MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012848	TTA	2	6	288205	288210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113253
5502	NC_012848	AGA	2	6	288214	288219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113253
5503	NC_012848	ACA	2	6	288241	288246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113253
5504	NC_012848	GGC	2	6	288323	288328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113253
5505	NC_012848	GTT	2	6	288350	288355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113253
5506	NC_012848	ATG	2	6	288390	288395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113253
5507	NC_012848	AGTG	2	8	288739	288746	25 %	25 %	50 %	0 %	241113254
5508	NC_012848	GTC	2	6	288788	288793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113254
5509	NC_012848	TCA	2	6	288948	288953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113254
5510	NC_012848	ACA	2	6	288957	288962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113254
5511	NC_012848	CCG	2	6	288995	289000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113254
5512	NC_012848	CCG	2	6	289011	289016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113254
5513	NC_012848	ATGA	2	8	289036	289043	50 %	25 %	25 %	0 %	241113254
5514	NC_012848	TTGA	2	8	289083	289090	25 %	50 %	25 %	0 %	241113254
5515	NC_012848	TCAT	2	8	289160	289167	25 %	50 %	0 %	25 %	241113254
5516	NC_012848	ATT	2	6	289246	289251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113255
5517	NC_012848	GTA	2	6	289316	289321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113255
5518	NC_012848	AGC	2	6	289326	289331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5519	NC_012848	GTAGAG	2	12	289333	289344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	241113255
5520	NC_012848	GAT	2	6	289349	289354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113255
5521	NC_012848	ATT	2	6	289362	289367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113255
5522	NC_012848	GCA	2	6	289381	289386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5523	NC_012848	GCC	2	6	289454	289459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113255
5524	NC_012848	GCG	2	6	289464	289469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113255
5525	NC_012848	CCT	2	6	289471	289476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113255
5526	NC_012848	GAA	2	6	289499	289504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113255
5527	NC_012848	ATG	2	6	289524	289529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113255
5528	NC_012848	CGG	2	6	289579	289584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113255
5529	NC_012848	GC	3	6	289627	289632	0 %	0 %	50 %	50 %	241113255
5530	NC_012848	AAGA	2	8	289667	289674	75 %	0 %	25 %	0 %	241113255
5531	NC_012848	GCA	2	6	289735	289740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5532	NC_012848	ATG	2	6	289749	289754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113255
5533	NC_012848	TCAA	2	8	289764	289771	50 %	25 %	0 %	25 %	241113255
5534	NC_012848	CTC	2	6	289790	289795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113255
5535	NC_012848	CG	3	6	289813	289818	0 %	0 %	50 %	50 %	241113255
5536	NC_012848	AGC	2	6	289841	289846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5537	NC_012848	GAC	2	6	289961	289966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5538	NC_012848	CGG	2	6	290020	290025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113255
5539	NC_012848	GCC	2	6	290052	290057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113255
5540	NC_012848	GC	3	6	290123	290128	0 %	0 %	50 %	50 %	241113255
5541	NC_012848	TGGC	2	8	290247	290254	0 %	25 %	50 %	25 %	241113255
5542	NC_012848	TCGG	2	8	290348	290355	0 %	25 %	50 %	25 %	241113255
5543	NC_012848	GT	3	6	290370	290375	0 %	50 %	50 %	0 %	241113255
5544	NC_012848	GAC	2	6	290387	290392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5545	NC_012848	AGGT	2	8	290457	290464	25 %	25 %	50 %	0 %	241113255
5546	NC_012848	GC	3	6	290555	290560	0 %	0 %	50 %	50 %	241113255
5547	NC_012848	ATT	2	6	290592	290597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113255
5548	NC_012848	GCAT	2	8	290634	290641	25 %	25 %	25 %	25 %	241113255
5549	NC_012848	GAG	2	6	290681	290686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113255
5550	NC_012848	CGA	2	6	290692	290697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5551	NC_012848	GAT	2	6	290771	290776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113255
5552	NC_012848	GCC	2	6	291043	291048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113255
5553	NC_012848	CGA	2	6	291049	291054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113255
5554	NC_012848	CA	3	6	291067	291072	50 %	0 %	0 %	50 %	241113255
5555	NC_012848	GGA	2	6	291614	291619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113256
5556	NC_012848	CCA	3	9	291628	291636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113256
5557	NC_012848	CCGA	2	8	291666	291673	25 %	0 %	25 %	50 %	241113256
5558	NC_012848	GCT	2	6	291692	291697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113256
5559	NC_012848	CGG	2	6	291716	291721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113256
5560	NC_012848	AATGA	2	10	291848	291857	60 %	20 %	20 %	0 %	241113256
5561	NC_012848	CGGA	2	8	291858	291865	25 %	0 %	50 %	25 %	241113256
5562	NC_012848	AGA	2	6	291901	291906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113256
5563	NC_012848	CCG	2	6	292001	292006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113256
5564	NC_012848	CGCC	2	8	292019	292026	0 %	0 %	25 %	75 %	241113256
5565	NC_012848	TCTTT	2	10	292031	292040	0 %	80 %	0 %	20 %	241113256
5566	NC_012848	CAG	2	6	292230	292235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113257
5567	NC_012848	CGGC	2	8	292262	292269	0 %	0 %	50 %	50 %	241113257
5568	NC_012848	AGCG	2	8	292413	292420	25 %	0 %	50 %	25 %	241113257
5569	NC_012848	CTT	2	6	292702	292707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113258
5570	NC_012848	GGC	2	6	292745	292750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113258
5571	NC_012848	TGG	2	6	292777	292782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113258
5572	NC_012848	GCG	2	6	293034	293039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113258
5573	NC_012848	ACA	2	6	293085	293090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113258
5574	NC_012848	CGG	2	6	293101	293106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113258
5575	NC_012848	GCG	2	6	293176	293181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113258
5576	NC_012848	CTGAT	2	10	293223	293232	20 %	40 %	20 %	20 %	241113258
5577	NC_012848	CGC	2	6	293261	293266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113258
5578	NC_012848	CTGAC	2	10	293316	293325	20 %	20 %	20 %	40 %	241113258
5579	NC_012848	GC	4	8	293366	293373	0 %	0 %	50 %	50 %	241113258
5580	NC_012848	TTC	2	6	293408	293413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113258
5581	NC_012848	CCAG	2	8	293423	293430	25 %	0 %	25 %	50 %	241113258
5582	NC_012848	CCG	2	6	293433	293438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113258
5583	NC_012848	GGA	2	6	293480	293485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113258
5584	NC_012848	GCA	2	6	293514	293519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113258
5585	NC_012848	GT	3	6	293576	293581	0 %	50 %	50 %	0 %	241113258
5586	NC_012848	ACCG	2	8	293603	293610	25 %	0 %	25 %	50 %	241113258
5587	NC_012848	TGA	2	6	293638	293643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113258
5588	NC_012848	TTCC	2	8	293675	293682	0 %	50 %	0 %	50 %	241113258
5589	NC_012848	TGA	2	6	293687	293692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113258
5590	NC_012848	CGTT	2	8	293695	293702	0 %	50 %	25 %	25 %	241113258
5591	NC_012848	ACG	2	6	293736	293741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113258
5592	NC_012848	CCT	2	6	293757	293762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113259
5593	NC_012848	CGA	2	6	293787	293792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113259
5594	NC_012848	TCC	2	6	293958	293963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113259
5595	NC_012848	GCA	2	6	293996	294001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113259
5596	NC_012848	CGG	2	6	294535	294540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113260
5597	NC_012848	CCT	2	6	294559	294564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113260
5598	NC_012848	TAT	2	6	294569	294574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113260
5599	NC_012848	GAT	2	6	294658	294663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113260
5600	NC_012848	AAGGG	2	10	294711	294720	40 %	0 %	60 %	0 %	241113260
5601	NC_012848	GTA	2	6	294742	294747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113260
5602	NC_012848	CGC	2	6	294789	294794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113260
5603	NC_012848	ACGT	2	8	294841	294848	25 %	25 %	25 %	25 %	241113260
5604	NC_012848	GCT	2	6	294910	294915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113260
5605	NC_012848	A	6	6	295005	295010	100 %	0 %	0 %	0 %	241113260
5606	NC_012848	CTC	2	6	295034	295039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113260
5607	NC_012848	ATC	2	6	295043	295048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113260
5608	NC_012848	CG	3	6	295087	295092	0 %	0 %	50 %	50 %	241113260
5609	NC_012848	GAA	2	6	295115	295120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113260
5610	NC_012848	GCT	2	6	295279	295284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113260
5611	NC_012848	GC	3	6	295314	295319	0 %	0 %	50 %	50 %	241113260
5612	NC_012848	TGGC	2	8	295342	295349	0 %	25 %	50 %	25 %	241113260
5613	NC_012848	TGC	2	6	295363	295368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113260
5614	NC_012848	GC	3	6	295367	295372	0 %	0 %	50 %	50 %	241113260
5615	NC_012848	TCA	2	6	295396	295401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113260
5616	NC_012848	CTG	2	6	295689	295694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113261
5617	NC_012848	TGC	2	6	295896	295901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113261
5618	NC_012848	CATGC	2	10	296063	296072	20 %	20 %	20 %	40 %	241113261
5619	NC_012848	GA	3	6	296084	296089	50 %	0 %	50 %	0 %	241113261
5620	NC_012848	CGAA	2	8	296251	296258	50 %	0 %	25 %	25 %	241113261
5621	NC_012848	GCG	2	6	296277	296282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113262
5622	NC_012848	CGA	2	6	296310	296315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113262
5623	NC_012848	CGA	2	6	296337	296342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113262
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5626	NC_012848	GA	3	6	296543	296548	50 %	0 %	50 %	0 %	241113262
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5628	NC_012848	GA	3	6	296694	296699	50 %	0 %	50 %	0 %	241113262
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5740	NC_012848	CAGCG	2	10	303875	303884	20 %	0 %	40 %	40 %	241113269
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5743	NC_012848	ACAGG	2	10	303979	303988	40 %	0 %	40 %	20 %	241113269
5744	NC_012848	CCT	2	6	304027	304032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113269
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5759	NC_012848	ATGAG	2	10	305072	305081	40 %	20 %	40 %	0 %	241113271
5760	NC_012848	TA	3	6	305232	305237	50 %	50 %	0 %	0 %	241113271
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5865	NC_012848	GAT	2	6	311508	311513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113276
5866	NC_012848	TCG	2	6	311596	311601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113276
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5972	NC_012848	ACTTC	2	10	318139	318148	20 %	40 %	0 %	40 %	241113281
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5985	NC_012848	GGC	2	6	319027	319032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113282
5986	NC_012848	GTT	2	6	319038	319043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113282
5987	NC_012848	TC	3	6	319157	319162	0 %	50 %	0 %	50 %	241113282
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5990	NC_012848	CGG	2	6	319385	319390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113282
5991	NC_012848	CGG	2	6	319431	319436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113282
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5999	NC_012848	CGA	2	6	320012	320017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113283
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