MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012848	GCT	2	6	25290	25295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
502	NC_012848	CGG	2	6	25371	25376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113022
503	NC_012848	CAT	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113022
504	NC_012848	TCG	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
505	NC_012848	CG	4	8	25401	25408	0 %	0 %	50 %	50 %	241113022
506	NC_012848	GGT	2	6	25434	25439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113022
507	NC_012848	CGG	2	6	25512	25517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113022
508	NC_012848	TGC	2	6	25538	25543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
509	NC_012848	GCA	2	6	25611	25616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113022
510	NC_012848	TTC	2	6	25625	25630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113022
511	NC_012848	GCC	2	6	25638	25643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113022
512	NC_012848	GCC	2	6	25736	25741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113022
513	NC_012848	GCT	2	6	25764	25769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113022
514	NC_012848	GCC	2	6	25821	25826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
515	NC_012848	CGA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
516	NC_012848	TGG	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113023
517	NC_012848	GC	3	6	25933	25938	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
518	NC_012848	CTG	2	6	25961	25966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
519	NC_012848	TGA	2	6	26026	26031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113023
520	NC_012848	AGC	2	6	26046	26051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
521	NC_012848	GCT	2	6	26077	26082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
522	NC_012848	GC	3	6	26135	26140	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
523	NC_012848	GGC	2	6	26253	26258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
524	NC_012848	CGT	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
525	NC_012848	GCC	2	6	26375	26380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
526	NC_012848	CG	3	6	26407	26412	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
527	NC_012848	GAAA	2	8	26421	26428	75 %	0 %	25 %	0 %	241113023
528	NC_012848	GC	3	6	26429	26434	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
529	NC_012848	GAT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113023
530	NC_012848	CGG	2	6	26455	26460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
531	NC_012848	GTC	2	6	26472	26477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
532	NC_012848	CTG	2	6	26498	26503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113023
533	NC_012848	TTC	2	6	26544	26549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113023
534	NC_012848	GCG	2	6	26626	26631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113023
535	NC_012848	TCC	3	9	26640	26648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113023
536	NC_012848	CCG	2	6	26671	26676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
537	NC_012848	GC	3	6	26693	26698	0 %	0 %	50 %	50 %	241113023
538	NC_012848	GCC	2	6	26700	26705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113023
539	NC_012848	AAG	2	6	26744	26749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113023
540	NC_012848	GCA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113023
541	NC_012848	GCCTCG	2	12	26989	27000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113024
542	NC_012848	GGC	2	6	27084	27089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
543	NC_012848	GGC	2	6	27153	27158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
544	NC_012848	TGC	2	6	27164	27169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
545	NC_012848	GGC	2	6	27213	27218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113024
546	NC_012848	GA	3	6	27226	27231	50 %	0 %	50 %	0 %	241113024
547	NC_012848	CCG	2	6	27235	27240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113024
548	NC_012848	CGC	2	6	27269	27274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113024
549	NC_012848	CAG	2	6	27492	27497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
550	NC_012848	GCAG	2	8	27533	27540	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
551	NC_012848	CGA	2	6	27592	27597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
552	NC_012848	CGA	2	6	27616	27621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
553	NC_012848	CGT	2	6	27638	27643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
554	NC_012848	TCG	2	6	27652	27657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113024
555	NC_012848	TCGA	2	8	27663	27670	25 %	25 %	25 %	25 %	241113024
556	NC_012848	ACA	2	6	27697	27702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113024
557	NC_012848	AAG	2	6	27723	27728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113024
558	NC_012848	ACGG	2	8	27744	27751	25 %	0 %	50 %	25 %	241113024
559	NC_012848	CAT	2	6	27791	27796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113024
560	NC_012848	AAG	2	6	27852	27857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113024
561	NC_012848	TTC	2	6	27858	27863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113024
562	NC_012848	ACCGAC	2	12	27894	27905	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	241113024
563	NC_012848	ACG	2	6	27921	27926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113024
564	NC_012848	GAA	2	6	27959	27964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113024
565	NC_012848	GGC	2	6	28056	28061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113025
566	NC_012848	AGG	2	6	28070	28075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113025
567	NC_012848	GTC	2	6	28093	28098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113025
568	NC_012848	TCA	2	6	28178	28183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113025
569	NC_012848	CAT	2	6	28227	28232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113025
570	NC_012848	GCCT	2	8	28298	28305	0 %	25 %	25 %	50 %	241113025
571	NC_012848	CG	3	6	28478	28483	0 %	0 %	50 %	50 %	241113025
572	NC_012848	CGG	2	6	28491	28496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113025
573	NC_012848	CG	3	6	28522	28527	0 %	0 %	50 %	50 %	241113025
574	NC_012848	GCT	3	9	28545	28553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113025
575	NC_012848	CGC	2	6	28569	28574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113025
576	NC_012848	CGA	2	6	28578	28583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113025
577	NC_012848	ACG	3	9	28604	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113025
578	NC_012848	TGC	2	6	28613	28618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113025
579	NC_012848	TC	3	6	28683	28688	0 %	50 %	0 %	50 %	241113025
580	NC_012848	GTG	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113025
581	NC_012848	ACC	2	6	28747	28752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113025
582	NC_012848	GGA	2	6	28848	28853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113025
583	NC_012848	TGA	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113025
584	NC_012848	CGG	2	6	28926	28931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113026
585	NC_012848	TCA	2	6	28969	28974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113026
586	NC_012848	TCA	2	6	28981	28986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113026
587	NC_012848	GTG	2	6	29004	29009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113026
588	NC_012848	TCA	2	6	29065	29070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113026
589	NC_012848	GGC	2	6	29148	29153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113026
590	NC_012848	CGC	2	6	29251	29256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113026
591	NC_012848	CTCC	2	8	29272	29279	0 %	25 %	0 %	75 %	241113026
592	NC_012848	TCG	2	6	29311	29316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113026
593	NC_012848	TTC	2	6	29319	29324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113026
594	NC_012848	GCT	2	6	29417	29422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113026
595	NC_012848	CTGC	2	8	29433	29440	0 %	25 %	25 %	50 %	241113026
596	NC_012848	CGG	3	9	29474	29482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113026
597	NC_012848	CGC	2	6	29495	29500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113026
598	NC_012848	CGT	2	6	29501	29506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113026
599	NC_012848	CCG	2	6	29527	29532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113026
600	NC_012848	CGC	2	6	29600	29605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113026
601	NC_012848	CAC	2	6	29648	29653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113026
602	NC_012848	AGC	2	6	29691	29696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113026
603	NC_012848	CCG	2	6	29735	29740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
604	NC_012848	CCG	2	6	29778	29783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
605	NC_012848	TCA	2	6	29841	29846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113027
606	NC_012848	GCC	2	6	29861	29866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
607	NC_012848	CGGC	3	12	29870	29881	0 %	0 %	50 %	50 %	241113027
608	NC_012848	CCG	2	6	29889	29894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
609	NC_012848	GATC	2	8	29905	29912	25 %	25 %	25 %	25 %	241113027
610	NC_012848	GC	3	6	30015	30020	0 %	0 %	50 %	50 %	241113027
611	NC_012848	CGG	2	6	30074	30079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113027
612	NC_012848	CGCTC	2	10	30090	30099	0 %	20 %	20 %	60 %	241113027
613	NC_012848	GCATC	2	10	30157	30166	20 %	20 %	20 %	40 %	241113027
614	NC_012848	ATTGC	2	10	30212	30221	20 %	40 %	20 %	20 %	241113027
615	NC_012848	CTT	2	6	30265	30270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113027
616	NC_012848	CAA	2	6	30285	30290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113027
617	NC_012848	CGG	2	6	30301	30306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113027
618	NC_012848	GGC	2	6	30314	30319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113027
619	NC_012848	CGA	2	6	30409	30414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113027
620	NC_012848	GAT	2	6	30419	30424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113027
621	NC_012848	TGC	2	6	30462	30467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113027
622	NC_012848	CCG	2	6	30492	30497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
623	NC_012848	TTG	2	6	30502	30507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113027
624	NC_012848	CTCG	2	8	30508	30515	0 %	25 %	25 %	50 %	241113027
625	NC_012848	CCG	2	6	30534	30539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
626	NC_012848	CG	3	6	30538	30543	0 %	0 %	50 %	50 %	241113027
627	NC_012848	GCG	2	6	30645	30650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113027
628	NC_012848	GCC	3	9	30671	30679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
629	NC_012848	CCG	2	6	30804	30809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
630	NC_012848	GTC	2	6	30815	30820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113027
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633	NC_012848	TCG	2	6	30840	30845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113027
634	NC_012848	CGC	2	6	30868	30873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
635	NC_012848	GC	3	6	30903	30908	0 %	0 %	50 %	50 %	241113027
636	NC_012848	CGT	2	6	30949	30954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113027
637	NC_012848	CGC	2	6	30959	30964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113027
638	NC_012848	CGT	2	6	31012	31017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113027
639	NC_012848	AGA	2	6	31102	31107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113028
640	NC_012848	AGCTC	2	10	31142	31151	20 %	20 %	20 %	40 %	241113028
641	NC_012848	TCG	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113028
642	NC_012848	CGC	2	6	31246	31251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113028
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645	NC_012848	GCC	2	6	31317	31322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113028
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648	NC_012848	CGG	2	6	31463	31468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113028
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650	NC_012848	CGG	2	6	31487	31492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113028
651	NC_012848	GGC	2	6	31512	31517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113028
652	NC_012848	CCTGCG	2	12	31538	31549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241113028
653	NC_012848	CGT	2	6	31550	31555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113028
654	NC_012848	CG	3	6	31573	31578	0 %	0 %	50 %	50 %	241113028
655	NC_012848	CAT	2	6	31637	31642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113028
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659	NC_012848	CGC	2	6	31784	31789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113028
660	NC_012848	TCG	2	6	31849	31854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113028
661	NC_012848	TGA	2	6	31858	31863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113028
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663	NC_012848	CGG	2	6	31900	31905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113028
664	NC_012848	TGCG	2	8	31999	32006	0 %	25 %	50 %	25 %	241113028
665	NC_012848	TCA	2	6	32125	32130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113028
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725	NC_012848	CGC	2	6	36511	36516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113032
726	NC_012848	CTT	2	6	36529	36534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113032
727	NC_012848	CAG	2	6	36536	36541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113032
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737	NC_012848	ACG	2	6	36990	36995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113032
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746	NC_012848	CCGA	2	8	37401	37408	25 %	0 %	25 %	50 %	241113033
747	NC_012848	CAC	2	6	37504	37509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113033
748	NC_012848	TGTAGG	2	12	37531	37542	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	241113033
749	NC_012848	CG	3	6	37574	37579	0 %	0 %	50 %	50 %	241113033
750	NC_012848	CGAG	2	8	37615	37622	25 %	0 %	50 %	25 %	241113033
751	NC_012848	CGA	2	6	37669	37674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113033
752	NC_012848	CCG	2	6	37687	37692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113033
753	NC_012848	GGC	2	6	37713	37718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113033
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755	NC_012848	GGC	2	6	37957	37962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113033
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1000	NC_012848	TGA	2	6	51355	51360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113045

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