MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 23198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012633	T	7	7	134913	134919	0 %	100 %	0 %	0 %	229586344
2502	NC_012633	AT	3	6	134977	134982	50 %	50 %	0 %	0 %	229586344
2503	NC_012633	TTAA	2	8	134984	134991	50 %	50 %	0 %	0 %	229586344
2504	NC_012633	CTA	2	6	135003	135008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586344
2505	NC_012633	T	6	6	135016	135021	0 %	100 %	0 %	0 %	229586344
2506	NC_012633	AG	3	6	135134	135139	50 %	0 %	50 %	0 %	229586344
2507	NC_012633	GCA	2	6	135182	135187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586344
2508	NC_012633	ATT	2	6	135325	135330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586345
2509	NC_012633	GTA	2	6	135336	135341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2510	NC_012633	TGC	2	6	135474	135479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
2511	NC_012633	TTG	2	6	135504	135509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586345
2512	NC_012633	TC	3	6	135543	135548	0 %	50 %	0 %	50 %	229586345
2513	NC_012633	ATTT	2	8	135597	135604	25 %	75 %	0 %	0 %	229586345
2514	NC_012633	GCTTT	2	10	135684	135693	0 %	60 %	20 %	20 %	229586345
2515	NC_012633	TAA	2	6	135697	135702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
2516	NC_012633	AATT	2	8	135708	135715	50 %	50 %	0 %	0 %	229586345
2517	NC_012633	TTGCTA	2	12	135750	135761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229586345
2518	NC_012633	GAT	2	6	135791	135796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2519	NC_012633	A	8	8	135818	135825	100 %	0 %	0 %	0 %	229586345
2520	NC_012633	TGA	2	6	135859	135864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2521	NC_012633	AT	3	6	135896	135901	50 %	50 %	0 %	0 %	229586345
2522	NC_012633	AAGATA	2	12	135915	135926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229586345
2523	NC_012633	AT	3	6	135979	135984	50 %	50 %	0 %	0 %	229586345
2524	NC_012633	CTTTAG	2	12	136077	136088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229586345
2525	NC_012633	GATG	2	8	136109	136116	25 %	25 %	50 %	0 %	229586345
2526	NC_012633	AGT	2	6	136150	136155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2527	NC_012633	TATGT	2	10	136334	136343	20 %	60 %	20 %	0 %	229586345
2528	NC_012633	T	6	6	136343	136348	0 %	100 %	0 %	0 %	229586345
2529	NC_012633	GCC	2	6	136378	136383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586345
2530	NC_012633	TA	3	6	136394	136399	50 %	50 %	0 %	0 %	229586345
2531	NC_012633	TGC	2	6	136558	136563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
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2533	NC_012633	TCTT	2	8	136591	136598	0 %	75 %	0 %	25 %	229586345
2534	NC_012633	ATT	2	6	136656	136661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586345
2535	NC_012633	AT	3	6	136671	136676	50 %	50 %	0 %	0 %	229586345
2536	NC_012633	T	6	6	136717	136722	0 %	100 %	0 %	0 %	229586345
2537	NC_012633	TTTAGT	2	12	136736	136747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	229586345
2538	NC_012633	CCA	2	6	136751	136756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586345
2539	NC_012633	TATT	2	8	136759	136766	25 %	75 %	0 %	0 %	229586345
2540	NC_012633	ATG	2	6	136796	136801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2541	NC_012633	TGC	2	6	136846	136851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
2542	NC_012633	CTC	2	6	136911	136916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586345
2543	NC_012633	ATT	2	6	136953	136958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586345
2544	NC_012633	TGG	2	6	137004	137009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586345
2545	NC_012633	AGA	2	6	137101	137106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586345
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2547	NC_012633	GAT	2	6	137171	137176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
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2549	NC_012633	AGT	2	6	137359	137364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2550	NC_012633	GTTA	2	8	137434	137441	25 %	50 %	25 %	0 %	229586345
2551	NC_012633	TAG	2	6	137476	137481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2552	NC_012633	AGCT	2	8	137484	137491	25 %	25 %	25 %	25 %	229586345
2553	NC_012633	TGC	2	6	137497	137502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
2554	NC_012633	TAA	2	6	137527	137532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
2555	NC_012633	GCAA	2	8	137548	137555	50 %	0 %	25 %	25 %	229586345
2556	NC_012633	TGC	2	6	137593	137598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
2557	NC_012633	G	6	6	137605	137610	0 %	0 %	100 %	0 %	229586345
2558	NC_012633	AGG	2	6	137629	137634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586345
2559	NC_012633	GGA	2	6	137663	137668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586345
2560	NC_012633	ATA	2	6	137709	137714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
2561	NC_012633	TGC	2	6	137716	137721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586345
2562	NC_012633	AAC	2	6	137749	137754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586345
2563	NC_012633	TCT	2	6	137768	137773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586345
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2565	NC_012633	TGT	2	6	137821	137826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586345
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2569	NC_012633	AGT	2	6	137939	137944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
2570	NC_012633	TGT	2	6	137959	137964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586345
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2573	NC_012633	CAC	2	6	138036	138041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586345
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2576	NC_012633	ATA	2	6	138093	138098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
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2593	NC_012633	TAG	2	6	140702	140707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
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2595	NC_012633	TA	3	6	140764	140769	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
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2598	NC_012633	TAA	2	6	140876	140881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586346
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2600	NC_012633	AATG	2	8	140896	140903	50 %	25 %	25 %	0 %	229586346
2601	NC_012633	ACT	2	6	141037	141042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
2602	NC_012633	AGCA	2	8	141158	141165	50 %	0 %	25 %	25 %	229586346
2603	NC_012633	GAT	2	6	141280	141285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
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2605	NC_012633	ATT	2	6	141324	141329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
2606	NC_012633	TCC	2	6	141372	141377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586346
2607	NC_012633	TCG	2	6	141408	141413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586346
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2612	NC_012633	ATGA	2	8	141553	141560	50 %	25 %	25 %	0 %	229586346
2613	NC_012633	TTG	2	6	141611	141616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586346
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2620	NC_012633	CAT	2	6	141864	141869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
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2622	NC_012633	TAA	2	6	142008	142013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586346
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2625	NC_012633	TGA	2	6	142244	142249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
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2999	NC_012633	CTA	2	6	162081	162086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586360
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