MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 21874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012730	TAC	2	6	29957	29962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650236
502	NC_012730	TTGC	2	8	30056	30063	0 %	50 %	25 %	25 %	238650236
503	NC_012730	TTA	3	9	30067	30075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650236
504	NC_012730	AAAT	2	8	30111	30118	75 %	25 %	0 %	0 %	238650236
505	NC_012730	ATA	2	6	30209	30214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650236
506	NC_012730	AAT	2	6	30241	30246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650236
507	NC_012730	A	6	6	30316	30321	100 %	0 %	0 %	0 %	238650236
508	NC_012730	TAA	2	6	30331	30336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650236
509	NC_012730	ATT	2	6	30379	30384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650236
510	NC_012730	TA	3	6	30389	30394	50 %	50 %	0 %	0 %	238650236
511	NC_012730	CTT	2	6	30400	30405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650236
512	NC_012730	AG	3	6	30421	30426	50 %	0 %	50 %	0 %	238650236
513	NC_012730	AAATCT	2	12	30552	30563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650237
514	NC_012730	GTA	2	6	30604	30609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650237
515	NC_012730	AAT	2	6	30691	30696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650237
516	NC_012730	TAGT	2	8	30736	30743	25 %	50 %	25 %	0 %	238650237
517	NC_012730	CTT	2	6	30762	30767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650237
518	NC_012730	T	6	6	30766	30771	0 %	100 %	0 %	0 %	238650237
519	NC_012730	TA	3	6	30785	30790	50 %	50 %	0 %	0 %	238650237
520	NC_012730	ATT	2	6	30809	30814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650237
521	NC_012730	T	6	6	30813	30818	0 %	100 %	0 %	0 %	238650237
522	NC_012730	GCT	2	6	30845	30850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650237
523	NC_012730	ATA	2	6	30885	30890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650237
524	NC_012730	AAT	2	6	30933	30938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650237
525	NC_012730	CAA	2	6	30951	30956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650237
526	NC_012730	A	6	6	30975	30980	100 %	0 %	0 %	0 %	238650237
527	NC_012730	CAA	2	6	31012	31017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650237
528	NC_012730	TACC	2	8	31027	31034	25 %	25 %	0 %	50 %	238650237
529	NC_012730	ATTT	2	8	31082	31089	25 %	75 %	0 %	0 %	238650237
530	NC_012730	AAT	2	6	31114	31119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650237
531	NC_012730	CTT	2	6	31120	31125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650237
532	NC_012730	GTA	2	6	31131	31136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650237
533	NC_012730	AAG	2	6	31158	31163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650237
534	NC_012730	A	6	6	32150	32155	100 %	0 %	0 %	0 %	238650238
535	NC_012730	TAT	2	6	32162	32167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
536	NC_012730	ATT	2	6	32301	32306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
537	NC_012730	AAT	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650238
538	NC_012730	A	7	7	32353	32359	100 %	0 %	0 %	0 %	238650238
539	NC_012730	AAT	2	6	32377	32382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650238
540	NC_012730	ATG	2	6	32462	32467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650238
541	NC_012730	GAAT	2	8	32487	32494	50 %	25 %	25 %	0 %	238650238
542	NC_012730	GT	3	6	32501	32506	0 %	50 %	50 %	0 %	238650238
543	NC_012730	TAT	2	6	32589	32594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
544	NC_012730	ATT	2	6	32680	32685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
545	NC_012730	A	6	6	32688	32693	100 %	0 %	0 %	0 %	238650238
546	NC_012730	TGA	2	6	32698	32703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650238
547	NC_012730	TAAT	2	8	32739	32746	50 %	50 %	0 %	0 %	238650238
548	NC_012730	TA	4	8	32815	32822	50 %	50 %	0 %	0 %	238650238
549	NC_012730	AAT	2	6	32831	32836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650238
550	NC_012730	GGA	2	6	32842	32847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650238
551	NC_012730	A	7	7	32946	32952	100 %	0 %	0 %	0 %	238650238
552	NC_012730	TAA	2	6	32970	32975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650238
553	NC_012730	TAT	2	6	33022	33027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
554	NC_012730	GCAA	2	8	33049	33056	50 %	0 %	25 %	25 %	238650238
555	NC_012730	GAA	2	6	33104	33109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650238
556	NC_012730	ATA	2	6	33150	33155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650238
557	NC_012730	TA	3	6	33159	33164	50 %	50 %	0 %	0 %	238650238
558	NC_012730	GCT	2	6	33200	33205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650238
559	NC_012730	AGA	2	6	33229	33234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650238
560	NC_012730	ATT	2	6	33292	33297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
561	NC_012730	ATG	2	6	33396	33401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650238
562	NC_012730	TCA	3	9	33415	33423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650238
563	NC_012730	TTC	2	6	33481	33486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650238
564	NC_012730	TGC	2	6	33523	33528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650238
565	NC_012730	CAG	2	6	33609	33614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650238
566	NC_012730	TTA	2	6	33624	33629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
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568	NC_012730	AATT	2	8	33723	33730	50 %	50 %	0 %	0 %	238650238
569	NC_012730	TAG	2	6	33751	33756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650238
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571	NC_012730	ATAAAA	2	12	33861	33872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650238
572	NC_012730	ATT	2	6	33893	33898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
573	NC_012730	ATT	2	6	33937	33942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650238
574	NC_012730	CCG	2	6	34019	34024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650238
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578	NC_012730	A	6	6	34300	34305	100 %	0 %	0 %	0 %	238650238
579	NC_012730	GCA	2	6	34403	34408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650238
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581	NC_012730	TTC	2	6	34512	34517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650238
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583	NC_012730	AGA	2	6	34528	34533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650238
584	NC_012730	TAC	2	6	34558	34563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650238
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586	NC_012730	AATT	2	8	34587	34594	50 %	50 %	0 %	0 %	238650238
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591	NC_012730	T	7	7	35087	35093	0 %	100 %	0 %	0 %	238650239
592	NC_012730	CAAAA	2	10	35105	35114	80 %	0 %	0 %	20 %	238650239
593	NC_012730	ACA	2	6	35196	35201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650239
594	NC_012730	TA	4	8	35202	35209	50 %	50 %	0 %	0 %	238650239
595	NC_012730	GTT	2	6	35262	35267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650239
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597	NC_012730	CGCA	2	8	35383	35390	25 %	0 %	25 %	50 %	238650239
598	NC_012730	AAT	2	6	35406	35411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650239
599	NC_012730	CCT	2	6	35413	35418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238650239
600	NC_012730	T	6	6	35496	35501	0 %	100 %	0 %	0 %	238650239
601	NC_012730	ATG	2	6	35533	35538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650239
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604	NC_012730	ACT	2	6	35622	35627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650239
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609	NC_012730	TGT	2	6	35782	35787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650239
610	NC_012730	GCG	2	6	35803	35808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238650239
611	NC_012730	TAT	2	6	35812	35817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650239
612	NC_012730	AT	3	6	35838	35843	50 %	50 %	0 %	0 %	238650239
613	NC_012730	A	6	6	35910	35915	100 %	0 %	0 %	0 %	238650239
614	NC_012730	ATT	2	6	35918	35923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650239
615	NC_012730	T	6	6	36022	36027	0 %	100 %	0 %	0 %	238650239
616	NC_012730	A	6	6	36039	36044	100 %	0 %	0 %	0 %	238650239
617	NC_012730	TACT	2	8	36073	36080	25 %	50 %	0 %	25 %	238650239
618	NC_012730	T	7	7	36134	36140	0 %	100 %	0 %	0 %	238650239
619	NC_012730	TA	3	6	36172	36177	50 %	50 %	0 %	0 %	238650239
620	NC_012730	ATT	2	6	36209	36214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650239
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622	NC_012730	GAAG	2	8	36255	36262	50 %	0 %	50 %	0 %	238650239
623	NC_012730	TA	3	6	36271	36276	50 %	50 %	0 %	0 %	238650239
624	NC_012730	TTATAT	2	12	36393	36404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650239
625	NC_012730	ATGTT	2	10	36464	36473	20 %	60 %	20 %	0 %	238650239
626	NC_012730	TAA	2	6	36536	36541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650239
627	NC_012730	TTAT	2	8	36546	36553	25 %	75 %	0 %	0 %	238650239
628	NC_012730	CTT	2	6	36564	36569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650239
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