 %	50 %	50 %	241113517
11566	NC_012848	CGC	2	6	591317	591322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113517
11567	NC_012848	TCG	2	6	591411	591416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11568	NC_012848	CCG	2	6	591485	591490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113518
11569	NC_012848	CTG	2	6	591557	591562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11570	NC_012848	CAG	2	6	591566	591571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113518
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11572	NC_012848	GCT	2	6	591673	591678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11573	NC_012848	CGG	2	6	591679	591684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
11574	NC_012848	CGG	2	6	591741	591746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
11575	NC_012848	CGA	2	6	591751	591756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113518
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11577	NC_012848	GTC	2	6	591845	591850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11578	NC_012848	CGG	2	6	591858	591863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
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11583	NC_012848	GAG	2	6	591998	592003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113518
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11585	NC_012848	GCT	2	6	592108	592113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11586	NC_012848	CGT	2	6	592153	592158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
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11588	NC_012848	CTT	2	6	592204	592209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113518
11589	NC_012848	CGG	2	6	592251	592256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
11590	NC_012848	CGG	3	9	592272	592280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
11591	NC_012848	GGC	2	6	592337	592342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
11592	NC_012848	CGT	2	6	592378	592383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113518
11593	NC_012848	CTGG	2	8	592434	592441	0 %	25 %	50 %	25 %	241113518
11594	NC_012848	CATT	2	8	592483	592490	25 %	50 %	0 %	25 %	241113518
11595	NC_012848	GCG	2	6	592495	592500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113518
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11597	NC_012848	TCGT	2	8	592806	592813	0 %	50 %	25 %	25 %	241113519
11598	NC_012848	CTG	2	6	592916	592921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113519
11599	NC_012848	GGC	2	6	593002	593007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113519
11600	NC_012848	GCC	2	6	593097	593102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113519
11601	NC_012848	CGG	2	6	593195	593200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113519
11602	NC_012848	TCG	2	6	593400	593405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113520
11603	NC_012848	TAAC	2	8	593430	593437	50 %	25 %	0 %	25 %	241113520
11604	NC_012848	AGA	2	6	593470	593475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113520
11605	NC_012848	AGC	3	9	593571	593579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113520
11606	NC_012848	ATG	2	6	593580	593585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113520
11607	NC_012848	GCG	2	6	593655	593660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
11608	NC_012848	GC	3	6	593662	593667	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
11609	NC_012848	TGC	2	6	593690	593695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113520
11610	NC_012848	GC	3	6	593702	593707	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
11611	NC_012848	CG	3	6	593719	593724	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
11612	NC_012848	GC	3	6	593734	593739	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
11613	NC_012848	G	6	6	593780	593785	0 %	0 %	100 %	0 %	241113520
11614	NC_012848	CCGG	2	8	593793	593800	0 %	0 %	50 %	50 %	241113520
11615	NC_012848	CGG	2	6	593854	593859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
11616	NC_012848	TCA	2	6	593890	593895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113520
11617	NC_012848	GCG	2	6	593943	593948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113520
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11973	NC_012848	GGC	4	12	612147	612158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113534
11974	NC_012848	GAC	2	6	612267	612272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11975	NC_012848	TTC	4	12	612273	612284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113535
11976	NC_012848	GC	3	6	612310	612315	0 %	0 %	50 %	50 %	241113535
11977	NC_012848	TG	3	6	612323	612328	0 %	50 %	50 %	0 %	241113535
11978	NC_012848	GGCAT	2	10	612424	612433	20 %	20 %	40 %	20 %	241113535
11979	NC_012848	GCC	2	6	612439	612444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113535
11980	NC_012848	AGCC	2	8	612471	612478	25 %	0 %	25 %	50 %	241113535
11981	NC_012848	ATG	2	6	612497	612502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113535
11982	NC_012848	AGC	2	6	612538	612543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11983	NC_012848	TGC	2	6	612560	612565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11984	NC_012848	CGG	2	6	612830	612835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11985	NC_012848	CGG	2	6	612860	612865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11986	NC_012848	AGC	2	6	612882	612887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11987	NC_012848	TCG	2	6	612902	612907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11988	NC_012848	TCT	2	6	612909	612914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113535
11989	NC_012848	TCA	2	6	612938	612943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113535
11990	NC_012848	CGG	2	6	612950	612955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11991	NC_012848	GCT	2	6	612965	612970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11992	NC_012848	GCG	2	6	612989	612994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11993	NC_012848	GGC	3	9	613128	613136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11994	NC_012848	CGG	2	6	613155	613160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113535
11995	NC_012848	CAG	2	6	613176	613181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113535
11996	NC_012848	GGT	2	6	613234	613239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113535
11997	NC_012848	GCG	2	6	613403	613408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113536
11998	NC_012848	CAA	2	6	613428	613433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113536
11999	NC_012848	CGG	2	6	613461	613466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113536
12000	NC_012848	GCG	2	6	613478	613483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113536

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