MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132501

Total Repeats: 16324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012848	CCA	2	6	226551	226556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113203
4502	NC_012848	CGA	2	6	226577	226582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113203
4503	NC_012848	TCCT	2	8	226631	226638	0 %	50 %	0 %	50 %	241113203
4504	NC_012848	GGC	2	6	226721	226726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113203
4505	NC_012848	TCG	2	6	226734	226739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113203
4506	NC_012848	GCC	2	6	226741	226746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113203
4507	NC_012848	GC	3	6	226753	226758	0 %	0 %	50 %	50 %	241113203
4508	NC_012848	TGG	2	6	226839	226844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113203
4509	NC_012848	CCG	2	6	226852	226857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113203
4510	NC_012848	ACGA	2	8	226902	226909	50 %	0 %	25 %	25 %	241113203
4511	NC_012848	A	6	6	226973	226978	100 %	0 %	0 %	0 %	241113203
4512	NC_012848	CAT	2	6	227069	227074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113203
4513	NC_012848	GTA	2	6	227096	227101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113203
4514	NC_012848	AGCC	2	8	227142	227149	25 %	0 %	25 %	50 %	241113203
4515	NC_012848	AAG	2	6	227162	227167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113203
4516	NC_012848	CAG	2	6	227234	227239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113203
4517	NC_012848	ACG	2	6	227253	227258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113203
4518	NC_012848	CG	3	6	227262	227267	0 %	0 %	50 %	50 %	241113203
4519	NC_012848	TCGG	2	8	227303	227310	0 %	25 %	50 %	25 %	241113203
4520	NC_012848	CAT	2	6	227380	227385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113203
4521	NC_012848	TCG	2	6	227439	227444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113203
4522	NC_012848	TTG	2	6	227739	227744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113204
4523	NC_012848	TCG	2	6	227758	227763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113204
4524	NC_012848	AGG	2	6	227771	227776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113204
4525	NC_012848	TGC	2	6	227779	227784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113204
4526	NC_012848	C	8	8	227869	227876	0 %	0 %	0 %	100 %	241113204
4527	NC_012848	ATC	2	6	227882	227887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113204
4528	NC_012848	CGG	2	6	227918	227923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113204
4529	NC_012848	TCA	2	6	227992	227997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113204
4530	NC_012848	CG	3	6	228030	228035	0 %	0 %	50 %	50 %	241113204
4531	NC_012848	ACGC	2	8	228048	228055	25 %	0 %	25 %	50 %	241113204
4532	NC_012848	ATC	2	6	228103	228108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113204
4533	NC_012848	TCG	2	6	228152	228157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113204
4534	NC_012848	CGC	2	6	228194	228199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113204
4535	NC_012848	CGGCC	2	10	228216	228225	0 %	0 %	40 %	60 %	241113204
4536	NC_012848	CGC	2	6	228250	228255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113204
4537	NC_012848	GC	3	6	228285	228290	0 %	0 %	50 %	50 %	241113204
4538	NC_012848	CGTC	2	8	228375	228382	0 %	25 %	25 %	50 %	241113204
4539	NC_012848	GGTC	2	8	228396	228403	0 %	25 %	50 %	25 %	241113204
4540	NC_012848	AAG	2	6	228506	228511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113204
4541	NC_012848	GGC	2	6	228533	228538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113204
4542	NC_012848	GACG	2	8	228568	228575	25 %	0 %	50 %	25 %	241113204
4543	NC_012848	GCT	2	6	228610	228615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113204
4544	NC_012848	GA	3	6	228630	228635	50 %	0 %	50 %	0 %	241113204
4545	NC_012848	GCA	2	6	228705	228710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113204
4546	NC_012848	T	6	6	228862	228867	0 %	100 %	0 %	0 %	241113205
4547	NC_012848	GGAC	2	8	229069	229076	25 %	0 %	50 %	25 %	241113205
4548	NC_012848	GCG	2	6	229086	229091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113205
4549	NC_012848	CGA	2	6	229129	229134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4550	NC_012848	CCCA	2	8	229143	229150	25 %	0 %	0 %	75 %	241113205
4551	NC_012848	CTG	2	6	229154	229159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4552	NC_012848	CAG	2	6	229160	229165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4553	NC_012848	GCC	2	6	229170	229175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113205
4554	NC_012848	CG	3	6	229255	229260	0 %	0 %	50 %	50 %	241113205
4555	NC_012848	CGA	2	6	229348	229353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4556	NC_012848	AGGTT	2	10	229371	229380	20 %	40 %	40 %	0 %	241113205
4557	NC_012848	GC	3	6	229390	229395	0 %	0 %	50 %	50 %	241113205
4558	NC_012848	TGG	2	6	229399	229404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113205
4559	NC_012848	GACGA	2	10	229426	229435	40 %	0 %	40 %	20 %	241113205
4560	NC_012848	GGC	2	6	229454	229459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113205
4561	NC_012848	GC	3	6	229467	229472	0 %	0 %	50 %	50 %	241113205
4562	NC_012848	CGG	2	6	229505	229510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113205
4563	NC_012848	CAG	2	6	229514	229519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4564	NC_012848	GCT	2	6	229614	229619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4565	NC_012848	GC	3	6	229631	229636	0 %	0 %	50 %	50 %	241113205
4566	NC_012848	CAG	2	6	229664	229669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113205
4567	NC_012848	CG	3	6	229671	229676	0 %	0 %	50 %	50 %	241113205
4568	NC_012848	GACG	2	8	229859	229866	25 %	0 %	50 %	25 %	241113206
4569	NC_012848	ATT	2	6	229867	229872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241113206
4570	NC_012848	GCC	2	6	229892	229897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113206
4571	NC_012848	CG	3	6	229918	229923	0 %	0 %	50 %	50 %	241113206
4572	NC_012848	GGC	2	6	229924	229929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113206
4573	NC_012848	GCT	2	6	230002	230007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113206
4574	NC_012848	ACA	2	6	230015	230020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241113206
4575	NC_012848	GC	3	6	230046	230051	0 %	0 %	50 %	50 %	241113206
4576	NC_012848	ATC	2	6	230234	230239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113206
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4578	NC_012848	CG	3	6	230343	230348	0 %	0 %	50 %	50 %	241113206
4579	NC_012848	GAGC	2	8	230413	230420	25 %	0 %	50 %	25 %	241113206
4580	NC_012848	GTC	2	6	230492	230497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113206
4581	NC_012848	TCGA	2	8	230498	230505	25 %	25 %	25 %	25 %	241113206
4582	NC_012848	TCT	2	6	230583	230588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113206
4583	NC_012848	ATC	2	6	230738	230743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113206
4584	NC_012848	CGC	2	6	230909	230914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113207
4585	NC_012848	GCT	2	6	231035	231040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113207
4586	NC_012848	CTT	2	6	231062	231067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113207
4587	NC_012848	CTG	2	6	231106	231111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113207
4588	NC_012848	GCA	2	6	231137	231142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113207
4589	NC_012848	CG	3	6	231155	231160	0 %	0 %	50 %	50 %	241113207
4590	NC_012848	TTG	2	6	231199	231204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241113207
4591	NC_012848	ATCCTG	2	12	231211	231222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241113207
4592	NC_012848	GCG	2	6	231286	231291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113207
4593	NC_012848	GCC	2	6	231292	231297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113207
4594	NC_012848	CG	3	6	231315	231320	0 %	0 %	50 %	50 %	241113207
4595	NC_012848	GTC	2	6	231340	231345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113207
4596	NC_012848	GTTC	2	8	231420	231427	0 %	50 %	25 %	25 %	241113208
4597	NC_012848	GTG	2	6	231566	231571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113208
4598	NC_012848	CTTC	2	8	231591	231598	0 %	50 %	0 %	50 %	241113208
4599	NC_012848	GC	3	6	231617	231622	0 %	0 %	50 %	50 %	241113208
4600	NC_012848	TCG	2	6	231633	231638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113208
4601	NC_012848	CGG	2	6	231648	231653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113208
4602	NC_012848	GGA	2	6	231682	231687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113208
4603	NC_012848	TGA	2	6	231693	231698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113208
4604	NC_012848	GCT	3	9	231734	231742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113208
4605	NC_012848	ATC	2	6	231776	231781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113208
4606	NC_012848	GCG	2	6	231813	231818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113208
4607	NC_012848	CTC	2	6	231961	231966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113208
4608	NC_012848	CG	3	6	231995	232000	0 %	0 %	50 %	50 %	241113208
4609	NC_012848	GAC	2	6	232006	232011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113208
4610	NC_012848	CGC	2	6	232017	232022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113208
4611	NC_012848	GCT	2	6	232060	232065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113208
4612	NC_012848	GAC	2	6	232078	232083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113208
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4614	NC_012848	AAG	2	6	232187	232192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113209
4615	NC_012848	GCAG	2	8	232193	232200	25 %	0 %	50 %	25 %	241113209
4616	NC_012848	GAAG	2	8	232204	232211	50 %	0 %	50 %	0 %	241113209
4617	NC_012848	CCA	2	6	232217	232222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241113209
4618	NC_012848	GCC	2	6	232244	232249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4619	NC_012848	GCC	2	6	232259	232264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4620	NC_012848	CGC	2	6	232304	232309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4621	NC_012848	CCG	2	6	232408	232413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4622	NC_012848	CAG	3	9	232433	232441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113209
4623	NC_012848	AGC	2	6	232457	232462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113209
4624	NC_012848	GAG	2	6	232484	232489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113209
4625	NC_012848	GCG	2	6	232500	232505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113209
4626	NC_012848	CCAG	2	8	232524	232531	25 %	0 %	25 %	50 %	241113209
4627	NC_012848	CCG	2	6	232533	232538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4628	NC_012848	GCCGAG	2	12	232541	232552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241113209
4629	NC_012848	CGC	2	6	232655	232660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113209
4630	NC_012848	GCA	2	6	232687	232692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113209
4631	NC_012848	GAC	2	6	232745	232750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113209
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4648	NC_012848	CG	3	6	233487	233492	0 %	0 %	50 %	50 %	241113210
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4650	NC_012848	TC	3	6	233572	233577	0 %	50 %	0 %	50 %	241113210
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4653	NC_012848	GC	3	6	233615	233620	0 %	0 %	50 %	50 %	241113210
4654	NC_012848	TGG	2	6	233622	233627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113210
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4677	NC_012848	GCCC	2	8	235197	235204	0 %	0 %	25 %	75 %	241113212
4678	NC_012848	GA	3	6	235210	235215	50 %	0 %	50 %	0 %	241113212
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4686	NC_012848	GCA	2	6	235516	235521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113213
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4688	NC_012848	CCAG	2	8	235603	235610	25 %	0 %	25 %	50 %	241113213
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4695	NC_012848	GC	3	6	235959	235964	0 %	0 %	50 %	50 %	241113213
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4717	NC_012848	GCT	2	6	236765	236770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113213
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4720	NC_012848	TCCGA	2	10	236832	236841	20 %	20 %	20 %	40 %	241113213
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4723	NC_012848	TCGCC	2	10	236923	236932	0 %	20 %	20 %	60 %	241113213
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4727	NC_012848	GTC	2	6	237123	237128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113213
4728	NC_012848	GC	3	6	237162	237167	0 %	0 %	50 %	50 %	241113213
4729	NC_012848	GGC	2	6	237179	237184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113213
4730	NC_012848	CGC	2	6	237193	237198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113213
4731	NC_012848	GCC	2	6	237212	237217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113213
4732	NC_012848	GCC	2	6	237228	237233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113213
4733	NC_012848	GCC	2	6	237246	237251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113213
4734	NC_012848	CAT	2	6	237254	237259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113213
4735	NC_012848	CGG	2	6	237313	237318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113213
4736	NC_012848	CTA	2	6	237362	237367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113213
4737	NC_012848	GC	3	6	237378	237383	0 %	0 %	50 %	50 %	241113213
4738	NC_012848	CGC	2	6	237473	237478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241113213
4739	NC_012848	TGG	2	6	237484	237489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113213
4740	NC_012848	CCGG	2	8	237513	237520	0 %	0 %	50 %	50 %	241113213
4741	NC_012848	ATC	2	6	237531	237536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113213
4742	NC_012848	TCC	2	6	237556	237561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113213
4743	NC_012848	GGCG	2	8	237566	237573	0 %	0 %	75 %	25 %	241113213
4744	NC_012848	GGA	2	6	237638	237643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113213
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4746	NC_012848	GGC	2	6	237723	237728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113213
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4858	NC_012848	CTTTG	2	10	243738	243747	0 %	60 %	20 %	20 %	241113217
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4862	NC_012848	GC	3	6	244060	244065	0 %	0 %	50 %	50 %	241113218
4863	NC_012848	CA	3	6	244115	244120	50 %	0 %	0 %	50 %	241113218
4864	NC_012848	CGG	2	6	244132	244137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113218
4865	NC_012848	C	6	6	244156	244161	0 %	0 %	0 %	100 %	241113218
4866	NC_012848	GACT	2	8	244177	244184	25 %	25 %	25 %	25 %	241113218
4867	NC_012848	CCT	2	6	244220	244225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241113218
4868	NC_012848	TTC	2	6	244245	244250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113218
4869	NC_012848	CTG	2	6	244314	244319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113218
4870	NC_012848	GGC	2	6	244383	244388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113218
4871	NC_012848	CGAC	2	8	244447	244454	25 %	0 %	25 %	50 %	241113218
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4874	NC_012848	GTC	2	6	244608	244613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113218
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4895	NC_012848	TGC	2	6	245585	245590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113219
4896	NC_012848	CTA	2	6	245673	245678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113219
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4899	NC_012848	GCCTG	2	10	245709	245718	0 %	20 %	40 %	40 %	241113219
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4973	NC_012848	ACGAG	2	10	249178	249187	40 %	0 %	40 %	20 %	241113222
4974	NC_012848	CATC	2	8	249292	249299	25 %	25 %	0 %	50 %	241113222
4975	NC_012848	GGGC	2	8	249328	249335	0 %	0 %	75 %	25 %	241113222
4976	NC_012848	CCAT	2	8	249429	249436	25 %	25 %	0 %	50 %	241113222
4977	NC_012848	CTT	2	6	249514	249519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241113222
4978	NC_012848	CACCT	2	10	249633	249642	20 %	20 %	0 %	60 %	241113222
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4981	NC_012848	TCG	2	6	249850	249855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241113223
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4983	NC_012848	TGGTCG	2	12	249976	249987	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241113223
4984	NC_012848	CG	4	8	249989	249996	0 %	0 %	50 %	50 %	241113223
4985	NC_012848	ATG	2	6	250026	250031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241113223
4986	NC_012848	GGC	2	6	250053	250058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113223
4987	NC_012848	GCG	2	6	250201	250206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113223
4988	NC_012848	CAT	2	6	250229	250234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113223
4989	NC_012848	CGA	2	6	250241	250246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113223
4990	NC_012848	GTG	3	9	250254	250262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241113223
4991	NC_012848	CGA	2	6	250292	250297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241113223
4992	NC_012848	GAG	2	6	250320	250325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241113223
4993	NC_012848	CG	3	6	250330	250335	0 %	0 %	50 %	50 %	241113223
4994	NC_012848	CTA	2	6	250367	250372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241113223
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4996	NC_012848	CGG	2	6	250925	250930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113224
4997	NC_012848	CCGC	2	8	250933	250940	0 %	0 %	25 %	75 %	241113224
4998	NC_012848	AGA	2	6	250960	250965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113224
4999	NC_012848	GAA	2	6	250980	250985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241113224
5000	NC_012848	GCG	2	6	251007	251012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241113224

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