MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	TTTTA	2	10	2498	2507	20 %	80 %	0 %	0 %	238650217
2	NC_012730	ATTTA	2	10	2851	2860	40 %	60 %	0 %	0 %	238650217
3	NC_012730	GGTCA	2	10	4098	4107	20 %	20 %	40 %	20 %	238650218
4	NC_012730	TAAAT	2	10	4807	4816	60 %	40 %	0 %	0 %	238650218
5	NC_012730	GTAGT	2	10	5133	5142	20 %	40 %	40 %	0 %	238650218
6	NC_012730	TAATA	2	10	5993	6002	60 %	40 %	0 %	0 %	238650218
7	NC_012730	ACTTT	2	10	6792	6801	20 %	60 %	0 %	20 %	238650220
8	NC_012730	AATAC	2	10	7333	7342	60 %	20 %	0 %	20 %	238650220
9	NC_012730	ATCCA	2	10	7830	7839	40 %	20 %	0 %	40 %	238650221
10	NC_012730	GCTTT	2	10	14441	14450	0 %	60 %	20 %	20 %	238650225
11	NC_012730	TAGTT	2	10	17423	17432	20 %	60 %	20 %	0 %	238650226
12	NC_012730	CATAT	2	10	17966	17975	40 %	40 %	0 %	20 %	238650226
13	NC_012730	ATTAG	2	10	18105	18114	40 %	40 %	20 %	0 %	238650226
14	NC_012730	TTTCA	2	10	20476	20485	20 %	60 %	0 %	20 %	238650228
15	NC_012730	ACATT	2	10	20747	20756	40 %	40 %	0 %	20 %	238650228
16	NC_012730	ATTTC	2	10	21799	21808	20 %	60 %	0 %	20 %	238650229
17	NC_012730	TTTTA	2	10	26790	26799	20 %	80 %	0 %	0 %	238650234
18	NC_012730	CAAAA	2	10	35105	35114	80 %	0 %	0 %	20 %	238650239
19	NC_012730	GCTCC	2	10	35278	35287	0 %	20 %	20 %	60 %	238650239
20	NC_012730	ATGTT	2	10	36464	36473	20 %	60 %	20 %	0 %	238650239
21	NC_012730	TAAAA	2	10	40442	40451	80 %	20 %	0 %	0 %	238650245
22	NC_012730	TATAA	2	10	41270	41279	60 %	40 %	0 %	0 %	238650246
23	NC_012730	AATTA	2	10	43385	43394	60 %	40 %	0 %	0 %	238650248
24	NC_012730	GCATT	2	10	44419	44428	20 %	40 %	20 %	20 %	238650248
25	NC_012730	TTTCT	2	10	45757	45766	0 %	80 %	0 %	20 %	238650248
26	NC_012730	AAATA	2	10	46905	46914	80 %	20 %	0 %	0 %	238650249
27	NC_012730	TGCAA	2	10	47263	47272	40 %	20 %	20 %	20 %	238650249
28	NC_012730	GTAAC	2	10	48352	48361	40 %	20 %	20 %	20 %	238650250
29	NC_012730	ATTTA	2	10	49040	49049	40 %	60 %	0 %	0 %	238650250
30	NC_012730	AGTGC	2	10	49175	49184	20 %	20 %	40 %	20 %	238650251
31	NC_012730	GCAAG	2	10	49595	49604	40 %	0 %	40 %	20 %	238650252
32	NC_012730	AAGTA	2	10	49978	49987	60 %	20 %	20 %	0 %	238650252
33	NC_012730	ACGGT	2	10	51303	51312	20 %	20 %	40 %	20 %	238650252
34	NC_012730	ACGGT	2	10	51405	51414	20 %	20 %	40 %	20 %	238650252
35	NC_012730	GCAAA	2	10	51576	51585	60 %	0 %	20 %	20 %	238650252
36	NC_012730	ATATT	2	10	53115	53124	40 %	60 %	0 %	0 %	238650254
37	NC_012730	TAATA	2	10	53708	53717	60 %	40 %	0 %	0 %	238650255
38	NC_012730	GTAAT	2	10	54007	54016	40 %	40 %	20 %	0 %	238650255
39	NC_012730	TAAAA	2	10	56040	56049	80 %	20 %	0 %	0 %	238650257
40	NC_012730	ATTAT	2	10	57263	57272	40 %	60 %	0 %	0 %	238650259
41	NC_012730	CCTCC	2	10	57390	57399	0 %	20 %	0 %	80 %	238650259
42	NC_012730	AGATA	2	10	57883	57892	60 %	20 %	20 %	0 %	238650259
43	NC_012730	AATTA	2	10	61838	61847	60 %	40 %	0 %	0 %	238651134
44	NC_012730	TTTAA	2	10	61887	61896	40 %	60 %	0 %	0 %	238651134
45	NC_012730	TTTTC	2	10	62473	62482	0 %	80 %	0 %	20 %	238651134
46	NC_012730	AGTTA	2	10	64094	64103	40 %	40 %	20 %	0 %	238650260
47	NC_012730	CCGGT	2	10	72691	72700	0 %	20 %	40 %	40 %	238650267
48	NC_012730	AAATA	2	10	73178	73187	80 %	20 %	0 %	0 %	238650267
49	NC_012730	TCCCA	2	10	75785	75794	20 %	20 %	0 %	60 %	238650269
50	NC_012730	TGAGG	2	10	89130	89139	20 %	20 %	60 %	0 %	238650278
51	NC_012730	CTTGC	2	10	89724	89733	0 %	40 %	20 %	40 %	238650279
52	NC_012730	ATACC	2	10	90837	90846	40 %	20 %	0 %	40 %	238650281
53	NC_012730	TTCTA	2	10	90994	91003	20 %	60 %	0 %	20 %	238650281
54	NC_012730	TTATT	2	10	94640	94649	20 %	80 %	0 %	0 %	238650286
55	NC_012730	ATAGA	2	10	95639	95648	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
56	NC_012730	GTAAA	2	10	95791	95800	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
57	NC_012730	AATAG	2	10	96205	96214	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
58	NC_012730	TTTTC	2	10	98428	98437	0 %	80 %	0 %	20 %	238650288
59	NC_012730	TATCA	2	10	99290	99299	40 %	40 %	0 %	20 %	238650288
60	NC_012730	TAGAA	2	10	99930	99939	60 %	20 %	20 %	0 %	238650289
61	NC_012730	ACTAA	2	10	104242	104251	60 %	20 %	0 %	20 %	238650293
62	NC_012730	ATGGA	2	10	106096	106105	40 %	20 %	40 %	0 %	238650294
63	NC_012730	TAAAT	2	10	110159	110168	60 %	40 %	0 %	0 %	238650298
64	NC_012730	TAGTA	2	10	110381	110390	40 %	40 %	20 %	0 %	238650298
65	NC_012730	AAATA	2	10	111185	111194	80 %	20 %	0 %	0 %	238650298
66	NC_012730	TAGTT	2	10	115945	115954	20 %	60 %	20 %	0 %	238650301
67	NC_012730	CTTTT	2	10	116913	116922	0 %	80 %	0 %	20 %	238650302
68	NC_012730	AATTA	2	10	118155	118164	60 %	40 %	0 %	0 %	238650302
69	NC_012730	AAATT	2	10	120750	120759	60 %	40 %	0 %	0 %	238650305
70	NC_012730	TAATT	2	10	122975	122984	40 %	60 %	0 %	0 %	238650306
71	NC_012730	TAATT	2	10	123206	123215	40 %	60 %	0 %	0 %	238650306
72	NC_012730	ATCAA	2	10	128258	128267	60 %	20 %	0 %	20 %	238650310
73	NC_012730	ACGCT	2	10	129435	129444	20 %	20 %	20 %	40 %	238650310
74	NC_012730	TAAGT	2	10	129469	129478	40 %	40 %	20 %	0 %	238650310
75	NC_012730	AAAGA	2	10	130433	130442	80 %	0 %	20 %	0 %	238650310
76	NC_012730	ATTTA	2	10	135725	135734	40 %	60 %	0 %	0 %	238650316
77	NC_012730	CTTTT	2	10	138648	138657	0 %	80 %	0 %	20 %	238650317
78	NC_012730	TATTC	2	10	140646	140655	20 %	60 %	0 %	20 %	238650318
79	NC_012730	ATATT	2	10	140952	140961	40 %	60 %	0 %	0 %	238650318
80	NC_012730	TACTT	2	10	143886	143895	20 %	60 %	0 %	20 %	238650320
81	NC_012730	CTTCT	2	10	144293	144302	0 %	60 %	0 %	40 %	238650322
82	NC_012730	ATTTT	2	10	147454	147463	20 %	80 %	0 %	0 %	238650325
83	NC_012730	GGCTC	2	10	154047	154056	0 %	20 %	40 %	40 %	238650328
84	NC_012730	AGCAG	2	10	154472	154481	40 %	0 %	40 %	20 %	238650328
85	NC_012730	TTAAT	2	10	154615	154624	40 %	60 %	0 %	0 %	238650328
86	NC_012730	TAAAA	2	10	156721	156730	80 %	20 %	0 %	0 %	238650330
87	NC_012730	ATTTA	2	10	158155	158164	40 %	60 %	0 %	0 %	238650332
88	NC_012730	TTTTA	2	10	158923	158932	20 %	80 %	0 %	0 %	238650332
89	NC_012730	TTTGT	2	10	172027	172036	0 %	80 %	20 %	0 %	238650338
90	NC_012730	CTTTA	2	10	190151	190160	20 %	60 %	0 %	20 %	238650351
91	NC_012730	ACTTA	2	10	192521	192530	40 %	40 %	0 %	20 %	238650353
92	NC_012730	TATAT	2	10	192569	192578	40 %	60 %	0 %	0 %	238650353
93	NC_012730	GCAAG	2	10	193820	193829	40 %	0 %	40 %	20 %	238650354
94	NC_012730	TTAGC	2	10	194143	194152	20 %	40 %	20 %	20 %	238650354
95	NC_012730	ACCGC	2	10	194361	194370	20 %	0 %	20 %	60 %	238650354
96	NC_012730	AATTT	2	10	195007	195016	40 %	60 %	0 %	0 %	238650354
97	NC_012730	TTATT	2	10	197846	197855	20 %	80 %	0 %	0 %	238650356
98	NC_012730	TTTTA	2	10	198338	198347	20 %	80 %	0 %	0 %	238650356
99	NC_012730	ACTTT	2	10	198412	198421	20 %	60 %	0 %	20 %	238650356
100	NC_012730	TGTTT	2	10	198733	198742	0 %	80 %	20 %	0 %	238650356
101	NC_012730	TATAT	2	10	199164	199173	40 %	60 %	0 %	0 %	238650357
102	NC_012730	AATTC	2	10	204289	204298	40 %	40 %	0 %	20 %	238650362
103	NC_012730	AAAAT	2	10	205704	205713	80 %	20 %	0 %	0 %	238650363
104	NC_012730	CTTTA	2	10	208238	208247	20 %	60 %	0 %	20 %	238650366
105	NC_012730	ATGCT	2	10	209112	209121	20 %	40 %	20 %	20 %	238650367
106	NC_012730	TTTTA	2	10	209224	209233	20 %	80 %	0 %	0 %	238650367
107	NC_012730	TTGCA	2	10	214606	214615	20 %	40 %	20 %	20 %	238650369
108	NC_012730	GAATG	2	10	216487	216496	40 %	20 %	40 %	0 %	238650369
109	NC_012730	TTAAT	2	10	217416	217425	40 %	60 %	0 %	0 %	238650369
110	NC_012730	TAAAT	2	10	218578	218587	60 %	40 %	0 %	0 %	238650369
111	NC_012730	ATTAT	2	10	219845	219854	40 %	60 %	0 %	0 %	238650370
112	NC_012730	CAAAT	2	10	220133	220142	60 %	20 %	0 %	20 %	238650370
113	NC_012730	ATATT	2	10	223475	223484	40 %	60 %	0 %	0 %	238650373
114	NC_012730	GATTT	2	10	223638	223647	20 %	60 %	20 %	0 %	238650373
115	NC_012730	CTTTT	2	10	226116	226125	0 %	80 %	0 %	20 %	238650376
116	NC_012730	TACCG	2	10	230654	230663	20 %	20 %	20 %	40 %	238650379
117	NC_012730	ATACT	2	10	234449	234458	40 %	40 %	0 %	20 %	238650380
118	NC_012730	AAAAT	2	10	234905	234914	80 %	20 %	0 %	0 %	238650380
119	NC_012730	AAAAT	2	10	235496	235505	80 %	20 %	0 %	0 %	238650381
120	NC_012730	AGCAA	2	10	236502	236511	60 %	0 %	20 %	20 %	238650382
121	NC_012730	TAATT	2	10	239588	239597	40 %	60 %	0 %	0 %	238650387
122	NC_012730	AAAAG	2	10	240850	240859	80 %	0 %	20 %	0 %	238650389
123	NC_012730	CTAAC	2	10	240885	240894	40 %	20 %	0 %	40 %	238650389
124	NC_012730	AAATT	2	10	242122	242131	60 %	40 %	0 %	0 %	238650390
125	NC_012730	ATTTA	2	10	242506	242515	40 %	60 %	0 %	0 %	238650390
126	NC_012730	AAGCT	2	10	243208	243217	40 %	20 %	20 %	20 %	238650390
127	NC_012730	TAAGT	2	10	246160	246169	40 %	40 %	20 %	0 %	238650392
128	NC_012730	TTATT	2	10	256298	256307	20 %	80 %	0 %	0 %	238650395
129	NC_012730	CTGCT	2	10	258470	258479	0 %	40 %	20 %	40 %	238650398
130	NC_012730	ATTAT	2	10	265792	265801	40 %	60 %	0 %	0 %	238650405
131	NC_012730	ACTTT	2	10	266320	266329	20 %	60 %	0 %	20 %	238650406
132	NC_012730	TCAAC	2	10	267199	267208	40 %	20 %	0 %	40 %	238650406
133	NC_012730	CAAAT	2	10	268862	268871	60 %	20 %	0 %	20 %	238650409
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135	NC_012730	ATTTT	2	10	271783	271792	20 %	80 %	0 %	0 %	238650410
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